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基于隨機森林和梯度提升決策樹的高血壓分析預(yù)測

2023-05-14 03:08:29沈賽拉鐘鋒梁興陳思悅沈詩鈺陳璐靜
計算機時代 2023年5期
關(guān)鍵詞:隨機森林慢性病高血壓

沈賽拉 鐘鋒 梁興 陳思悅 沈詩鈺 陳璐靜

摘要: 為進行高血壓的危險因素分析與預(yù)測,提出一種基于隨機森林和梯度提升決策樹的模型。首先基于體檢報告數(shù)據(jù)進行缺失值處理、one-hot編碼、歸一化、數(shù)據(jù)初步聚類等預(yù)處理;然后針對數(shù)據(jù)樣本不均衡的特性,利用SOMTE算法進行重采樣,基于隨機森林得到特征重要性評分并進行特征選擇;最后基于排名前20的特征值,利用梯度提升決策樹算法產(chǎn)生預(yù)測模型。模型分析結(jié)果顯示了高血壓的危險性因素。經(jīng)數(shù)據(jù)集交叉驗證,模型準(zhǔn)確率可以達到84.51%,具有較高的應(yīng)用價值。

關(guān)鍵詞: 慢性病; 高血壓; 隨機森林; 梯度提升決策樹

中圖分類號:TP391? ? ? ? ? 文獻標(biāo)識碼:A? ? ? 文章編號:1006-8228(2023)05-15-05

Analyze and predict the risk factors of hypertension based on the Random

Forest and Gradient Boosting Decision Tree

Shen Saila1, Zhong Feng1, Liang Xing2, Chen Siyue1, Shen Shiyu1, Chen Lujing1

(1. Department of Computer Science and Technology, School of International Business, Zhejiang International Studies University, Hangzhou, Zhejiang 310023, China; 2. Lejian Health Technology Group Co., Ltd)

Abstract: To analyze and predict the risk factors of hypertension, a model based on the Random Forest and Gradient Boosting Decision Tree is proposed. Firstly, the missing value handling, one-hot encoding, data normalization and data cluster methods are applied for data preprocessing based on the medical examination report data. Then, the SOMTE resampling algorithm is used to solve the imbalanced class problem, and the feature evaluation and selection are realized through the Random Forest. Finally, the prediction model is training by the Gradient Boosting Decision Tree based on the top 20 features. The analysis result shows the risk factors of hypertension. The accuracy of the model can reach 84.51% by the cross validation of the dataset. It has a good value in application field.

Key words: chronic disease; hypertension; Random Forest; Gradient Boosting Decision Tree

0 引言

健康是人類最普遍最根本的需求,人民健康是民族昌盛和國家富強的重要標(biāo)志[1]。據(jù)國家衛(wèi)健委發(fā)布的《中國居民營養(yǎng)與慢性病狀況報告(2020)》,2019年我國因慢性病導(dǎo)致的死亡占總死亡的88.5%,其中,心腦血管病、癌癥、慢性呼吸系統(tǒng)疾病死亡比例為80.7%。高血壓、糖尿病、慢性阻塞性肺疾病患病率和癌癥發(fā)病率與2015年相比有所上升[2]。

高血壓是常見且容易被忽略的慢性疾病,長期罹患高血壓易導(dǎo)致視網(wǎng)膜、腎臟、心臟及腦部血管的并發(fā)癥,尤其對心臟與腦部血管的影響最常見[3]。通過對高血壓慢性病相關(guān)因素分析,可以發(fā)現(xiàn)并排查其他體檢指標(biāo)與高血壓患者高度相似但血壓測量正常的體檢者,這部分人可能也具有高血壓潛在風(fēng)險,對其預(yù)測具有重要意義。

