王小云 孫紅艷 史夢 于佳
摘要:以黃瓜乙烯響應(yīng)因子CsERF7轉(zhuǎn)錄本為研究對象,通過外源硒緩解黃瓜鎘脅迫試驗分析其表達(dá)及黃瓜生長狀況,并克隆CsERF7基因,構(gòu)建過表達(dá)載體轉(zhuǎn)化擬南芥,同時分析CsERF7的理化性質(zhì)和功能。結(jié)果表明,外源硒顯著升高了鎘脅迫引起的黃瓜生長指標(biāo)的降低,CsERF7在鎘處理下的表達(dá)豐度是對照的56%,而鎘+硒比單獨鎘處理上調(diào)表達(dá)4.53倍,與RNA-seq結(jié)果相符,此基因可能在硒調(diào)控黃瓜鎘脅迫響應(yīng)中起作用。同時,成功構(gòu)建超表達(dá)載體pEGOEP35S-H-ERF7-GFP,轉(zhuǎn)化擬南芥獲得轉(zhuǎn)基因株系。生物信息學(xué)分析表明,黃瓜CsERF7基因?qū)儆贏P2/ERF家族的AP2亞家族,開放閱讀框ORF長度588 bp,編碼196個氨基酸,有1個AP2結(jié)構(gòu)域;該蛋白屬于非跨膜親水性蛋白,亞細(xì)胞定位預(yù)測定位在線粒體中,存在22個氨基酸磷酸化位點;其二級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和延伸鏈構(gòu)成,與三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果高度一致,所得蛋白序列與黃瓜、甜瓜同源性最高。
關(guān)鍵詞:黃瓜;ERF;基因克隆;過表達(dá)載體構(gòu)建;生物信息分析
中圖分類號:S642.201文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號:1002-1302(2023)11-0046-07
黃瓜(Cucumis sativus)是世界范圍內(nèi)普遍種植的蔬菜,是我國設(shè)施蔬菜主要栽培種之一,在蔬菜產(chǎn)業(yè)中的地位十分重要;同時兼具清熱利水、健腦安神、潤膚美容等多種功效。我國城市食用黃瓜產(chǎn)地多位于城市近郊,這里同時也聚集較多的城市廢棄物,以及含重金屬的農(nóng)藥、化肥的大量使用,使得我國蔬菜質(zhì)量問題依然堪憂,其中包括鎘在內(nèi)的重金屬污染十分突出。重金屬鎘具有較高的可轉(zhuǎn)移性,能夠被植物的根部吸收,繼而轉(zhuǎn)運至地上部分可食器官并在植物中積累[1];并通過食物鏈富集于人體引發(fā)多種疾病,嚴(yán)重威脅人類健康[2]。因此,治理土壤鎘污染,深入探討黃瓜鎘毒害及耐性的生理與分子機制,發(fā)掘耐鎘關(guān)鍵基因,培育耐鎘新品種已經(jīng)成為當(dāng)前農(nóng)業(yè)科學(xué)的研究熱點。
乙烯響應(yīng)因子ERF(ethylene-responsive factor)是植物界的一類轉(zhuǎn)錄因子,屬于植物AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物抗病、干旱、低溫、高鹽等逆境脅迫中具有重要作用,該基因在不同植株中的超表達(dá)能夠提高其抗性[3]。根據(jù)其結(jié)構(gòu)域的數(shù)量及其相互間的序列相似性分為AP2、RAV和ERF 3個主要亞家族[4],其中AP2蛋白在調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育過程中起著重要作用[5];RAV家族蛋白在生物和非生物脅迫響應(yīng)過程中發(fā)揮重要作用[6];ERF亞家族成員對植物的生長發(fā)育以及逆境脅迫應(yīng)答反應(yīng)有著重要的調(diào)控作用,主要包括植物生長、果實發(fā)育、低溫和干旱脅迫等環(huán)境脅迫[7-8]。
在黃瓜轉(zhuǎn)錄因子ERF研究中,張慧敏等報道CsERF(登錄號:Csa7M448110)是黃瓜葉片中調(diào)控苦味形成的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子[9];CsERFs和CsHDAs基因表達(dá)水平與黃瓜果實冷害有一定的關(guān)系[10];潘健等報道部分ERF基因家族成員參與雌花分化初期的基因表達(dá)調(diào)控[11]。至今,ERF轉(zhuǎn)錄因子與鎘脅迫相關(guān)的研究鮮見報道,因此本研究擬以前期通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法篩選獲得應(yīng)答鎘脅迫的轉(zhuǎn)錄因子CsERF7為研究對象,驗證其與硒和鎘的調(diào)節(jié)作用關(guān)系,通過對目的基因的擴增,構(gòu)建CsERF7過表達(dá)載體,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,最后利用農(nóng)桿菌花序法轉(zhuǎn)化擬南芥獲得轉(zhuǎn)基因植株,為CsERF7功能的深入研究提供依據(jù),為硒介導(dǎo)的黃瓜耐鎘機理研究奠定基礎(chǔ)。
