周少丞 毛琦淇 季曉春 滕偉峰 張佳男
根據(jù)WTO 國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)發(fā)布的2020 年全球癌癥數(shù)據(jù)報(bào)告,乳腺癌的新發(fā)病例數(shù)正迅速增加,已超越肺癌,成為全球首位。此外,乳腺癌的死亡病例數(shù)也位居世界之首,突顯了其對(duì)全球公共衛(wèi)生的重大挑戰(zhàn)[1]。近年來(lái),在全球范圍內(nèi)已開(kāi)展了大量關(guān)于乳腺癌發(fā)病潛在機(jī)制的研究。針對(duì)乳腺癌包括手術(shù)、化療、內(nèi)分泌治療、靶向治療等在內(nèi)的綜合診療水平不斷提高。但是,仍有部分患者出現(xiàn)耐藥、復(fù)發(fā)及轉(zhuǎn)移,患者的生存率顯著降低、預(yù)后不良。因此,需要尋找一種新的抗乳腺癌治療策略。腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移本質(zhì)上依賴(lài)于細(xì)胞骨架蛋白的機(jī)械運(yùn)動(dòng)。通過(guò)前期研究發(fā)現(xiàn),LAD1 作為一個(gè)細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白,在腫瘤的發(fā)生及發(fā)展中起到重要作用。有基因組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),LAD1 蛋白在基底細(xì)胞樣和三陰性乳腺癌中表達(dá),提示LAD1 與乳腺癌的惡性程度相關(guān),其高表達(dá)可提示患者預(yù)后不良[2-3]。且有研究報(bào)道提示,LAD1 在喉癌、口腔鱗癌中表達(dá),并在腫瘤的進(jìn)展中發(fā)揮重要作用[4]。因此,本文將探究LAD1 作為一個(gè)骨架相關(guān)蛋白,在乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中是否起重要作用。
1.1 LAD1在不同腫瘤中的表達(dá)差異分析 通過(guò)TIMER 2.0數(shù)據(jù)庫(kù)(http://timer.cistrome.org/)[5],類(lèi)型選擇“LAD1”,分析LAD1 在不同癌癥組織中的差異表達(dá)。
1.2 乳腺組織樣本收集 登陸癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Altas,TCGA)在線(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(https://portal.gdc.cancer.gov/),篩選條件:(1)Primary Site: Breast;(2)Program: 人類(lèi)腫瘤基因組(the cancer genome altas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)下載;(3)Project: TCGA-BRCA;(4)Disease Type: ductal and lobular neoplasms;(5)Data Category:transcriptome profiling;(6)Data Type: Gene Expression Quantification。
1.3 LAD1 mRNA 表達(dá)水平差異分析 利用TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析LAD1 mRNA 在乳腺癌腫瘤組織樣本和正常乳腺組織樣本中的表達(dá)差異。
1.4 LAD1 蛋白表達(dá)水平驗(yàn)證 利用人類(lèi)蛋白質(zhì)質(zhì)譜查詢(xún)網(wǎng)站(www.proteinatlas.org)檢索LAD1 蛋白在乳腺癌組織和正常乳腺組織中的表達(dá)差異。
1.5 樣本組織中浸潤(rùn)免疫細(xì)胞比例分析 采用CIBERSORT 算法推斷每個(gè)樣本組織的22 種免疫細(xì)胞的相對(duì)比例[6-7]。
1.6 京都基因和基因數(shù)據(jù)庫(kù)(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析 利用“clusterProfiler”和“ggplot2”軟件包對(duì)樣本進(jìn)行KEGG 富集分析。
2.1 LAD1 蛋白在乳腺癌組織中高表達(dá) 通過(guò)TIMER 2.0 數(shù)據(jù)庫(kù)分析,LAD1 蛋白在乳腺癌組織中表達(dá)明顯高于乳腺正常組織,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)圖1。
圖1 LAD1 蛋白在泛癌中的表達(dá)水平
