丁 強(qiáng),向繼武,周 明,程 波,譚小芳 ,閆 雪,沈 潔
1. 宜昌三峽制藥有限公司,湖北 宜昌 443000;
2. 武漢工程大學(xué)環(huán)境生態(tài)與生物工程學(xué)院,湖北 武漢 430205;
3. 宜昌人福藥業(yè)有限責(zé)任公司,湖北 宜昌 443000 ;
4. 中國科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院,安徽 合肥 230000
安普霉素是美國Eli Lilly 公司首次發(fā)現(xiàn)的,由黑暗鏈霉菌合成的一種氨基環(huán)醇類抗生素中尼拉霉素復(fù)合物的一個(gè)組分[1],又名阿普拉霉素,其分子式為C21H41N5O11,由3 部分組成,分別為4-氨基-4-脫氧-α-吡喃型葡萄糖,辛二糖胺,2-脫氧鏈霉胺,其結(jié)構(gòu)如圖1 所示。安普霉素具有廣譜抗菌性,在獸藥范圍和畜禽類養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)領(lǐng)域被普遍使用于畜禽類的腸道感染治療,特別是對幼禽因?yàn)榇竽c桿菌、沙氏門菌等導(dǎo)致的腹瀉,腸道炎癥的治療和預(yù)防上,效果非常顯著[2];在畜禽養(yǎng)殖上,適量的安普霉素用于飼料添加劑,可以使畜禽體重獲得明顯增加,達(dá)到提前出欄的效果[3],研究還表明,安普霉素作為飼料添加劑的成分能有效提高水產(chǎn)養(yǎng)殖中魚、蝦增的重率和蛋白質(zhì)效率[4],市場前景巨大。
圖1 安普霉素分子結(jié)構(gòu)式Fig.1 Molecular structure of apramycin
為了獲得適應(yīng)大規(guī)模工業(yè)發(fā)酵的安普霉素優(yōu)良生產(chǎn)菌株,目前對安普霉素生產(chǎn)菌株的研究主要集中以下3 個(gè)方面:其一是采用傳統(tǒng)誘變方法如紫外、化學(xué)法等提高其產(chǎn)品效價(jià)[5];其次對安普霉素的發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化以獲得更高的生產(chǎn)效率[6-10];另外對安普霉素合成途徑進(jìn)行了解析[11],為安普霉素產(chǎn)品的開發(fā)和菌種選育提供了參考,例如李相豐等[12]推斷出了安普霉素可能的合成途徑,即葡萄糖起始合成巴龍霉胺后經(jīng)環(huán)合生成安普霉胺,進(jìn)一步與4-氨基-4-脫氧葡萄糖連接,最終生成了安普霉素,王普宏[13]通過阻斷tacA 基因獲得安普霉素單組份突變株。目前,不論是傳統(tǒng)誘變方法還是基因工程改造技術(shù)都在提高安普霉素效價(jià)方面取得了相當(dāng)?shù)某尚РV泛用于產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)??梢?,通過誘變育種將安普霉素工業(yè)生產(chǎn)菌株的產(chǎn)品效價(jià)提高是行之有效的[14]。
常壓室溫等離子體(atmospheric and room temperature plasma,ARTP)技術(shù)因其溫和安全、突變率高等特點(diǎn),在菌種誘變上得到了廣泛的應(yīng)用[15]。而中國科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院通過結(jié)合近年來發(fā)展起來的大氣壓低溫等離子體誘變育種技術(shù),集電子、離子、激發(fā)態(tài)中性分子、自由基、電場、紫外輻射等諸多生物誘變因素,提出氣液相等離子體,以空氣作為放電氣體,通過電極間形成的等離子體通道注入到水溶液中的改進(jìn)常壓室溫等離子體誘變系統(tǒng)[16]。由于采用空氣(主要成分為N2、O2)激發(fā)產(chǎn)生等離子,并且等離子體直接與水溶液接觸,可以產(chǎn)生豐富的高濃度活性氧(如OH、氧原子、O2-、H2O2等)和活性氮基團(tuán)(如激發(fā)態(tài)氮分子、NO 等),高含量活性氧、活性氮及磁場雙重作用下,將大大提高菌株突變率和突變庫容量,結(jié)合通量篩選技術(shù),磁場協(xié)同氣液等離子體技術(shù)有望成為高效誘變育種的新方法[17]。改進(jìn)后的氣液相等離子體誘變技術(shù)具有操作方便,經(jīng)濟(jì)成本低;對菌株遺傳物質(zhì)損傷多樣性,可以提高獲得突變菌株的概率;誘變安全,對人體無害,對環(huán)境無污染等諸多優(yōu)點(diǎn)。因此本試驗(yàn)將中國科學(xué)院等離子體物理研究所的氣液等離子體技術(shù)應(yīng)用于安普霉素生產(chǎn)菌株的誘變育種,建立并優(yōu)化誘變工藝,期望為獲得穩(wěn)定高產(chǎn)的安普霉素工業(yè)菌株提供參考。
