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基于文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的國內(nèi)糖尿病有關(guān)LncRNA研究可視化分析*

2022-08-03 07:26:00林燕英
海峽科學(xué) 2022年6期
關(guān)鍵詞:發(fā)文圖譜編碼

林燕英 陳 剛

(1.福建省醫(yī)學(xué)科學(xué)研究院,福建 福州 350001;2.福建省立醫(yī)院內(nèi)分泌科,福建 福州 350001)

長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一組長度超過200個(gè)核苷酸且沒有蛋白質(zhì)編碼潛力的非編碼RNA,最初被認(rèn)為是沒有生物學(xué)意義的轉(zhuǎn)錄“噪音”。然而,近年的分子生物學(xué)研究顯示,LncRNA可以從多個(gè)層面調(diào)控基因的表達(dá)水平,主要包括表觀遺傳學(xué)調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控三個(gè)層面。LncRNA參與許多生理過程,如細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、細(xì)胞凋亡、腫瘤的遷移及代謝等[1]。糖尿病是最常見的一種代謝紊亂,越來越多的證據(jù)表明,LncRNA在糖尿病及其并發(fā)癥中發(fā)揮關(guān)鍵作用,并有望成為糖尿病新的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)[1]。LncRNA是近年來糖尿病研究領(lǐng)域的一大熱點(diǎn),但目前尚缺乏專業(yè)的文獻(xiàn)計(jì)量工具對糖尿病有關(guān)LncRNA的研究現(xiàn)狀和趨勢進(jìn)行系統(tǒng)分析。引文空間(CiteSpace)軟件是一款科學(xué)文獻(xiàn)計(jì)量和知識(shí)網(wǎng)絡(luò)分析的可視化工具[2],通過豐富的知識(shí)圖譜直觀展示特定領(lǐng)域的研究狀況和相關(guān)熱點(diǎn),近年來已廣泛應(yīng)用于探索各學(xué)科發(fā)展趨勢。本研究利用CiteSpace軟件,對糖尿病有關(guān)LncRNA的歷年中文文獻(xiàn)進(jìn)行知識(shí)圖譜繪制和分析,梳理國內(nèi)該領(lǐng)域研究的發(fā)展脈絡(luò),探討研究熱點(diǎn)和學(xué)術(shù)前沿,以期為潛在的研究人員和機(jī)構(gòu)提供借鑒。

1 資料與方法

1.1 數(shù)據(jù)來源

以中國知網(wǎng)中文總庫為檢索數(shù)據(jù)庫,在“高級(jí)檢索”界面,檢索策略為主題=“長鏈非編碼RNA”或“LncRNA”或“長非編碼RNA”與“糖尿病”,檢索時(shí)間范圍設(shè)定為2021年12月31日之前。共獲得符合檢索條件的文獻(xiàn)363篇,剔除重復(fù)文獻(xiàn)及綜述、meta分析、期刊索引、資訊類和明顯不相關(guān)文獻(xiàn),最終共260篇文獻(xiàn)納入研究。

1.2 方法

應(yīng)用CiteSpace V5.8.R3軟件對糖尿病上述文獻(xiàn)進(jìn)行數(shù)據(jù)梳理和可視化分析。CiteSpace相關(guān)參數(shù)設(shè)置:時(shí)間范圍為2013—2021年,時(shí)間切片為1年,分別以作者、機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞為節(jié)點(diǎn),繪制相應(yīng)的知識(shí)圖譜。以軟件生成的作者共現(xiàn)圖展示該領(lǐng)域的主要作者及作者間的合作情況,以關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖展示研究熱點(diǎn),以關(guān)鍵詞突現(xiàn)圖展示研究前沿。

2 結(jié)果

2.1 時(shí)間分布

在260篇文獻(xiàn)中,最早的一篇發(fā)布于2013年。2013—2021年的文獻(xiàn)量依次為2、3、5、15、26、35、59、44、71篇,僅2020年文獻(xiàn)量有所回落,2021年又明顯升高,總體呈逐年增高趨勢。