1材料與方法
1.1試驗材料
以黃瓜津研四號為研究材料,其種子購自太原市種子公司;哥倫比亞野生型擬南芥種子、大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞、農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞均由武漢艾迪晶生物科技有限公司提供。所用化學(xué)試劑均采用普通分析純,均購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
黃瓜幼苗培養(yǎng)及生理指標(biāo)測定和RNA測序試驗于2021年10—12月進(jìn)行,實時熒光定量qPCR驗證、過表達(dá)載體及重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌、擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化試驗于2022年3—5月進(jìn)行,所有試驗均在太原科技大學(xué)生物工程實驗室開展(RNA測序除外),具體試驗處理和方法如下。
1.2黃瓜幼苗的培養(yǎng)及處理
1.2.1黃瓜種子的處理先用2%的H2O2將黃瓜種子消毒20 min,再用蒸餾水沖洗干凈,并浸種2 h后置于22 ℃/18 ℃生長室內(nèi)砂床發(fā)芽。
1.2.2黃瓜幼苗水培試驗設(shè)計及分析測定項目黃瓜幼苗長至2葉1心期,選生長均勻一致的黃瓜植株移苗至水培溶液中放置在溫室內(nèi)培養(yǎng)。水培容器為3 L水桶,每桶盛培養(yǎng)液2.5 L,每桶6穴,每穴2株,海綿固定。營養(yǎng)液pH值調(diào)至5.8±0.1,基本培養(yǎng)液預(yù)培養(yǎng)7 d后進(jìn)行鎘、硒處理:對照(CK,基本培養(yǎng)液)、3 μmol/L Se、50 μmol/L Cd、50 μmol/L Cd+3 μmol/L Se,并分別記作CK、Se、Cd、Cd+Se,各處理隨機排列,重復(fù)3次;24 h保持通氣,每隔5 d更換培養(yǎng)液。處理10 d后各處理間有了顯著差異,收集葉片,清洗表面灰塵,并在液氮中迅速冷凍后置于-80 ℃超低溫冰箱中備用;并分析測定黃瓜株高、根長、SPAD值和生物量[12-13]。
1.3RNA-seq高通量測序
采用Illumina HiSeqTM高通量測序平臺在北京諾禾致源科技股份有限公司進(jìn)行黃瓜葉片RNA-seq測序,原始序列過濾后得到clean reads。選取HISAT軟件將過濾后的測序序列進(jìn)行基因組定位分析;經(jīng)過組裝、比較,新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測;最后,采用HTSeq軟件union模型對各樣品進(jìn)行基因表達(dá)水平分析,采用DEGSeq軟件對構(gòu)建的基因作差異分析,差異基因篩選的閾值設(shè)置為q值<0.005,然后篩選硒和鎘處理黃瓜幼苗中差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本。結(jié)合差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本的q值及在葉片中的基因表達(dá)豐度值,最終選取CsERF7作為本研究對象。
1.4實時熒光定量qPCR驗證
根據(jù)GenBank中β-actin基因(登錄號:XM_011659465)和測序后轉(zhuǎn)錄本CsERF7的序列(登錄號:Csa7G432080),利用Primer BLAST在線設(shè)計特異性熒光定量PCR所用引物。引物序列分別為β-actin,F(xiàn):5′-GAATCCAGCACGATACCA-3′,R:5′-TCAACCCAAAGGCTAACA-3′,預(yù)計擴增長度為136 bp;CsERF7,F(xiàn):5′-CCGAGCTACCTCGCATACAG-3′,R:5′-TCCGAGGTCTAGCAGCTCTT-3′,預(yù)計擴增長度為228 bp。引物均由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。
