趙小波閆彩霞李春娟黨彥學(xué)孫全喜王 奇邱俊蘭單世華*
(1.山東省花生研究所,山東 青島 266100;2.臨沂市農(nóng)業(yè)科學(xué)院,山東 臨沂 276003;3.威海市農(nóng)業(yè)農(nóng)村事務(wù)服務(wù)中心,山東 威海 264200)
花生(ArachishypogaeaL.)是世界四大油料作物之一,在100多個(gè)國(guó)家廣泛種植,主要分布在亞洲、非洲和美洲地區(qū)。我國(guó)是世界花生生產(chǎn)大國(guó),占世界花生總產(chǎn)的40%以上,居世界第一位[1]。2021年中央1號(hào)文件明確指出發(fā)展花生等油料作物。我國(guó)鹽堿土面積占耕地總面積的6.2%,目前利用率僅20%左右[2]。通過(guò)培育耐鹽品種,充分利用鹽堿土地種植花生,擴(kuò)大花生種植面積,是提高花生總產(chǎn)的重要途徑之一。通過(guò)對(duì)花生種質(zhì)耐鹽性的評(píng)價(jià)研究表明,花生對(duì)鹽脅迫具有一定的耐受性[3],目前花生耐鹽基因利用方面的研究較少,通過(guò)分子生物學(xué)方法研究花生耐鹽機(jī)制具有重要意義。
bHLH(basic Helix-Loop-Helix)轉(zhuǎn)錄因子家族廣泛存在于真核生物,是植物最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一[4]。bHLH 結(jié)構(gòu)域可分為堿性氨基酸區(qū)(10~15個(gè)氨基酸)和α-螺旋-環(huán)-α-螺旋區(qū)(HLH 區(qū),40個(gè)氨基酸左右)[5]。越來(lái)越多的研究表明,該轉(zhuǎn)錄因子參與植物眾多的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程。另外,大量的研究表明,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子在植物逆境脅迫響應(yīng)機(jī)制中發(fā)揮重要作用。擬南芥轉(zhuǎn)錄因子ICE1(Inducer of CBF expression1,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子家族成員)通過(guò)結(jié)合CBF啟動(dòng)子調(diào)節(jié)下游相關(guān)基因表達(dá),從而響應(yīng)低溫脅迫[6];AtbHLH92[7]、SlbHLH22[8]、bHLH122[9]等轉(zhuǎn)錄因子均通過(guò)ABA 通路調(diào)節(jié)以及提高抗氧化防護(hù)機(jī)制提高植株耐鹽性。此外,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子參與植物鹽脅迫響應(yīng)還有其他途徑,例如ZmbHLH55通過(guò)提高抗壞血酸的生物合成提高植株耐鹽性[10]。前期研究中,我們發(fā)現(xiàn)鹽脅迫時(shí),花生轉(zhuǎn)錄因子AhbHLH18是表達(dá)量顯著提高的轉(zhuǎn)錄因子之一[11]。本研究驗(yàn)證了花生轉(zhuǎn)錄因子AhbHLH18的功能,并分析了其作用機(jī)制,為深入研究花生耐鹽分子機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。
以耐鹽花生品種花育6303為研究對(duì)象。加Hoagland氏培養(yǎng)液于28℃,濕度60%,光照強(qiáng)度500μmol/(m2·s)條件下培養(yǎng)。種子培養(yǎng)21 d后,于200 mmol/L NaCl溶液分別處理0、4、8、12、24 h后取根部組織,液氮冷凍后保存于-80℃冰箱以用于RNA 提取[12]。使用MiniBEST Universal RNA Extraction Kit試劑盒(TaKaRa,大連寶生物)提取根部RNA,并利用PrimeScriptTMII 1st Strand cDNA Synthesis Kit(TaKaRa,大連寶生物)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,參考peanutbase(www.peanutbase.org)上的序列設(shè)計(jì)引物(表1)。反應(yīng)程序?yàn)?94℃,5 min。隨后30個(gè)循環(huán)設(shè)為:94℃,30 s;56℃,50 s;72℃,1 min。最后72℃,8 min。
根據(jù)擴(kuò)增得到的序列,用Beacon Designer 7.0設(shè)計(jì)熒光定量PCR特異引物(表1)。以鹽脅迫處理后0、4、8、12、24 h的根部組織為樣本,以0 h樣本為對(duì)照,使用7500 FAST熒光定量PCR儀(ABI公司)分析AhbHLH18的相對(duì)表達(dá)情況。反應(yīng)條件:95℃,10 s;95℃,5 s;60℃,30 s;72℃,10 s;40個(gè)循環(huán)。試驗(yàn)設(shè)置3 次重復(fù)。相對(duì)表達(dá)量的計(jì)算采用2-ΔΔCT方法[13],選擇Actin 11作為內(nèi)參基因[14],試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用SPSS12.0 分析(SPSS Inc.,Chicago,USA)。
