苗永美 苗翠蘋 于慶才
(1.安徽科技學(xué)院生命與健康科學(xué)學(xué)院,鳳陽 233100;2.云南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,昆明 650504)
鐮刀菌(Fusarium)是一種世界性真菌,已鑒定的有300多種,常以物種復(fù)合體存在,其中23種復(fù)合體已被研究,近年來,該病原菌因在世界范圍內(nèi)侵染大量農(nóng)作物造成巨大經(jīng)濟(jì)損失而備受關(guān)注[1]。如棉花枯萎病和香蕉枯萎病均由尖孢鐮刀菌引起[2-3],小麥赤霉病由禾谷鐮刀菌復(fù)合種引起[4-5]。鐮刀菌不僅侵染植物,還有70多個(gè)種使人類致病,如鐮刀菌性角膜炎菌對(duì)免疫力缺陷患者會(huì)造成較為嚴(yán)重的感染[1]。此外,鐮刀菌代謝毒素如鐮刀酸、伏馬菌素和白僵菌素會(huì)污染食品,引起人畜食用急性中毒[6]。鐮刀菌具有多宿主性和強(qiáng)侵染力,通過侵染寄主植物維管束系統(tǒng)破壞輸導(dǎo)組織,引起植物器官腐爛、萎蔫等,導(dǎo)致作物產(chǎn)量損失和品質(zhì)下降。鐮刀菌通過形成厚垣孢子及與寄主、輪作物、雜草等形成寄生和致病關(guān)系,持續(xù)存于生產(chǎn)系統(tǒng)中[2],診斷和控制具有挑戰(zhàn)性,尤其是土傳病菌尖孢鐮刀菌的防治。生物防治具有高效、安全、環(huán)保等優(yōu)勢(shì),符合現(xiàn)代農(nóng)業(yè)持續(xù)發(fā)展趨勢(shì)。
脂肽是一種具有獨(dú)特兩親性的微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物,一部分是由多個(gè)氨基酸組成的肽鏈,為親水基,另一部分是具有β-羥基或氨基的脂肪酸鏈,為親油基[7]。脂肽因其低耐藥性而被認(rèn)為是抗生素安全替代品從而受到廣泛關(guān)注,具有抗真菌、細(xì)菌、病毒、腫瘤和殺蟲等功能。近期研究表明,絕大多數(shù)芽孢桿菌菌株都可以產(chǎn)生LPs,如枯草芽孢桿菌、解淀粉芽孢桿菌、蘇云金芽孢桿菌和蠟樣芽孢桿菌??咕鶯Ps根據(jù)結(jié)構(gòu)分為Iturins、Surfactins 和Fengycins三大家族,其氨基酸殘基序列、肽的環(huán)化以及脂肪酸鏈的長(zhǎng)度和分支決定其性質(zhì)和生物活性[8]。不同芽孢桿菌產(chǎn)生的脂肽類型不同,其表面活性劑特性和抑菌活性也存在差異。目前關(guān)于脂肽抑菌機(jī)制研究大多是從形態(tài)上通過電鏡掃描觀察細(xì)胞壁和細(xì)胞膜損傷、產(chǎn)生質(zhì)膜離子通道導(dǎo)致離子滲透、ROS導(dǎo)致細(xì)胞壁破壞等幾個(gè)層面。Li等[9]通過轉(zhuǎn)錄組分析脂肽中Fengycin和Iturins對(duì)黃曲霉的抑制機(jī)制發(fā)現(xiàn),主要是通過下調(diào)核糖體發(fā)生途徑和黃曲霉毒素合成途徑中部分基因。
病原菌MF01(分子鑒定與黃色鐮刀菌F.culmorum相似性高),為實(shí)驗(yàn)室前期從發(fā)病棉花植株上分離,黃色鐮刀菌是重要的谷物冠腐病菌,易導(dǎo)致食品污染[10]。作者前期開展石豆蘭(Bulbophyllum sp.)離體培養(yǎng)時(shí)發(fā)現(xiàn)內(nèi)生菌豐富,通過平板對(duì)峙和發(fā)酵液抑菌兩級(jí)方法,篩選出一株細(xì)菌對(duì)MF01有較好抑制效果,分子鑒定與Bacillus subtilis subsp.subtilis strain 168相似性為98.93%,命名BBs-27[11]。為進(jìn)一步掌握發(fā)酵液中抑菌成分及抑菌機(jī)制,對(duì)發(fā)酵液理化性質(zhì)進(jìn)行初步分析發(fā)現(xiàn),主要抑菌成分為脂肽(lipopeptides, LPs)。然而,BBs-27分泌的脂肽類型及其對(duì)F.culmorum抑菌機(jī)制尚不明確。本研究擬通過LC-MS分析抑制F.culmorum的脂肽類型,并從形態(tài)、生理和轉(zhuǎn)錄組3個(gè)方面分析其抑菌機(jī)理,旨在為鐮刀屬病原菌防治提供新思路,為開發(fā)新型、安全殺菌劑提供應(yīng)用基礎(chǔ)。
