藍(lán)康澍 雷柞 何祎雯 高龍?chǎng)?潘傳英 王勇勝*

（1，西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院 712100；2，西北農(nóng)林科技大學(xué)圖書(shū)館 712100；3，西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院 712100）

微小RNA（microRNA，miRNA）是一種內(nèi)源性、長(zhǎng)度為18～25 個(gè)核苷酸的非編碼單鏈RNA。1993 年Lee 等首次在其研究中提到Lin-4（miRNA 的一種），由此拉開(kāi)了對(duì)miRNA 研究的序幕[1]。近年來(lái)，miRNA 被證實(shí)與多種癌癥有關(guān)[2]，因此，逐漸引起人們的重視。miRNA 的出現(xiàn)使得對(duì)癌癥早期診斷和治療成為可能，因此，近年來(lái)，miRNA 一直是癌癥相關(guān)研究的熱點(diǎn)，關(guān)于miRNA 與癌癥發(fā)生機(jī)制的研究層出不窮[3]。但目前對(duì)miRNA 的研究只是冰山一角，對(duì)其作用機(jī)制還存在許多未知，加快對(duì)miRNA 的研究有助于進(jìn)一步了解腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程及其治療手段。

文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)（Bibliometrics）是一門(mén)采用數(shù)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)研究文獻(xiàn)等計(jì)量指標(biāo)進(jìn)行分析，以對(duì)某個(gè)領(lǐng)域進(jìn)行有效可視化，進(jìn)而幫助科研人員分析領(lǐng)域整體趨勢(shì)，為該領(lǐng)域的后續(xù)發(fā)展提供不同見(jiàn)解的學(xué)科[4]。文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)最早的應(yīng)用可追溯到18世紀(jì)，科研人員利用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)完成對(duì)某一領(lǐng)域的基礎(chǔ)文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)。隨著文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)在越來(lái)越多的領(lǐng)域應(yīng)用，以及使用越趨成熟，文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的內(nèi)容已從簡(jiǎn)單的數(shù)理統(tǒng)計(jì)發(fā)展為使用可視化軟件對(duì)計(jì)量指標(biāo)進(jìn)行分析以達(dá)到解析研究熱點(diǎn)和預(yù)測(cè)發(fā)展趨勢(shì)[5,6]。

目前，國(guó)內(nèi)外尚未有學(xué)者對(duì)miRNA 相關(guān)論文發(fā)表進(jìn)行系統(tǒng)分析，因此，miRNA 相關(guān)研究趨勢(shì)及論文發(fā)表情況仍不明確。本文從文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的角度，基于Web of science（WOS）和中國(guó)知網(wǎng)（CNKI）數(shù)據(jù)庫(kù)，首次對(duì)20 世紀(jì)以來(lái)miRNA 的相關(guān)論文進(jìn)行分析，結(jié)合Excel 2019、Citespace 5.6[7]和GraphPad Prism 9.3.0[8]等軟件，從論文發(fā)表量、國(guó)家、作者、研究領(lǐng)域等方面進(jìn)行動(dòng)態(tài)分析，旨在為未來(lái)miRNA 相關(guān)研究提供全新方向及思路。

1 數(shù)據(jù)來(lái)源及研究方法

國(guó)際miRNA 論文發(fā)表概況分析以WOS 數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)，對(duì)20 世紀(jì)以來(lái)發(fā)表的相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行可視化分析；國(guó)內(nèi)miRNA論文發(fā)表概況則以CNKI 數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)，同樣以2000～2021 年作分析區(qū)間，將miRNA 研究概況具體化。

1.1 國(guó)際論文數(shù)據(jù)來(lái)源

數(shù)據(jù)源于WOS 核心合集（Web of Science Core Collection），檢索方式為高級(jí)檢索-檢索式：TI=（miRNA OR microRNA），索引日期為：2000-01-01 至2021-12-31，檢索日期為2022 年2 月5 日，共檢索出56284 條SCI 論文，其中有23939 篇來(lái)自國(guó)內(nèi)（通過(guò)添加國(guó)際/地區(qū)篩選條件）。對(duì)論文發(fā)表的國(guó)家/地區(qū)和發(fā)表論文質(zhì)量進(jìn)行進(jìn)一步分析。

1.2 國(guó)內(nèi)論文數(shù)據(jù)來(lái)源

由于WOS 數(shù)據(jù)庫(kù)不太收錄中文論文，而我國(guó)部分論文都發(fā)表在中文期刊，因此，對(duì)CNKI 數(shù)據(jù)庫(kù)上的論文進(jìn)行分析，有助于我們更進(jìn)一步了解國(guó)內(nèi)miRNA 相關(guān)研究進(jìn)展。

