張藝政 王 念 武天舒 謝軍偉 孫 星
(1.滁州學(xué)院生物與食品工程學(xué)院,安徽 滁州 239000;2.江蘇碧清園食品科技有限公司,江蘇 鹽城 224100)
近年來,隨著養(yǎng)殖科技水平的提升以及人們對(duì)水產(chǎn)品需求的增加,淡水養(yǎng)殖業(yè)得到了蓬勃發(fā)展[1-3]。然而,由于多年來人們一直片面追求產(chǎn)量而忽略質(zhì)量,導(dǎo)致淡水養(yǎng)殖水體的水質(zhì)不斷下降,滋生出諸多淡水魚類致病菌,嚴(yán)重影響淡水魚養(yǎng)殖業(yè)的生產(chǎn)效益[4-5]。使用普通抗生素藥物防治淡水魚類致病菌會(huì)出現(xiàn)諸多問題,如致病菌耐藥性增強(qiáng)、藥物殘留污染環(huán)境、水產(chǎn)品品質(zhì)下降等[6]。因此,尋找到一種高效無污染的防治技術(shù)至關(guān)重要。
生物防治技術(shù)以無污染、成本低、作用時(shí)間長(zhǎng)等優(yōu)勢(shì),逐漸成為魚類病害防治的熱門技術(shù)。其中,海洋來源的微生物因其特殊的生境而具有耐高鹽、耐高壓、寡營(yíng)養(yǎng)等強(qiáng)大的適應(yīng)環(huán)境能力及良好的抑菌作用,被引入諸多生境中用于防治魚類病害[7-9]。筆者從黃海海域采集淺海的海泥與海草等樣品,從中篩選可抑制奇異變形桿菌的菌株,以期為防治淡水魚類致病菌提供更多的理論依據(jù)。
海泥與海草,采自江蘇省連云港市黃海海域海岸線淺海地區(qū);奇異變形桿菌,來自滁州學(xué)院生物與食品工程學(xué)院微生物實(shí)驗(yàn)室。
2216E培養(yǎng)基:蛋白胨5.0 g、酵母膏1.0 g、磷酸高鐵0.1 g、瓊脂15.0~20.0 g、蒸餾水1 000 mL,加熱溶解后121 ℃高壓滅菌15 min,待冷卻至50 ℃倒入無菌平皿備用。
LB液體培養(yǎng)基:胰蛋白胨10.0 g、酵母提取物5.0 g、氯化鈉10.0 g,蒸餾水定容至1 000 mL,pH值約為7.0。
1.3.1 菌株的提取與分離。取少許海草與海泥放入試管,倒入10 mL蒸餾水,充分振蕩;用移液槍吸取1 mL渾濁液滴在2216E培養(yǎng)基上,用滅過菌的涂布棒將渾濁液均勻涂布在培養(yǎng)基表面,放入37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h;將培養(yǎng)基上長(zhǎng)出的菌落根據(jù)形態(tài)分離純化成單菌落,保存于4 ℃冰箱。
1.3.2 抑菌菌株的篩選。用滅過菌的接種環(huán)分別挑取分離出的單菌株及奇異變形桿菌少許菌絲,接種到LB液體培養(yǎng)基中,在180 r/min、37 ℃的恒溫?fù)u床中過夜培養(yǎng);用移液槍吸取1 mL奇異變形桿菌的菌液滴到2216E培養(yǎng)基上,用滅過菌的涂布棒均勻涂開,而后在培養(yǎng)皿中放3張已滅過菌、直徑6 mm的濾紙片,分別吸取分離出的單菌株菌液0.5 mL滴到各濾紙片上。將接種好的單菌株篩選培養(yǎng)皿放入37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,觀察每個(gè)培養(yǎng)基中3個(gè)濾紙片周圍有無抑菌圈,測(cè)量抑菌圈的直徑,取平均值,保留具有明顯抑菌圈、可抑制奇異變形桿菌的菌株。
1.3.3 抑菌菌株的生理生化鑒定。對(duì)篩選出的菌株進(jìn)行形態(tài)觀察,根據(jù)《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》進(jìn)行革蘭氏染色、淀粉水解、分解纖維素、硫化氫反應(yīng)、過氧化氫反應(yīng)、甲基紅反應(yīng)、乙酰甲基醇反應(yīng)和吲哚反應(yīng)等試驗(yàn)。
1.3.4 16S rDNA鑒定。取少量篩選到具有抑菌作用菌株的菌絲,接種到2216E培養(yǎng)液中37 ℃振蕩過夜培養(yǎng)。根據(jù)DNA提取試劑盒推薦步驟,對(duì)菌株的DNA進(jìn)行提取:移取2 mL菌液到EP管中,8 000 rpm/min離心2 min,取沉淀物。根據(jù)細(xì)菌16S rDNA兩端的保守序列,設(shè)計(jì)細(xì)菌通用引物(滁州通用生物有限公司)為PCR擴(kuò)增,引物序列27F:5'-TACCTTGTTACGACTT-3',1492R:5'-ATTAGATACCCTDGTAGTCC-3'。反 應(yīng) 條件:94 ℃預(yù)變性3 min,94 ℃變性30 s,56 ℃退火1 min,72 ℃延長(zhǎng)1.5 min;30個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸5 min。
