杜元軍 韓海霞 劉瑋 李大鵬 雷秋霞 周艷 劉杰 王杰 李福偉 陳甫

摘要：本研究旨在利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)（RNA-seq）篩選雞十二指腸中與暗斑蛋形成相關(guān)的功能基因和信號(hào)通路。選取連續(xù)產(chǎn)暗斑蛋率低和連續(xù)產(chǎn)暗斑蛋率高的濟(jì)寧百日母雞各10只分別作為對(duì)照組和暗斑組，采集十二指腸組織，測(cè)定鈣代謝相關(guān)基因mRNA表達(dá)量，利用RNA-seq技術(shù)對(duì)差異表達(dá)基因（differentially expressed genes，DECs）進(jìn)行GO（gene ontology）功能注釋和KECC（ kyoto encyclopediaof genes and genomes）信號(hào)通路富集。結(jié)果表明，轉(zhuǎn)錄組獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)108.75 Cb且所有樣本Q30>97%;共篩選得到471個(gè)DECs，其中327個(gè)上調(diào)，144個(gè)下調(diào)，隨機(jī)選取7個(gè)DECs進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）驗(yàn)證，表達(dá)趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果基本一致；co功能注釋分析篩選到SLC8A3、SLC24A4、SLC9A2等DECs主要富集到線粒體鈣離子穩(wěn)態(tài)、鈉離子跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)和鈣離子結(jié)合的過(guò)程；KECC通路富集結(jié)果顯示，CSTTI、CST02、CSTA3、CIDN2、CIDN10等DECs主要富集到細(xì)胞色素P450介導(dǎo)的外源物代謝通路、藥物代謝一細(xì)胞色素P450、鈣信號(hào)通路等；與對(duì)照組相比，暗斑組十二指腸鈣結(jié)合蛋白（CALB1）的mRNA表達(dá)量顯著下降（P<0.05）。綜上，蛋雞十二指腸中CSTTI、CST02、CSTA3基因的上調(diào)和SLC8A3、SLC24A4等基因的下調(diào)是影響暗斑蛋形成的關(guān)鍵因素，鈣信號(hào)通路在暗斑形成中發(fā)揮了重要作用。本研究為暗斑蛋的機(jī)理研究提供了基礎(chǔ)材料。

關(guān)鍵詞：蛋雞；蛋殼暗斑；十二指腸；差異表達(dá)基因；轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

中圖分類號(hào)：S831.2：Q78 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2023）12-0143-07