總RNA的提取采用上述各處理的冷凍葉片,用液氮研磨后采用Trizol法提取,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)合超微量紫外可見分光光度計檢測濃度、純度及完整性。cDNA的合成嚴(yán)格按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書執(zhí)行。PCR反應(yīng)體系為25 μL,單管含有12.5 μL 2×SYBR green,各0.2 μL上游和下游引物,11.1 μL ddH2O和1 μL cDNA模板。熒光定量PCR在CFX 實時熒光PCR檢測系統(tǒng)(BioRAD)里進(jìn)行,反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性10 s,60 ℃ 退火30 s,72 ℃延伸45 s,循環(huán)40次。每個樣品設(shè)置3次重復(fù)。cDNA產(chǎn)物用Actin引物作參照用于定量RT-PCR,對照(CK)的表達(dá)設(shè)為1。
1.5過表達(dá)載體pEGOEP35S-H-ERF7-GFP的構(gòu)建
CsERF7基因引物設(shè)計方法和合成公司同上,并在上下游兩端分別加上保護(hù)堿基和EcoRⅠ、HindⅢ 限制性內(nèi)切酶酶切位點(下劃線處序列)。引物序列為F:5′-ACTAGGGTCTCGCACC ATGGCTCGTCCACAACAACG-3′,R:5′-ACTAGGGTCTCTGCC TGTAATAATTTCGAATGATCCGAGGT-3′,預(yù)計擴增片段長度為588 bp。
采用上述引物和cDNA模板進(jìn)行目的片段擴增并回收,與改造后的載體pEGOEP35S-H 連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌、菌檢、提取質(zhì)粒測序,測序結(jié)果序列與目的片段序列比對一致,即為該過表達(dá)載體構(gòu)建成功。
1.6重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌
取100 μL冰凍的農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞GV3101,加5 μL上述質(zhì)粒DNA;迅速轉(zhuǎn)入37 ℃解凍;在 37 ℃ 溫浴5 min(無振蕩);加入1 mL LB液體培養(yǎng)基,并轉(zhuǎn)移至10 mL離心管中,28 ℃、260 r/min振蕩,預(yù)表達(dá)2~4 h;取適當(dāng)體積均勻涂布于含有抗生素的LB平板;28 ℃ 培養(yǎng)2~4 d,即可觀察到轉(zhuǎn)化子。
挑取單菌落克隆到5 mL LB培養(yǎng)基中28 ℃培養(yǎng)24~40 h,作PCR驗證,挑取陽性PCR的克隆1個,將此菌液取100 μL加入100 μL 30%甘油(提前滅菌)。充分渦旋混勻,室溫放置數(shù)小時,每30 min到1 h混勻1次。最后儲藏于-80 ℃待用。
1.7農(nóng)桿菌介導(dǎo)的擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化
首先,將哥倫比亞野生型擬南芥播種之后用保鮮膜覆蓋達(dá)到保溫保濕的效果。待擬南芥長出2張真葉時移栽,移栽后的苗用保鮮膜保濕3~4 d即可揭去保鮮膜,1個月左右蓮座葉可以覆蓋塑料杯,此時幼苗的澆水量要適中。當(dāng)生長至第1次抽莖產(chǎn)生第1輪花蕾時,摘去該花蕾,在短日照的情況下讓擬南芥營養(yǎng)生長,在侵染1周左右可將其置于長日照下,當(dāng)其旁支的第2花蕾的枝條長2~10 cm時進(jìn)行浸染。取出上述-80 ℃保存的含有重組質(zhì)粒的農(nóng)桿菌室溫解凍后浸染花序,第1次侵染前要去除已長出的角果,第1次侵染之后隔1周侵染1次,侵染2~3次,侵染之后植株不能缺水;每次浸染后用塑料薄膜套袋24 h,取掉薄膜后用去離子水洗去殘余菌液,大約3周后等擬南芥角果泛黃干燥后收種子。