2.2 LAD1 mRNA 在乳腺癌組織與正常乳腺組織中表達(dá)的比較 通過(guò)對(duì)TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)挖掘,收集得到轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)樣本共1 182 例,其中乳腺癌樣本1 070例,正常乳腺組織樣本112 例。統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)提示,與正常乳腺組織比較,LAD1 mRNA 在乳腺癌組織中高表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)圖2。
圖2 LAD1 mRNA 在乳腺癌組織及正常乳腺組織中的表達(dá)水平(A:乳腺癌組織及正常乳腺組織中LAD1 mRNA 表達(dá)水平比較,與正常乳腺組織比較,aP<0.01;B:乳腺癌組織及正常乳腺組織中LAD1 mRNA 表達(dá)水平比較,與正常乳腺組織比較,aP<0.05)
2.3 LAD1 mRNA 在不同年齡、性別患者中的比較通過(guò)TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析介于65 歲上下患者及女性和男性乳腺癌中LAD1 mRNA 的表達(dá)水平差異。統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),相對(duì)于年齡>65 歲患者,LAD1 mRNA 在≤65歲患者中表達(dá)更高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)圖3A。而在女性和男性乳腺癌患者中,LAD1 mRNA的表達(dá)水平差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)圖3B。
圖3 LAD1 mRNA 在乳腺癌中的表達(dá)水平(A:不同年齡患者LAD1 mRNA 表達(dá)水平比較,aP<0.05;B:不同性別患者LAD1 mRNA表達(dá)水平比較)
2.4 免疫組化染色結(jié)果 通過(guò)人類(lèi)蛋白質(zhì)譜查詢(xún)網(wǎng)站(www.proteinatlas.org),檢索乳腺癌組織和正常乳腺組織LAD1 蛋白的免疫組化染色結(jié)果,可見(jiàn)乳腺癌病理組織中LAD1 蛋白的表達(dá)高于正常乳腺組織,見(jiàn)圖4。
圖4 LAD1 蛋白在乳腺癌組織和正常乳腺組織中的表達(dá)(A:乳腺癌組織中LAD1 蛋白的表達(dá)情況;B:正常乳腺組織中LAD1 蛋白的表達(dá)情況)
2.5 LAD1 的表達(dá)與乳腺癌中浸潤(rùn)的免疫細(xì)胞之間的相關(guān)性 本研究使用CIBERSORT 算法計(jì)算低風(fēng)險(xiǎn)和高風(fēng)險(xiǎn)隊(duì)列之間免疫細(xì)胞分?jǐn)?shù)的比較。結(jié)果顯示,高表達(dá)LAD1 基因在乳腺癌免疫微環(huán)境中與M2 型巨噬細(xì)胞、樹(shù)突細(xì)胞細(xì)胞靜息、嗜酸性粒細(xì)胞的表達(dá)呈正相關(guān),且差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)。高表達(dá)LAD1 基因與記憶性B 細(xì)胞、初始B 細(xì)胞和漿細(xì)胞的表達(dá)呈負(fù)相關(guān),且差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05),見(jiàn)圖5(封三)。
圖5 腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞的變化(A:使用CIBERSORT 算法計(jì)算低風(fēng)險(xiǎn)和高風(fēng)險(xiǎn)組之間免疫細(xì)胞分?jǐn)?shù);B:京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)富集分析低風(fēng)險(xiǎn)和高風(fēng)險(xiǎn)組之間免疫細(xì)胞分?jǐn)?shù))
惡性腫瘤容易出現(xiàn)細(xì)胞增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,這是導(dǎo)致其難治性的最主要原因[8]。細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移本質(zhì)上依賴(lài)于細(xì)胞骨架蛋白的機(jī)械運(yùn)動(dòng)。LAD1作為一個(gè)細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白,其蛋白分子量約59 kD,在脊椎動(dòng)物物種中不保守,而且在無(wú)脊椎動(dòng)物中不存在,這表明它的起源較晚[9]。LAD1 蛋白首先是從小鼠皮膚cDNA 文庫(kù)中克隆得到,編碼的蛋白除了包含一個(gè)精氨酸和6 個(gè)絲氨酸-谷氨酸(SEK)三肽結(jié)構(gòu)域外,沒(méi)有其他結(jié)構(gòu)域可以識(shí)別。