1 樣本數(shù)據(jù)預(yù)處理及初步分析

1.1 樣本數(shù)據(jù)預(yù)處理

首先對樣本數(shù)據(jù)進行預(yù)處理[4]。

⑴ 刪除缺失值過多數(shù)據(jù)和無效數(shù)據(jù),主要是收縮壓或者舒張壓有缺失值的數(shù)據(jù)。

⑵ 將數(shù)據(jù)隨機打亂。由于數(shù)據(jù)是按時間排序的,數(shù)據(jù)打亂后分出的訓(xùn)練集和測試集更有代表性。

⑶ 缺失值填充。缺失字段采用眾數(shù)填充的方法補充缺失值。

⑷ 如果數(shù)據(jù)特征值類型個數(shù)少于等于6個,轉(zhuǎn)換為one-hot編碼;如果數(shù)據(jù)特征值類型個數(shù)大于6個, 轉(zhuǎn)換為小數(shù)類型。one-hot編碼可以有效解決分類器不好處理屬性數(shù)據(jù)的問題,在一定程度上也起到了擴充特征的作用。它的值只有0和1,不同的類型存儲在垂直的空間。

⑸ 歸一化處理。有利于提高數(shù)據(jù)精度,讓各個特征對結(jié)果的做出的貢獻相同。

1.2 樣本數(shù)據(jù)初步分析

本項目采用脫敏體檢報告數(shù)據(jù)共計57427條,除去無效數(shù)據(jù)10689條(收縮壓或舒張壓數(shù)據(jù)有缺失),有效數(shù)據(jù)共計46738條。經(jīng)過初步分析,有高血的數(shù)據(jù)樣本為7492,占比16.03%,正負(fù)樣本比例1:5.24,屬于不均衡數(shù)據(jù)。對高血壓樣本進行進一步分析,Ⅰ級高血壓和單純性收縮期高血壓占了正樣本絕大部分,比例為77.33%,具體數(shù)據(jù)如表1所示。

根據(jù)樣本特征預(yù)測樣本類型,通過嘗試聚類進行初步探索分析[5],驗證高血壓的傳統(tǒng)分類是否具有可行性。我們使用樣本數(shù)據(jù)中除血壓(收縮壓)、血壓(舒張壓)外的體檢項目指標(biāo)對樣本進行聚類分析,嘗試聚為2-4類,并觀察類別的血壓分布,結(jié)果如圖1所示。

結(jié)果發(fā)現(xiàn),k=3時聚類效果較好,兩條分類界線大致為140/90的傳統(tǒng)分界線和數(shù)據(jù)分布主軸(主軸兩側(cè)是高脈壓差和低脈壓差)。結(jié)合醫(yī)學(xué)背景知識,根據(jù)收縮壓-舒張壓=50將高血壓細分為高脈壓差高血壓和低脈壓差高血壓,得到最終的因變量表2。

2 高血壓慢病體檢指標(biāo)相關(guān)性與預(yù)測

2.1 研究框架

根據(jù)研究兩種模型的特性,隨機森林魯棒性好,但上限低;梯度提升決策樹對訓(xùn)練集較敏感,但上限高。本案例將數(shù)據(jù)做預(yù)處理后用隨機森林進行特征評價,再次做預(yù)處理后用梯度提升決策樹進行分類。算法流程圖如圖2所示。

⑴ 采集體檢報告數(shù)據(jù),每個樣本包含脫敏體檢人信息7個和體檢項目信息1209個(即體檢項目總數(shù))。根據(jù)血壓(收縮壓)、血壓(舒張壓)兩個項目給樣本做分類,刪去這兩個項目,其余信息稱為特征。

⑵ 刪除無效數(shù)據(jù)記錄和缺失值過多的特征,對缺失值進行眾數(shù)填充,特征值進行轉(zhuǎn)換和歸一化處理。共得到有效數(shù)據(jù)46738條,每條數(shù)據(jù)具有有效特征數(shù)目128個。

⑶ 對樣本進行初步聚類分析,結(jié)合高血壓慢性病自身分類規(guī)則,對樣本進行初步三分類。

⑷ 針對數(shù)據(jù)正負(fù)樣本比為1:5.24的特點,文章在樣本的采樣上選擇SMOT過采樣技術(shù)進行處理。

⑸ 利用隨機森林算法產(chǎn)生預(yù)測模型,同時得到特征重要性評分打分。根據(jù)特征值分值權(quán)重,我們選取前20個作為正式模型訓(xùn)練特征。

