雷學俊,張霞,劉芳,趙東,2,喬宗偉,2,羅青春,王曉妹,劉多濤,鄭佳,2
(1.宜賓五糧液股份有限公司,四川宜賓 644000;2.中國輕工業(yè)濃香型白酒固態(tài)發(fā)酵重點實驗室,四川宜賓 644000)
濃香型白酒占我國白酒年總產(chǎn)量的70 %以上,因入口甜、落口綿、窖香濃郁、綿柔甘洌、香味協(xié)調(diào)、尾凈余長等特點,廣受消費者的喜愛[1-2]。窖泥作為濃香型白酒釀造過程中厭氧微生物的發(fā)酵載體,是賦予濃香型白酒主體香、窖香等復(fù)雜風味的主要來源[3]。在長期不間斷的生產(chǎn)過程中,窖泥微生物菌群也在不斷的發(fā)生演替變化,逐漸形成了以乳桿菌屬(Lactobacillus)、己酸菌屬(Caproiciproducens)、梭菌屬(Clostridium)、互營單胞菌屬(Syntrophomonas)、沉積菌屬(Sedimentibacter)和甲烷桿菌屬(Methanobacterium)等為優(yōu)勢微生物屬[4-5],宜賓產(chǎn)區(qū)優(yōu)勢微生物為沉積菌屬(Sedimentbacter)、Sporanaerobacter和Tissierella[6-7]等。不同種類優(yōu)勢微生物各司其職,又相互影響,例如,Lactobacillus相對豐度6.45 %~55.79 %[8-9],能夠利用葡萄糖產(chǎn)生氫氣、二氧化碳和乙酸等[10];Caproiciproducens相對豐度隨著窖齡的增加而升高,約為40.40 %[11-12],能利用葡萄糖、乳糖等產(chǎn)生乙酸、CO2和H2[13];Sedimentibacter相對豐度為1.14 %[9],具有降解氨基酸的作用[14];Clostridium與Caproiciproducens在厭氧及有關(guān)酶的作用下,代謝產(chǎn)生己酸和氫氣[4],與產(chǎn)甲烷菌之間通過種間氫轉(zhuǎn)移過程,消耗氫氣,促進己酸的合成[15]。
近年來,運用高通量測序技術(shù)和統(tǒng)計學方法等研究窖泥微生物群落與理化指標之間的關(guān)系越來越多。研究發(fā)現(xiàn),窖泥微生物生長的最適溫度為32~35 ℃,溫度過低會抑制窖泥微生物生長[16]。乙酸、銨態(tài)氮和pH 值等與老窖泥的菌群呈正相關(guān),乳酸、乙醇和丙酸含量與新窖泥的菌群呈正相關(guān)[17]。成熟期窖泥中的乳酸與Caproiciproducens和Clostridium微生物呈負相關(guān)[18]。此外,30 年窖齡的窖泥中的有機酸與Caproiciproducens、Caloramatoraceae呈正相關(guān)[19]。目前的研究熱點在于尋找窖齡、窖泥微生物和窖泥理化特性與風味物質(zhì)相關(guān)的信息,因此,探索不同環(huán)境因素脅迫條件下窖泥微生物群落結(jié)構(gòu)的定向馴化(特別是優(yōu)勢微生物菌群)是十分有意義的。
本研究應(yīng)用高通量測序系統(tǒng)研究了環(huán)境因素(溫度為物理因素,乙醇、乳酸、乙酸為化學因素)脅迫下窖泥微生物菌群的演化,通過定量的環(huán)境因素水平下揭示窖泥優(yōu)勢微生物群落的變化情況,以期為闡明窖泥微生物的功能和影響因素提供理論依據(jù)。
樣品及材料:窖泥樣品由五糧液股份有限公司提供,窖齡約20年,窖泥均采集下層窖泥,編號分別為A和B。
試劑及耗材:乳酸,美國Sigma 公司;乙醇,成都市科隆化學品有限公司;乙酸,成都市科隆化學品有限公司,以上試劑均為分析純。土壤樣品提取試劑盒(MP Biomedicals FastDNA),美國MP Biomedicals 生物醫(yī)學公司;五糧粉液體發(fā)酵培養(yǎng)基參照文獻[20]進行制備。
儀器設(shè)備:高速冷凍離心機(5810R),德國Eppendorf 公司;NanoDrop one 超微量分光光度計,賽默飛世爾科技公司;生化培養(yǎng)箱(BPC-250F),上海一恒科學儀器有限公司;蒸汽滅菌鍋(HVE-50),上海一恒科學儀器有限公司;高通量測序儀(Next-Seq 500),美國Illumina公司。
1.2.1 窖泥微生物洗脫液的制備