枯草芽孢桿菌BBs-27為前期從石豆蘭植物中分離[11];病原菌MF01從發(fā)病棉花植株上切取莖段、經(jīng)表面消毒,接種PDA培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng),經(jīng)過多次分離、純化獲得。
1.2.1 MF01分子鑒定 擴(kuò)增18S RNA、28S RNA、tef-1α三個(gè)基因片段。引物(NS1: 5′-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3′, NS4: 5′-CTTCCGTCAATTCCTTTAAG-3′)擴(kuò)增18S RNA,引物(NL1: 5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′, NL4: 5′-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3′)擴(kuò)增28S RNA,引物(EF1: 5′-ATGGGTAAGGA(A/G)GACAAGAC-3′, EF2: 5′-GGA(G/A)GTAC CAGT(G/C)ATCATG-3′)擴(kuò)增tef-1α[12]。DNA提取、引物合成、擴(kuò)增、序列拼接等工作委托通用生物(安徽)股份有限公司完成。根據(jù)各基因序列系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果,從NCBI/GenBank數(shù)據(jù)庫中搜索并下載相關(guān)菌株的各基因序列,Sequencher軟件將下載的原始基因序列串聯(lián)拼接,用Clustal X軟件將拼接后的基因序列Alignment比對(duì)。用MEGA 7.0軟件,選擇Kimura 2-parameter+Gamma Distributed模型計(jì)算進(jìn)化距離,采用最大似然法(maximum-likelihood)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,Bootstrap method 1 000次評(píng)估系統(tǒng)發(fā)育樹各分支置信度。
1.2.2 BBs-27發(fā)酵上清液制備 參照苗永美等[13]方法依次進(jìn)行菌種活化、種子液制備、發(fā)酵、收集上清、微孔膜過濾。
1.2.3 發(fā)酵液理化性質(zhì)分析 1.2.2過濾液用4% HCl(V/V)和4% NaOH(m/V)將pH分別調(diào)至2、4、6、8、10、12,放置5 h,再調(diào)回至初始pH;取10 mL過濾液于直徑9 cm培養(yǎng)皿中,紫外照射5、10、15、20、25、30 min;取9 mL過濾液分別加入1 mL 10 mg/mL的胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶、蛋白酶K,37℃放置2 h;不進(jìn)行任何處理為對(duì)照組(pH 5.5)。各處理液:PDA(1∶10)混合制平板,選用瓊脂柱法進(jìn)行抑菌試驗(yàn),計(jì)算抑菌率,具體方法參照苗永美等[13]方法。
1.2.4 粗脂肽提取 根據(jù)1.2.3結(jié)果,推斷發(fā)酵液中主要抑菌物質(zhì)為脂肽。按照Wu等[14]方法略作修改。具體方法:7 mol/L HCl調(diào)至pH 2,過夜、收集沉淀,少量蒸餾水溶解,1 mol/L NaOH調(diào)至中性,甲醇多次抽提、40℃減壓濃縮、35℃真空干燥得粗脂肽干品。配制10 mg/mL母液。