在知網(wǎng)中進(jìn)行專(zhuān)業(yè)檢索，檢索式為：TI=‘miRNA’ +‘microRNA’+‘微小RNA’+‘微RNA’，檢索區(qū)間與WOS 中檢索區(qū)間一致，為2000-01-01 至2021-12-31，檢索日期為2022 年2 月5 日，共檢索出論文25541 篇，對(duì)結(jié)果進(jìn)行可視化分析，進(jìn)一步得出結(jié)論。

1.3 分析及研究方法

在Web of Science 和中國(guó)知網(wǎng)上對(duì)相關(guān)關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索，使用網(wǎng)站的可視化分析功能對(duì)文章發(fā)表情況（如發(fā)表主題、國(guó)家等）進(jìn)行初步分析，再將數(shù)據(jù)導(dǎo)出至Excel 2019 軟件中進(jìn)行整理。通過(guò)網(wǎng)站輸出的數(shù)據(jù)，利用Citespace 5.6 軟件進(jìn)行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類(lèi)分析：從Web of Science 中導(dǎo)出數(shù)據(jù)（文件格式為txt）后，將Citespace 界面的node types 選定為“Keyword”，時(shí)間區(qū)間設(shè)為“2000～2021”，時(shí)間切片設(shè)為1。在進(jìn)行正式分析前對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)試驗(yàn)分析，界面中Top N%（表示每個(gè)時(shí)間切片引用次數(shù)最多的前N%）設(shè)定為10.0，由于文獻(xiàn)數(shù)量太多，分析結(jié)果的節(jié)點(diǎn)過(guò)大且圖譜雜亂交錯(cuò)，最終選定適宜設(shè)定值為1.0。

2 結(jié)果

2.1 國(guó)際發(fā)表論文概況

分析結(jié)果顯示，自20 世紀(jì)以來(lái)，miRNA 相關(guān)SCI 論文發(fā)表趨勢(shì)是先上升后下降。2001～2019 年，miRNA 相關(guān)論文的發(fā)表數(shù)量大幅度提升；但在2019 年后，miRNA 相關(guān)論文的發(fā)表數(shù)量明顯下降，如圖1。

圖1 WOS 數(shù)據(jù)庫(kù)20 世紀(jì)以來(lái)miRNA 相關(guān)論文發(fā)表量變化

從研究方向看，腫瘤學(xué)以12146 篇相關(guān)論文在所有miRNA 相關(guān)SCI 論文中占比最大（21.58%），遠(yuǎn)超于第二名生物化學(xué)/分子生物學(xué)（相關(guān)論文7985，占總發(fā)表論文數(shù)的14.187%）和第三名細(xì)胞生物學(xué)（相關(guān)論文7266 篇，占總發(fā)表論文數(shù)12.91%）。

在miRNA 相關(guān)論文發(fā)表的國(guó)家中，中國(guó)以23939 篇占總發(fā)表論文的42.53%，遠(yuǎn)超于第二名的美國(guó)（發(fā)表論文14445篇，占總發(fā)表論文的25.66%）和第三名的德國(guó)（發(fā)表論文2841篇，占總發(fā)表論文的5.09%），見(jiàn)表1；此外，在發(fā)表miRNA相關(guān)論文的作者中，發(fā)表論文數(shù)前十名都來(lái)自我國(guó)；在基金資助機(jī)構(gòu)方面，我國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)資助相關(guān)論文10500 篇，占所有論文數(shù)的18.66%，見(jiàn)表2。

表1 國(guó)際miRNA 相關(guān)論文發(fā)表數(shù)Top 10 國(guó)家

表2 國(guó)際miRNA 相關(guān)論文發(fā)表數(shù)Top 5 基金資助機(jī)構(gòu)

論文發(fā)表數(shù)量不能作為單一衡量指標(biāo)，所發(fā)表論文的質(zhì)量也需要受到重視。為更準(zhǔn)確衡量國(guó)家之間miRNA 發(fā)表論文的質(zhì)量，筆者通過(guò)添加“高被引論文or 熱點(diǎn)論文”和“國(guó)家/地區(qū)”條件進(jìn)行進(jìn)一步分析，發(fā)現(xiàn)我國(guó)發(fā)表的文章篇均被引頻次為207.52 次，h 因子（h-index，h 因子為N 則表示有N 篇論文分別被引用了至少N 次）達(dá)99，與其他兩個(gè)論文發(fā)表數(shù)前三的國(guó)家相比仍有一定差距；美國(guó)發(fā)表miRNA 相關(guān)SCI 論文篇均被引頻次為364.82，h 因子為127；德國(guó)發(fā)表miRNA 相關(guān)SCI 論文篇均被引頻次為370.38，h 因子為42。

