孫雅琴
細(xì)胞之內(nèi),無數(shù)精密的分子過程隨時隨刻在運(yùn)轉(zhuǎn)著,復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、組裝、呼吸、代謝……這些受到高度時空調(diào)控的分子過程締造出生命體的千變?nèi)f化,繁衍生息。如果將每個生命體視為一部機(jī)器,這些分子過程就像一個個精巧的部件,其精確程度遠(yuǎn)非人工可比。
作為生命體遺傳物質(zhì)的脫氧核糖核酸(DNA),廣為人知的是其固有的雙螺旋結(jié)構(gòu),通過AGCT堿基的精密配對與無限排列組合承載了龐大的生命遺傳信息。但在上海交通大學(xué)長聘教軌副教授張歡的研究中,DNA不僅僅是一種遺傳物質(zhì)的載體。多年從事分析化學(xué)、化學(xué)生物學(xué)交叉學(xué)科研究的她,更多時候?qū)NA視為一種可編程的生物信息材料,一種基礎(chǔ)的分子砌塊,通過精確組裝,能夠衍生出很多自然界不存在的形態(tài)?!昂蛡鹘y(tǒng)的DNA相比,DNA框架核酸具有更穩(wěn)定的結(jié)構(gòu),不容易被體內(nèi)的外切酶降解,能更加準(zhǔn)確高效地進(jìn)入細(xì)胞,向人體內(nèi)遞送靶向藥物。此外,我們還可以利用不同形式的DNA結(jié)構(gòu),實(shí)現(xiàn)動植物體內(nèi)的檢測、成像和基因編輯。”張歡說。
中國科學(xué)院院士樊春海教授是張歡在框架核酸研究中的引路人。2009年,化學(xué)專業(yè)背景的張歡順利考上中國科學(xué)院上海應(yīng)用物理研究所的直博研究生,師從樊春海院士和黃慶研究員。樊老師深耕核酸分析化學(xué)、框架核酸設(shè)計(jì)與生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用研究,而黃老師在納米材料生物效應(yīng)研究方面做出了獨(dú)具特色的研究工作?!安煌谝话銏F(tuán)隊(duì),樊老師的課題組是一支融合物理、化學(xué)和生物于一體的多學(xué)科交叉研究隊(duì)伍。”張歡說,“這種獨(dú)特的學(xué)科交叉研究氛圍不僅讓我對其他學(xué)科的知識有了進(jìn)一步的了解,而且開闊了我的科研視野?!睂?shí)驗(yàn)室所在的研究所位于上海嘉定區(qū)的新木橋,屬于郊區(qū),研究所周邊盡是田園景色。但在樊老師的帶領(lǐng)下,團(tuán)隊(duì)逐漸形成了“艱苦奮斗、勇于爭先”的新木橋科研精神,在這種積極向上的科研氛圍中,張歡的課題也取得了不錯的進(jìn)展。即使是博士畢業(yè)8年后的今天,已成長為課題組長和博士生導(dǎo)師的張歡也依然深受新木橋精神的激勵。
2017年,張歡遠(yuǎn)赴美國,在加州大學(xué)伯克利分?;瘜W(xué)與生物分子工程系瑪奇塔·P.蘭德里(Markita P.Landry)教授課題組開展博士后研究工作。在蘭德里課題組,張歡第一次接觸到了植物學(xué)。博士期間在樊老師課題組積累的交叉學(xué)科背景,使得張歡意識到可以將核酸納米技術(shù)應(yīng)用到植物學(xué)研究中,并做出了一系列領(lǐng)域內(nèi)具有開拓意義的工作。近年來,張歡在《自然·納米技術(shù)》(Nature Nanotechnology)、《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)、《自然·實(shí)驗(yàn)室指南》(Nature Protocols)、《自然·通訊》(Nature Communications)、《納米快報(bào)》(Nano Letters)等國際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文20余篇,相關(guān)研究成果在學(xué)術(shù)界和工業(yè)界產(chǎn)生一定影響力,被英國《泰晤士報(bào)》、美國國家公共電臺(NPR)等主流媒體及化學(xué)與工程新聞(C&EN),美國科學(xué)促進(jìn)會(AAAS)、科學(xué)網(wǎng)等國內(nèi)外主流學(xué)術(shù)媒體專門報(bào)道,并獲得先正達(dá)(Syngenta)、巴斯夫(BASF)、華大基因等公司的關(guān)注和資助。
張歡
2020年,張歡在美國的工作迎來全面收獲之際,她選擇了回國?!胺蠋煹募覈閼岩恢庇绊懼遥覀兪侵袊?,我們的根在這里!”張歡說。近期,張歡剛剛加入上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,在上海交大的優(yōu)異平臺及團(tuán)隊(duì)支撐基礎(chǔ)上,張歡相信她可以更好地發(fā)揮自身交叉學(xué)科的優(yōu)勢,在植物學(xué)領(lǐng)域繼續(xù)做出更多有意義的工作。目前,她的首要任務(wù)便是在交大組建團(tuán)隊(duì):“熱情歡迎化學(xué)、計(jì)算機(jī)、物理、材料、生物、農(nóng)林及相關(guān)交叉學(xué)科背景的學(xué)者加入我的課題組!我們將與加州大學(xué)伯克利分校、加州理工大學(xué)、中國科學(xué)院等研究機(jī)構(gòu)展開密切合作,共同推進(jìn)核酸技術(shù)相關(guān)領(lǐng)域的研究?!毙缕瘘c(diǎn),新征程!目前課題組已有多名博士后、研究生及本科生加入張歡的隊(duì)伍,而她的科學(xué)研究也將繼續(xù)有條不紊地推進(jìn)。
