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甘藍(lán)型油菜葉綠素含量的主基因+多基因遺傳分析

2023-03-21 01:51:20李遠(yuǎn)紅余坤江何雨琦王曉東
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年4期
關(guān)鍵詞:甘藍(lán)型油菜葉綠素

李遠(yuǎn)紅,余坤江,何雨琦,王曉東

(1.貴州大學(xué)農(nóng)學(xué)院,貴州貴陽 550025; 2.江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所,江蘇南京 210014)

油菜是我國食用植物油的第一大來源,同時兼具觀、菜、蜜、飼、肥等[1]多維度利用價值。2020年,我國油菜種植面積、油菜籽產(chǎn)量已達(dá)3 610.7萬hm2、7 179.6萬t,在我國食用油市場中具有舉足輕重的地位[2-3]。近年來,利用雜種優(yōu)勢來大幅度提高油菜產(chǎn)量難度較大,高光效育種受到越來越多研究者的重視[4]。葉片是植物進(jìn)行光合作用的主要器官,決定植物體內(nèi)干物質(zhì)的積累。葉綠素在綠色植物進(jìn)行光合作用時起到至關(guān)重要的作用,植物吸收太陽輻射后體內(nèi)會激發(fā)反應(yīng)中心色素從而啟動光化學(xué)反應(yīng),為生物圈提供動力。葉綠素含量的高低直接影響植物光合潛力和初級生產(chǎn)[5],對油菜籽粒的產(chǎn)量也具有顯著影響[6-7]。因此,解析油菜葉綠素含量的遺傳機(jī)制對于推進(jìn)我國的油菜高光效育種具有重要的理論及實踐意義。

關(guān)于油菜葉綠素含量的研究報道較多,國內(nèi)外學(xué)者已對其性狀的遺傳做了相關(guān)研究。Zhao等分離出油菜黃綠葉(yvl)突變體,通過BSA-seq定位在BnaA03,全基因組測序發(fā)現(xiàn)CHLH在突變體中堿基替換,導(dǎo)致CHLH活性降低,從而影響葉綠體發(fā)育和葉綠素的合成[8]。Ye等構(gòu)建了近等基因系 (NIL),對葉綠素基因座進(jìn)行了精細(xì)定位,研究發(fā)現(xiàn)cqSPDA2是歐洲油菜葉綠素含量的一個顯性QTL,在A02上被精細(xì)定位到 21.89~22.04 Mb 區(qū)間[9]。郎麗娜在研究油菜在鹽脅迫中的QTL時,在LG5發(fā)現(xiàn)與葉綠素相關(guān)基因座qSPAD5[10]。代文東等利用紫紅葉油菜和綠葉油菜通過DarT-seq技術(shù)對BC1群體單株進(jìn)行基因分型并構(gòu)建連鎖遺傳圖譜,共檢測出8個葉綠素含量QTL,分別位于A0l、A03、A06、A07、C01、C03和C04連鎖群上[11]。此外,有學(xué)者利用構(gòu)建的分子遺傳連鎖圖譜,定位了油菜種胚[12]、角果皮[13]部位葉綠素含量性狀相關(guān)的QTL。這些研究均根據(jù)田間各遺傳群體測量葉綠素含量來進(jìn)行遺傳分析,而通過數(shù)量性狀遺傳分離分析方法進(jìn)行深入系統(tǒng)研究的報道較少。植物主基因+多基因混合模型是蓋鈞鎰等提出來解決數(shù)量性狀遺傳的分析方法[14],并在多種作物中已普遍運(yùn)用。雖已有研究對油菜葉綠素進(jìn)行QTL定位,但葉綠素合成和調(diào)控機(jī)制仍較復(fù)雜。彭門路等以有、無突變體(yl1)雜交的6個世代(P1、P2、F1、F2、B1、B2)為材料,利用主基因+多基因混合遺傳模型對突變性狀進(jìn)行遺傳分析,結(jié)果表明甘藍(lán)型油菜葉綠素缺失性狀受1對加性-顯性主基因控制,yl1葉綠素缺失為不完全顯性遺傳[15]。筆者旨在應(yīng)用該分析方法研究甘藍(lán)型油菜葉片葉綠素含量,解析其遺傳變異規(guī)律,為相關(guān)性狀的分子標(biāo)記開發(fā)和高光效育種改良奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