1.2.5 粗脂肽的純化與LC-MS鑒定 甲醇溶解粗脂肽,拌硅膠、陰涼處自然風(fēng)干。濕法裝柱、氯仿壓柱、上樣,用氯仿洗脫,依次用氯仿∶甲醇體積比為98∶2、95∶5、9∶1、8∶2進(jìn)行梯度洗脫,牛津杯法分析各組分抑菌活性。具抑菌活性的組分采用超高效液相色譜-線性離子阱靜電場(chǎng)軌道阱高分辨質(zhì)譜儀(型號(hào):Ulitimate 3000- LTQ Orbitrap XL)進(jìn)行分析。色譜條件:C18柱(Hypersil GOLD,100 mm×2.1 mm),填料粒徑1.9 μm,柱溫27.5℃。流動(dòng)相:甲醇∶水(0.1%含甲酸)=98∶2,流速0.3 mL/min。質(zhì)譜條件:HESI離子源,離子源溫度300℃,噴霧電壓3.5 kV,高分辨FTMS模式,分辨率60 000,采集正離子,質(zhì)核比范圍100-1 200。
1.2.6 電鏡掃描 PDA 培養(yǎng)基中添加500 μg/L脂肽后接種病原菌,培養(yǎng)3 d,挑取菌絲電鏡掃描,具體步驟參見苗永美等[13]方法。
1.2.7 生理指標(biāo)測(cè)定 根據(jù)1.2.4試驗(yàn)結(jié)果,PDA中添加脂肽使終濃度分別為100、500、1 000 μg/L,蒸餾水為對(duì)照。培養(yǎng)3 d時(shí),刮取菌絲于預(yù)冷研缽中,加pH 7.8、0.05 mol/L預(yù)冷PBS研磨成勻漿,4℃、12 000 r/min離心20 min,上清為待測(cè)酶液。超氧化物歧化酶(SOD)活性采用氮藍(lán)四唑法測(cè)定,以抑制NBT光化還原的50%為一個(gè)酶活單位(U);過氧化物酶(POD)活性采用愈創(chuàng)木酚法測(cè)定,以每分鐘OD值變化(升高)0.1為1個(gè)酶活性單位(U);過氧化氫酶(CAT)活性采用過氧化氫還原法測(cè)定,以每分鐘OD值變化0.1為1個(gè)酶活性單位(U);可溶性蛋白質(zhì)采用考馬斯亮藍(lán)法測(cè)定;可溶性糖含量采用苯酚硫酸法測(cè)定。
1.2.8 轉(zhuǎn)錄組分析 PDA+500 μg/L脂肽,鋪玻璃紙、接種、28℃培養(yǎng)3 d,刮取菌絲液氮速凍后送至美吉生物公司,3次生物學(xué)重復(fù)(T1-T3),蒸餾水為對(duì)照(C1-C3)。依次提取總RNA、Oligo dt富集mRNA、片段化,反轉(zhuǎn)錄、End Repair Mix將雙鏈cDNA補(bǔ)成平末端,加ployA接頭、擴(kuò)增、Illumina平臺(tái)測(cè)序。對(duì)原始數(shù)據(jù)過濾和質(zhì)控,使用比對(duì)工具Hisat2將高質(zhì)量序列與參照物種禾谷鐮刀菌(F.graminearum)基因組進(jìn)行mapping,統(tǒng)計(jì)每個(gè)樣品比對(duì)到每個(gè)基因上reads數(shù);RSEM軟件以TPM>1為衡量標(biāo)準(zhǔn)計(jì)算每個(gè)基因表達(dá)量;DESeq2軟件分析差異表達(dá)基因DEGs,以P-adjust<0.05和|log2FC|≥1為DEGs的篩選條件;用GO數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因功能注釋;以顯著性水平P-value≤0.5對(duì)功能注釋的基因進(jìn)行KEGG富集,確定DEGs主要富集的通路及其可能的生物學(xué)功能。
1.2.9 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 采用Excel軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理、SPSS19.0軟件進(jìn)行差異顯著性分析,Origin2018作圖。轉(zhuǎn)錄組分析及作圖均在美吉生物公司網(wǎng)站完成。