通常,我們見到的DNA圖片都是一條長長的鏈狀,這是一種一維的線性結(jié)構(gòu)。2006年,在美國加州理工大學(xué)發(fā)表的工作中,美國科學(xué)家保羅·羅特蒙德通過DNA折紙術(shù),編織了一個二維平面的對稱“笑臉”形狀,實(shí)現(xiàn)了DNA分子形貌的精確操控。同年,樊春海和賀林院士一起利用DNA折紙技術(shù)構(gòu)建了第一個非對稱的中國地圖結(jié)構(gòu),并將這個工作發(fā)表在《科學(xué)通報(bào)》的中英文版,以中國特色的形象在國際上亮相。從理論上來講,這項(xiàng)技術(shù)的問世意味著可以把DNA編制成任何一個幾何圖形,從一維、二維到三維。
團(tuán)隊(duì)合影
“不同形式的DNA結(jié)構(gòu)也被稱為框架核酸。通過核酸納米技術(shù),將DNA當(dāng)作組裝基元,經(jīng)過設(shè)計(jì)和堆疊,構(gòu)建出自己想要的模樣,實(shí)現(xiàn)了人工設(shè)計(jì)自組裝的框架核酸結(jié)構(gòu)。這種高度可設(shè)計(jì)的框架核酸,具有可編程的尺寸、形狀和機(jī)械性能。有了它們,科學(xué)家就可以在納米范圍內(nèi)精確地組織小分子,使其具有特定的功能?!睆垰g介紹道,“隨著研究的不斷深入,有學(xué)者在DNA折紙技術(shù)基礎(chǔ)上,精確排布固定適配體、生物酶、抗體等,這相當(dāng)于把DNA折紙做成框架載體,而后固定各種功能元件,以實(shí)現(xiàn)更復(fù)雜的生物學(xué)功能,如早期診斷、腫瘤治療、DNA邏輯計(jì)算等?!?/p>
植物基因工程是農(nóng)業(yè)科技革命的關(guān)鍵技術(shù),發(fā)展高效、安全的遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)是基因工程和遺傳育種等領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一。利用框架核酸卓越的可設(shè)計(jì)性和可編程性,張歡構(gòu)建了尺寸和形貌精確可控的DNA納米結(jié)構(gòu),研究其與煙草植物葉片細(xì)胞相互作用,首次發(fā)現(xiàn)DNA納米結(jié)構(gòu)可突破細(xì)胞壁屏障進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),并且發(fā)現(xiàn)納米載體的結(jié)構(gòu)和力學(xué)性質(zhì)是決定其攝取效率的主要因素。這一研究突破了植物研究中外源分子遞送困難的挑戰(zhàn),成功地將干擾小RNA(siRNA)送入植物細(xì)胞并發(fā)揮基因沉默作用。相關(guān)研究成果和實(shí)驗(yàn)方法發(fā)表在國際著名學(xué)術(shù)期刊《美國國家科學(xué)院院刊》及《自然·實(shí)驗(yàn)室指南》上,并被雜志選為當(dāng)周特色工作(Featured Nature Protocol of the week),工作發(fā)現(xiàn)DNA納米材料能夠被植物細(xì)胞攝取,并且是一種可同時實(shí)現(xiàn)無毒、對植物細(xì)胞組織沒有破壞性、對植物種類具有普適性的高效生物分子遞送方法,大大拓展了核酸納米技術(shù)在植物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。
2021年,張歡與加州大學(xué)伯克利分校蘭德里教授及楊培東院士展開合作,在發(fā)展新型siRNA基因藥物遞送技術(shù)方面取得重要進(jìn)展。研究表明聚乙烯酰胺功能化的納米金簇可以快速進(jìn)入植物細(xì)胞,并且可以作為優(yōu)良載體載帶siRNA進(jìn)入植物葉片進(jìn)行基因沉默,相關(guān)研究成果發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《納米快報(bào)》上。2022年,張歡與加州大學(xué)伯克利分校蘭德里教授又通過構(gòu)建核酸修飾的金納米顆粒,深入系統(tǒng)地研究了納米材料與植物組織及細(xì)胞的相互作用,闡明納米載體的形貌對其與植物組織及細(xì)胞相互作用的影響;發(fā)現(xiàn)并提出植物體系中的RNA遞送新機(jī)制:對于siRNA的高效遞送,無須載體本身進(jìn)入植物細(xì)胞。這一工作為植物體系高效靶向載體的設(shè)計(jì)開發(fā)提供了理論基礎(chǔ)及技術(shù)支持,相關(guān)成果發(fā)表在國際著名學(xué)術(shù)期刊《自然·納米科技》(Nature Nanotechnology),論文得到了國內(nèi)外同行的高度關(guān)注,被《自然綜述:材料》(Nature Reviews Materials)(IF=66.308)以研究熱點(diǎn)形式報(bào)道。
“發(fā)展新型基因編輯技術(shù)對實(shí)現(xiàn)新一代生物育種具有重要意義,也是‘十四五’規(guī)劃中國家重點(diǎn)要攻堅(jiān)的科學(xué)問題之一,將核酸納米技術(shù)、生物相容性良好的框架核酸材料和新型的CRISPR基因編輯技術(shù)相結(jié)合,優(yōu)勢互補(bǔ),有望在關(guān)鍵技術(shù)上取得突破,為生物育種提供新的技術(shù)和思路。”張歡相信,在不遠(yuǎn)的未來,框架核酸將在生物醫(yī)學(xué)、基因育種、精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)、信息存儲、國防安全等多個領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,而這一切未知都等著她去探索與發(fā)現(xiàn)……