国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

豬細(xì)環(huán)病毒的傳播及公共衛(wèi)生意義

2023-11-13 12:10:50李賓山東省博興縣呂藝鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)站
中國畜牧業(yè) 2023年19期
關(guān)鍵詞:圓環(huán)基因組檢出率

文│李賓 (山東省博興縣呂藝鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)站)

細(xì)環(huán)病毒是屬于Anelloviridae科的小型單鏈DNA病毒,1997年首次發(fā)現(xiàn)可能是導(dǎo)致日本的一位患者輸血后肝炎的病因,該病毒被命名為TT病毒,指的是患者的首字母縮寫。人類細(xì)環(huán)病毒及其他變體,如Torque Teno Mini和Torque Teno Midi病毒,被發(fā)現(xiàn)可以高比率感染人類。細(xì)環(huán)病毒還感染各種哺乳動(dòng)物,包括豬、牛、羊、駱駝、家禽、貓、狗、嚙齒動(dòng)物和靈長(zhǎng)類動(dòng)物(黑猩猩、獼猴),細(xì)環(huán)病毒是哺乳動(dòng)物正常病毒群的一部分。在接受免疫抑制藥物治療的器官移植后人類患者中,細(xì)環(huán)病毒構(gòu)成了超過65%的病毒群,而在未接受治療的個(gè)體中,這一比例僅為10%。這種免疫失衡、共感染和細(xì)環(huán)病毒血癥之間的關(guān)聯(lián)表明細(xì)環(huán)病毒是機(jī)會(huì)性病原體,許多豬和人的細(xì)環(huán)病毒感染的流行病學(xué)研究也都證實(shí)了這一點(diǎn)。細(xì)環(huán)病毒DNA在水源、豬肉制品、疫苗、血液制品、異種移植、醫(yī)院環(huán)境和人類血清中均被檢測(cè)到。一頭豬同時(shí)被幾種豬細(xì)環(huán)病毒感染并不罕見,用感染豬的骨髓對(duì)未感染和不提供初乳的仔豬進(jìn)行實(shí)驗(yàn)性感染,能夠?qū)е虏∽兒蛡魅拘圆《狙Y,可以在實(shí)驗(yàn)感染豬的多個(gè)器官和系統(tǒng)中獨(dú)立產(chǎn)生病變。

一、細(xì)環(huán)病毒和豬細(xì)環(huán)病毒的分子特征、分類和復(fù)制

對(duì)于細(xì)環(huán)病毒的研究初期,因?yàn)榧?xì)環(huán)病毒與圓環(huán)病毒(Circoviridae)科成員特別是雞貧血病毒(chicken anemia virus)結(jié)構(gòu)和分子特征相似,細(xì)環(huán)病毒被認(rèn)為是第一個(gè)人類圓環(huán)病毒。然而,進(jìn)一步的研究表明細(xì)環(huán)病毒和圓環(huán)病毒之間沒有顯著的序列一致性。2005年,國際病毒分類委員會(huì)提出將Torque Teno Mini和人細(xì)環(huán)病毒歸入新的Anellovirus屬,并賦予其首字母縮略詞Torque teno的含義,由拉丁語Torque(項(xiàng)鏈)和tenuis(狹窄)組成。2009年,國際病毒分類委員會(huì)建立了新的Anelloviridae科,將其分為11個(gè)屬。

細(xì)環(huán)病毒呈二十面體對(duì)稱的球形顆粒,直徑30~50納米,基因組大小為2.1~3.9kb,取決于宿主物種。一般來說,動(dòng)物細(xì)環(huán)病毒的基因組比人類細(xì)環(huán)病毒的基因組小,感染人類和黑猩猩的細(xì)環(huán)病毒基因組大小在3.7~3.9kb之間,豬細(xì)環(huán)病毒的基因組大?。s2.8kb)介于人類細(xì)環(huán)病毒和迄今為止在貓中分離出的最小的細(xì)環(huán)病毒(< 2.1kb)之間。細(xì)環(huán)病毒基因組由一個(gè)包含至少3個(gè)ORF的編碼區(qū)和一個(gè)約1.2kb(豬細(xì)環(huán)病毒為0.8kb)的非編碼區(qū)組成。ORF1編碼約700~770個(gè)氨基酸,被認(rèn)為是病毒衣殼蛋白。ORF1的遺傳變異性大,其中至少有三個(gè)高變區(qū),其特征是多次插入和缺失。ORF2編碼約200個(gè)氨基酸,在一些基因型中,它分為更小的ORF2a和ORF2b,后者含有一個(gè)類似于蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶的雞貧血病毒樣保守氨基酸基序,可能參與了自然感染期間病毒轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)的加工。ORF3編碼一個(gè)含有285個(gè)氨基酸的蛋白,被認(rèn)為是一種功能未知的非結(jié)構(gòu)蛋白。

