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擬南芥CARK5激酶響應(yīng)脫落酸信號(hào)的研究

2023-04-29 03:39:00李柯萱李小意王若琳楊毅
關(guān)鍵詞:株系擬南芥激酶

李柯萱 李小意 王若琳 楊毅

為了研究擬南芥脫落酸(Abscisic acid,ABA)受體的翻譯后修飾,本研究以能夠磷酸化ABA受體的激酶CARK5作為研究對(duì)象,通過構(gòu)建了轉(zhuǎn)基因株系來檢測(cè)CARK5在ABA信號(hào)途徑中的功能.結(jié)果顯示: CARK5能夠促進(jìn)ABA介導(dǎo)的抑制種子萌發(fā)、幼苗的形態(tài)建成以及主根的生長(zhǎng),但是過表達(dá)激酶失活型CARK5m(CARK5N250A)則跟突變體cark5表型類似.擬南芥中過表達(dá)CARK5增強(qiáng)植株抗旱性;ABA處理后,ABA響應(yīng)標(biāo)記基因RAB18表達(dá)量增加.這些結(jié)果說明,CARK5通過可以磷酸化ABA受體,正調(diào)控ABA信號(hào)通路.

CARK5; 磷酸化; 脫落酸; 干旱脅迫

Q495A2023.036001

收稿日期: 2022-05-26

基金項(xiàng)目: 四川省國(guó)家自然科學(xué)基金(2022NSFSC0162)

作者簡(jiǎn)介: 李柯萱(1997-), 女, 四川自貢人, 碩士研究生, 研究方向?yàn)橹参镞z傳學(xué). E-mail: likexuan1312@163.com

通訊作者: 楊毅. E-mail: yangyi528@scu.edu.cn

Response of CARK5 kinase to ABA signaling in Arabidopsis

LI Ke-Xuan, LI Xiao-Yi, WANG Ruo-Lin, YANG Yi

(Key Laboratory of Bio-Resources and Eco-Environment of Ministry of Education,? College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu 610065, China)

In order to explore the post-translational modification of Arabidopsis abscisic acid (ABA) receptor, this study constructed overexpressing CARK5 and kinase-dead CARK5m (CARK5N250A) in the wild type and T-DNA mutant cark5 plants by genetic and physiological assays, to analyze the functions of CARK5 in ABA signaling. The results showed that CARK5 can promote ABA-mediated inhibition of seed germination, seedling cotyledon and primary root elongation, but the overexpression kinase-inactive CARK5m (CARK5N250A) has a similar phenotype to the mutant cark5. In addition, overexpressing CARK5 enhanced plant drought resistance and ABA-marked gene RAB18 expression. Taken together, these data suggest that CARK5 positively regulates the ABA signaling pathway by phosphorylation of ABA receptors.

CARK5; Phosphorylation; Abscisic acid; Drought stress

1 引 言

植物能夠通過捕捉環(huán)境信號(hào),然后激活植物激素介導(dǎo)的多種內(nèi)源途徑,進(jìn)而影響植物從種子成熟、種子萌發(fā)到開花結(jié)果以及響應(yīng)生物或者非生物脅迫等各種生命活動(dòng)[1,2].其中脫落酸(Abscisicacid,ABA)是一種由類胡蘿卜素裂解而成的重要植物激素[3],在植物中具有多種生理功能.ABA通過調(diào)控種子的休眠和萌發(fā)以及氣孔的開度等生理活動(dòng),來應(yīng)對(duì)干旱、高溫、高鹽等環(huán)境脅迫[4].擬南芥響應(yīng)ABA信號(hào)通路的過程是:首先ABA受體PYR1/PYLs/RCARs(Regulatory Components of ABA Receptors/Pyrabactin Resistance/PYR like)感知ABA后,能夠抑制磷酸酶PP2C活性,激活激酶SnRK2s,使其磷酸化ABA信號(hào)通路的下游信號(hào)分子,最終響應(yīng)ABA信號(hào).ABA受體作為ABA信號(hào)通路中的核心成員[5-7],在擬南芥中總共有14個(gè)成員[8].在14個(gè)成員中除了PYL13以外,其余13個(gè)都被證實(shí)能夠結(jié)合ABA.