誘變出發(fā)菌株:黑暗鏈霉菌(Streptomyces tenebrarius)A-0,為本公司保藏菌種。
生物效價(jià)檢測用菌種:枯草芽孢桿菌(bacillus subtitles)。
平板選擇培養(yǎng)基各組分質(zhì)量分?jǐn)?shù)(%):葡萄糖1.0 ,蛋白胨0.5 ,牛肉膏0.1,酵母膏0.1 ,NaCl 0.2 ,MgSO4.7H2O 0.025,瓊脂粉1.5,溶于pH 7.2的蒸餾水。
斜面培養(yǎng)基各組分質(zhì)量分?jǐn)?shù)(%):可溶性淀粉2.0,NaCl 0.05,KNO30.1 ,K2HPO4.3H2O 0.05,MgSO4.7H2O 0.05 ,F(xiàn)eSO4.7H2O 0.001,瓊脂2.0,溶于pH 7.4~7.6 的自來水。
種子瓶培養(yǎng)基各組分質(zhì)量分?jǐn)?shù)(%):葡萄糖3.0,玉米淀粉2.0 ,黃豆粉2.5 ,酵母粉0.1,碳酸鈣0.2,,硫酸鎂0.1,玉米漿1.5,硫酸銨0.1。
發(fā)酵瓶培養(yǎng)基各組分質(zhì)量分?jǐn)?shù)(%):葡萄糖4.0,玉米淀粉2.0,黃豆餅粉4.0,酵母粉0.5,蛋白胨1.0,玉米漿0.5,硫酸銨0.5,硫酸鎂0.4,磷酸二氫鉀0.1,淀粉酶0.2,碳酸鈣0.5,豆油0.5。
國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司:NaCl,MgSO4·7H2O,KNO3,K2PO4·3H2O,F(xiàn)eSO4·7H2O,硫酸銨,碳酸鈣,磷酸二氫鉀,氯化銨,瓊脂粉。
北京奧博星生物技術(shù)有限公司:葡萄糖,牛肉膏,可溶性淀粉,玉米粉,玉米漿,蛋白胨,黃豆餅粉,豆油,淀粉酶。
安琪酵母有限公司:酵母粉,酵母膏。
阿拉丁化學(xué)試劑網(wǎng):安普霉素標(biāo)準(zhǔn)品(K0231610 1mg 含517 單位安普霉素)。
北京中海生物科技有限公司:抗生素檢定培養(yǎng)基1 號。
美國Fisher公司:甲醇(色譜純)。
本實(shí)驗(yàn)使用的儀器設(shè)備見表1。
表1 儀器及設(shè)備型號Tab.1 Models of instruments and equipment
以Streptomyces tenebrarius菌株A-0 為出發(fā)菌株,采用改進(jìn)后的氣液相等離子體誘變技術(shù)進(jìn)行誘變育種,實(shí)驗(yàn)路線見圖2。
圖2 安普霉素菌種氣液相等離子體誘變實(shí)驗(yàn)路線Fig.2 Experimental route of gas-liqiud phase plasma mutagenesis of apramycin strains
1.5.1 安普霉素斜面培養(yǎng) 制備安普霉素茄子瓶斜面,30 ℃空培5~7 d,目測無雜菌后接種0.1 mL孢子液,37 ℃培養(yǎng)7 d,待斜面孢子轉(zhuǎn)白后收入冰箱保藏備用。
1.5.2 菌懸液制備 取滅菌后的純化水20 mL 將斜面孢子洗下打散并用紗布過濾,調(diào)整孢子量為1.0~1.2×108CFU/mL,備用。
1.5.3 氣液相等離子體誘變處理菌懸液 以孢子數(shù)為1.0~1.2×108CFU/mL 的菌懸液,進(jìn)行氣液相等離子體誘變,基本參數(shù)如下:無菌空氣流量2.5 L/h,放電功率10 W,溫度25~30 ℃,壓力為標(biāo)準(zhǔn)大氣壓,調(diào)節(jié)離子噴射探頭至液面下,距杯底1.0~1.5 cm處,分別處理30、45、60、75、90、105、120 s。處理過程中,在到達(dá)預(yù)設(shè)處理時(shí)間時(shí),通過特定取樣管道進(jìn)行取樣,用質(zhì)量分?jǐn)?shù)0.85%生理鹽水稀釋不同梯度涂布平板,37 ℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)5 d,進(jìn)行平板活菌計(jì)數(shù)(colony-forming units,CFU),計(jì)數(shù)誘變致死率,制作致死率曲線。