擴(kuò)增后,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測(cè),取5 μL擴(kuò)增樣品在1%瓊脂糖凝膠上、80 V電壓下進(jìn)行電泳檢測(cè),將條帶清晰、大小正確的目的片段送至通用生物公司進(jìn)行測(cè)序。
1.3.5 序列分析和數(shù)據(jù)處理。測(cè)序完成后,將所測(cè)細(xì)菌16S rRNA基因序列(大約1 500 bp),與在美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)數(shù)據(jù)庫中選取的與這些菌株親緣關(guān)系較近的相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)菌16S rDNA基因序列,用BioEdit的多序列比對(duì)排列軟件進(jìn)行序列比對(duì);用DNASTAR Lasergene軟件建立Neighbour-Joining發(fā)育樹。
筆者從海泥與海草中共分離出32株單菌株,利用奇異變形桿菌對(duì)分離出的菌株進(jìn)行抑菌篩選,僅篩選出一株對(duì)奇異變形桿菌生長(zhǎng)具有良好抑制作用的菌株,編號(hào)為YZ1。菌株YZ1單菌落為乳白色,圓形、全緣、半透明、濕潤(rùn)、易挑取,菌落直徑1.0~1.5 mm,抑菌圈直徑為22.3 mm。
生理生化鑒定結(jié)果表示,菌株YZ1為革蘭氏陽性菌,淀粉水解試驗(yàn)呈陽性,分解纖維素試驗(yàn)呈陰性,硫化氫反應(yīng)呈陽性,在過氧化氫試驗(yàn)中出現(xiàn)氣泡,甲基紅試驗(yàn)呈陰性,乙酰甲基醇試驗(yàn)呈陽性,吲哚反應(yīng)呈陰性(見表1)。
表1 菌株YZ1的生理生化鑒定結(jié)果
提取菌株YZ1的DNA,通過PCR擴(kuò)增目的片段,將目的片段進(jìn)行測(cè)序,利用DNA Star軟件分析目的片段的DNA序列,序列全長(zhǎng)為1 429 bp(見圖1)。
圖1 目的片段DNA序列圖(1 429 bp)
將目的片段的DNA序列在NCBI網(wǎng)站進(jìn)行BLAST比對(duì)(見表2),其中近200株芽孢桿菌(Bacillussp.)的DNA序列與目的片段的DNA序列相似性在99%以上。選擇其中9株相似性較高的菌株序列,利用DNASTAR Lasergene軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(見圖3),發(fā)現(xiàn)菌株YZ1與解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciensstain)M16.s的親緣關(guān)系最為接近,結(jié)合菌株YZ1的生理生化鑒定結(jié)果及采樣地點(diǎn),證明菌株YZ1屬于海洋來源的芽孢桿菌,暫將其命名為Bacillussp.YZ1。
表2 菌株YZ1 DNA序列BLAST比對(duì)結(jié)果
圖2 菌株YZ1的系統(tǒng)進(jìn)化樹
因特殊的生境,海洋源微生物具有獨(dú)特適應(yīng)能力、代謝過程及生理功能,進(jìn)而產(chǎn)生不同于陸地微生物的結(jié)構(gòu),以及新穎、功能獨(dú)特的生物活性物質(zhì)[8],應(yīng)用前景廣泛。筆者通過對(duì)從海泥與海草中分離出的32株菌株進(jìn)行抑菌試驗(yàn),僅發(fā)現(xiàn)一株菌株可抑制奇異變形桿菌生長(zhǎng),編號(hào)為YZ1。筆者初步觀察菌株YZ1的形態(tài)(乳白色,圓形、全緣、半透明、濕潤(rùn)、易挑取,菌落直徑為1.0~1.5 mm);并對(duì)菌株YZ1進(jìn)行生理生化鑒定,發(fā)現(xiàn)其為革蘭氏陽性菌,能水解淀粉,產(chǎn)生硫化氫氣體,分解過氧化氫產(chǎn)生氣泡,但不能分解纖維素和葡萄糖;通過16S rDNA鑒定,其與芽孢桿菌屬在同一物種水平上,與解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciensstain)的親緣關(guān)系最近,初步認(rèn)定菌株YZ1屬于海洋來源的解淀粉芽孢桿菌。此結(jié)果為淡水魚類病原菌的防治提供了一個(gè)可行途徑,但其防治效果和防治機(jī)制還需要進(jìn)一步的研究。