18S RNA、28S RNA、tef-1α三個(gè)基因片段串聯(lián)拼接、比對(duì)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果(圖1)表明,MF01與F.culmorum、F.cerealis聚成一個(gè)支持強(qiáng)度為78%的末端分支。根據(jù)相似性高低,將MF01鑒定為黃色鐮刀菌(F.culmorum)。
圖1 基于三基因序列拼接的MF01系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.1 Phylogenetic tree of MF01 based on three-gene sequence splicing
發(fā)酵液經(jīng)酸堿處理后抑菌活性有明顯變化,pH 6-8時(shí)抑菌活性與對(duì)照(pH 5.5)差異不顯著,說明抑菌成分能耐一定酸堿,當(dāng)pH < 4或>10時(shí),活性會(huì)顯著降低(圖2-A)。短時(shí)間紫外線照射不會(huì)影響抑菌成分活性,超過10 min會(huì)明顯降低活性(圖2-B)。抑菌物質(zhì)對(duì)胃蛋白酶不敏感,但經(jīng)胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和蛋白酶K處理后其抑菌率顯著降低(圖2-C)。
圖2 不同處理后發(fā)酵液的抑菌效果Fig.2 Inhibitory effects of fermentation broths after different treatments
硅膠柱共分離到24種組分,其中組分23具有抑菌活性。對(duì)組分23進(jìn)行UPLC-MS分析,0.94 min左右出現(xiàn)一個(gè)主要洗脫峰(圖3-A),收集洗脫物進(jìn)行HESI-MS,結(jié)果出現(xiàn)了兩大類物質(zhì)。第一大類主含物質(zhì)其m/z值為1 065.54、1 079.55、1 093.57(圖3-B),它們的相對(duì)分子量相差14 Da,與一個(gè)亞甲基-CH2的分子量大小一致,說明是相差一個(gè)脂肪鏈的同系物,對(duì)比脂肽類物質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量推斷出為伊枯草菌素家族類物質(zhì)。第二大類主含物質(zhì)其m/z值為1 433.80、1 447.82、1 461.83、1 463.81、1 477.83、1 491.84、1 505.85、1 519.86、1 533.88,1 485.78、1 499.80、1 513.82(圖3-C),以上兩組物質(zhì)相對(duì)分子量也相差14 Da,根據(jù)分子量推測(cè)為豐原素同系物。
圖3 脂肽的LC-MS分析Fig.3 LC-MS analysis of LPs
電鏡掃描結(jié)果顯示,對(duì)照組菌絲表面光滑,粗細(xì)較為一致,生長(zhǎng)正常(圖4-A),脂肽處理組菌絲扭曲、不規(guī)則、粗細(xì)不均,異常擴(kuò)張,部分部位膨大為“氣球狀”(圖4-B)。由此看出,脂肽對(duì)黃色鐮刀菌的傷害在菌絲形態(tài)上體現(xiàn)較為明顯。
圖4 掃描電鏡下黃色鐮刀菌菌絲形態(tài)特征Fig.4 Mycelium morphology of F.culmorum by SEM
由圖5-A看出,100 μg/L脂肽處理菌絲體內(nèi)SOD活性與對(duì)照差異不顯著,當(dāng)濃度大于500 μg/L時(shí),SOD活性顯著低于對(duì)照,兩個(gè)處理濃度下分別降低了49.78%和53.66%,說明此時(shí)已對(duì)SOD系統(tǒng)造成傷害。3個(gè)脂肽濃度會(huì)顯著降低菌體POD和CAT活性,POD比對(duì)照分別降低了41.05%、62.57%、63.68%(圖5-B),CAT活性比對(duì)照分別降低了30.66%、58.64%、74.70%(圖5-C),說明100 μg/L的脂肽濃度就會(huì)對(duì)POD和CAT系統(tǒng)造成傷害。3種保護(hù)酶系統(tǒng)受脂肽影響最大的是POD,其次是CAT,最小的是SOD。