自從ABA受體被發(fā)現(xiàn)以來,研究者也一直在研究其翻譯后修飾,其中ABA受體的磷酸化修飾在ABA信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中具有重要作用[9].本實(shí)驗(yàn)室前期研究篩選出能夠結(jié)合并使部分RCARs磷酸化的ABA受體激酶(Cytosolic? ABA Receptor? Kinase,CARK),該家族一共有11個(gè)成員,它們的激活環(huán)中都具有保守的天冬氨酰(N).其中CARK1屬于擬南芥絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶RLCKⅧ亞家族,研究發(fā)現(xiàn)CARK1能夠通過結(jié)合并磷酸化RCAR3和RCAR11-14從而抑制PP2C活性,促進(jìn)ABA信號(hào)通路[10,11].除此之外,CARK3以ABA依賴的方式轉(zhuǎn)錄干擾果膠甲酯酶抑制物(PMEL)的轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而調(diào)節(jié)擬南芥的花粉育性[12].最近的研究也表明,CARK2、CARK4、CARK5、CARK7和CARK11磷酸化二聚化受體后,從而解聚,增強(qiáng)ABA結(jié)合能力[13].由于CARKs在植物的生長(zhǎng)發(fā)育以及抗逆性中的作用既存在冗余又可能有差異,所以有必要對(duì)每個(gè)成員在ABA信號(hào)途徑中的功能進(jìn)行分析.因此,本研究選取能夠與RCARs相互作用的CARK5進(jìn)行分析,探究其響應(yīng)ABA信號(hào)的表型和ABA下游基因的轉(zhuǎn)錄水平.

2 材料與方法

2.1 材 料

T-DNA插入突變的擬南芥種子cark5(SALK_136404)購(gòu)買自網(wǎng)站擬南芥生物資源中心ABRC(http://www.arabidopsis.org/).野生型擬南芥(Arabidopsis thalian)為哥倫比亞野生型(Col-0).擬南芥先播種在MS固體培養(yǎng)基(MS粉末加上2%蔗糖和0.8%的瓊脂粉)上培養(yǎng)5~7 d,等到開始長(zhǎng)出真葉時(shí)再移栽到配置的營(yíng)養(yǎng)土(蛭石∶營(yíng)養(yǎng)土=1∶3混勻,并進(jìn)行121 ℃高壓滅菌20 min后冷卻至室溫).

2.2 實(shí)驗(yàn)方法

2.2.1 擬南芥過表達(dá)和回補(bǔ)株系構(gòu)建 將目的基因構(gòu)建到pBI121載體中,回補(bǔ)株系用pZH01載體.構(gòu)建成功的載體轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α,進(jìn)行菌落PCR和測(cè)序檢測(cè),確定構(gòu)建成功后將DH5α進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)并提取質(zhì)粒轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101中.采用花絮侵染法[14]得到帶有卡那抗性(回補(bǔ)株系為利福平抗性)的T0代種子,再利用含抗性的MS平板進(jìn)行篩選出能夠長(zhǎng)出真葉的陽性株系,然后在土壤中培養(yǎng)傳代,利用孟德爾遺傳定律檢驗(yàn)得到T2代株系.T2代種子再播種于相應(yīng)抗性的MS平板上,驗(yàn)證純合株系.T3代種子用于表現(xiàn)分析.

2.2.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR) 將待測(cè)組織用液氮速凍后研磨,每50~100 mg組織用1 mL Trizol試劑對(duì)組織進(jìn)行裂解,加入氯仿后在冰上沉淀10 min,使核蛋白復(fù)合物解離,再用異丙醇沉淀回收總 RNA.得到的總RNA后根據(jù)Takara反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書將RNA反轉(zhuǎn)成cDNA,最后根據(jù)Takara熒光定量PCR酶使用說明書配制qRT-PCR反應(yīng)體系,體系及程序如表1所示,同時(shí)保證每個(gè)樣本技術(shù)重復(fù)三次,生物學(xué)重復(fù)三次.

2.2.3 ABA處理下種子萌發(fā)率統(tǒng)計(jì) 將每個(gè)株系約100顆種子春化3 d后消毒播種于含終濃度分別為0、0.3、1.0、3.0和10.0 μmol/L ABA的MS培養(yǎng)基中,置于溫室中培養(yǎng),持續(xù)1 w,每天數(shù)萌發(fā)率.萌發(fā)率=萌發(fā)的種子數(shù)/種子的總數(shù).