本研究以甘藍(lán)型油菜高葉綠素含量品系A(chǔ)PL01、低葉綠素含量品系Holly及2個品系雜交后衍生的198個重組自交家系群體(AH群體目前已發(fā)展到F2:13代)為材料,種植于貴州省貴陽市貴州大學(xué)教學(xué)試驗場(26°N、106°E、海拔為1 100.55 m、土壤為黃壤)。采用隨機(jī)區(qū)組試驗設(shè)計,每個品系種植4行,行距40 cm,株距20 cm,每行15株。試驗地肥力均勻一致,田間管理參照當(dāng)?shù)卮筇镌耘喙芾泶胧?。所有試驗材料均由江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所提供。

1.2 葉綠素含量的測定

在2019、2020、2021年3個年份環(huán)境下,使用葉綠素計(型號:SPAD-502;品牌:柯尼卡美能達(dá);產(chǎn)地:日本)測定APL01和Holly以及AH群體各品系9張葉片期葉片的葉綠素相對含量(SPAD值),每個品系測量3株,每株測量3張葉(由上至下第3、4、5張葉),每張葉測量3個點(diǎn),取其平均值,測量時避開主葉脈。2019、2020、2021年3個年份環(huán)境分別用19GY、20GY、21GY表示。

1.3 統(tǒng)計分析

對2019—2020年3個年份環(huán)境的甘藍(lán)型油菜葉片葉綠素含量,利用Excel、SPSS 21.0軟件[16]進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計及群體變異分析。利用植物主基因+多基因混合遺傳模型,結(jié)合SEA-G3DH軟件對親本和AH群體3個年份環(huán)境的SPAD值進(jìn)行遺傳分析[17]。遺傳模型的選擇首先根據(jù)AIC值(Akaike’s information criterion)最小原則確定3~4個候選模型,然后對候選模型進(jìn)行適合性檢驗,以確定最適模型,最后計算最適模型下的遺傳參數(shù)。分析軟件由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)章元明教授提供。

2 結(jié)果與分析

2.1 葉綠素含量的變異分析

由表1可知,在3個不同年份環(huán)境下種植的AH群體葉綠素含量的變異系數(shù)大小順序依次為21GY>19GY>20GY,說明第3個年份環(huán)境測量葉綠素含量時其變異豐度最大,而3個年份環(huán)境間群體葉綠素含量存在變異,表明該性狀受環(huán)境影響。從平均值上看,19GY,21GY的平均葉綠素含量較接近,差值僅達(dá)2.16,20GY的均值較高于19GY和21GY,20GY與19GY的差值為7.32,20GY與21GY的差值為5.16。21GY的變異系數(shù)是3個環(huán)境中最高,可見在3個年份環(huán)境下所測得的葉綠素含量,第3個環(huán)境影響最大,其次是第1個環(huán)境,最后是第2個環(huán)境。

表1 在3個年份環(huán)境下AH群體的葉綠素含量變異情況

2.2 葉綠素含量分布特征分析

從圖1可以看出,在3個年份環(huán)境下的葉綠素含量在43~66的區(qū)間呈連續(xù)的分布,表現(xiàn)為典型的數(shù)量性狀特征。19GY、21GY的葉綠素含量主要都集中在40~60的區(qū)間范圍內(nèi),而在0~40和60以上的分布頻數(shù)較低。20GY的葉綠素含量主要集中在50~65的區(qū)間范圍內(nèi)。其群體葉綠素含量分布呈現(xiàn)為正態(tài)分布,表明該群體中葉綠素含量的遺傳符合主基因+多基因遺傳特征。