將T0種子用75%乙醇洗30 s左右,之后用無菌水清洗2次,再用30%次氯酸鈉浸泡10 min左右,用無菌水洗2~3次,用無菌水浸泡1 h后,用01%的瓊脂水溶液懸浮后,轉(zhuǎn)移至含潮霉素的MS篩選培養(yǎng)基。待擬南芥長出2張真葉且長勢較好時移栽,移栽后的苗用保鮮膜保濕3~4 d即可揭去保鮮膜,適量澆水,1個月左右蓮座葉可以覆蓋塑料杯。約1個月后,待擬南芥長到一定大小之后用CTAB法提取DNA,進(jìn)行PCR檢測。
1.8生物信息學(xué)分析
使用BLAST對黃瓜CsERF7基因編碼氨基酸序列進(jìn)行同源性比對;使用Prot-Param分析CsERF7基因基本理化性質(zhì);利用在線工具NCBI-CDS里的SMART軟件預(yù)測蛋白保守結(jié)構(gòu)域;利用在線軟件NetPhos 3.1分析ERF7蛋白的潛在磷酸化位點;利用PSORT Ⅱ預(yù)測ERF7蛋白的亞細(xì)胞定位;通過SignalP 4.1 Server在線工具進(jìn)行信號肽預(yù)測分析,在線軟件TMHMM 2.0預(yù)測跨膜螺旋區(qū),SOPMA預(yù)測二級結(jié)構(gòu),使用SWISS-MODEL進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)預(yù)測,使用ProtScale分析蛋白質(zhì)的親疏水性。利用MEGA 11軟件,采用NJ鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹;采用BioAider V1.423軟件進(jìn)行序列相似性分析。
2結(jié)果與分析
2.1RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果
由表1可知,RNA-seq-CsERF7在鎘處理組和鎘+硒復(fù)合處理組中的表達(dá)豐度非常高,其中鎘處理表達(dá)豐度為對照的2.104倍,鎘+硒處理表達(dá)豐度為單獨鎘處理的5.600倍,推測其可能在外源硒介導(dǎo)的黃瓜耐鎘脅迫中扮演著重要的角色。因此,選擇CsERF7作為后續(xù)研究對象。
2.2外源硒對鎘脅迫下黃瓜幼苗生長的影響
黃瓜幼苗在50 μmol/L Cd處理5 d后受到了顯著的抑制,主要表現(xiàn)為植株矮化,葉片發(fā)黃(圖1-a);根長比對照顯著下降36.64%,地上部和根系干質(zhì)量分別比對照下降了31.32%和33.57%,其中根長受到的影響尤為嚴(yán)重。3 μmol/L外源硒(Cd+Se處理)顯著緩解了50 μmol/L Cd引起的黃瓜幼苗毒害癥狀,SPAD值較單一鎘處理上升9.61%,同時增加黃瓜生物量積累,對根長和根系干質(zhì)量的緩解效果最為明顯;在無鎘條件下添加硒對黃瓜幼苗的生長沒有顯著效應(yīng)(圖1-b)。進(jìn)一步表明,外源亞硒酸鈉能顯著緩解鎘脅迫下黃瓜受到的毒害現(xiàn)象。
2.3CsERF7 qPCR鑒定結(jié)果
為驗證RNA-seq測序結(jié)果的準(zhǔn)確性,對CsERF7進(jìn)行qPCR鑒定。由圖2-a可知,鎘處理CsERF7表達(dá)豐度是對照的56%;而鎘+硒復(fù)合處理與單獨鎘處理相比表達(dá)豐度顯著升高,比單獨鎘處理上調(diào)表達(dá)4.53倍。此表達(dá)結(jié)果與RNA-seq測序結(jié)果完全相符。
2.4黃瓜CsERF7基因擴增
提取黃瓜幼苗鎘+硒處理的葉片總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,PCR擴增后電泳檢測出約588 bp的條帶,說明已成功擴增出黃瓜CsERF7基因編碼區(qū)序列(圖2-b)。
2.5黃瓜過表達(dá)載體pEGOEP35S-H-ERF7-GFP的構(gòu)建
將上述目標(biāo)基因片段轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞DH5α,提取質(zhì)粒并使用EcoRⅠ和HindⅢ 對表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切鑒定(圖2-c);電泳檢測后觀察到預(yù)期目的片段793 bp的條帶。經(jīng)測序比對,序列結(jié)果與已知的CsERF7基因序列完全匹配。
2.6擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化研究