1.5.4 誘變菌懸液涂布分離 將誘變后的菌懸液用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.85%生理鹽水按10 的倍數(shù)進(jìn)行梯度稀釋,選擇10-3、10-4、10-5共3 個(gè)梯度進(jìn)行平板涂布,取樣量為100 μL/皿,每批涂布3 個(gè)平板,設(shè)置空白對照,37 ℃培養(yǎng)5~7 d。
1.5.5 安普霉素菌落初篩 不同單孢子接種的培養(yǎng)平板長滿后,分別用滅菌打孔器將(約2~3 cm2)菌片接種到24 孔板中,每孔裝5 mL 的發(fā)酵培養(yǎng)基,37 ℃,220 r/min,培養(yǎng)120 h。3 000 r/min,5 min 離心發(fā)酵液,取上清液用高效液相色譜(high performance liquid chromatography,HPLC)進(jìn)行含量測定,選擇安普霉素含量高的菌株。
1.5.6 安普霉素?fù)u瓶復(fù)篩 選擇安普霉素初篩后效價(jià)較出發(fā)菌株有明顯提高的突變菌株進(jìn)行搖瓶復(fù)篩。500 mL 搖瓶中裝50 mL 培養(yǎng)基,37 ℃,220 r/min,培養(yǎng)120 h,每個(gè)菌號做3 組平行實(shí)驗(yàn),采用HPLC 測定安普霉素含量,同時(shí)通過枯草芽孢桿菌使用牛津杯法測定安普霉素突變菌株的生物效價(jià)。
1.5.7 突變菌株遺傳穩(wěn)定性考察 復(fù)篩得到的突變菌株連續(xù)傳代至第五代,37 ℃,220 r/min,120 h搖瓶考察突變菌株傳代的效價(jià),選擇第一代和第五代之間效價(jià)差距低于5%的菌種,為選育成功,遺傳穩(wěn)定性較好,可以用于生產(chǎn)的菌株。
1.5.8 安普霉素檢測及計(jì)算方法[14]
(1)致死率計(jì)算
誘變后的菌懸液和未經(jīng)誘變的對照菌懸液分別進(jìn)行10 的倍數(shù)梯度稀釋,取10-4、10-5、10-6分別涂布3 個(gè)平板,37 ℃,7 d 后進(jìn)行活菌計(jì)算,根據(jù)平板上的菌落數(shù)量計(jì)算致死率。
其中:Q為誘變前對照品菌懸液的菌落數(shù)/(CFU/mL);H為ARTP 誘變處理后菌懸液的活菌數(shù)/(CFU/mL)。
(2)突變率計(jì)算
以安普霉素出發(fā)菌A0的效價(jià)作為對照組,將效價(jià)提高20%及以上和效價(jià)降低20%及以下的菌株歸為突變菌株,其中效價(jià)提高20%及以上的稱為正突變菌株,根據(jù)下面公式計(jì)算突變率和正突變率。
(3)菌濃測定
體積法:用移液管取混合均勻的發(fā)酵液10 mL至離心管中,3 000 r/min 離心10 min,然后將上清液倒入計(jì)量管中,讀取上清液體積,計(jì)算菌渣體積,即菌濃。
(4)安普霉素生物效價(jià)測定
生物效價(jià)測定方法:培養(yǎng)基為抗生素檢定培養(yǎng)基1 號;檢測菌:枯草芽孢桿菌;樣品濃度:高濃度標(biāo)準(zhǔn)品、高濃度樣品、低濃度標(biāo)準(zhǔn)品、低濃度樣品;培養(yǎng)溫度:35~37 ℃;培養(yǎng)時(shí)間:16~18 h;R值選取范圍:0.9~1.1(若低于或高與則需要重新估供試品效價(jià))。
(5)安普霉素高效液相色譜法測定含量
HPLC檢測:色譜柱為Apollo C18 5 μm×250 mm×4.6 mm;柱溫:30 ℃;流動(dòng)相:用20 mL/L 三氟乙酸和1 mL/L七氟丁酸混合后加超純水定容至1 000 mL;進(jìn)樣量:20 μL;流速:0.8 mL/min;蒸發(fā)光溫度:110 ℃;氣體流量:3.0 L/min。
