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CircRNA EZH2 通過調(diào)控miR-30c-5p 促進前列腺癌細胞增殖和遷移

2022-07-30 13:22:56段元鵬張國穎畢城偉楊李波施致裕張建朋
昆明醫(yī)科大學學報 2022年7期
關鍵詞:熒光素酶前列腺癌抑制劑

趙 斌 ,段元鵬 ,張國穎 ,畢城偉 ,楊李波 ,施致裕 ,楊 勇 ,張建朋 ,高 婷

(1)云南省腫瘤醫(yī)院泌尿外科,云南 昆明 650118;2)云南財經(jīng)大學校醫(yī)院,云南 昆明 650021)

前列腺癌是全球男性中最常見的癌癥之一[1],轉(zhuǎn)移性前列腺癌的5 a 生存率僅為31%,且復發(fā)及晚期前列腺癌通常被認為是無法治愈的[2]。在世界較發(fā)達地區(qū),前列腺癌的發(fā)病率最高[3],相比之下,亞洲男性的發(fā)病率低于全球水平,但前列腺癌仍然是影響男性健康的一個重大醫(yī)學問題。因此,闡明前列腺癌的基因機制,尋找新的診斷和治療的生物標志物至關重要。

CircRNA 是一類內(nèi)源性非編碼RNA,源自前體mRNA 反向剪接,其通過3' 和5' 端反向剪接形成共價閉合結構。近年來,在各種生物體中已鑒定出數(shù)以千計的circRNA,并發(fā)現(xiàn)他們在許多疾病中發(fā)揮著關鍵作用,尤其是癌癥,circRNA可以參與癌證的諸多病理生理過程,包括細胞增殖、遷移、侵襲和凋亡[4-6]。然而,目前有關circRNA 在前列腺癌中的報道較少。Wen 等[7]發(fā)現(xiàn)circRNA EZH2 與膠質(zhì)瘤細胞增殖、遷移和侵襲相關。但circRNA EZH2 在前列腺癌中的作用和機制尚不清楚。

微小RNA(miRNA)是一類長度約22 個核苷酸的非編碼小RNA,在調(diào)節(jié)細胞周期、細胞增殖和凋亡以及腫瘤發(fā)展中起著關鍵作用。MiR-30c-5p 是多種惡性腫瘤進展的關鍵調(diào)控基因,在非小細胞肺癌[8]、大腸癌[9]、胰腺癌[10]等疾病中均有報道。CircRNA 和miRNA 的相互作用在癌癥發(fā)生和發(fā)展中起重要作用。本研究旨在為解釋circRNA EZH2 調(diào)控miR-30c-5p 在前列腺癌中的作用機制提供理論依據(jù),同時將為前列腺癌的診斷和治療提供新的生物標志物和靶點。

1 材料與方法

1.1 細胞系及主要試劑

人前列腺癌細胞系LNCaP(貨號CL-0143)、人正常前列腺上皮細胞RWPE1(貨號CL-0200)、人胚腎細胞HEK-293(貨號CL-0001)購自武漢Procell 公司;RPMI1640 培養(yǎng)基、青鏈霉素雙抗、谷氨酰胺、胎牛血清、胰酶均購自美國Gibco 公司;CCK-8 試劑盒購自上海東仁化學公司,劃痕插件購自德國IBIDI 公司;riboFECT? CP 轉(zhuǎn)染試劑購自廣州銳博生物公司;circRNA EZH2 的siRNA(si-circRNA EZH2)、siRNA 陰性對照(si-NC)、miR-30c-5p inhibitors 序列由廣州銳博生物公司合成;Trizol 試劑盒購自美國 Life technologies 公司,F(xiàn)astKing RT Kit (With gDNase)FastKing cDNA 第一鏈合成試劑盒購自北京天根公司,ECL 顯影液購自美國Millipore 公司;RIPA 裂解液、BCA 蛋白濃度測定試劑盒、SDSPAGE 蛋白上樣緩沖液均購自碧云天;雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒、JAK1、PI3K 抗體購自英國abcam 公司;GAPDH 抗體、HRP 標記的IgG二抗購自美國CST 公司。熒光素酶載體購自上海海吉浩格生物科技有限公司;Lipofectamine?3000、購自美國Thermo 公司;RNase R 購自廣州吉賽公司。