圖5 脂肽對(duì)保護(hù)酶的影響Fig.5 Effects of lipopeptide on protective enzymes
隨著脂肽濃度的提高,菌絲體內(nèi)可溶性蛋白和可溶性糖含量逐漸降低,顯著低于對(duì)照??扇苄缘鞍追謩e降低了25.32%、39.09%、63.44%,但100 μg/L和500 μg/L處理上含量差異不顯著(圖6-A)。3個(gè)脂肽處理下可溶性糖比對(duì)照分別降低了28.40%、43.85%、78.13%(圖6-B)。說明大于100 μg/L的脂肽已顯著影響菌體中兩種滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)的合成。
圖6 脂肽對(duì)滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)影響Fig.6 Effects of lipopeptide on osmoregulatory substances
抑菌率高說明菌絲生長(zhǎng)緩慢,菌絲受到傷害大。相關(guān)性分析顯示(表1),抑菌率與5項(xiàng)指標(biāo)呈極顯著負(fù)相關(guān),說明菌絲體內(nèi)3種保護(hù)酶、可溶性糖和可溶性蛋白受到脅迫后都作出強(qiáng)烈響應(yīng),或者說受到嚴(yán)重破壞。除SOD活性與其他4項(xiàng)指標(biāo)、POD與可溶性糖呈顯著相關(guān)外,其他指標(biāo)之間相關(guān)性均達(dá)到極顯著水平。每項(xiàng)指標(biāo)與其他5項(xiàng)指標(biāo)相關(guān)系數(shù)平均值從大到小依次為:抑菌率>CAT活性>可溶性蛋白>可溶性糖>POD活力>SOD活力。
表1 指標(biāo)之間相關(guān)系數(shù)Table 1 Correlation coefficient among indexes
2.8.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析 T組和C組6個(gè)cDNA庫共產(chǎn)生316 765 242條reads,質(zhì)控后獲得305 671 078條reads,各樣品測(cè)得數(shù)據(jù)過濾后所占比例超過96%,樣品誤差率< 0.03%,Q20>96%,Q30>91%,GC含量在52.27%-52.87%,比對(duì)率>78%,說明測(cè)得數(shù)據(jù)準(zhǔn)確度較高,利于后期數(shù)據(jù)分析(表2)。
表2 質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果Table 2 Quality control data statistics
2.8.2 基因表達(dá)及DEGs分析 利用TPM>1為衡量指標(biāo)計(jì)算基因表達(dá)量,對(duì)照組中共鑒定出9 015個(gè)表達(dá)基因,特有表達(dá)基因187個(gè);處理組中共有9 219個(gè)基因,特有表達(dá)基因391個(gè);共同表達(dá)的基因有8 828個(gè)(圖7)。與對(duì)照相比,處理組中篩選出712個(gè)DEGs,其中上調(diào)表達(dá)基因393個(gè),下調(diào)表達(dá)基因319個(gè)(圖8)。
圖7 不同樣品間表達(dá)量Venn分析Fig.7 Venn analysis of gene expressions between samples
