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家蠶育種技術研究進展

2022-12-11 17:55宋興亞呂穎賢黃永震朱緒偉
河南畜牧獸醫(yī) 2022年19期
關鍵詞:家蠶基因組雜交

楊 尚,宋興亞,趙 鵬,呂穎賢,于 翔,袁 穎,黃永震,朱緒偉*

(1.河南省蠶業(yè)科學研究院,河南 鄭州 450000;2.西北農林科技大學動物科技學院;3.河南省農學會;4.河南省動物衛(wèi)生監(jiān)督所)

家蠶又名桑蠶,是一種具有極高經濟價值的鱗翅目昆蟲,不僅用于養(yǎng)蠶業(yè),還用于許多科學領域。從農耕文明的養(yǎng)蠶繅絲到工業(yè)文明的輕紡工業(yè),家蠶一直扮演著重要角色。在我國悠久的養(yǎng)蠶歷史中,不同地區(qū)因地制宜,飼養(yǎng)適應當?shù)貤l件的家蠶品種。自然條件和人為干預的選擇使得分布在不同地區(qū)家蠶的遺傳資源更加復雜化和多樣化,這為選育工作提供了豐富的原始資料。對家蠶品種選育方法的改進可以提高養(yǎng)蠶的生產效率和經濟效益,從而推動整個家蠶產業(yè)的發(fā)展。

1 家蠶選育的必要性

家蠶養(yǎng)殖技術起源于中國,隨著“一帶一路”倡議在國際上被廣泛認同,南亞、東南亞及非洲等地的一些國家對蠶絲的熱情格外高漲[1]。豐富的土地資源和廉價的勞動力使得這些國家發(fā)展桑蠶產業(yè)有著得天獨厚的優(yōu)勢。印度的蠶絲生產量已經緊隨中國之后,位居世界第二,而巴西雖然產業(yè)規(guī)模小,但能生產世界最優(yōu)質的生絲,成為一些世界奢侈品的原料專供地[2]。這些國家蠶桑業(yè)的發(fā)展使得我國蠶桑業(yè)遭受極大的考驗,發(fā)展環(huán)境不容樂觀。加快產業(yè)轉型和品種培育便是提高我國蠶桑產品國際競爭力的出路。因此,培育出“體質強健、多抗好養(yǎng)、優(yōu)質高產、繁育能力強”的優(yōu)質蠶種勢在必行。

2 家蠶育種基本思路

2.1 確定合理的育種目標

育種目標的確定是為了讓動物生產獲得更大的經濟效益,這是育種工作中最為重要的決策。目標的偏離或是不合理,會導致動物世代間的遺傳進展極大降低甚至背道相馳。因此,合理的育種目標可以為育種計劃的制定指明方向,讓育種工作少走彎路。

確定合理的育種目標需要綜合多方面因素全面考慮,主要需要包括以下要素:

2.1.1 市場需求

動物生產的最終目的都是為人類提供服務,這決定了家蠶育種也必須以市場需求為出發(fā)點,明確在育種中應該提升或改變哪些性狀。綜合考慮家蠶和蠶絲的相關性狀來順應市場需求,這樣的育種工作才有意義。但同時因為育種的效果存在滯后性,即育種群的遺傳進展要經過雜交繁育的代代傳遞,并且世代之間取得的遺傳進展有限,同時我國的家蠶良種繁育采用嚴格的三級繁育、四級制種制度,一個優(yōu)良家蠶品種從理論育成到實際推廣,需要幾年時間。所以在制定育種目標的時候不能只簡單地看到當下的市場需求,必須要對市場做出一定的預測,預測短期、中期、長期的市場需求。

2.1.2 育種素材

預測市場需求后,育種工作的開展已經有了方向,但要實際開展,必須要有物質條件——育種素材,有滿足條件的育種素材才可以繼續(xù)進行實際的育種工作。因此,必須充分了解現(xiàn)有的育種群,包括核心群數(shù)量、群體結構、性狀均值、遺傳參數(shù)、近交系數(shù)和群體之間的配合力等等。然后再根據這些育種群的情況,來選擇符合育種目標的育種群進行雜交,標準品種不能滿足需要的時候可以引進地方品種血統(tǒng)。

2.2 選擇育種素材

根據育種目標選定改良的性狀,選出符合條件的純種群體,如育成帶有對生產影響大的家蠶疾病抗性基因的蠶種、某些產品對蠶絲品質有更高的要求、部分地區(qū)受氟污染影響嚴重需要選育出耐氟品種等等。當前主要通過多元雜交的方式進行育種,這就要選擇帶有不同突出性狀的種群作為父本和母本,從而把雙親的性狀綜合到新品種身上。