2.2.4 ABA處理下幼苗形態(tài)建成實(shí)驗(yàn)分析 每個(gè)株系播種約50顆種子于終濃度為0和0.3? μmol/L ABA的MS平板上,7 d后觀察它們子葉變綠情況,計(jì)算子葉變綠的比率.

2.2.5 ABA處理下根長(zhǎng)實(shí)驗(yàn)分析 每個(gè)株系擬南芥種子播種于MS平板,豎置生長(zhǎng)2~3 d后選擇長(zhǎng)度長(zhǎng)勢(shì)相似的植株移植到1/2MS平板中,且加入30 μmol/L ABA.觀察它們主根伸長(zhǎng)情況,7~8 d后拍照用imageJ軟件測(cè)量主根長(zhǎng)度.

2.2.6 幼苗干旱及復(fù)水處理 將擬南芥種子春化后直接播種到土里,每個(gè)株系至少3盆,每?jī)商鞚惨淮嗡WC植物正常生長(zhǎng),生長(zhǎng)兩周后,停止?jié)菜?,干?3 d后拍照記錄,再進(jìn)行復(fù)水處理,連續(xù)澆水直到土壤吸水飽和,兩天后觀察植株存活率.

3 結(jié) 果

3.1 qRT-PCR鑒定CARK5轉(zhuǎn)基因株系

前期已經(jīng)從購(gòu)買的種子中鑒定出cark5突變株系,然后構(gòu)建并篩選出了CARK5過表達(dá)株系OE-CARK5 #5和OE-CARK5 #31,并進(jìn)行了qRT-PCR實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證.qRT-PCR結(jié)果顯示cark5突變株系的CARK5基因表達(dá)水平幾乎未檢測(cè)到,說明該突變體為敲除突變體,用于后續(xù)分析;兩種過表達(dá)株系的CARK5表達(dá)量相比野生型都增加5倍以上(圖 1).另外為了更好地驗(yàn)證CARK5基因的功能,本實(shí)驗(yàn)還構(gòu)建了cark5突變株的背景下回補(bǔ)CARK5激酶位點(diǎn)突變的株系com-CARK5m #1和com-CARK5m #9,如qRT-PCR結(jié)果所示,CARK5 mRNA轉(zhuǎn)錄水平相對(duì)于野生型也有顯著提高(圖 1).

3.2 ABA對(duì)CARK5轉(zhuǎn)基因株系種子萌發(fā)和幼苗形態(tài)建成的影響

因?yàn)橐延械难芯勘砻鰿ARK5能夠與ABA受體相互作用,所以本研究想探討它在擬南芥中是否調(diào)控ABA介導(dǎo)的種子萌發(fā)和幼苗形態(tài)建成等生物學(xué)功能.首先進(jìn)行了種子萌發(fā)實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示:不添加外源ABA的情況下,以及0.3 μmol/L低濃度ABA處理時(shí),CARK5轉(zhuǎn)基因株系種子的萌發(fā)率都沒有明顯區(qū)別; 1.0 μmol/L ABA時(shí),WT、cark5、OE-CARK5 #5、OE-CARK5 #31、com-CARK5m #1和com-CARK5m #9的萌發(fā)率分別為:40%、75%、35%、40%、54%和60%;當(dāng)ABA濃度升高到3 μmol/L時(shí),OE-CARK5 #5和OE-CARK5 #31種子幾乎不萌發(fā),而cark5、com-CARK5m #1和com-CARK5m #9沒有顯著差異.因此,擬南芥中CARK5缺失之后,與野生型相比,對(duì)ABA的敏感程度降低,而過表達(dá)CARK5會(huì)增加植株對(duì)ABA的敏感程度.并且回補(bǔ)CARK5激酶活性位點(diǎn)突變的CARK5m到cark5株系后,com-CARK5m #1和com-CARK5m #9株系萌發(fā)率顯著高于野生型,而與cark5沒有顯著差異,都表現(xiàn)出對(duì)ABA不敏感(圖2a).

雖然在0.3 μmol/L ABA處理下,CARK5轉(zhuǎn)基因植株的種子萌發(fā)率沒有明顯區(qū)別(圖2a),但是繼續(xù)培養(yǎng)10天后, WT、cark5、OE-CARK5 #5、OE-CARK5 #31、com-CARK5m #1和com-CARK5m #9的子葉綠化率比率分別為:8%、100%、20%、12%、94%和95%.com-CARK5m與cark5相似且都表現(xiàn)為ABA的不敏感,幼苗子葉變綠程度極高.而過表達(dá)株系與野生型都表現(xiàn)出了ABA抑制子葉變綠(圖2b).綜上結(jié)果表明CARK5在ABA介導(dǎo)的抑制種子萌發(fā)和子葉變綠中起正調(diào)控作用.