利用凍融法將載體pEGOEP35S-H-ERF7-GFP轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101,以花序浸染法進(jìn)行擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化,依次經(jīng)過質(zhì)粒農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化子,擬南芥培養(yǎng)、浸染、篩選培養(yǎng)、潮霉素抗性基因的PCR檢測后獲得T1代擬南芥轉(zhuǎn)基因種子(圖3)。
2.7CsERF7生物信息學(xué)分析
2.7.1CsERF7基因編碼氨基酸序列分析序列分析結(jié)果表明,CsERF7基因可編碼196個氨基酸(圖4-a),相對分子量為22 393.94 u;在線ProtParam軟件預(yù)測CsERF7蛋白理論等電點為6.35,原子總數(shù)為3 080,分子式為C980H1 503N287O302S8,相對分子量為22 393.94 u,帶負(fù)電荷殘基總數(shù)(Asp+Glu)21個,帶正電荷殘基總數(shù)(Arg+Lys)18個,脂肪指數(shù)67.81,總平均親水性預(yù)測為-0.753,屬于親水蛋白,不穩(wěn)定指數(shù)為53.24,屬于不穩(wěn)定蛋白。
2.7.2黃瓜ERF7蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測與分析對黃瓜ERF7蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測分析表明,該蛋白屬于AP2/ERF家族、 AP2亞家族, 在多肽鏈的N端第7~70位氨基酸之間存在AP2結(jié)構(gòu)域,代表DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,無其他特征(圖4-a)。
2.7.3黃瓜ERF7蛋白質(zhì)信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測分析對黃瓜ERF7蛋白進(jìn)行信號肽分析, 發(fā)現(xiàn)該蛋
白質(zhì)無信號肽,屬于非分泌型蛋白。利用軟件TMHMM 2.0對黃瓜ERF7蛋白的跨膜螺旋區(qū)進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)跨膜螺旋區(qū),表明該蛋白屬非跨膜蛋白。
2.7.4黃瓜ERF7磷酸化位點、亞細(xì)胞定位分析在黃瓜轉(zhuǎn)錄因子ERF7蛋白中,共有22個磷酸化位點,其中16個絲氨酸(S)磷酸化位點、4個酪氨酸(Y)磷酸化位點、2個蘇氨酸(T)磷酸化位點。黃瓜ERF7蛋白的亞細(xì)胞定位預(yù)測顯示,黃瓜ERF7蛋白65.2%的概率分布在線粒體中,其次分布在細(xì)胞核內(nèi),在細(xì)胞質(zhì)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中也有分布(表2);推測黃瓜ERF7轉(zhuǎn)錄因子定位于線粒體中。
2.7.5黃瓜ERF7空間結(jié)構(gòu)與親疏水性分析黃瓜ERF7蛋白二級結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示,此蛋白包括103個無規(guī)卷曲,占52.55%;71個α-螺旋,占3622%;15個延伸鏈,占7.65%;7個β-轉(zhuǎn)角,占357%(圖4-a、表3)。
采用SWISS-MODEL進(jìn)行同源建模,在11個相關(guān)蛋白模板的基礎(chǔ)上構(gòu)建出的三級結(jié)構(gòu)模型見圖4-b,其中螺旋部位代表α-螺旋,其余部位代表延伸鏈,結(jié)果與二級結(jié)構(gòu)高度一致。從圖4-b可以看出,此模型的全球性模型質(zhì)量估測結(jié)果(GMQE值)為0.18,序列相似性為53.03%,模型結(jié)果可信。
采用ProtScale分析蛋白質(zhì)親疏水性,結(jié)果發(fā)現(xiàn),CsERF7蛋白質(zhì)的疏水性最大值1.556在84位點,最小值 -3.256 在158和159位點,平均親水性(GRAVY)為-0.788(圖5)。根據(jù)GRAVY數(shù)值為負(fù)可推測黃瓜ERF7蛋白為親水性蛋白,與理化性質(zhì)分析結(jié)果一致。