AhbHLH18氨基酸序列與擬南芥基因組中已有序列信息[15]進(jìn)行比對(duì)。然后利用Clustal W軟件對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行人工對(duì)齊排序。選擇Kimura2-parameter公式計(jì)算遺傳距離。MEGA6.0中采用鄰近法(Neighbor-Joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù),自舉值Bootstrap為1000次重復(fù)。DNAMAN軟件對(duì)其氨基酸序列進(jìn)行理化性質(zhì)分析。
提取耐鹽品種花育6303總RNA,反轉(zhuǎn)錄成總cDNA。利用表1引物,以cDNA為模板,擴(kuò)增花生AhbHLH18基因。反應(yīng)程序?yàn)?94℃,5 min;隨后30個(gè)循環(huán)為:94℃,1 min;57℃,50 s;72℃,50 s;最后72℃,10 min。用SacI和XbaI雙酶切載體pCAMBIA2300,T4連接酶將酶切產(chǎn)物與擴(kuò)增產(chǎn)物連接至DH5α感受態(tài)細(xì)胞,篩選陽(yáng)性克隆,轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101,然后利用花序侵染法轉(zhuǎn)化擬南芥[16]。
表1 研究所用引物Table 1 Primers used in this research
將收獲的轉(zhuǎn)AhbHLH18轉(zhuǎn)錄因子的擬南芥T0代種子,播種于含卡那霉素50μg/mL 的MS培養(yǎng)基上,4℃黑暗放置1~2 d后,轉(zhuǎn)至光周期16 h/8 h(光照/黑暗)條件下培養(yǎng)1個(gè)月,提取其基因組DNA 與RNA,利用引物18-CDS-F、18-CDS-R 進(jìn)行PCR與RT-PCR檢測(cè)。對(duì)檢測(cè)合格的株系保種繁殖,直至獲得T3代植株。
野生型與轉(zhuǎn)基因擬南芥種子放置于4℃黑暗條件下培養(yǎng)3 d,進(jìn)行春化作用。隨后,種子轉(zhuǎn)移至光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng),培養(yǎng)條件設(shè)置為:晝夜節(jié)律16 h/8 h,溫度22℃,光照強(qiáng)度200μmol/(m2·s),相對(duì)濕度65%。培養(yǎng)20 d 后,用400 mmol/L NaCl溶液進(jìn)行鹽脅迫處理10 d,檢測(cè)野生型與轉(zhuǎn)基因擬南芥鹽脅迫下POD(過(guò)氧化物酶)、SOD(過(guò)氧化物歧化酶)、CAT(過(guò)氧化氫酶)活性和MDA(丙二醛)含量[17]。
測(cè)序結(jié)果表明,AhbHLH18 轉(zhuǎn)錄因子的編碼區(qū)(coding sequence,CDS)為585 bp,共編碼194個(gè)氨基酸,與栽培花生基因組(www.peanutbase.org)中的arahy.5IZP5X 序列一致。該基因位于栽培花生第18號(hào)染色體,長(zhǎng)度為1 501 bp。編碼氨基酸中絲氨酸、亮氨酸、賴氨酸含量居前三位,分別為26、22和21個(gè),占比分別為11.16%、9.44%和9.01%。AhbHLH18蛋白的分子量為26.147 k D,等電點(diǎn)為10.27,圖1為其二級(jí)結(jié)構(gòu)。進(jìn)化分析顯示AhbHLH18蛋白質(zhì)與擬南芥同源基因AtbHLH18 蛋白(At2g22750)聚成一支。按照Toledo-Oritiz[15]的分類(lèi)模式,AtbHLH18蛋白屬于14 亞家族,因此AhbHLH18 也屬于bHLH 家族14亞家族 (圖2)。
圖1 AhbHLH18氨基酸序列二級(jí)結(jié)構(gòu)Fig.1 Secondary structure of AhbHLH18 amino acids
圖2 基于擬南芥基因組的AhbHLH18系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 Phylogenetic analyses of AhbHLH18 protein based on bHLH domains from A rabidopsis thaliana
鹽脅迫處理后,AhbHLH18轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)有明顯變化(圖3)。12 h內(nèi),AhbHLH18轉(zhuǎn)錄因子的相對(duì)表達(dá)量處于上升階段,12 h后趨于穩(wěn)定。相比0 h,6 h的相對(duì)表達(dá)量為顯著差異(P<0.05),12~48 h的表達(dá)量為極顯著差異(P<0.01)。
圖3 Ahb HLH 18鹽脅迫處理后表達(dá)模式Fig.3 Expression of Ahb HLH 18 under salt stress
用SacI和XbaI雙酶切載體pCAMBIA2300和PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,T4 連接酶連接,構(gòu)建了植物超表達(dá)載體。利用基因特異引物進(jìn)行PCR 檢測(cè),在轉(zhuǎn)基因擬南芥株系(T3-1與T3-2)中可以擴(kuò)增到約700 bp的條帶,而在野生型擬南芥株系中未見(jiàn)對(duì)應(yīng)條帶(圖4)。RT-PCR 檢測(cè)進(jìn)一步表明,AhbHLH18 在轉(zhuǎn)基因擬南芥中已成功表達(dá) (圖5)。