按窖泥∶無菌水=1∶10比例進行渦旋混勻5 min,800 r/min 低速分離,收集上清液;10000 r/min 高速收集,去掉上清液,再按窖泥∶無菌水=1∶10 比例加入無菌水,重復(fù)以上步驟5~6次,盡量洗脫窖泥溶解于水中的風味物質(zhì),得到窖泥微生物洗脫液。
1.2.2 發(fā)酵實驗方案
1.2.2.1 物理因素脅迫窖泥微生物發(fā)酵
溫度:窖泥洗脫液按培養(yǎng)基的10 %接種至100 mL 已滅菌的五糧粉液態(tài)培養(yǎng)基中,分別放置28 ℃、34 ℃、40 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)30 d。
1.2.2.2 化學因素脅迫窖泥微生物發(fā)酵
乙醇:窖泥洗脫液按培養(yǎng)基的10 %接種至100 mL 已滅菌的五糧粉液態(tài)培養(yǎng)基中,再添加1%、2%、4%乙醇,混合均勻,放置34 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)30 d。
有機酸:窖泥洗脫液按培養(yǎng)基的10 %比例接種至100 mL 已滅菌的五糧粉液態(tài)培養(yǎng)基中,分別添加0.1%、0.2%、0.4%乳酸和乙酸,混合均勻,放置34 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)30 d。
1.2.3 基因組DNA提取及PCR擴增
采用MP Biomedicals FastDNA 試劑盒提取窖泥發(fā)酵液中微生物基因組總DNA,用NanoDrop one 超微量分光光度計檢測DNA 濃度和純度。以DNA 為模板,引物為Hyb515F(5'-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGGTG -CCAGCMGCCGCGGTAA-3') 和 Hyb806R (5'-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAG -ACAGGGACTACHVGGGTTCTAAT-3-) 對細菌16S rDNA 基因V4 區(qū)域擴增[7]。PCR 擴增具體反應(yīng)程序如下:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性20 s,53 ℃退火25 s,72 ℃延伸45 s,共25 個循環(huán);72 ℃延伸5 min。
1.2.4 高通量測序及序列分析
高通量測序及序列分析步驟具體參照文獻[7]進行。
1.2.5 數(shù)據(jù)處理
對測序原始數(shù)據(jù)參照文獻[7]進行處理;采用Origin 2021繪制柱狀圖。
如圖1 所示,物理因素脅迫發(fā)酵后,pH 值由5.2~5.5 降低至3.0 左右;經(jīng)化學因素脅迫發(fā)酵后,pH 值由3.0~4.2 降低至3.0 左右,均呈現(xiàn)減少的現(xiàn)象,說明經(jīng)環(huán)境因素脅迫,窖泥微生物能進行正常生長且一定程度上代謝產(chǎn)酸。
圖1 發(fā)酵前后pH值變化情況
2.2.1 目水平下群落結(jié)構(gòu)變化
基于OTU 注釋,每個發(fā)酵樣品中厚壁菌門(Fimicutes)相對含量占96%以上,與四川某知名濃香型酒廠窖泥中厚壁菌門為絕對優(yōu)勢菌群具有一致性[21]。門水平下差異性不顯著,故選擇在目水平進行比較。在目水平下共檢出8 個目,占每個樣品總含量的95%以上,如圖2所示。
目水平下,兩個窖泥樣品微生物群落結(jié)構(gòu)組成大體一致(圖2)。經(jīng)物理因素脅迫發(fā)酵后,主要由4 個目主導(dǎo),包括梭菌目(Clostridiales)>Thermoanaerobacterales>乳桿菌目(Lactobacillales)≥芽孢桿菌目(Bacillales),擬桿菌目(Bacteroidales)、Coriobacteriales、互養(yǎng)菌目(Synergistales)和Acholeplasmatales未檢出。
圖2 目水平下窖泥中原核微生物群落結(jié)構(gòu)的變化