配制0.2 mg/mL 的安普霉素標(biāo)準(zhǔn)溶液為100%,稀釋成5 個(gè)不同濃度的水平標(biāo)準(zhǔn)溶液,進(jìn)樣檢測,以測得的響應(yīng)信號對應(yīng)被測物濃度作圖,獲得標(biāo)準(zhǔn)曲線方程lgA=1.213 2lgC+2.451(R2=0.999 9),其中l(wèi)gA為峰面積,lgC為樣品濃度,R值在0.99 范圍內(nèi),可見安普霉素標(biāo)準(zhǔn)品溶液線性良好。將安普霉素?fù)u瓶發(fā)酵液離心后,取上清液,用0.22 μm 微孔濾膜過濾后進(jìn)樣檢測,獲得安普霉素的HPLC 圖譜,如圖3 所示,安普霉素的出峰時(shí)間在13.5 min 左右,將峰面積帶入標(biāo)準(zhǔn)曲線方程,經(jīng)過計(jì)算得出安普霉素初始菌株A-0 的安普霉素120 h 發(fā)酵的生物含量為0.282 mg/mL。
圖3 產(chǎn)安普霉素原始菌株A-0 發(fā)酵120 h 的HPLC 圖譜Fig.3 HPLC diagram of apramycin fermentation broth produced by original strain A-0 after 120 h fermentation
通過平板涂布計(jì)算氣液相等離子誘變每間隔20 s 誘變下菌株的存活個(gè)數(shù),確定誘變的致死率,得到最佳的誘變時(shí)間。以0 min 誘變時(shí)間菌落的死亡率為0 制作致死率曲線,如圖4 所示。
圖4 氣液相等離子誘變黑暗鏈霉菌致死率曲線Fig.4 Streptomyces tenebrarius lethality rate curve of gas-liquid phase plasma mutagenesis
由圖4 可知,隨著氣液相等離子體誘變時(shí)間的延長,安普霉素菌種的存活率在不斷降低,在處理90 s后黑暗鏈霉菌的的致死率接近90%,處理120 s后基本不再變化,維持在100%的死亡率,。根據(jù)現(xiàn)代科學(xué)的誘變統(tǒng)計(jì),致死率在75%左右是最佳的誘變點(diǎn),因此,選擇誘變時(shí)間75 s 作為后續(xù)誘變菌株的最佳節(jié)點(diǎn),在該時(shí)間內(nèi),黑暗鏈霉菌的致死率為78.6%,突變率經(jīng)過計(jì)算為43.5%,其中正突變率為22.6%。
2.3.1 氣液相等離子體誘變誘變菌株初篩 選擇75 s 處理時(shí)間用氣液相等離子體誘變處理黑暗鏈霉菌,梯度稀釋誘變后的菌懸液,涂布平板選擇培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)7~12 d 后進(jìn)行挑單菌落。根據(jù)菌落的形態(tài)、大小、生長情況,選擇較飽滿、生長旺盛、單個(gè)或形態(tài)與原種相比發(fā)生很大變化的菌落進(jìn)行挑選傳代,然后將余下的菌苔整個(gè)挑下放入24 孔板發(fā)酵5 d 考察效價(jià)。通過HPLC 法檢測安普霉素發(fā)酵含量,與原種A-0 含量相比較,50 個(gè)篩選菌種里面,共獲得5 個(gè)較出發(fā)菌株安普霉素產(chǎn)量增幅大于5%~30%的突變菌種,如圖5 所示,挑選菌號分別為8,12,25,35,47,對突變菌種重新編號,分別對應(yīng)A-01,A-02,A-03,A-04,A-05。
圖5 氣液相等離子體誘變誘變后突變菌株安普霉素產(chǎn)量的初篩結(jié)果Fig.5 Preliminary screening results of apramycin yields after gas-liquid phase plasma mutagenesis
2.3.2 突變菌株復(fù)篩 通過初篩得到5 株突變的高效價(jià)菌株,將得到的菌株進(jìn)行3 輪搖瓶復(fù)篩,管碟法測定生物效價(jià),與對照A-0 相比較,篩選出來的5 個(gè)突變菌株中A-4 的效價(jià)最為穩(wěn)定,基本3 輪復(fù)篩都維持在(3 300±100)U/mL 的范圍內(nèi),其他4個(gè)突變菌株在復(fù)篩中效價(jià)相對穩(wěn)定,但效價(jià)水平均低于A-4 突變菌株,如下圖6 所示,故選擇A-4進(jìn)行連續(xù)傳代考察穩(wěn)定性。