2.3 葉綠素含量遺傳模型分析

2.3.1 遺傳模型的選擇 采用是植物數(shù)量性狀主基因+多基因混合遺傳模型對親本及AH群體的葉綠素含量性狀進(jìn)行遺傳分析,估算獲得了0對主基因(0MG模型)、1對主基因(1MG模型)、2對主基因(2MG模型)、多基因(PG模型)、1對主基因+多基因(MX1模型)、2對主基因+多基因(MX2模型)、3對主基因(3MG模型)、3對主基因+多基因(MX3模型)、4對主基因(4MG模型)等9類共39種遺傳模型的極大似然函數(shù)值和AIC值(表2)。根據(jù)Akaike準(zhǔn)則,選取AIC值最小及與最小AIC值比較接近的遺傳模型作為候選模型,每個環(huán)境確定4個候選模型。用2019年葉綠素含量數(shù)據(jù)獲得19GY的候選模型為3MG-A、3MG-CEA、MX3-AI-AI、4MG-AI,用2020年葉綠素含量數(shù)據(jù)獲得20GY的候選模型為3MG-A、3MG-CEA、MX3-AI-AI、MX3-AI-A;21GY獲得候選模型為MX3-AI-AI、MX3-AI-A、MX3-A-A、4MG-A。

表2 葉綠素含量各遺傳模型的AIC值

從上述結(jié)果來看,其中2個年份環(huán)境(20GY、21GY)的最適模型皆為MX3-AI-AI,而19GY年份環(huán)境下所檢驗出的最適模型為4MG-AI,而3個年份環(huán)境下2個候選模型的AIC值(MX3-AI-AI為1 248.57,4MG-AI為1239.92)較接近,造成這個分析結(jié)果的原因可能是因為19GY的環(huán)境差異較大,葉片的葉綠素含量所受環(huán)境的影響也相對加強(qiáng),結(jié)合3個環(huán)境結(jié)果,推測出AH群體葉綠素的最適模型為MX3-AI-AI。

表3 AH群體的模型適合性檢驗

2.3.3 最適模型下遺傳參數(shù)的估計 分別計算油萊AH群體在3個年份環(huán)境下葉片葉綠素含量在最適遺傳模型下的各遺傳參數(shù),結(jié)果(表4)表明,在19GY環(huán)境下,群體葉綠素含量的3對主基因的加性效應(yīng)均表現(xiàn)為負(fù)向遺傳效應(yīng),效應(yīng)大小順序為da>dc>db;主基因上位性效應(yīng)分別為-6.35、-6.35、-6.34、-6.34;主基因遺傳率為63.22%;多基因遺傳率為35.7%。 20GY環(huán)境下的群體葉綠素含量3對主基因的加性效應(yīng)均表現(xiàn)為負(fù)向遺傳效應(yīng),加性效應(yīng)大小順序為da>dc>db;主基因上位性效應(yīng)分別為-6.60、-6.61、-6.60、-6.60;主基因遺傳率為73.09%;多基因遺傳率為26.32%。21GY環(huán)境下的群體葉綠素的3對主基因的加性效應(yīng)均表現(xiàn)為負(fù)向遺傳效應(yīng),加性效應(yīng)大小順序為da>dc>db;主基因上位性效應(yīng)分別為-7.24、-7.25、-7.24、-7.24;在19GY、20GY中,主基因加性效應(yīng)和主基因上位性效應(yīng)值都是負(fù)值,說明2個效應(yīng)都能使葉綠素含量降低。在21GY中,主基因加性效應(yīng)值都為負(fù)值,主基因上位性效應(yīng)為正值,說明主基因加性效應(yīng)使葉綠素含量降低,則主基因上位性效應(yīng)提高葉綠素含量。綜上所述,AH群體葉綠素含量受主基因加性和上位性效應(yīng)調(diào)控,同時,存在明顯的多基因加性效應(yīng)影響。

連續(xù)2年3個環(huán)境的數(shù)據(jù)中,主基因遺傳率為63.22%~73.33%,多基因遺傳率在25.94%~35.7%,主基因遺傳率平均值69.88%,顯著大于多基因遺傳率,可見葉片葉綠素含量的遺傳體系中,主基因的貢獻(xiàn)率占主要部分。此外,AH群體葉綠素含量在3個環(huán)境方差都為0.66左右,說明葉綠素含量易受環(huán)境影響。