與培養(yǎng)前相比,梭菌目的相對豐度為68 %~79%,差異性不顯著,除在28 ℃脅迫發(fā)酵后;Thermoanaerobacterales 相對豐度從4 %增加到14 %~16%,差異性顯著。經(jīng)28 ℃脅迫發(fā)酵后,窖泥A 和B 中乳桿菌目相對豐度分別為23.7 %和9.3 %,相比其他水平脅迫(相對豐度為0.1%~8%),達到了最高相對豐度。
2.2.2 屬水平下群落結(jié)構(gòu)變化
將平均相對豐度超過1 %的微生物定義為優(yōu)勢屬[22]。本研究基于OTU注釋,兩個窖泥樣品微生物群落結(jié)構(gòu)組成大體一致,共得到113 個屬,其中相對豐度>1%的優(yōu)勢菌屬共17個,各優(yōu)勢菌屬的相對豐度如圖3 所示。經(jīng)物理因素脅迫發(fā)酵后,主要由6 個屬主導(dǎo),包括Sedimentibacter(占20 %~35 %)>Caloribacterium(占10 %~17 %)>Tepidimicrobium(占6 %~12 %)>Lactobacillus(占1 %~23 %)≥Sporanaerobacter(占2 %~4 %)≥Tissierella(占2 %~3 %),占每個樣品總含量的60 %以上。Aminobacterium、Proteiniphilum、Acholeplasma和Atopobium均未檢出。
圖3 屬水平下窖泥中原核微生物群落結(jié)構(gòu)的變化
與培養(yǎng)前相比,Sedimentibacter、Tissierella和Sporanaerobacter的相對豐度差異不顯著;Calorib-acterium和Tepidimicrobium相對豐度均增加了2 倍以上,但在不同溫度脅迫下差異不顯著;在28 ℃發(fā)酵下,Lactobacillus相對豐度最高,增加了3倍以上。有關(guān)研究表明,Sedimentibacter和Tepidimicrobium能夠為己酸合成提供前體物質(zhì)乙酸和丁酸[13,23],Caloribacterium和Sporanaerobacter能夠利用葡萄糖發(fā)酵產(chǎn)乙酸、氫氣和二氧化碳[24-25]。
相比對照組(34 ℃培養(yǎng)下),低溫28 ℃能促進Lactobacillus的生長。作為固態(tài)法白酒生產(chǎn)的重要微生物Lactobacillus,代謝產(chǎn)有機酸能促進釀酒酶系的糖化和發(fā)酵[26],代謝積累的乳酸可作為梭菌屬合成丁酸和己酸的底物,還具有維護與保持釀酒微生態(tài)環(huán)境等作用[27-28]。
2.3.1 目水平下群落結(jié)構(gòu)變化
基于OTU 注釋,每個發(fā)酵樣品中厚壁菌門(Fimicutes)相對含量占99%以上,無法進行樣品之間的差異性比較,故選擇在目水平進行比較。在目水平下共檢出8 個目,占每個樣品總含量的97 %以上,兩個窖泥樣品微生物群落結(jié)構(gòu)組成大體一致,如圖4所示。
圖4 目水平下窖泥中原核微生物群落結(jié)構(gòu)的變化
目水平下,經(jīng)化學因素脅迫發(fā)酵后,主要由4個目主導(dǎo),包括梭菌目(Clostridiales)>Thermoanaerobacterales>乳桿菌目(Lactobacillales)≥芽孢桿菌目(Bacillales),擬桿菌目(Bacteroidales)、Coriobacteriales、互養(yǎng)菌目(Synergistales)和Acholeplasmatales 未檢出。添加乳酸脅迫發(fā)酵,能抑制梭菌目微生物生長,添加乙酸脅迫,則無顯著性作用,這與吳浪濤等[18]表明的乳酸與大部分梭菌綱微生物都呈負相關(guān)相一致。
與培養(yǎng)前相比,Thermoanaerobacterales 相對豐度從4 %增加到14 %~16 %,差異性顯著;芽孢桿菌目和乳桿菌目相對豐度均呈現(xiàn)增加的趨勢,芽孢桿菌目在添加0.2 %乙酸(在窖泥A 中相對豐度為12.1%)和0.4 %乳酸(在窖泥B 中相對豐度為13.8 %)脅迫發(fā)酵下達到最高,乳桿菌目在添加0.2 %乳酸脅迫發(fā)酵下達到最高(A-30.4 %,B-25.5%)。