1.2 生物信息學分析

在癌癥基因組圖譜(TCGA)[11]數(shù)據(jù)庫(https://portal.gdc.cancer.gov/)中獲取數(shù)據(jù)對前列腺癌旁和腫瘤組織中的circRNA EZH2 表達差異進行分析,中位數(shù)作為閾值區(qū)分高低表達。用Kaplan-Meier曲線檢測circRNA EZH2 與前列腺癌進展的時間相關性,起點事件為手術切除;終點事件為死亡;刪失數(shù)據(jù)為失訪、死于其他疾病、觀察結束時病人尚存活。Logrank 法檢驗及單因素預后分析,Cox 風險比例模型多因素預后分析。用starBase v2.0 篩選下游靶基因。

1.3 細胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染

用含10% FBS、1%雙抗和1%谷氨酰胺的RPMI 1640 培養(yǎng)基,于37 ℃、5% CO2恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)LNCaP 細胞。待細胞匯合度達80%時,將細胞接種至6 孔培養(yǎng)板,每孔接種5×104個細胞,過夜培養(yǎng)。細胞分為:對照組、陰性對照組、si-circRNA EZH2 組、si-circRNA EZH2 和miR-30c-5p inhibitors 聯(lián)合應用組。參照riboFECT?CP 轉(zhuǎn)染試劑說明書進行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染前,對照組更換為無雙抗的RPMI 1640 培養(yǎng)基;陰性對照組更換為含si-NC(50 nM)的RPMI 1640 培養(yǎng)基;sicircRNA EZH2 組更換為含si-circRNA EZH2(50 nM)的RPMI 1640 培養(yǎng)基;si-circRNA EZH2和miR-30c-5p inhibitors 聯(lián)合應用組更換為含sicircRNA EZH2(50 nM)和miR-30c-5p inhibitors的RPMI 1640 培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48 h。

1.4 CCK-8 法檢測細胞增殖能力

接種LNCaP 細胞至96 孔板內(nèi),另接種3 孔LNCaP 細胞正常培養(yǎng)作為CCK-8 對照組,每孔接種2 500 個細胞,每組3 個孔重復。RPMI1640培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)48 h 后,每孔加入10 μLCCK-8試劑,在培養(yǎng)箱內(nèi)孵育2 h 后,于酶標儀450 nm波長下檢測吸光度。

1.5 劃痕實驗檢測細胞遷移能力

接種LNCaP 細胞至IBIDI 插件內(nèi),每孔接種5×104個細胞,使用RPMI 1640 培養(yǎng)基在37 ℃、5% CO2恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待匯合度達80%時,移除劃痕插件,于0 h 和24 h 時間點觀察劃痕寬度,在倒置顯微鏡下拍攝記錄。

1.6 RT-qPCR 檢測細胞中相關 circRNA、miRNA 及JAK1 的mRNA 表達水平

按照TRIZOL 法提取LNCaP 細胞中的總RNA,測量RNA 濃度后,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA 第一條鏈。根據(jù)qPCR 試劑盒說明書對cDNA 進行擴增。引物序列見表1。反應體系為10 μL,反應條件:95 ℃ 10 min,95 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s,共進行45個循環(huán)。以GAPDH 作為circRNA EZH2 和JAK1的內(nèi)參,以U6 作為miR-30c-5p 的內(nèi)參,運用2-ΔΔCt法進行定量分析。

表1 RT-qPCR 所需引物序列Tab.1 Primer sequences

1.7 Western blot 實驗檢測細胞中JAK1 和PI3K 的表達水平

JAK1 信號在癌癥中常被激活[12],于是筆者檢測了circRNA EZH2 對其是否有調(diào)控。加入RIPA 裂解液和蛋白酶抑制劑,從LNCaP 細胞中提取總蛋白,用BCA 蛋白濃度測定試劑盒進行定量。樣品中的蛋白采用SDS-PAGE 分離并濕轉(zhuǎn)移至PVDF 膜上,BSA 封閉后加入JAK1(1∶1 000)和PI3K(1∶1 000)一抗,在4 ℃下孵育過夜。二抗(1∶2 000)室溫孵育1 h,使用ECL 顯影液曝光。使用Image J 軟件測定灰度值。