⑹ 采用梯度提升決策樹算法正式產(chǎn)生預(yù)測模型,結(jié)果為樣本屬于高血壓類別的概率。

2.2 不均衡數(shù)據(jù)采樣處理

大多數(shù)機器學(xué)習(xí)算法在模型的學(xué)習(xí)過程中要求正負(fù)樣本數(shù)據(jù)比例相當(dāng),模型可以學(xué)習(xí)正負(fù)樣本數(shù)據(jù)所有特性,才具有較為良好的效果。而實際數(shù)據(jù)往往分布得很不均勻,例如本文樣本數(shù)據(jù)二分類正負(fù)樣本比例為1:5.24,三分類樣本比例為10.86:3.22:85.92。數(shù)據(jù)的不均衡給模型的學(xué)習(xí)帶來了困難。

本文采用SMOTE過采樣技術(shù)進行數(shù)據(jù)采樣,它是基于隨機過采樣算法的一種改進方案。傳統(tǒng)的隨機過采樣采取簡單復(fù)制樣本的策略來增加少數(shù)類樣本,這樣容易產(chǎn)生模型過擬合的問題。SMOTE算法基本思想如下。

⑴ 對于少數(shù)類中每一個樣本X,以歐氏距離為標(biāo)準(zhǔn)計算它到少數(shù)類樣本集中所有樣本的距離,得到其k近鄰。

⑵ 根據(jù)樣本不平衡比例設(shè)置一個采樣比例以確定采樣倍率N,對于每一個少數(shù)類樣本X,從其k近鄰中隨機選擇若干個樣本,假設(shè)選擇的近鄰為Xn。

⑶ 對于每一個隨機選出的近鄰Xn,分別與原樣本按照如下的公式⑴構(gòu)建新的樣本。

[Xnew=X+rand(0,1)?X-Xn]? ⑴

2.3 基于隨機森林的相關(guān)性與分析

隨機森林模型(Random Forest)是一種高度靈活的基于Bagging的集成學(xué)習(xí)模型機器學(xué)習(xí)算法,它可以同時生成多個預(yù)測模型,并匯總模型的結(jié)果以提升分類準(zhǔn)確率,結(jié)構(gòu)見圖3[6]。

隨機森林集成了Bagging和隨機選擇特征分裂等方法的特點,基本克服了過擬合問題,能根據(jù)特征的重要性進行特征選擇,且算法效率較高,被廣泛應(yīng)用在各種分類和回歸問題之中。Bagging是早期組合樹方法之一,又稱自助聚集(bootstrap aggregating),是一種從訓(xùn)練集中隨機抽取部分樣本(不一定有放回抽樣)來生成決策樹的方法。

Bagging回歸算法流程為:

⑴ 以相同概率從訓(xùn)練集中隨機有放回地抽出m個子訓(xùn)練集;

⑵ 對每個子訓(xùn)練集分別訓(xùn)練,產(chǎn)生m個基模型;

⑶ 取各基模型的平均值作為最終結(jié)果。

隨機森林包含了多個由Bagging訓(xùn)練思想得到的決策樹,在輸入待訓(xùn)練樣本后,各個子決策樹結(jié)果的均值就是模型的最終結(jié)果。建立隨機森林的步驟為:

① 對樣本集T進行N次抽樣,形成新的樣本集;

② 隨機選取特征,形成特征子集;

③ 在新樣本集和特征子集上,找到最佳分割屬性,建立決策樹;

④ 重復(fù)①、②、③步驟m次,構(gòu)建m棵決策樹;

⑤ 組合m棵決策樹的結(jié)果,建立隨機森林模型。

2.4 基于梯度提升決策樹的預(yù)測模型

梯度提升決策樹(Gradient Boosted Decision Tree,GBDT)是由Friedman等提出的一種經(jīng)典的機器學(xué)習(xí)方法,屬于boosting系列算法中的一個代表算法,是一種迭代的決策樹算法,所有樹的結(jié)論累加起來作為最終答案[7~8]。GBDT設(shè)計的目的是求解損失函數(shù)的優(yōu)化,具體思路為對損失函數(shù)求梯度,以負(fù)梯度的方向代入模型的當(dāng)前值,以當(dāng)前值作為殘差值的近似。它采用了加法模型,通過向著減小殘差的方向收斂得到將輸入數(shù)據(jù)分類或回歸的模型。