2.8.3 DEGs的GO功能注釋分析 GO功能注釋分類結(jié)果表明,712個(gè)DEGs主要涉及到6個(gè)生物學(xué)過程、11個(gè)細(xì)胞組分和12分子功能,基因數(shù)量前20位GO分類見圖9。3個(gè)大類分別有300個(gè)(上調(diào)基因130個(gè),下調(diào)基因170個(gè))、453個(gè)(上調(diào)基因214個(gè),下調(diào)基因239個(gè))、570個(gè)(上調(diào)基因275個(gè),下調(diào)基因295個(gè))DEGs。根據(jù)富集DEGs數(shù)量,主要生物學(xué)過程有代謝進(jìn)程(metabolic process)和細(xì)胞進(jìn)程(cellular process),主要細(xì)胞組分有膜組分(membrane part)和細(xì)胞組分(cell part),主要分子功能有催化活性(catalytic activity)和結(jié)合功能(binding)。
2.8.4 DEGs的KEGG通路富集分析 對(duì)所有DEGs進(jìn)行KEGG通路富集分析,結(jié)果表明,712個(gè)DEGs中有185個(gè)富集到78條代謝通路中,涉及到代謝、細(xì)胞進(jìn)程、生物系統(tǒng)、人類疾病、環(huán)境信息處理、遺傳信息處理6個(gè)一級(jí)分類,其中89個(gè)上調(diào)DEGs參與41個(gè)代謝通路,96個(gè)下調(diào)DEGs參與60個(gè)代謝通路(圖10)。P-value<0.05顯著富集的有6條(表3)。
圖10 差異表達(dá)基因KEGG富集前20位代謝通路Fig.10 Top 20 metabolic pathways of differentially expressed genes enriched by KEGG
顯著富集到碳水化合物途徑共14個(gè)DEGs,參與半乳糖代謝(Map00052)、氨基糖和核苷糖代謝(Map00520),已知的有半乳糖氧化酶(galactose oxidase, GAO)前體、內(nèi)切幾丁質(zhì)酶(endochitinase,CHIT)前體,幾丁質(zhì)合成酶3(chitin synthase 3,CHS3)、甘露糖-1-磷酸鳥苷酰轉(zhuǎn)移酶(mannose-1-phosphate guanyltransferase, MPG1)基因,其他均為未知假設(shè)蛋白(hypothetical protein)(表3)。脂肽處理會(huì)使菌絲體中GAO和MPG1上調(diào)表達(dá),而CHS3和CHIT都下調(diào)表達(dá)。
DEGs顯著富集到脂代謝通路是麥角甾醇合成途徑(Map00100),有具體名稱的3個(gè)DEGs分別是Δ(14)-甾醇還原酶基因(Delta(14)-sterol reductase, ERG24)、C-5甾醇去飽和酶基因(C-5 sterol desaturase, ERG3)、C-4甲基甾醇氧化酶基因(C-4 methylsterol oxidase, ERG25)[15]。ERG24、ERG25、ERG3和FGSG_06215均上調(diào),而FGSG_02016下調(diào)表達(dá),說明所用脂肽處理濃度對(duì)細(xì)胞膜傷害較小,菌體通過積極上調(diào)部分麥角甾醇合成相關(guān)酶表達(dá)來調(diào)整細(xì)胞膜流動(dòng)性以抵抗外界脅迫。
氨基酸代謝通路中有具體名稱的3個(gè)DEGs分別是3-異丙基蘋果酸脫水酶(3-isopropylmalate dehydratase, 3-IPDH)、酮酸還原酶(ketol-acid reductoisomerase, KARI)、鳥氨酸脫羧酶(ornithine decarboxylase, ODC),該4種酶參與支鏈氨基酸纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的生物合成(Map00290)。IPDH呈下調(diào)、KARI呈上調(diào)變化,另兩種未知酶分別呈上調(diào)和下調(diào)變化,其變化可能會(huì)影響3種支鏈氨基酸合成,尤其是變化幅度較大的下調(diào)基因如IPDH可作為BBs-27脂肽靶標(biāo)重點(diǎn)研究。脂肽處理組菌體中參與谷胱甘肽代謝的酶基因有3個(gè)上調(diào)、2個(gè)下調(diào),下調(diào)表達(dá)且有具體功能描述的是ODC,該酶催化鳥氨酸形成的尸胺參與到谷胱甘肽代謝(Map00480),通過下調(diào)表達(dá)可能會(huì)影響生物體的谷胱甘肽代謝,從而影響抗氧化系統(tǒng)。