2.3.2 屬水平下群落結(jié)構(gòu)變化
經(jīng)化學因素脅迫發(fā)酵后,兩個窖泥樣品微生物群落結(jié)構(gòu)組成大體一致,各優(yōu)勢菌屬的相對豐度如圖5 所示。主要由6 個屬主導(dǎo),包括Sedimentibacter(占19 %~30 %)>Caloribacterium(占10 %~16 %)>Tepidimicrobium(占4 %~12 %)>Lactobacillus(占3 %~30 %)≥Sporanaerobacter(占2~4%)≥Tissierella(占1%~3%),占每個樣品總含量的60 %以上。Aminobacterium、Proteiniphilum、Acholeplasma和Atopobium均未檢出。
圖5 屬水平下窖泥中原核微生物群落結(jié)構(gòu)的變化
與培養(yǎng)前相比,Lactobacillus相對豐度差異極顯著,在添加0.2%乳酸脅迫下的相對豐度最高,占25%~30%;Sedimentibacter和Sporanaerobacter相對豐度差異不顯著;Caloribacterium和Tepidimicrobium相對豐度均增加了2 倍以上,但在不同乙醇濃度脅迫下差異不顯著;Caloribacterium相對豐度增加了2 倍以上,但在不同乳酸、乙酸濃度下相對豐度差異不顯著;在窖泥樣品B組中,Tepidimicrobium相對豐度增加幅度具有顯著性。
相比對照組(34 ℃培養(yǎng)下),添加乳酸和乙酸脅迫發(fā)酵能促進Lactobacillus的生長,抑制Tissierella和Clostridium的生長。推測原因如圖1 所示,添加乳酸和乙酸脅迫發(fā)酵后,環(huán)境pH 維持在3.0 左右,適宜乳酸桿菌屬生長(Lactobacillus可以在pH值低至2.4 的條件下存活[29]),不適宜Tissierella和Clostridium生長(Tissierella生長的最適pH值為6.0~7.0[30],Clostridium生長的最適pH 值為5.0~7.0[31])。
本研究利用高通量測序儀對環(huán)境因素(溫度物理因素,乙醇、乳酸、乙酸化學因素)脅迫下窖泥微生物群落結(jié)構(gòu)進行分析和比較。結(jié)果表明,選取2個窖泥樣品進行環(huán)境因素脅迫發(fā)酵后,在目水平和屬水平下,窖泥微生物群落結(jié)構(gòu)組成大體一致,具有一定程度的可重復(fù)性。
目水平下,經(jīng)環(huán)境因素脅迫發(fā)酵后,28 ℃和0.2 %乳酸脅迫下,對乳桿菌目菌群微生物的生長具有促進作用。主要由4 個目主導(dǎo),包括梭菌目(Clostridiales)>hermoanaerobacterales>乳桿菌目(Lactobacillales)≥芽孢桿菌目(Bacillales),擬桿菌目(Bacteroidales)、Coriobacteriales、互養(yǎng)菌目(Synergistales)和Acholeplasmatales 未檢出。與培養(yǎng)前相比,Thermoanaerobacterales 相對豐度由4 %增加到14%~16%,具有顯著差異性;在化學因素脅迫發(fā)酵下,芽孢桿菌目和乳桿菌目相對豐度均呈現(xiàn)增加的趨勢。
屬水平下,經(jīng)環(huán)境因素脅迫發(fā)酵后,得出低溫、乳酸和乙酸對Lactobacillus的生長具有促進作用;乳酸和乙酸對Tissierella和Clostridium具有抑制作用。主要由6 個屬主導(dǎo),包括Sedimentibacter>Caloribacterium>Tepidimicrobium>Lactobacillus≥Sporanaerobacter≥Tissierella,Aminobacterium、Proteiniphilum、Acholeplasma和Atopobium均未檢出。與培養(yǎng)前相比,Sedimentibacter、Tissierella和Sporanaerobacter的相對豐度差異不顯著;Lactobacillus在低溫28 ℃和0.2 %乳酸脅迫發(fā)酵下相對豐度最高,分別為16.2%和27.65%。