1.8 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒?/h3>

將circRNA EZH2 的野生型(WT)或突變型(MUT)3’-UTR 克隆到pGL3 啟動子熒光素酶載體。按照制造商說明,使用Lipofectamine?3000用miR-30c-5p mimic 和circRNA EZH2 或其突變體轉(zhuǎn)染HEK-293 細胞。48 h 后通過雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒檢測熒光素酶活性。

1.9 RNase R 處理

總RNA(2 μg)在37 ℃下與3 U/mg RNase R共同孵育15 min。qRT-PCR 檢測circRNA EZH2的表達。

1.10 統(tǒng)計學處理

通過 Graph-Pad Prism 9 軟件(GraphPad Software,San Diego,CA) 進行 Kolmogorov-Smirnov 檢驗數(shù)據(jù)的正態(tài)性。正態(tài)分布的連續(xù)性變量均以平均數(shù)±標準差(mean±SD)表示,并通過Graph-Pad Prism 9 軟件進行統(tǒng)計分析。組間比較采用單因素方差分析,如有差異進一步用Tukey's 檢測兩兩比較,P< 0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1 circRNA EZH2 在前列腺癌中高表達

首先通過TCGA 數(shù)據(jù)庫評估了circRNA EZH2 在499 例前列腺癌腫瘤樣本和52 例癌旁組織中的表達,腫瘤樣本中位數(shù)為2.504,癌旁組織中位數(shù)為1.483,發(fā)現(xiàn)circRNA EZH2 在前列腺癌組織中顯著高表達(P< 0.01,圖1A)。此外,對TCGA 數(shù)據(jù)庫中的前列腺癌樣本進行Kaplan-Meier 分析結果顯示,前列腺癌患者中,circRNA EZH2 表達水平較高的患者(250 例)相較于circRNA EZH2 表達水平較低的患者(249 例)生存率更低(圖1B)。RT-qPCR 結果顯示,circRNA EZH2 在前列腺癌LNCaP 細胞中的表達較人前列腺上皮細胞RWPE1 中更高(P< 0.001,圖1C)。這些數(shù)據(jù)表明circRNA EZH2 在前列腺中過表達,并且circRNA EZH2 高表達與前列腺癌的進展和不良預后相關。

圖1 CircRNA EZH2 在前列腺癌中高表達Fig.1 circRNA EZH2 in prostate cancer

2.2 CircRNA EZH2 環(huán)狀結構的驗證

通過RNase R 酶切實驗,證實了circRNA EZH2 具有高度保守的環(huán)狀結構,結果顯示,線性EZH2 被RNase R 酶切,而circRNA EZH2 沒有被酶切(P< 0.001),見圖2。

圖2 qRT-PCR 檢測LNCaP 細胞總RNA 經(jīng)RNase R處理后circRNA EZH2 及線性EZH2 的表達Fig.2 qRT-PCR detected the expression of circRNA EZH2 and linear EZH2 after RNase treatment total RNA from LNCaP cells

2.3 敲降circRNA EZH2 抑制前列腺癌細胞增殖和遷移

在LNCaP 細胞中通過轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2成功下調(diào)circRNA EZH2 的表達,且轉(zhuǎn)染si-NC未改變circRNA EZH2 的表達(P< 0.000 1,圖3A)。CCK-8 檢測表明,轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 可抑制LNCaP 細胞的增殖(P< 0.000 1,圖3B),使其生長密度降低(圖3D)。此外,劃痕實驗表明,轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 后,LNCaP 細胞的遷移明顯減弱(P< 0.000 1,圖3C、3E)。以上數(shù)據(jù)表明,circRNA EZH2 促進LNCaP 細胞的增殖和遷移。