在輔助因子和維生素代謝(Map00770)中差異表達(dá)的DEGs有4個(gè),包含1個(gè)下調(diào)和3個(gè)上調(diào),具體名稱描述的是KARI,呈上調(diào)變化。
目前研究表明有些枯草芽孢桿菌菌株的代謝物質(zhì)能抑制農(nóng)業(yè)病原菌[16]、動(dòng)物病原菌[17]或食品源致病菌[18]。不同菌株產(chǎn)生的活性物質(zhì)不同,抑菌效果也不同,目前報(bào)道的活性成分多是蛋白質(zhì)類[19-21]和脂肽類[3,7,22],也有揮發(fā)性物質(zhì)研究的少量報(bào)道[23]。吳越等[19]研究表明,枯草芽孢桿菌HAINUP40分泌的能夠抑制羅非魚無乳鏈球菌的活性物質(zhì)對(duì)蛋白酶K敏感,不耐高溫,pH < 4或> 8時(shí)失去抑菌活性,可以耐受短時(shí)間(< 180 s)紫外線照射,表明抑菌物質(zhì)為大分子蛋白質(zhì),并非小分子脂肽。鄧陽等[20]研究枯草芽孢桿菌J-4菌株產(chǎn)生的抑菌物質(zhì)在100℃水浴60 min、pH為2.8-8.0范圍內(nèi)均具有較高活性,CTAB和CaCl2還能增強(qiáng)其活性,但會(huì)被胃蛋白酶或胰蛋白酶分解,據(jù)此推測(cè)為抗菌蛋白類物質(zhì)。李麗等[21]也從枯草芽孢桿菌S6的發(fā)酵液中分離到抗棉花枯萎病的拮抗蛋白。關(guān)于枯草芽孢桿菌產(chǎn)脂肽類抑菌物質(zhì)的研究更多,脂肽是非核糖體途徑合成,具有活性強(qiáng)、穩(wěn)定性高、安全等特點(diǎn)。與抗菌蛋白質(zhì)不同的是多數(shù)脂肽耐受性強(qiáng),曾國(guó)洪等[22]研究表明,枯草芽孢桿菌產(chǎn)生的脂肽在25-80℃下抗菌活性幾乎保持不變,具良好熱和pH穩(wěn)定性,對(duì)胰蛋白酶和胃蛋白酶不敏感。BBs-27發(fā)酵液理化性質(zhì)分析結(jié)合前期耐熱性研究[13],推測(cè)抑菌物質(zhì)是以脂肽類為主,且包括少量蛋白質(zhì)。不同菌株產(chǎn)生脂肽類型不同,LC-MS分析證實(shí)BBS-27抑制F.culmorum的抗菌肽主要是伊枯草菌素和豐原素兩大類,每類也都是復(fù)合物。B.velezensis產(chǎn)生的脂肽主要是伊枯草菌素和豐原素[18],B.amyloliquefaciens能產(chǎn)生表面活性素、泛革素和伊枯草菌素三類脂肽類化合物以及Bacillibactin、Difficidin和Bacillaene三類聚酮類化合物[24]。
BBs-27分泌的兩類脂肽會(huì)導(dǎo)致菌絲畸形,細(xì)胞壁合成受阻,異常腫脹,部分呈“氣球狀”,與B.velezensis和B.amyloliquefaciens粗提脂肽分別對(duì)黃曲霉和香蕉枯萎菌絲細(xì)胞壁破壞結(jié)果非常相似[21,24],也能使曲霉細(xì)胞呈“氣球狀”[25]。BBs-27分泌的兩類脂肽使菌體中SOD、POD、CAT酶活性和可溶性蛋白、可溶性糖含量顯著下降,相關(guān)性分析表明,脂肽是通過破壞SOD、POD、CAT等保護(hù)酶系統(tǒng),及抑制可溶性蛋白和可溶性糖合成來抑制菌體生長(zhǎng)。