2.2 作者、機(jī)構(gòu)分布和合作情況

圖1顯示,N(節(jié)點(diǎn))=200,E(連線)=240,表明這260篇文獻(xiàn)來自200位作者,這些作者間共有240次合作。其中,發(fā)文量最多的作者為孫艷,共發(fā)表5篇;其次是張政,發(fā)表4篇;發(fā)表3篇的有喬程、易紅、李愛玲、王敏和孫倩;其他作者發(fā)文量為1~2篇。根據(jù)普賴斯定律,高產(chǎn)作者最低發(fā)文量=最高產(chǎn)作者發(fā)文量平方根的0.749倍[3],計(jì)算得到本研究高產(chǎn)作者最低發(fā)文量為3篇,則有7位作者滿足這一條件,為高產(chǎn)作者。高產(chǎn)作者總發(fā)文量為24篇,占文獻(xiàn)總數(shù)的9.2%。各團(tuán)隊(duì)節(jié)點(diǎn)間未見明顯連線,可見團(tuán)隊(duì)間缺乏合作,分散性大。260篇文獻(xiàn)共來自119個(gè)研究機(jī)構(gòu),其中發(fā)文2篇的機(jī)構(gòu)有8個(gè),包括中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院腎內(nèi)科、華南理工大學(xué)醫(yī)學(xué)院等,其他機(jī)構(gòu)都僅發(fā)文1篇,機(jī)構(gòu)間有61次合作。

圖1 糖尿病有關(guān)LncRNA研究作者共現(xiàn)圖譜

2.3 關(guān)鍵詞的構(gòu)成和變遷

2.3.1 高頻關(guān)鍵詞

圖2顯示,N(節(jié)點(diǎn))=246,E(連線)=419,表明260篇文獻(xiàn)共有246個(gè)關(guān)鍵詞,這些關(guān)鍵詞間有419次共現(xiàn)。除了本研究的檢索主題長鏈非編碼RNA和糖尿病之外,排名前二十的高頻關(guān)鍵詞依次為糖尿病腎病、2型糖尿病、細(xì)胞凋亡、炎癥、mRNA、糖尿病視網(wǎng)膜病變、基因芯片、細(xì)胞增殖、MALAT1、妊娠期糖尿病、生物信息學(xué)分析、腎小球系膜細(xì)胞、高糖、非編碼RNA、足細(xì)胞、纖維化、基因表達(dá)、氧化應(yīng)激、1型糖尿病、MEG3??梢?,不同類型的糖尿病、糖尿病并發(fā)癥、疾病機(jī)制、基因篩查、LncRNA部分家族成員等是該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。

圖2 糖尿病有關(guān)LncRNA研究的關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜

2.3.2 突現(xiàn)關(guān)鍵詞

不同時(shí)區(qū)的突現(xiàn)關(guān)鍵詞(即引用量激增的關(guān)鍵詞)見圖3。

圖3 糖尿病有關(guān)LncRNA研究的關(guān)鍵詞突現(xiàn)圖譜

2014—2016年的突現(xiàn)關(guān)鍵詞為胰島素合成和分泌、基因芯片、胰腺十二指腸同源盒-1(pancreatic duodenal homology box 1,PDX-1)、LncRNA MAFA;2016—2018年為腎小球系膜細(xì)胞、纖維化、1型糖尿病、信號(hào)通路、微小RNA、生物標(biāo)記物等;2018—2019年為生物信息學(xué)分析、冠心病、LncRNA Dlx6-as1;2019—2021年則為炎癥、吸煙、競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)、非編碼RNA、核因子κB (nuclear factor kappa-B,NF-κB)、愛帕琳受體(APLNR)、LncRNA Arid2-IR,近年的這些突現(xiàn)關(guān)鍵詞代表當(dāng)前國內(nèi)在該領(lǐng)域的研究前沿。