圖3 CircRNA EZH2 對前列腺癌細胞增殖和遷移的影響Fig.3 The effects of circRNA EZH2 on proliferation and migration of prostate cancer cells

2.4 circRNA EZH2 靶向調(diào)控miR-30c-5p

通過CircBase、StarBase 等數(shù)據(jù)庫進行預測發(fā)現(xiàn)circRNA EZH2 具有hsa-miR-30c-5p 結合位點,推測circRNA EZH2 可能與miR-30c-5p 有相互作用(圖4A)。雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示,miR-30c-5p 顯著降低了WT-circRNA EZH2 的熒光素酶活性(P< 0.000 1,圖4B)。通過RT-qPCR實驗對miR-30c-5p 抑制劑效果進行驗證,結果顯示與對照組和過表達組相比,miR-30c-5p 抑制劑顯著降低了miR-30c-5p 的表達(P< 0.001,圖4C)。RT-qPCR 實驗顯示,在轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 的LNCaP 細胞中miR-30c-5p 表達顯著上調(diào),轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 和miR-30c-5p 抑制劑后,miR-30c-5p 的表達與僅轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 組相比明顯降低(P<0.000 1,圖4D)。而circRNA EZH2 的表達受miR-30c-5p 抑制劑影響不明顯(P< 0.000 1,圖4E),猜測miR-30c-5p 可能是circRNA EZH2 的下游靶基因。

圖4 CircRNA EZH2 靶向miR-30c-5pFig.4 CircRNA EZH2 targeted miR-30c-5p

2.5 circRNA EZH2/miR-30c-5p 軸調(diào)控前列腺癌細胞增殖和遷移

CCK-8(P< 0.000 1,圖5A)和細胞培養(yǎng)顯微鏡觀察(圖5B)顯示,miR-30c-5p 抑制劑的加入下調(diào)了轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 對LNCaP 細胞增殖的抑制,且細胞增殖能力恢復至較control 組和si-NC 組無顯著差異。此外,LNCaP 細胞的遷移能力也在抑制miR-30c-5p后恢復(P< 0.000 1,圖5C、5D)。上述實驗結果說明circRNA EZH2可以通過調(diào)控miR-30c-5p 的表達來調(diào)控LNCaP細胞增殖和遷移。

圖5 CircRNA EZH2 調(diào)控miR-30c-5p 軸對前列腺癌細胞增殖和遷移的影響Fig.5 CircRNA EZH2 regulated cell proliferation and migration via miR-30c-5p in prostate cancer cell

2.6 circRNA EZH2 調(diào)控JAK1 和PI3K 信號通路

RT-qPCR 結果顯示(P< 0.000 1,圖6A),sicircRNA EZH2 的轉(zhuǎn)染使JAK1 的表達顯著下調(diào),而si-circRNA EZH2 轉(zhuǎn)染后加入miR-30c-5p 抑制劑使JAK1 的表達相較于僅轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 組顯著上調(diào),Western blot 實驗也得到同樣的結果(P< 0.000 1,圖6B、6C)。Western blot 結果顯示,轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 后PI3K 的表達下調(diào),而同時轉(zhuǎn)染si-circRNA EZH2 和miR-30c-5p 抑制劑后PI3K 的表達水平高于僅轉(zhuǎn)染sicircRNA EZH2 組(P< 0.005,圖6B、6D)。這表明PI3K 信號與circRNA EZH2 的高表達正相關,且受miR-30c-5p 的負調(diào)控。