豬的自然感染最早在1999年被報(bào)道,第一個(gè)完整的豬細(xì)環(huán)病毒基因組在2002年被發(fā)表。感染豬的包括Iotatorquevvirus屬和Kappatorquevirus屬,Iotatorquevvirus屬包括Torque teno sus virus 1a(TTSuV 1a)和Torque teno sus virus 1b(TTSuV 1b),二者也可被歸類為TTSuV 1。Kappatorquevirus屬包括Torque teno sus virus K2a(TTSuV K2a)和Torque teno sus virus K2b(TTSuV K2b),二者也可被歸類為TTSuV 2。TTSuV 1和TTSuV 2具有非常低的約50%的核苷酸同源性,TTSuV 1的種內(nèi)變異(>30%)高于TTSuV 2的種內(nèi)變異(<15%)。豬細(xì)環(huán)病毒具有顯著的遺傳多樣性,與RNA病毒和其他單鏈DNA病毒相媲美。當(dāng)使用全基因組序列進(jìn)行分析時(shí),分類的復(fù)雜性大大增加,TTSuV 1c、TTSuV 1d、TTSuV K2c、 TTSuV K2d、TTSuV K2e、TTSuV K2f 和TTSuV K2g等被鑒定和提出。

在自然宿主組織中的分布以及在多種生物樣本中的檢測(cè)表明,細(xì)環(huán)病毒能夠在不同的細(xì)胞類型中復(fù)制,識(shí)別分布在不同組織中的受體。由于DNA聚合酶編碼序列從未被證實(shí),因此人們相信細(xì)環(huán)病毒像大多數(shù)小型DNA病毒一樣,使用DNA聚合酶和宿主細(xì)胞的復(fù)制機(jī)制復(fù)制其DNA。細(xì)環(huán)病毒基因組的復(fù)制過程已在多種組織中被檢測(cè)到,包括肺、外周血單個(gè)核細(xì)胞、骨髓、脾、肝、胰腺、腎、甲狀腺和淋巴結(jié)。然而,目前仍缺乏可靠的體外培養(yǎng)體系,限制了對(duì)細(xì)環(huán)病毒與其宿主相互作用的分子機(jī)制的研究。

二、 傳播和公共衛(wèi)生意義

豬細(xì)環(huán)病毒在豬群中的高患病率表明存在有效的傳播機(jī)制,雖然糞口途徑被認(rèn)為是主要的傳播方式,但其他途徑也可能有助于病毒的傳播。豬細(xì)環(huán)病毒在仔豬出生第一周的糞便和鼻分泌物中被發(fā)現(xiàn),感染的流行率隨著年齡的增長(zhǎng)而增加,病毒更多地通過鼻腔分泌物而不是通過糞便排出。精液中也發(fā)現(xiàn)豬細(xì)環(huán)病毒存在性傳播感染的可能性,但尚未證明豬細(xì)環(huán)病毒會(huì)影響精液的數(shù)量或質(zhì)量。在初乳和死產(chǎn)仔豬中也發(fā)現(xiàn)了豬細(xì)環(huán)病毒DNA,這表明垂直傳播和經(jīng)胎盤、宮內(nèi)傳播是可能的。因此,豬細(xì)環(huán)病毒感染發(fā)生在生命早期,并導(dǎo)致進(jìn)行性、持續(xù)性感染,病毒血癥水平隨著動(dòng)物年齡的增加而增加。豬的大多數(shù)組織和器官包括腦、肺、腎、骨髓、心臟、脾、腸系膜和縱隔淋巴結(jié)都可檢測(cè)出豬細(xì)環(huán)病毒,其中淋巴組織和T淋巴細(xì)胞分別被大多數(shù)研究者認(rèn)為是豬細(xì)環(huán)病毒的靶位點(diǎn)和靶細(xì)胞。根據(jù)有限的體內(nèi)研究,病毒最初的復(fù)制可能發(fā)生在黏膜相關(guān)淋巴組織和局部淋巴結(jié),然后才發(fā)生全身傳播。對(duì)豬群中豬細(xì)環(huán)病毒流行率估計(jì)差異很大,但在健康豬和病豬中通常都非常高,在老年豬(屠宰日齡)中檢出率可達(dá)100%。世界各地的豬血清中都發(fā)現(xiàn)了豬細(xì)環(huán)病毒,TTSuV 1流行率在16.8%~100%之間,TTSuV 2流行率在31%~90%之間,但TTSuV K2b感染相關(guān)的數(shù)據(jù)仍然有限。