2.2 國(guó)內(nèi)發(fā)表論文概況

根據(jù)CNKI 數(shù)據(jù)庫(kù)可視化分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)，2006 年以前，我國(guó)miRNA 有關(guān)中文論文發(fā)表數(shù)量較少，每年發(fā)表數(shù)量均在100 篇以下，2006 年以后論文發(fā)表數(shù)進(jìn)入增長(zhǎng)期，2018 年論文發(fā)表數(shù)出現(xiàn)短暫下降，但總體保持穩(wěn)定；2019 年后，論文發(fā)表數(shù)量明顯下降，參見(jiàn)圖2。由此可見(jiàn)，基于CNKI 數(shù)據(jù)庫(kù)論文可視化的分析，我國(guó)發(fā)表在中文期刊的miRNA 相關(guān)論文數(shù)量變化趨勢(shì)與國(guó)際miRNA 相關(guān)SCI 論文發(fā)表變化趨勢(shì)大致一致。

圖2 20 世紀(jì)以來(lái)中文期刊miRNA 相關(guān)論文發(fā)表數(shù)量趨勢(shì)

從論文主要主題分布情況看，除去miRNA 本身名稱(chēng)主題（miRNA、miRNAs、微RNAs 等），我國(guó)對(duì)miRNA 的研究主題主要為靶基因、差異表達(dá)、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞增殖等；“靶基因”關(guān)鍵詞占比較高的原因是近年來(lái)許多研究人員都開(kāi)始將重點(diǎn)放在具體miRNA 的靶基因預(yù)測(cè)和挖掘上，如梁學(xué)振等[9]和張寧芳等[10]的研究，以及高陽(yáng)[11]對(duì)miR-202 的靶基因預(yù)測(cè)以進(jìn)一步miR-202 對(duì)早期胚胎影響的研究?！安町惐磉_(dá)”主題體現(xiàn)了miRNA 的差異表達(dá)對(duì)細(xì)胞生理過(guò)程及疾病過(guò)程的影響，如曲蕾對(duì)miR-202 差異表達(dá)的研究[12]。而“細(xì)胞凋亡”“細(xì)胞增殖”等代表miRNA 通過(guò)調(diào)節(jié)不同靶基因表達(dá)而形成的影響。

從學(xué)科分布看，發(fā)表在中文期刊的miRNA 相關(guān)論文大多都與腫瘤學(xué)相關(guān)，腫瘤學(xué)以10435 篇論文處于絕對(duì)數(shù)量?jī)?yōu)勢(shì)，甚至超過(guò)其他前五名學(xué)科發(fā)表論文數(shù)的總和（心血管系統(tǒng)疾病相關(guān)論文2310 篇，生物學(xué)相關(guān)論文2196 篇，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)相關(guān)論文1678 篇，婦產(chǎn)科學(xué)相關(guān)論文1385 篇），而且其他學(xué)科分布相對(duì)均勻，如婦產(chǎn)科學(xué)、泌尿科學(xué)、消化系統(tǒng)疾病等，參見(jiàn)圖3。這與miRNA 參與各系統(tǒng)器官腫瘤調(diào)控有密切關(guān)系，如Sun等[13]和巫夢(mèng)雪[14]等對(duì)miRNA 與卵巢癌關(guān)系的研究，李亞男等[15]和李杰[16]等對(duì)消化系統(tǒng)癌癥的研究。

圖3 20 世紀(jì)以來(lái)中文期刊miRNA 相關(guān)論文學(xué)科分布Top 20（來(lái)源：中國(guó)知網(wǎng)）

2.3 關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類(lèi)分析

筆者進(jìn)一步使用Citesapce 軟件對(duì)國(guó)外miRNA 相關(guān)發(fā)表論文進(jìn)行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類(lèi)分析，根據(jù)Citespace 分析結(jié)果得出出現(xiàn)頻率最高的前十個(gè)關(guān)鍵詞，見(jiàn)表3。

表3 Citespace 分析得出出現(xiàn)頻率最高的關(guān)鍵詞前10

在關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜中，節(jié)點(diǎn)大小與該詞出現(xiàn)的頻數(shù)成正比，圖譜中關(guān)鍵詞“expression”出現(xiàn)的頻數(shù)最多，結(jié)合miRNA 功能分析得出miRNA 的差異表達(dá)仍是國(guó)際miRNA 相關(guān)研究的重點(diǎn)，miRNA 在癌癥中的差異表達(dá)（過(guò)表達(dá)或者表達(dá)下調(diào)）可以調(diào)控癌癥的發(fā)生發(fā)展。關(guān)鍵詞“proliferation”出現(xiàn)的高頻率很可能與miRNA 對(duì)癌癥的增殖擴(kuò)散作用有關(guān)，這一點(diǎn)也可與關(guān)鍵詞“cancer”的高頻出現(xiàn)相聯(lián)系，見(jiàn)圖4。綜合可得，miRNA 相關(guān)研究的重點(diǎn)仍與癌癥緊密相關(guān)。