2.3 預測育種效果

我國家蠶品種資源豐富,僅根據育種目標初步篩選出的育種群,可能會有很多群體進入備選名單。如果直接開展雜交試驗,結果不盡人意,就會耗費大量人力物力和時間,因此在進行雜交之前,需要對不同組合的雜交效果進行大致估計,以此篩選出成功率較高、雜交效果好的組合進行雜交試驗。

長期以來人們一直在探索可以準確預測出雜交效果的方法,現(xiàn)在被廣泛應用的方法主要有兩種:一是遺傳距離法;二是配合力預測法。遺傳距離法利用基因的相對距離來反映基因交換的概率,但其只能估計群體間的差異程度,對單獨性狀的生產性能無法準確預測。之前有研究通過DNA 多態(tài)性遺傳距離來預測雜交效果,結果顯示以DNA 多態(tài)性遺傳距離篩選出的雜交組合能夠獲得更優(yōu)的生產性能[3]。配合力預測法目前發(fā)展較為成熟,在生產實踐中廣泛應用。在其他動物的研究中有將配合力預測放在基因組水平上的報道[4],可以在早期選種節(jié)約時間,提高選擇效率,目前在家蠶中尚未見有此研究。

2.4 新品系選育

根據確定好的育種目標和雜交組合,采用雜交的方式,再對子代進行系統(tǒng)選擇,一般雜交進行到第3、4代后,換為同蛾區(qū)交配的方式,即互為全同胞的雌雄個體之間交配,可以比較容易地得到更加穩(wěn)定的遺傳性狀。

3 育種技術進展

20世紀以來,連續(xù)個體選擇法和系統(tǒng)選擇法的出現(xiàn),使得家蠶育種取得兩次飛躍性的進步[5],也將家蠶育種推向了一個高峰。隨著時間的遷移,傳統(tǒng)育種方法的局限性慢慢顯露出來:有限的遺傳資源在漫長的時間里幾乎被發(fā)掘完全。

但隨著技術的快速進步,分子生物學等領域取得許多技術創(chuàng)新和技術突破,并被迅速應用在動物育種上,讓育種工作可以在基因水平挖掘品種的潛力,為育種工作的開展注入新的活力[6]。

3.1 物理誘變制造育種素材

物理誘變是制造基因突變的有效手段,但由于其誘變方向的不確定性和生物安全問題,物理誘變在動物育種中的應用不如在植物和微生物中的廣泛。誘變方向的不確定性使得誘變育種在動物育種上的應用極大受限,原因是動物相較于植物和微生物而言,存在繁殖力低、世代間隔長、培育成本高等特點。家蠶作為昆蟲,與其他動物相比,繁殖性能強且世代間隔短,因此,20 世紀末一些科研院所應用物理誘變的方法來獲取新的家蠶育種材料。

安徽省農業(yè)科學院蠶桑研究所和中國科學院等離子體物理所聯(lián)合開展低能氮離子(N+)對家蠶的誘變育種研究:將N+注入家蠶雌蛹及卵中,誘發(fā)基因突變,隨后在獲得的變異群體中選擇表現(xiàn)優(yōu)于對照組,即獲得有益突變的個體,作為育種素材,用以培育新的優(yōu)良品種[7]。山東蠶業(yè)科學研究所育成的“C66”和“煙6”以及遼寧蠶業(yè)科學研究所選育的“多絲3 號”都是采用激光照射處理蠶卵或蠶蛹獲得的柞蠶新品種[8],也可參考用在家蠶的誘變育種中。

3.2 基因組技術挖掘育種潛力

隨著基因組技術的發(fā)展,我國在1996 年提出家蠶基因組計劃,在2004年公布了家蠶基因組序列草稿,隨后以西南大學為主的跨國研究團隊于2008年在此基礎上完成了家蠶基因組精細圖譜,將家蠶全長cDNA序列整合成長度為432Mb、包含14 623 個基因的完整基因組序列、次年以29 種家蠶和11 種野生蠶為材料進行了全基因組重測序,鑒定了基因組多態(tài)性,構建了單堿基對解析的高精度家蠶遺傳變異圖。有關專家基于重測序數(shù)據構建了第1個針對家蠶的CNV圖譜,并在家蠶基因組中共鑒定出319個CNVs。這些研究在家蠶基因組中篩選出了大量穩(wěn)定存在的SNPs 和SVs 等遺傳突變,提出了許多與家蠶的生長發(fā)育及經濟性狀等關聯(lián)的候選基因,可作為家蠶分子育種的分子標記,揭示家蠶雜交育種機理的同時,為廣泛開展分子育種工作打下了基礎。