細(xì)環(huán)病毒在水源、廢物處理廠和醫(yī)院環(huán)境等環(huán)境中普遍存在,表明細(xì)環(huán)病毒在環(huán)境中是穩(wěn)定的,且易于傳播。人類細(xì)環(huán)病毒DNA在血液供應(yīng)和其他輸血產(chǎn)品中檢出率和檢測(cè)到的水平非常高。研究表明,TTSuV 1可以獨(dú)立地在仔豬中誘導(dǎo)病變,并在實(shí)驗(yàn)豬模型中加劇與豬圓環(huán)病毒2型和豬繁殖與呼吸疾病綜合征病毒的混合感染。由于人類通過食用豬肉接觸豬細(xì)環(huán)病毒的可能性很高,對(duì)豬細(xì)環(huán)病毒是否可以在人類中檢測(cè)到的調(diào)查顯示,80%的人類血清測(cè)試豬細(xì)環(huán)病毒DNA呈陽性,40%的測(cè)試人類血清有針對(duì)TTSuV 1 ORF2的抗體,這表明在人類中發(fā)生了豬細(xì)環(huán)病毒的血清轉(zhuǎn)換。而且,豬肉制品和胰蛋白酶等生物制品如肝素均報(bào)道含有豬細(xì)環(huán)病毒DNA。由于豬器官在大小、生理和基因編輯技術(shù)上的相似性,豬器官是異種移植的首選,但潛在的人畜共患豬細(xì)環(huán)病毒的公共衛(wèi)生意義是需要嚴(yán)謹(jǐn)探究的。

三、檢測(cè)

針對(duì)保守非編碼區(qū)序列的檢測(cè)能夠檢測(cè)出大多數(shù)細(xì)環(huán)病毒,而針對(duì)基因組中可變區(qū)域的檢測(cè)有助于區(qū)分屬。一些基于定量PCR的分析和原位雜交已經(jīng)在血清、組織、糞便樣本和牛奶等多種基質(zhì)上進(jìn)行了可靠的檢測(cè)。使用基于核酸檢測(cè)和抗原檢測(cè)(如免疫組化)的組合可以提高診斷結(jié)果的可靠性?;贠RF1的酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定可用于TTSuV 1a、TTSuV 1b和TTSuV 2,TTSuV1a也可用ORF2為基礎(chǔ)的酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定。在仔豬、育肥豬和母豬中檢測(cè)到對(duì)TTSuV 1和TTSuV 2的抗體反應(yīng),反應(yīng)的強(qiáng)度和檢出率隨著動(dòng)物的年齡而增加。但遺傳多樣性、多基因型和其他病毒的共感染、宿主因素(如物種、年齡、免疫反應(yīng)和可能的抗體交叉反應(yīng))導(dǎo)致了不同的檢測(cè)結(jié)果,并且難以闡明細(xì)環(huán)病毒感染在體內(nèi)的真實(shí)作用。下一代測(cè)序技術(shù)具有序列檢測(cè)和深度覆蓋的優(yōu)勢(shì),可以有效地解決與細(xì)環(huán)病毒序列特異性檢測(cè)可變性的缺點(diǎn)。但目前下一代測(cè)序技術(shù)關(guān)于豬病毒組的研究還很有限,大多數(shù)已發(fā)表的研究集中在表征的糞便病毒。這些研究中,在健康豬和患病豬的糞便中都檢測(cè)到豬細(xì)環(huán)病毒,健康豬的最高檢出率可達(dá)5%,腹瀉仔豬的最高檢出率達(dá)10%。在健康和豬圓環(huán)病毒2型感染豬的扁桃體和淋巴結(jié)中檢測(cè)到TTSuV 1和TTSuV 2的比例很高。豬細(xì)環(huán)病毒感染與豬圓環(huán)病毒2型、豬圓環(huán)病毒3型和豬繁殖和呼吸系統(tǒng)綜合征病毒引起的相關(guān)疾病以及戊型肝炎病毒引起的肝炎之間存在顯著相關(guān)。分析的結(jié)果僅證實(shí)了先前基于核酸檢測(cè)的研究,并證明豬細(xì)環(huán)病毒是豬病毒群的一個(gè)組成部分。

猜你喜歡
圓環(huán)基因組檢出率
QCT與DXA對(duì)絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松癥檢出率的對(duì)比
加權(quán)全能量最小的圓環(huán)形變
安寧市老年人高血壓檢出率及其影響因素
牛參考基因組中發(fā)現(xiàn)被忽視基因
豬圓環(huán)病毒病的發(fā)生、診斷和防治
一例鴨圓環(huán)病毒病的診斷
長(zhǎng)程動(dòng)態(tài)心電圖對(duì)心律失常的檢出率分析
圓環(huán)上的覆蓋曲面不等式及其應(yīng)用
山東產(chǎn)品抽查:文胸嬰幼兒服裝不合格率居前
中國纖檢(2015年8期)2015-05-08 09:31:55
基因組DNA甲基化及組蛋白甲基化
遺傳(2014年3期)2014-02-28 20:58:49
鹤庆县| 武安市| 湘阴县| 雷州市| 库伦旗| 阳高县| 都匀市| 武穴市| 平南县| 大竹县| 图们市| 威海市| 中阳县| 临漳县| 虹口区| 乐亭县| 衡东县| 思南县| 河东区| 启东市| 龙泉市| 南靖县| 荔浦县| 海南省| 甘孜县| 丹棱县| 扶沟县| 冕宁县| 文登市| 怀远县| 日喀则市| 黄龙县| 泰安市| 砚山县| 莆田市| 棋牌| 石首市| 岑巩县| 台中县| 马尔康县| 专栏|