3 討論

3.1 歷年走勢

早在1991年,國際上就有LncRNA的相關(guān)報(bào)道[4],但直到2007年[5]之后,其熱度才開始居高不下。在國內(nèi),LncRNA研究起步較晚,中國知網(wǎng)第一篇有關(guān)LncRNA的文獻(xiàn)發(fā)布于2007年[6],而第一篇糖尿病有關(guān)LncRNA的文獻(xiàn)則發(fā)布于2013年[7]。本文計(jì)量分析結(jié)果顯示,該領(lǐng)域文獻(xiàn)量總體呈逐年上升趨勢,2013—2015年發(fā)展比較緩慢,文獻(xiàn)量均為個(gè)位數(shù);2016—2019年增長相對加快,穩(wěn)步上升;2020年文獻(xiàn)量有所回落,考慮與當(dāng)年突發(fā)新冠肺炎疫情吸引了研究者的部分注意力,使研究力量在研究課題間重新分配有關(guān);2021年又重新回歸上升趨勢。隨著我國社會(huì)的老齡化,作為老年人重要的常見病之一,糖尿病的相關(guān)研究也將得到持續(xù)關(guān)注,糖尿病有關(guān)LncRNA的研究在未來幾年有望得到進(jìn)一步發(fā)展,該領(lǐng)域文獻(xiàn)量將繼續(xù)保持增長趨勢。

3.2 作者和機(jī)構(gòu)分布

文獻(xiàn)計(jì)量結(jié)果顯示,國內(nèi)糖尿病有關(guān)LncRNA領(lǐng)域的研究者不多,只有200人左右,其中發(fā)文量3篇以上的高產(chǎn)作者很少,僅有7位;其中孫艷、張政、易紅、李愛玲等形成的團(tuán)隊(duì)在該領(lǐng)域的研究成果較多,但各作者團(tuán)隊(duì)間缺乏合作,分散性很大。文獻(xiàn)的來源機(jī)構(gòu)眾多,以醫(yī)學(xué)院校附屬醫(yī)院的下屬科室為主,每個(gè)機(jī)構(gòu)都僅有1~2篇的發(fā)文量,機(jī)構(gòu)間雖有61次合作,但大多是兩兩單次合作,未形成多邊、頻繁、緊密的機(jī)構(gòu)間合作??蒲械陌l(fā)展不僅需要相關(guān)領(lǐng)域的研究者有開闊的橫向視野,也需要其在確定科研方向之后潛心深耕,縱向挖掘,才能在該領(lǐng)域形成更多的高產(chǎn)作者及核心作者群;同時(shí),在作者之間、研究團(tuán)隊(duì)之間、研究機(jī)構(gòu)之間需加強(qiáng)交流和合作,破除學(xué)術(shù)壁壘,形成科研合力,才能創(chuàng)造出更多跨團(tuán)隊(duì)、跨機(jī)構(gòu)、多中心的高質(zhì)量科研成果。

3.3 研究熱點(diǎn)

研究熱點(diǎn)指在某一時(shí)間段內(nèi)有內(nèi)在聯(lián)系、數(shù)量相對較多的一組文獻(xiàn)所探討的學(xué)術(shù)或?qū)n}[8]。關(guān)鍵詞是對論文主題的高度概括,共現(xiàn)關(guān)鍵詞可代表某一時(shí)期的研究熱點(diǎn)[9-10]。本文結(jié)果顯示,國內(nèi)糖尿病有關(guān)LncRNA領(lǐng)域歷年的研究熱點(diǎn),除了本研究的檢索主題長鏈非編碼RNA和糖尿病之外,主要涵蓋以下幾個(gè)方面:①不同類型的糖尿病(主要包括2型糖尿病、妊娠期糖尿病、1型糖尿病);②糖尿病并發(fā)癥(主要包括糖尿病腎病、糖尿病視網(wǎng)膜病變);③疾病機(jī)制(主要包括細(xì)胞凋亡、炎癥、細(xì)胞增殖、高糖、纖維化、氧化應(yīng)激等);④LncRNA部分家族成員(主要包括MALAT 1和MEG 3);⑤基因篩查(主要包括基因表達(dá)、基因芯片等);⑥生物信息學(xué)分析。比如,在被引量最高的文獻(xiàn)中,張傳壽等[11]用小鼠LncRNA表達(dá)譜芯片檢測糖尿病db/db小鼠和db/m對照小鼠心肌中LncRNA的表達(dá),并用熒光定量PCR鑒定6個(gè)在糖尿病性心肌中高表達(dá)的代表性LncRNA。結(jié)果顯示,LncRNA AK014842和BF607975在糖尿病性心肌和糖尿病性心肌纖維化細(xì)胞模型中一致上調(diào)表達(dá)。這些研究熱點(diǎn)反映了糖尿病有關(guān)LncRNA領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀,即研究者主要著力于探討LncRNA在糖尿病及其并發(fā)癥中的表達(dá),某些LncRNA家族成員在糖尿病及其并發(fā)癥發(fā)病或治療中的作用機(jī)制及其作為生物標(biāo)志物在臨床診斷中的意義。