圖6 安普霉素突變菌株三輪復(fù)篩數(shù)據(jù)Fig.6 Data of rescreening of apramycin mutant strains for three times
2.3.3 安普霉素A-4 傳代遺傳穩(wěn)定性考察 安普霉素突變菌株A-4 在初篩和復(fù)篩中菌表現(xiàn)優(yōu)良,對A-4 突變菌進(jìn)行連續(xù)五次傳代,以A-4 一代菌為對照組,搖瓶考察傳代后的穩(wěn)定性,如圖7 所示,A-4在連續(xù)傳代的過程中,一代效價(jià)3 330 U/mL,到第五代是效價(jià)3 274 U/mL,降低幅度在5%以內(nèi),符合生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn),高效液相色譜測定含量一代最高達(dá)到0.375 mg/mL,傳代到第5 代,含量維持在0.358 mg/mL,可以進(jìn)行菌種保藏和生產(chǎn)應(yīng)用。
圖7 突變菌株A-4 連續(xù)傳代遺傳穩(wěn)定性考察Fig.7 Genetic stability test of mutant strain A-4 through continuous subculturing
2.3.4 安普霉素突變菌株A-4 搖瓶發(fā)酵過程監(jiān)控 以安普霉素出發(fā)菌株A-0 作為對照組,氣液相等離子體誘變突變菌株A-4 為試驗(yàn)組,進(jìn)行安普霉素突變菌的搖瓶發(fā)酵,發(fā)酵過程中菌絲體積變化(菌濃)和安普霉素產(chǎn)物積累如圖8 所示。
圖8 A-0 對照菌與突變菌A-4 發(fā)酵過程菌濃變化和發(fā)酵過程產(chǎn)物積累情況:(a)菌濃變化情況,(b)發(fā)酵過程產(chǎn)物積累情況Fig.8 (a)Variation trends of strain concentration during fermentation process,(b)comparison of product accumulation during fermentation process of comparison strain A-0 and mutant strain A-4
從圖8 可以看出突變菌株的菌絲生長更快,在48 h 達(dá)到生長的最高峰,未誘變的出發(fā)菌株A-0 的菌絲開始溶解,菌濃在72 h 后不斷下降,而突變菌A-4 則在84 h 菌濃才開始下降,突變菌菌絲溶解速度較原始菌緩慢,可見突變菌的穩(wěn)定期要比原始菌株長,推測突變菌株A-4 生長和合成安普霉素的時(shí)間較長,從而在相同發(fā)酵時(shí)間內(nèi)積累更多產(chǎn)物,從而發(fā)酵水平有所提高。如圖8 所示,84 h 以后原始菌株A-0 安普霉素的積累變得緩慢,到發(fā)酵結(jié)束36 h 內(nèi)增長的效價(jià)不多,在500 U/mL 左右,但突變菌株A-4 在84 h 后產(chǎn)物仍維持較快的增長速度,到120 h 時(shí),突變菌株的生物效價(jià)為3 420 U/mL,較84 h 效價(jià)增長了900 U/mL 左右,突變菌株較原始菌株A-0 發(fā)酵終點(diǎn)的生物效價(jià)2 580 U/mL,提高了32.6%。
本研究通過氣液相等離子體技術(shù)誘變安普霉素產(chǎn)生菌黑暗鏈霉菌A0,獲得了一株效價(jià)提高并具有穩(wěn)定遺傳性的安普霉素高產(chǎn)突變菌株A-4。結(jié)果表明氣液相等離子體誘變技術(shù)對黑暗鏈霉菌在一定的致死率下有較強(qiáng)的誘變效果,處理75 s后致死率達(dá)到78.6%,正突變率達(dá)到最佳效果28.9%,篩選得到的突變菌株A-4 生物效價(jià)達(dá)到3 420 U/mL,搖瓶發(fā)酵安普霉素含量0.375 mg/mL,較出發(fā)原始菌株A-0 效價(jià)提高了32.6%。氣液相等離子體誘變得到的突變菌株在經(jīng)過連續(xù)傳代后,仍維持在5%范圍內(nèi)的效價(jià)波動(dòng),穩(wěn)定性高。可見誘變用的活性離子導(dǎo)致細(xì)胞DNA 損傷和破壞,在其自我修復(fù)的過程中形成了不完全修復(fù)的突變,獲得穩(wěn)定遺傳的突變菌株。