3.3 CARK5在ABA處理下對(duì)根長(zhǎng)伸長(zhǎng)的影響

對(duì)CARK5轉(zhuǎn)基因株系在ABA介導(dǎo)下根伸長(zhǎng)情況進(jìn)行實(shí)驗(yàn)分析.將MS培養(yǎng)基培養(yǎng)3 d的幼苗轉(zhuǎn)移到不含ABA和含30 μmol/L ABA的1/2MS培養(yǎng)基中,繼續(xù)培養(yǎng)7 d后,結(jié)果如圖 3所示,在正常情況下,各株系的根長(zhǎng)幾乎一致;而ABA處理之后,WT、cark5、OE-CARK5 #5、OE-CARK5 #31、com-CARK5m #1和com-CARK5m #9跟對(duì)照組的比較,根長(zhǎng)分別抑制了45.8%、55.1%、31.7%、29.1%、67.4%和47.1%.過表達(dá)株系較于野生型株系對(duì)ABA敏感,突變體的主根伸長(zhǎng)對(duì)ABA處理較不敏感,而回補(bǔ)激酶失活型CARK5,不能回補(bǔ)到野生型的表型.這些結(jié)果說明CARK5同樣依賴其激酶活性來影響ABA對(duì)根長(zhǎng)的抑制作用.

3.4 CARK5轉(zhuǎn)基因株系對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)

對(duì)2周大小的WT、cark5、OE- CARK5 #5、OE-CARK5 #31、com-CARK5m#1和com-CARK5m #9幼苗進(jìn)行13 d的干旱處理,結(jié)果發(fā)現(xiàn):干旱13 d的時(shí)候,WT、cark5和com-CARK5m #1和com-CARK5m #9就已經(jīng)萎蔫了;相對(duì)而言,OE-CARK5 #5和OE-CARK5 #31脫水程度更低.復(fù)水2 d后發(fā)現(xiàn),WT大部分幼苗恢復(fù);而cark5、com-CARK5m #1和com-CARK5m #9的所有植株都因?yàn)槊撍滤溃欢鳲E-CARK5的兩個(gè)株系都全部恢復(fù).如圖所示(圖4),所有株系在干旱處理前的長(zhǎng)勢(shì)是一致的,因此可以得出OE-CARK5最耐旱,從而可以推斷CARK5在植物應(yīng)對(duì)干旱脅迫中起正調(diào)控作用.

3.5 ABA處理CARK5轉(zhuǎn)基因株系后調(diào)控下游基因的轉(zhuǎn)錄水平

CARK5與ABA受體能夠相互作用,因此本研究檢測(cè)了ABA信號(hào)通路中的標(biāo)記基因RAB18來判斷它是否會(huì)響應(yīng)ABA信號(hào)通路.用50 μmol/L ABA處理10 d大小的WT、cark5、com-CARK5m #1、com-CARK5m #9、OE-CARK 5 #31.3 h后收樣,提取RNA,然后做qRT-PCR,檢測(cè)ABA信號(hào)響應(yīng)標(biāo)記基因RAB18的相對(duì)表達(dá)量.如結(jié)果所示(圖5),ABA處理后RAB18的表達(dá)量相對(duì)于處理前都有顯著升高,其中在OE-CARK5#31中的表達(dá)量最高,在WT中次之,在cark5、com-CARK5m #1和com-CARK5m #9株系中最低,并且處理后它們都與野生型存在顯著性差異.因此,CARK5能促進(jìn)ABA下游響應(yīng)基因的表達(dá),相反,CARK5m不能激活A(yù)BA信號(hào)通路.