圖4 轉(zhuǎn)基因擬南芥的PCR 檢測(cè)Fig.4 Detection of transgenic lines A rabidopsis thaliana by PCR
圖5 轉(zhuǎn)基因與野生型(WT)擬南芥RT-PCR 檢測(cè)Fig.5 The transcript level of AhbHLH18 overexpression in transgenic Arabidopsis and wild type(WT)plants assayed by RT-PCR
正常條件下,野生型與轉(zhuǎn)基因擬南芥表型無(wú)差異。鹽脅迫處理10 d后野生型擬南芥表現(xiàn)出更加明顯的萎蔫狀態(tài)(圖6)。正常條件下,野生型與轉(zhuǎn)基因擬南芥中的抗氧化酶、MDA 含量無(wú)顯著差異。鹽脅迫處理后,轉(zhuǎn)基因擬南芥各類(lèi)抗氧化酶如SOD、POD 和CAT 活性顯著高于野生型,野生型擬南芥的MDA 含量則顯著高于轉(zhuǎn)基因擬南芥(圖7)。試驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,抗氧化酶活性的增長(zhǎng)在AhbHLH18基因應(yīng)答鹽脅迫時(shí)發(fā)揮重要作用?;ㄉ鶤hbHLH18基因可調(diào)節(jié)植物體內(nèi)抗氧化酶系統(tǒng)以應(yīng)答鹽脅迫環(huán)境。
圖6 鹽處理轉(zhuǎn)基因與野生型擬南芥Fig.6 Salt-treatment assay of wild type and transgenic Arabidopsis plants
圖7 不同條件野生型擬南芥與轉(zhuǎn)基因擬南芥的生理指標(biāo)變化Fig.7 The change of physiological indexes of the wild type and transgenic Arabidopsis plants under normal and salt stress condition
bHLH 轉(zhuǎn)錄因子家族被認(rèn)為廣泛參與了植物非生物脅迫應(yīng)答活動(dòng),包括干旱脅迫[18-19]、鹽脅迫[22-21]以及低溫脅迫[22-23]。但在花生中,相關(guān)研究仍然缺乏。本研究克隆了花生bHLH 轉(zhuǎn)錄因子AhbHLH18。進(jìn)化分析顯示,AhbHLH18 蛋白質(zhì)與擬南芥AtbHLH18(At2g22750)具有較近的親緣關(guān)系,屬于bHLH 家族14亞族。柑橘CsbHLH18 被認(rèn)為由低溫所誘導(dǎo),過(guò)表達(dá)CsbHLH18顯著提高了柑橘的耐冷性,沉默CsbHLH18則顯著降低了柑橘的耐冷性[24]。通過(guò)植物超表達(dá)載體構(gòu)建,將花生AhbHLH18 基因轉(zhuǎn)入擬南芥中,鹽脅迫試驗(yàn)結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)該基因可提高植株耐鹽性。進(jìn)一步分析,轉(zhuǎn)基因擬南芥鹽脅迫處理后,一些抗氧化酶,如POD、SOD 和CAT 活性顯著高于野生型擬南芥,同時(shí)MDA含量顯著低于野生型擬南芥。結(jié)果顯示,AhbHLH18可通過(guò)調(diào)節(jié)過(guò)氧化物酶系統(tǒng)以降低植株的活性氧(reactive oxygen species,ROS)活性,從而提高植株的耐鹽性。ROS能夠破壞植物細(xì)胞元件,植物的抗逆性很大程度上取決于ROS的產(chǎn)生與消除之間的平衡[25]。研究表明,大量的基因可通過(guò)調(diào)節(jié)抗氧化酶的活性從而提高植株的抗逆性。Magwanga等發(fā)現(xiàn),擬南芥中超表達(dá)CYP450基因,可以提高轉(zhuǎn)基因植株的抗旱性和耐鹽性,轉(zhuǎn)基因植株抗氧化酶活性顯著高于野生型擬南芥[26];通過(guò)提高過(guò)氧化酶活性,轉(zhuǎn)錄因子NtERF172能夠提高煙草抗旱性[27]。除過(guò)氧化酶系統(tǒng)外,bHLH 轉(zhuǎn)錄因子家族成員也可以通過(guò)其他方式影響植株的耐鹽性。AtMYC2 可調(diào)節(jié)Na+/H+轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白NHX 的表達(dá),提高擬南芥耐鹽性[28];水稻bHLH 轉(zhuǎn)錄因子OrbHLH001 通過(guò)調(diào)節(jié)OsAKT1基因的表達(dá)以保持植株鉀離子平衡,從而提高植株的耐鹽性[29]。
現(xiàn)有研究表明,轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控植物分子抗逆機(jī)制是一個(gè)極其復(fù)雜的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò),其中包括整合以及協(xié)同競(jìng)爭(zhēng)作用。下一步的工作應(yīng)該是在這個(gè)動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)中,明確不同bHLH 轉(zhuǎn)錄因子家族成員的精準(zhǔn)角色,從而為通過(guò)基因工程手段充分利用轉(zhuǎn)錄因子提高植物的抗逆性發(fā)揮更大作用。