2.7.6CsERF7基因同源性對比分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建將黃瓜CsERF7基因的編碼區(qū)(CDS)序列同源性相近的20個物種(表4)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建,結(jié)果(圖6)顯示,CsERF7基因編碼區(qū)序列與黃瓜XP_011659507.1在系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系上最親密,其次是甜瓜KAA0062846.1和XP_008461170.1,在同一分支下的還有南瓜、西葫蘆、冬瓜,說明它們之間的親緣關(guān)系較近;其余的赤豆、木豆等親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
3討論與結(jié)論
本研究利用前期轉(zhuǎn)錄組試驗數(shù)據(jù)庫,通過克隆成功獲得了CsERF7基因的開放閱讀框(ORF)全長,序列分析結(jié)果表明,CsERF7含有1個AP2保守結(jié)構(gòu)域,ORF全長588 bp,編碼196個氨基酸,屬于AP2/ERF家族的AP2亞家族;黃瓜ERF7有1個絲氨酸(S)磷酸化位點,推測其在ERF7蛋白功能中發(fā)揮作用;該基因與黃瓜XP_011659507.1親緣關(guān)系最近,其次是甜瓜KAA0062846.1和 XP_008461170.1。通過轉(zhuǎn)基因技術(shù),將CsERF7基因轉(zhuǎn)入擬南芥中,獲得了轉(zhuǎn)基因植株。在外源硒對鎘脅迫下黃瓜幼苗生長狀態(tài)的研究中發(fā)現(xiàn),外源硒顯著緩解了黃瓜鎘脅迫現(xiàn)象;預(yù)測黃瓜CsERF7可能與解毒、耐鎘等生物學(xué)功能相關(guān)。
目前,有關(guān)ERFs在黃瓜上的研究有AP2/ERF家族轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控黃瓜苦味基因Bi的表達(dá)[9],也有ERFs參與調(diào)控黃瓜果實貯藏冷害機制[10],調(diào)控黃瓜果實貯藏冷害及其與膜脂代謝關(guān)系的研究[14];另外, 蒙林平通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究發(fā)現(xiàn), ERFs在油菜素內(nèi)酯誘導(dǎo)黃瓜幼苗疫病的抗性方面發(fā)揮作用[15],隨后有報道稱ERFs在外源油菜素內(nèi)酯介導(dǎo)的黃瓜耐鹽性方面起調(diào)控作用[16], ERFⅦ在調(diào)控黃瓜耐澇性的分子機制方面發(fā)揮重要作用[17],但ERFs在調(diào)控黃瓜耐鎘性上鮮見報道。
本研究已完成了CsERF7基因序列和蛋白分析,CsERF7基因?qū)儆贏P2/ERF家族的AP2亞家族,ORF長度588 bp,編碼196個氨基酸,有1個AP2結(jié)構(gòu)域。該蛋白屬于非跨膜親水性蛋白,亞細(xì)胞定位預(yù)測定位于線粒體中,存在22個氨基酸磷酸化位點。其二級結(jié)構(gòu)主要由α-螺旋和延伸鏈構(gòu)成,二級結(jié)構(gòu)與三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果高度一致,同源基因進(jìn)化樹分析表明該基因與黃瓜XP_011659507.1親緣關(guān)系最近,其次是甜瓜XP_008461170.1,同時成功構(gòu)建了植物超表達(dá)載體pEGOEP35S-H-ERF7-GFP。本研究克隆得到了黃瓜CsERF7基因,成功構(gòu)建過表達(dá)載體pEGOEP35S-H-ERF7-GFP,利用農(nóng)桿菌花序法轉(zhuǎn)化擬南芥,經(jīng)PCR檢測,獲得擬南芥轉(zhuǎn)基因植株,該研究結(jié)果為該基因功能的深入研究提供了理論依據(jù)和基礎(chǔ)。
參考文獻(xiàn):
[1]Chang C Y,Yin R S,Zhang H,et al. Bioaccumulation and health risk assessment of heavy metals in the soil-rice system in a typical seleniferous area in central China[J]. Environmental Toxicology and Chemistry,2019,38(7):1577-1584.