3 討論與結(jié)論

3.1 油菜葉片葉綠素含量變異豐富

自20世紀(jì)70年代以來,許多國家將遺傳改良的重點(diǎn)放到了提高作物光合效率上,并且明確指出提高光效是作物育種的重要內(nèi)容[18]。本研究利用APL01、Holly品系及2個品系雜交后衍生的198個重組自交家系群體,葉綠素含量在2019、2020、2021年的變異系數(shù)分別為9.57%、8.45%、10.49%,葉綠素含量(SPAD值)為50.76、58.08、52.92。從結(jié)果分析來看,薦紅舉等對連續(xù)2年588份甘藍(lán)型油菜品種的葉綠素分析后發(fā)現(xiàn),在不同年份中葉綠素含量變化較小,變異系數(shù)分別為11.27%、12.73%[19]。有研究對紫紅葉和綠葉油菜品系構(gòu)建遺傳分離群體的葉綠素含量分析,葉綠素含量的變異系數(shù)為8.00%[11]。研究結(jié)果表明,油菜葉綠素含量變異系數(shù)較穩(wěn)定,具有豐富的變異,本研究與前人研究結(jié)果相符。而造成葉綠素含量變異的原因,主要是受環(huán)境的影響[20-21]。

表4 AH群體葉綠素含量在MX3-AI-AI模型下遺傳參數(shù)估計值

3.2 葉綠素含量受主基因+多基因共同控制

葉色調(diào)控在光合作用和干物質(zhì)生產(chǎn)中具有重要作用,明確其遺傳機(jī)制有利于后續(xù)育種實踐。關(guān)于植物葉綠素或黃化性狀的遺傳,國內(nèi)外已有較多研究,但針對甘藍(lán)型油菜葉片葉綠素含量相關(guān)QTL或候選基因的研究相對較少。本研究采用植物主基因+多基因混合遺傳模型,結(jié)合SEA-G3DH軟件得出AH群體葉綠素含量最優(yōu)遺傳模型為MX3-AI-AI,即3對加性-上位性主基因+多基因加性-上位性混合遺傳模型,與前人研究結(jié)果不盡相同。田穎等利用油菜黃化突變體L638-y與正常葉色材料2598雜交后代用于黃化基因標(biāo)記,發(fā)現(xiàn)葉色由2對隱性核基因gr1、gr2調(diào)控[22-23]。相關(guān)研究認(rèn)為,調(diào)控葉綠素含量受1對加性-顯性主基因控制,不存在多基因效應(yīng)的影響[14]。唐亮等研究了水稻群體葉綠素含量基因的遺傳規(guī)律,發(fā)現(xiàn)葉綠素含量受2對主基因+多基因共同控制[24]??梢?,葉綠素含量的遺傳機(jī)制相對復(fù)雜。代文東等研究檢測出8個葉綠素含量QTL,證實葉綠素含量同時也受加性效應(yīng)的調(diào)控,加性效應(yīng)在4.99~9.20[10]。本研究加性效應(yīng)在6.35~7.25,與前人研究結(jié)果不同,為進(jìn)一步挖掘相關(guān)QTL提供參考。造成這些異同點(diǎn)的原因,首先是試驗材料的不同,揭示甘藍(lán)型油菜葉綠素遺傳機(jī)制的研究較少。其次,研究方法大都采用蓋鈞鎰等編制的植物數(shù)量性狀分離分析軟件。本研究采用南京農(nóng)業(yè)大學(xué)劉兵等研制的植物數(shù)量性狀分離分析Windows軟件包SEA,該軟件具有友好的操作界面,能夠計算出一階遺傳參數(shù)和部分二階遺傳參數(shù),結(jié)果更易分析。葉綠素屬數(shù)量性狀,環(huán)境因素干擾大,大多研究群體較小,本研究擴(kuò)大育種群體規(guī)模,更利于考察該性狀。甘藍(lán)型油菜葉綠素含量性狀是由主基因控制和多基因共同控制,且主基因遺傳率顯著高于多基因遺傳率。本研究明確了甘藍(lán)型油菜主基因間作用方式為累加作用,并且得到了主基因加性效應(yīng)、主基因上位性效應(yīng)各效應(yīng)值,這為深入研究甘藍(lán)型油菜葉綠素含量性狀的遺傳機(jī)制提供了基礎(chǔ)。研究結(jié)果表明,葉綠素含量的遺傳力高,育種過程中在早期世代對葉綠素含量高的材料進(jìn)行選擇是有效的,在本試驗中,后代存在葉綠素含量超過親本的材料,說明可以采用雜交和回交方式轉(zhuǎn)移主基因,獲得超親材料。

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