3.4 研究前沿

研究前沿是指某一時(shí)間內(nèi)某個(gè)領(lǐng)域中涌現(xiàn)的具有發(fā)展?jié)摿Φ难芯糠较蚝涂茖W(xué)研究中最先進(jìn)、最新的研究主題[13]。某個(gè)領(lǐng)域一段時(shí)間內(nèi)的研究前沿可以通過突現(xiàn)關(guān)鍵詞來反映,突現(xiàn)關(guān)鍵詞指的是在這段時(shí)間內(nèi)被頻繁引用的某些詞匯[10]。文獻(xiàn)計(jì)量結(jié)果顯示,隨著糖尿病有關(guān)LncRNA研究的深入,研究主題越來越多元化,并出現(xiàn)了一些被引量突然激增的關(guān)鍵詞。早期僅出現(xiàn)少量的突現(xiàn)關(guān)鍵詞,涉及胰腺生理和小部分LncRNA家族成員;中期突現(xiàn)關(guān)鍵詞數(shù)量明顯增多,涉及不同類型糖尿病及并發(fā)癥、疾病機(jī)制、更多的LncRNA家族成員、生物信息學(xué)分析等;近年的突現(xiàn)關(guān)鍵詞得到進(jìn)一步豐富,除了涉及基因篩查、機(jī)制、LncRNA家族成員等之外,還增加了危險(xiǎn)因素、基因功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等方面的主題,這些主題是目前國內(nèi)糖尿病有關(guān)LncRNA的研究前沿。比如,在近年引用量較高的文獻(xiàn)中,林曉等[14]報(bào)道黃芪三七合劑治療后的小鼠腎功能得到一定程度的恢復(fù),炎癥因子表達(dá)呈現(xiàn)劑量依賴性下降,LncRNA Arid2-IR和NF-κB及其下游分子的表達(dá)下調(diào),表明黃芪三七合劑可有效減輕糖尿病腎病小鼠的腎炎癥反應(yīng),其機(jī)制可能與調(diào)節(jié)Arid2-IR/NF-κB信號(hào)軸有關(guān)。該文獲得較多的關(guān)注和引用,可能與其涉及炎癥、NF-κB、LncRNA Arid2-IR等多個(gè)前沿主題有關(guān)。根據(jù)知識(shí)圖譜突現(xiàn)關(guān)鍵詞的發(fā)展勢頭,可以看出前沿主題熱度不減,并將受到該領(lǐng)域?qū)W者的持續(xù)關(guān)注和重視。

綜上所述,本文利用CiteSpace對國內(nèi)糖尿病有關(guān)LncRNA的研究脈絡(luò)進(jìn)行了系統(tǒng)梳理,通過知識(shí)圖譜直觀展示該領(lǐng)域研究的年度走勢、作者及機(jī)構(gòu)分布、研究熱點(diǎn)和前沿主題,以幫助研究人員和機(jī)構(gòu)洞察該領(lǐng)域的發(fā)展趨勢,發(fā)現(xiàn)更有價(jià)值和潛力的研究方向,為后續(xù)研究課題的構(gòu)思和設(shè)計(jì)提供一定的參考。

由于本文僅搜集中國知網(wǎng)總庫收錄的中文文獻(xiàn),可能遺漏該數(shù)據(jù)庫未收錄的小部分中文文獻(xiàn);同時(shí),未納入國內(nèi)外發(fā)布的外文文獻(xiàn),暫未對糖尿病有關(guān)LncRNA的國際研究動(dòng)態(tài)和趨勢進(jìn)行分析,尚無法掌握該領(lǐng)域的研究全貌。有待后續(xù)進(jìn)一步搜集國內(nèi)外文獻(xiàn)資料,對該領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀和趨勢做更全面的文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)分析,為研究者提供更有價(jià)值的借鑒和指引。

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