[2]Clemens S,Aarts M G M,Thomine S,et al. Plant science:the key to preventing slow cadmium poisoning[J]. Trends in Plant Science,2013,18(2):92-99.
[3]Gu C,Guo Z H,Hao P P,et al. Multiple regulatory roles of AP2/ERF transcription factor in angiosperm[J]. Botanical Studies,2017,58(1):6.
[4]Nakano T,Suzuki K,F(xiàn)ujimura T,et al. Genome-wide analysis of the ERF gene family in Arabidopsis and rice[J]. Plant Physiology,2006,140(2):411-432.
[5]Aya K,Hobo T,Sato-Izawa K,et al. A novel AP2-type transcription factor,SMALL ORGAN SIZE1,controls organ size downstream of an auxin signaling pathway[J]. Plant and Cell Physiology,2014,55(5):897-912.
[6]Licausi F,Ohme-Takagi M,Perata P. APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF) transcription factors:mediators of stress responses and developmental programs[J]. New Phytologist,2013,199(3):639-649.
[7]Hu L F,Liu S Q. Genome-wide identification and phylogenetic analysis of the ERF gene family in cucumbers[J]. Genetics and Molecular Biology,2011,34(4):624-633.
[8]Wang C H,Xin M,Zhou X Y,et al. The novel ethylene-responsive factor CsERF025 affects the development of fruit bending in cucumber[J]. Plant Molecular Biology,2017,95(4):519-531.
[9]張慧敏,張雷,馬永碩,等. 調(diào)控黃瓜苦味基因Bi的AP2/ERF家族轉(zhuǎn)錄因子[J]. 園藝學(xué)報,2014,41(4):672-680.
[10]王曉晨. ERFs參與調(diào)控黃瓜果實貯藏冷害機制研究[D]. 廣
州:華南農(nóng)業(yè)大學(xué),2016:47-48.
[11]潘健,溫海帆,何歡樂,等. 黃瓜ERF基因家族鑒定及其在雌花芽分化中的表達(dá)分析[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2020,53(1):133-147.
[12]Sun H Y,Dai H X,Wang X Y,et al. Physiological and proteomic analysis of selenium-mediated tolerance to Cd stress in cucumber (Cucumis sativus L.)[J]. Ecotoxicology and Environmental Safety,2016,133:114-126.
[13]Sun H Y,Wang X Y,Wang Y N,et al. Alleviation of cadmium toxicity in cucumber (Cucumis sativus) seedlings by the application of selenium[J]. Spanish Journal of Agricultural Research,2016,14(4):e1105.
[14]趙普瑩. ERFs調(diào)控黃瓜果實貯藏冷害及其與膜脂代謝關(guān)系研究[D]. 廣州:華南農(nóng)業(yè)大學(xué),2018:1-3.
[15]蒙林平. 油菜素內(nèi)酯誘導(dǎo)黃瓜幼苗疫病抗性的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 廣州:華南農(nóng)業(yè)大學(xué),2018:1-2.
[16]李巧麗. 外源油菜素內(nèi)酯對黃瓜耐鹽性的調(diào)控[D]. 蘭州:西北師范大學(xué),2020:1-2.
[17]王凱旋. ERFⅦ調(diào)控黃瓜耐澇性的分子機制解析[D]. 揚州:揚州大學(xué),2021:64-66.