細(xì)胞壁是鐮刀菌侵染植物過程中最先接觸的結(jié)構(gòu),是鐮刀菌保持致病力和正常發(fā)育所必須結(jié)構(gòu)。真菌細(xì)胞壁多糖包括幾丁質(zhì)、葡聚糖、甘露聚糖和半乳糖等,GAO、CHIT、CHS3、MPG1參與細(xì)胞壁形成。GAO 催化半乳糖形成乙醛糖和H2O2,注射D-半乳糖致小鼠衰老的機(jī)理是ROS的增加引起機(jī)能損傷,干擾細(xì)胞正常代謝[26]。脂肽處理會(huì)引起F.culmorum中GAO上調(diào)表達(dá),推測(cè)真菌可能也與動(dòng)物體內(nèi)一樣因產(chǎn)生過多ROS損傷機(jī)體,此外乳糖的氧化還會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)遭到破壞。CHS3是參與合成禾谷鐮刀菌細(xì)胞壁的基因之一,是其致病和發(fā)育的關(guān)鍵基因[27],還影響環(huán)境適應(yīng)能力[28]。值得注意的是,本研究中幾丁質(zhì)合成基因CHS3和降解基因CHIT都下調(diào)表達(dá),推測(cè)脂肽主要是通過抑制幾丁質(zhì)合成來影響細(xì)胞壁結(jié)構(gòu),因此,CHS3可作為農(nóng)藥靶標(biāo)深入研究。此外,MPG1上調(diào)表達(dá)會(huì)加大催化甘露糖形成GDP-甘露糖的力度,造成細(xì)胞壁穩(wěn)定性和強(qiáng)度減弱,也會(huì)使菌體變脆弱。
脂肽能增大Botrytis cinerea和F.oxysporum細(xì)胞膜通透性,導(dǎo)致滲透物質(zhì)流出和電導(dǎo)率上升[6,29]。麥角甾醇是真菌細(xì)胞膜主要固醇類物質(zhì),本研究中參與麥角甾醇代謝通路的5個(gè)DEGs中有4個(gè)上調(diào),說明脂肽對(duì)F.culmorum細(xì)胞膜會(huì)有一定影響,菌體能通過積極上調(diào)部分麥角甾醇合成相關(guān)酶表達(dá)來調(diào)整細(xì)胞膜流動(dòng)性以抵抗傷害,而FGSG_02016表達(dá)下降,后期可對(duì)序列信息、調(diào)控功能、與細(xì)胞膜損傷相關(guān)性等進(jìn)行深入研究。本研究也進(jìn)一步證實(shí)了麥角固醇合成途徑的酶類是唑類抗真菌藥物的主要靶點(diǎn)[15]。
脂肽破壞3種酶系統(tǒng)的分子響應(yīng)機(jī)制,可能是通過改變GAO和ODC等基因表達(dá)。方欣等[30]通過基因敲除和外源恢復(fù)等方法,證明3-異丙基蘋果酸脫水酶基因(FgLEU1)在禾谷鐮刀菌亮氨酸合成、菌絲孢子形成及產(chǎn)毒致病過程中發(fā)揮著重要作用。脂肽導(dǎo)致IPDH下調(diào)表達(dá)的結(jié)果可能會(huì)干擾支鏈氨基酸合成,進(jìn)而影響菌體蛋白合成和生長(zhǎng)。由于支鏈氨基酸合成途徑只在植物和微生物中存在,哺乳動(dòng)物中不存在,從農(nóng)產(chǎn)品安全角度出發(fā),支鏈氨基酸合成酶成為安全藥劑的靶標(biāo)和研究熱點(diǎn)。
BBs-27產(chǎn)生抑制F.culmorum的物質(zhì)主要是脂肽類且含有少量蛋白質(zhì),抗菌肽包含伊枯草菌素和豐原素兩大類。脂肽使菌絲卷曲、畸形、異常膨大,能破壞SOD、POD、CAT和可溶性蛋白及可溶性糖合成系統(tǒng),生理變化與生長(zhǎng)表現(xiàn)呈極顯著相關(guān)性。脂肽通過改變GAO、CHS3、MPG1的表達(dá)來干擾幾丁質(zhì)、半乳糖和甘露糖和麥角甾醇合成以破壞細(xì)胞壁和細(xì)胞膜,導(dǎo)致細(xì)胞生長(zhǎng)受阻;脂肽還能上調(diào)GAO而產(chǎn)生H2O2損傷機(jī)體,下調(diào)ODC干擾谷胱甘肽抗氧化系統(tǒng),降低抗氧化酶活性。此外,脂肽還能通過下調(diào)IPDH表達(dá)干擾支鏈氨基酸代謝,導(dǎo)致細(xì)胞死亡。GAO、CHS3、MPG1、IPDH均可作為脂肽作用靶點(diǎn)用于殺菌劑開發(fā)。