圖6 CircRNA EZH2 對JAK1 和PI3K 的調(diào)控Fig.6 CircRNA EZH2 regulated JAK1 and PI3K

3 討論

CircRNA 豐富而保守,而且與大多數(shù)其他線性RNA 相比,circRNA 更加穩(wěn)定,因此circRNA可作為有效的生物標志物和治療靶點。目前關于circRNA EZH2 的研究較少,在已有報道中,circRNA EZH2 能通過NF-κB 通路調(diào)節(jié)豬腸上皮細胞的炎癥反應[13];circRNA EZH2 在膠質(zhì)瘤中可作為miR-1 265 的海綿調(diào)控DDAH1 和CBX3 的表達[14]。因此,circRNA EZH2 的失調(diào)可能在調(diào)節(jié)人類癌癥的進展中起重要作用。本研究中,筆者發(fā)現(xiàn)circRNA EZH2 在前列腺癌組織中高表達,并證明circRNA EZH2 在前列腺癌細胞中過表達且與癌癥發(fā)展相關。Kaplan-Meier 分析表明,circRNA EZH2 過表達與前列腺癌患者的生存率降低顯著相關。功能缺失實驗表明,circRNA EZH2在前列腺癌細胞中促進其增殖和遷移。在機制上,circRNA EZH2 通過調(diào)控miR-30c-5p 來調(diào)控JAK1 的表達并激活PI3K 信號通路。這些發(fā)現(xiàn)為了解circRNA EZH2 在前列腺癌進展中的致癌作用提供了見解,并表明circRNA EZH2 可能是前列腺癌預后和治療的生物標志物。

已經(jīng)證明,circRNA 可以和miRNA 相互作用,以發(fā)揮生物學功能。筆者的結果證明,circRNA EZH2 能夠調(diào)控miR-30c-5p 的表達,進而調(diào)控下游基因JAK1 的表達,促進前列腺癌生長。JAK1是Janus 激酶家族成員之一,在多種類型的細胞中表達。它在許多腫瘤,包括前列腺癌的發(fā)展中有重要作用,并在轉(zhuǎn)移性癌癥進展中起關鍵作用[12]。在筆者的實驗中,沉默circRNA EZH2 能下調(diào)JAK1的mRNA 和蛋白表達,這表明circRNA EZH2 可能作為一種JAK1 抑制劑在前列腺癌的治療中發(fā)揮作用。

本研究本研究的另一個重要發(fā)現(xiàn)是circRNA EZH2 可以激活磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)信號。PI3K 的信號傳導與人類腫瘤進展、腫瘤微血管密度增加以及癌細胞的趨化性和侵襲潛力顯著相關,PI3K 的突變在常見的人類癌癥中經(jīng)常發(fā)生[15],被認為是癌癥治療的關鍵靶點之一。筆者推測circRNA EZH2 在前列腺癌中的調(diào)控作用可能與PI3K 信號有關,并在LNCaP 細胞中檢測了circRNA EZH2 是否對PI3K 信號有影響。PI3K 信號通路在許多癌癥的發(fā)展中起著關鍵作用,在前列腺癌中也經(jīng)常被異常激活,尤其是在轉(zhuǎn)移性前列腺癌中[16]。PI3K 信號的過度激活促進了前列腺癌的增殖,轉(zhuǎn)移和復發(fā)。例如,miR-133a-3p 下調(diào)激活的PI3K 信號能促進前列腺癌骨轉(zhuǎn)移[17]。雄激素剝奪療法是治療前列腺癌的一種主要方法,然而,大多數(shù)患者會對雄激素剝奪產(chǎn)生抵抗力,從而導致腫瘤持續(xù)生長,患者死亡率上升[18]。PI3K 信號通路的激活能夠重新連接雄激素受體的信號傳導,從而減少腫瘤對雄激素的需求,以促進前列腺癌生長[19]。筆者發(fā)現(xiàn)circRNA EZH2 的抑制下調(diào)了PI3K 信號的表達,相反的是,miR-30c-5p 的抑制激活了PI3K 信號。這些結果闡明了circRNA EZH2 可作為PI3K 通路的調(diào)節(jié)劑,并可作為干預前列腺癌的潛在靶標。

總而言之,本研究發(fā)現(xiàn)circRNA EZH2 在前列腺癌組織中上調(diào),并有助于前列腺癌進展。circRNA EZH2 的缺失可影響miR-30c-p 的功能,下調(diào)JAK1 表達并干擾PI3K 信號通路,從而抑制前列腺癌細胞的增殖和遷移。綜上,circRNA EZH2 可能作為前列腺癌過程中的致癌基因,為前列腺癌的診斷和治療提供潛在靶標。

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