本研究通過(guò)TIME 2.0 數(shù)據(jù)庫(kù)分析得到LAD1 蛋白在乳腺癌組織中高表達(dá)。已有相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,在對(duì)EGF 刺激的乳腺細(xì)胞系進(jìn)行研究分析后,發(fā)現(xiàn)LAD1蛋白在EGF 激活的ERK 信號(hào)通路中起到了關(guān)鍵的作用。不僅其蛋白表達(dá)量有所增加,LAD1 蛋白還經(jīng)歷了結(jié)構(gòu)性修飾。此外,LAD1 蛋白與其他關(guān)鍵的細(xì)胞骨架蛋白,如肌動(dòng)蛋白actin,協(xié)同工作,共同調(diào)控乳腺癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移。這一發(fā)現(xiàn)揭示了LAD1 在乳腺癌進(jìn)展中扮演了至關(guān)重要的角色[10]。相關(guān)研究指出,在某些腫瘤中,Akt 和ERK 存在異常的磷酸化現(xiàn)象[11-12]。LAD1 不僅能與F-actin 形成復(fù)合體,還可以調(diào)節(jié)下游的Akt 和ERK 的磷酸化狀態(tài)。這種調(diào)節(jié)作用進(jìn)一步影響癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移能力[10]。根據(jù)以上已有的研究,LAD1 蛋白可通過(guò)影響重要信號(hào)通路等方式影響乳腺癌的增殖、侵襲及轉(zhuǎn)移。
腫瘤微環(huán)境作為腫瘤免疫研究當(dāng)中最為重要環(huán)節(jié),腫瘤微環(huán)境中的腫瘤細(xì)胞與免疫細(xì)胞相互通,影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移。趨化因子是一組可溶性,大小約為8~14 kDa 的小分子蛋白,是天然免疫系統(tǒng)的重要組成部分[13]。它可以通過(guò)與細(xì)胞表面G 蛋白偶聯(lián)受體結(jié)合,發(fā)揮生物學(xué)相關(guān)作用,如刺激各類(lèi)白細(xì)胞的定向和(或)非定向遷移。在腫瘤微環(huán)境中,趨化因子可以由腫瘤細(xì)胞、免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞分泌,分泌的趨化因子和細(xì)胞表面受體結(jié)合可激活多種信號(hào)途徑,并募集免疫細(xì)胞亞群進(jìn)入腫瘤微環(huán)境中[14]。有研究提示,乳腺癌細(xì)胞株MCF-7 和T47D 產(chǎn)生的CCL5 可以自分泌方式直接或間接通過(guò)刺激基質(zhì)金屬蛋白酶9 的表達(dá)等途徑促進(jìn)腫瘤的發(fā)展[15]。本團(tuán)隊(duì)對(duì)乳腺癌TCGA 數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)的分析發(fā)現(xiàn),LAD1 與腫瘤微環(huán)境中的M2 型巨噬細(xì)胞的表達(dá)呈正相關(guān)。M2 型巨噬細(xì)胞在誘導(dǎo)血管生成、限制免疫反應(yīng)和組織修復(fù)方面起著關(guān)鍵作用。一旦外周血中的單核細(xì)胞被招募到腫瘤部位,腫瘤微環(huán)境下可以迅速將單核細(xì)胞分化成TAMs。因此推測(cè),LAD1 是否可以通過(guò)調(diào)節(jié)乳腺癌某種趨化因子,募集得到M2 型巨噬細(xì)胞,間接影響乳腺癌的增殖、侵襲及轉(zhuǎn)移。
LAD1 蛋白在乳腺癌的發(fā)展中起到了重要的角色。它不僅參與了EGF 激活的ERK 信號(hào)通路,還影響了細(xì)胞骨架蛋白的動(dòng)態(tài)調(diào)控和與Akt 和ERK 的磷酸化狀態(tài),從而調(diào)節(jié)乳腺癌細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。此外,腫瘤微環(huán)境中的交互作用對(duì)于腫瘤的發(fā)展和轉(zhuǎn)移也具有關(guān)鍵意義。趨化因子在腫瘤微環(huán)境中扮演了重要的角色,能夠影響免疫細(xì)胞的活性和遷移。特別地,LAD1 與腫瘤微環(huán)境中的M2 型巨噬細(xì)胞呈正相關(guān),這些細(xì)胞在腫瘤的生長(zhǎng)、轉(zhuǎn)移和免疫逃逸中起到了關(guān)鍵作用??傊?,LAD1 蛋白和腫瘤微環(huán)境的相互作用為乳腺癌的治療提供了新的機(jī)制和潛在的治療靶點(diǎn)。