4 討 論

ABA受體的磷酸化是一種由不同的激酶引起的翻譯后修飾.例如,TOR磷酸化ABA受體PYL4(RCAR10),終止ABA信號(hào)來平衡植物的生長(zhǎng)和抗逆性[15].AEL酪蛋白激酶通過磷酸化136和182的絲氨酸來破壞ABA受體PYL1(RCAR12)的穩(wěn)定性,進(jìn)而抑制植物對(duì)ABA的響應(yīng),導(dǎo)致擬南芥應(yīng)對(duì)干旱脅迫的能力減弱[16].而本實(shí)驗(yàn)室前期研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn),CARK1磷酸化RCAR3、RCAR11抑制了PP2C活性,正向調(diào)節(jié)ABA信號(hào),所以過表達(dá)CARK1能夠顯著提高擬南芥的抗旱性[11]. 已有研究表明CARKs偏好于與ABA受體亞家族III的成員相互作用,在ABA信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中起冗余作用.有趣的是,CARK1、CARK4和CARK5與RCAR3相互作用,而CARK2、CARK7和CARK11不能[13].這種差異可能是因?yàn)镃ARK基因是從共同的祖先基因復(fù)制而來的,并且在植物多樣化的過程中發(fā)生功能分化[17]. 例如,蛋白激酶AEL磷酸化ABA受體,從而降低其穩(wěn)定性,抑制ABA信號(hào)通路.說明不同的激酶與ABA受體存在相互作用,并且能夠磷酸化ABA受體家族不同的基因以及不同的位點(diǎn),發(fā)生不同的ABA響應(yīng).CARK5與ABA受體RCAR3、RCAR11、RCAR12、RCAR13和RCAR14有相互作用,并且能磷酸化RCAR11、RCAR12、RCAR13和RCAR14[13].但是CARK5在植物生長(zhǎng)發(fā)育中具體表型還不明確,所以本研究在CARK5已有的分子研究基礎(chǔ)上,構(gòu)建CARK5相關(guān)轉(zhuǎn)基因株系,進(jìn)一步探討CARK5對(duì)幼苗響應(yīng)ABA在種子萌發(fā)和形態(tài)建成上的影響、成苗響應(yīng)干旱的影響以及對(duì)下游基因表達(dá)的影響.

對(duì)CARK5的轉(zhuǎn)基因株系的功能進(jìn)行分析表明:CARK5能抑制種子的萌發(fā)、幼苗的形態(tài)建成以及主根的生長(zhǎng).磷酸激酶活性位點(diǎn)突變的com-CARK5m株系雖然mRNA的表達(dá)量仍然較高,但是卻影響了CARK5的功能,再次說明CARK5通過磷酸化ABA受體來發(fā)揮作用,進(jìn)而影響擬南芥生長(zhǎng)發(fā)育.那么CARK5是如何與特定的ABA受體作用的呢?前面提到CARK5和CARK1一樣都能夠與RCAR3相互作用,已有研究表明CARK1磷酸化ABA受體后,改變了它們的結(jié)構(gòu),可能使它們更容易與ABA結(jié)合,特別是單體的狀態(tài)的RCARs,例如RCAR3;同時(shí)也可能導(dǎo)致本來是同源二聚體態(tài)的RCARs成為單體,從而暴露了結(jié)合PP2Cs的loop[18],所以CARK5很可能與CARK1有同樣的作用機(jī)制,是否存在差異還需要進(jìn)一步研究.

為了研究CARK5在非生物脅迫中的功能,對(duì)CARK5相關(guān)轉(zhuǎn)基因株系進(jìn)行干旱處理,結(jié)果表明它們?cè)谡{(diào)節(jié)干旱脅迫中起正調(diào)控的作用.并且過表達(dá)CARK5能夠使ABA誘導(dǎo)表達(dá)的下游標(biāo)記基因RAB18顯著升高,說明CARK5磷酸化ABA受體后,提高RAB18轉(zhuǎn)錄水平,從而促進(jìn)ABA信號(hào)通路,進(jìn)而提高植物耐旱性.但CARK5是如何受ABA調(diào)控來影響ABA受體RCARs的磷酸化還需要繼續(xù)研究.因此需要進(jìn)一步研究ABA是否誘導(dǎo)了CARKs的表達(dá),使RCARs被磷酸化的比例增加或者結(jié)構(gòu)改變,從而促進(jìn)ABA信號(hào)通路,或者是RCARs被磷酸化后,進(jìn)一步引起ABA信號(hào)通路中其它蛋白結(jié)構(gòu)的改變進(jìn)而影響ABA響應(yīng),所以還需要進(jìn)行更多實(shí)驗(yàn)來進(jìn)行驗(yàn)證.CARK5在ABA信號(hào)途徑中功能的分析,有助于理解植物抗逆機(jī)理.

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引用本文格式:

中 文:? 李柯萱, 李小意, 王若琳, 等. 擬南芥CARK5激酶響應(yīng)脫落酸信號(hào)的研究[J]. 四川大學(xué)學(xué)報(bào):? 自然科學(xué)版, 2023, 60:? 036001.

英 文:? Li K X, Li X Y, Wang R L, et al. Response of CARK5 kinase to ABA signaling in Arabidopsis [J]. J Sichuan Univ:? Nat Sci Ed, 2023, 60:? 036001.

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浙江柑橘(2016年1期)2016-03-11 20:12:31
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