GBDT的經(jīng)多次迭代后收斂,每輪訓(xùn)練多個分類器,每個分類器基于上一次迭代得到的殘差基礎(chǔ)上進行訓(xùn)練。作為集成學(xué)習(xí)方法的一種,GBDT的基分類器屬于弱分類器,要結(jié)構(gòu)簡單且滿足低方差、高偏差的條件,這與GBDT的損失函數(shù)是基于降低偏差有關(guān)。通常來說,GBDT通常以CART TREE 作為基分類器,且每棵CART TREE的深度相對較低以保證基分類器的復(fù)雜度不會過高。最終將每輪訓(xùn)練得到的基分類器加權(quán)求和,得到總的分類器。GBDT訓(xùn)練過程如圖4所示。

3 實驗及結(jié)果

3.1 隨機森林相關(guān)性指標(biāo)分析

文章針對樣本進行隨機采樣、欠采樣、過采樣和SMOTE欠采樣與過采樣結(jié)合四種方式進行數(shù)據(jù)集采樣,然后使用隨機森林模型對樣本進行初步訓(xùn)練。

針對不同采樣方式的實驗結(jié)果顯示:

⑴ 隨機森林決策樹數(shù)目(n_estimators)為50,最大深度(max_depth)為35,三樣本類比重為1.5、1.5、1,用于擬合和預(yù)測的并行運行的工作數(shù)量(n_job)為3,模型初步訓(xùn)練結(jié)果最優(yōu)。

⑵ 由于正樣本比例過小,基于Smote_Tomek的過采樣與欠采樣結(jié)合的采樣方式綜合效果最佳。

根據(jù)隨機森林訓(xùn)練模型對特征項打分結(jié)果,我們選取前20項為高血壓相關(guān)重要指標(biāo),如圖5所示。年齡權(quán)重非常大,體重指數(shù)、甘油三酯、谷草轉(zhuǎn)氨酶、谷酰轉(zhuǎn)氨酶、體重、谷丙轉(zhuǎn)氨酶、堿性磷酸酶、葡萄糖等8項指標(biāo)權(quán)重較大。

3.2 基于梯度提升決策樹的模型預(yù)測

⑴ k折交叉驗證

為了避免訓(xùn)練過擬合,文章采用k折交叉驗證[9]。嘗試?yán)貌煌挠?xùn)練集/測試集劃分來對模型做多組不同的訓(xùn)練/測試,來應(yīng)對單詞測試結(jié)果過于片面以及訓(xùn)練數(shù)據(jù)不足的問題。鑒于高血壓異常樣本較少的情況,文章將兩個高血壓類型合并,與“正常類型比較”。

圖6為k值取值不同,算法正確率(Accuracy)、查全率(Recall)、查準(zhǔn)率(Precision)指標(biāo)曲線。K值取25,正確率為84.51%,查全率39.41%,查準(zhǔn)率40.05%。采用隨機森林進行特征向量選取后,基于梯度提升決策樹進行預(yù)測,正確率相比隨機森林算法提升0.44%,查全率下降0.49%,查準(zhǔn)率提升0.74%。

采用k=25折進行計算,對基于隨機森林和梯度決策樹的最終算法進行測試,繪制ROC曲線并計算AUC面積[10]。我們看到,ROC曲線均在對稱軸之上,有較好的預(yù)測效果,AUC面積為0.86,模型效果較好。

4 結(jié)束語

本文基于體檢報告數(shù)據(jù),針對高血壓風(fēng)險進行分析與預(yù)測,提出首先利用隨機森林進行特征選取,再基于梯度提升決策樹進行預(yù)測的方法,最后利用K折交叉驗證進行優(yōu)化。

通過算法實驗,我們得到以下結(jié)果:①K值取25時候的交叉驗證,算法正確率為84.51%,查全率為39.41%,查準(zhǔn)率為40.05%,為最優(yōu)結(jié)果。此時,ROC曲線均在對稱軸之上,有較好的預(yù)測效果,AUC面積為0.86,模型效果較好。②樣本數(shù)據(jù)如果2分類正負(fù)樣本比例為1:5.24為不均衡數(shù)據(jù),雖然采用過采樣欠采樣結(jié)合進行取樣后查準(zhǔn)率和查全率有所提升,但是整體效果依然有限。

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