3.3 基因編輯拓寬育種道路

越來越多物種基因組的公布,基因組編輯也應運而生。ZFN、TALEN 等基因核酸酶的發(fā)現(xiàn),還有被稱為“基因魔剪”的CRISPR使得基因編輯技術在世界范圍內引起空前關注。

3.3.1 依賴ZFNs的基因組編輯

ZFN基因編輯技術適用于家蠶育種,將ZFN mRNA直接注射到胚胎中,可以省去構建表達載體等步驟并且不需要酶的異位表達,極大地縮減了進行家蠶基因編輯的時間。該技術另一個主要的優(yōu)勢在于ZFs 可以進行自定義修飾,以構建具有新的切割特異性的核酸酶。

3.3.2 依賴TALEN的基因組編輯

TALEN可以對基因進行定點突變是基于細菌TAL效應蛋白的作用,步驟包括TALEN 的組裝,離體TALEN RNA 的合成、胚胎顯微注射及突變檢測和PCR 分析。有關專家同樣用BmBLOS2 基因來表示TALEN 基因編輯的準確性,結果證實TALEN有更高的成功率,該結論在其他動物中也得到了驗證,并且TALENs的設計和構建非常簡單和快速。

3.3.3 依賴CRISPR-Cas的基因組編輯

在當下各種基因編輯方法中,避免脫靶效應至關重要。CRISPR/Cas9 系統(tǒng)以其高效率、高保真性和簡單性,從而成為最受歡迎和最廣泛應用的系統(tǒng)。CRISPR/Cas9通常由一個Cas9蛋白質與單一引導RNA(gRNA),兩者形成一個蛋白質-RNA 復合物,然后切割目標。使用CRISPR-Cas 系統(tǒng)對家蠶的大多數(shù)研究都集中在使用CRISPR-Cas系統(tǒng)進行功能基因分析,以闡明某些機制,或增強蠶對BmNPV 的抵抗力。

有關專家首次報道了使用CRISPR-Cas9 工具編輯家蠶基因組的成功操作:作者針對一個必需基因BmBlos2,它與人類Blos2 基因直系同源。設計了兩個sgRNA(23-bp)以誘導導致靶基因功能喪失的突變。由1 個sgRNA 和Cas9 核酸酶形成的每個復合物都被注射到前胚層胚胎階段。通常,幼蟲體被不透明,但當BmBlos2 基因功能喪失,外皮變成半透明。這種效應可以被視為突變體檢測的表型標記。

有關專家在家蠶中利用CRISPR/Cas9 系統(tǒng)獲得去除家蠶核多角體病毒的轉基因個體,揭示了一種通過使用強大的CRISPR-Cas 方法抑制不同家蠶的有前景的策略。IGFLP已被證實在家蠶體內參與成長過程,有關學者使用CRISPR/Cas9基因組編輯工具敲除IGFLP基因,發(fā)現(xiàn)與野生型相比,IGFLP 基因的缺失導致卵巢更小,產卵數(shù)量更少。

為了讓家蠶能夠生產高性能纖維,有關專家使用CRISPR-Cas9 成功敲入了蠶基因組中的蜘蛛絲基因,為了避免干擾蛋白質的產生,將蜘蛛絲基因敲入BmFibL或BmFibH 的內含子之一,證明了在家蠶中使用CRISPR-Cas9 在工業(yè)規(guī)模上獲得具有增強機械性能絲綢的可行性。

有關專家發(fā)現(xiàn)了兩個新的CRISPR 系統(tǒng)Saca 9 和AsCpf 1,這兩個系統(tǒng)也可以進行高效的位點特異性基因組編輯,并構建了完整的CRISPR系統(tǒng),通過集成系統(tǒng),在平均6.5個堿基對中就找到一個可定位的靶點,極大地便利了基因組水平開展的育種工作。

此外,CRISPR-Cas 還被用于家蠶中進行表觀遺傳修飾。在這種情況下,有關專家探討甲基化對家蠶發(fā)育的影響。該研究為研究靶位點DNA 甲基化重要性提供了一種策略,具有重要意義。此外,他們的研究代表了探索DNA 甲基化狀態(tài)對家蠶及其他不同表型影響的起點。

家蠶育種在我國已經有近千年的歷史,技術的飛快進步和育種工作者的辛勤勞動給家蠶育種行業(yè)注入了源源不斷的動力。育種工作從確定育種目標到選擇育種素材、從預測育種效果到選育新品系,步步是關鍵。21世紀生物技術的飛速發(fā)展,從隨機突變到精確敲除、從單純的基因突變體制作到多樣化的基因組精確編輯,家蠶全基因組的公布和基因編輯工具的升級給家蠶的研究與育種帶來了變革性的影響,抓住機遇,家蠶育種將進入全新的高速時代。

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