圖4 miRNA 相關(guān)論文關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析圖譜

用關(guān)鍵詞聚類(lèi)分析以對(duì)聯(lián)系緊密的關(guān)鍵詞進(jìn)行聚類(lèi)，共得出7 個(gè)聚類(lèi)。聚類(lèi)圖譜的聚類(lèi)模塊值（Q 值）為0.3674，聚類(lèi)結(jié)構(gòu)顯著[17]。由聚類(lèi)圖譜可得，#0 上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）是最主要的研究方向，EMT 也與癌癥緊密相關(guān)（EMT 與腫瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制有關(guān)）。此外，#2 再灌注損傷也是miRNA 相關(guān)研究的熱點(diǎn)之一，說(shuō)明miRNA 在除腫瘤、癌癥外的其他機(jī)體疾病、損傷過(guò)程也有重要的調(diào)控功能[18]，見(jiàn)圖5。

圖5 關(guān)鍵詞聚類(lèi)圖譜

3 總結(jié)與展望

本研究利用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的方法對(duì)20 世紀(jì)以來(lái)國(guó)際和國(guó)內(nèi)miRNA 相關(guān)發(fā)表論文趨勢(shì)進(jìn)行梳理，從發(fā)文量、基金資助機(jī)構(gòu)、發(fā)文作者和發(fā)文作者等角度進(jìn)行深入分析，為將來(lái)miRNA 研究趨勢(shì)提供參考。通過(guò)分析得出以下結(jié)論。

從國(guó)際和國(guó)內(nèi)miRNA 發(fā)表論文的趨勢(shì)看，miRNA 的研究熱度處于總體上升的趨勢(shì)，由于miRNA 能調(diào)控靶基因的表達(dá)，在細(xì)胞生理過(guò)程和疾病過(guò)程中扮演重要角色，人們逐漸重視對(duì)miRNA 的研究。國(guó)內(nèi)miRNA 相關(guān)研究的不斷發(fā)展離不開(kāi)國(guó)家基金的支持，從論文基金支持機(jī)構(gòu)看，我國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金共資助10500 篇miRNA 相關(guān)研究的論文發(fā)表，占總論文發(fā)表數(shù)的18.656%。2010 年，國(guó)家自然科學(xué)基金成立了“非編碼RNA 與腫瘤發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)歸”的重點(diǎn)項(xiàng)目立項(xiàng)領(lǐng)域[19]，這極大程度推動(dòng)了國(guó)內(nèi)miRNA 研究領(lǐng)域的發(fā)展。國(guó)內(nèi)許多miRNA 相關(guān)項(xiàng)目受到資助后[20,21]，相關(guān)研究人員開(kāi)始對(duì)miRNA 進(jìn)行進(jìn)一步研究，miRNA 的生理功能及其作用機(jī)理被不斷挖掘。有學(xué)者對(duì)國(guó)家自然科學(xué)基金在中醫(yī)內(nèi)科學(xué)領(lǐng)域立項(xiàng)項(xiàng)目的研究熱點(diǎn)進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)在1997～2019 年國(guó)家自然科學(xué)基金在中醫(yī)內(nèi)科學(xué)領(lǐng)域中立項(xiàng)的1751 項(xiàng)項(xiàng)目中，主題詞miRNA 以155 次的出現(xiàn)頻率位居第二，僅次于信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(791次)[22]。相較于美國(guó)等發(fā)達(dá)國(guó)家，我國(guó)科研起步雖然相對(duì)較晚，但通過(guò)后續(xù)發(fā)展過(guò)程中的基金資助及研究人員的不斷努力，我國(guó)在各領(lǐng)域的研究均已處于領(lǐng)先地位，在miRNA 相關(guān)領(lǐng)域，我國(guó)論文發(fā)表情況現(xiàn)已位居第一。

2019 年之后miRNA 相關(guān)研究出現(xiàn)了相對(duì)滯后的現(xiàn)象，推測(cè)為2019 年爆發(fā)的新冠肺炎疫情對(duì)各領(lǐng)域都帶來(lái)了重大沖擊，包括科研領(lǐng)域，何禮邦等[23]對(duì)國(guó)際山羊相關(guān)論文發(fā)表態(tài)勢(shì)的分析中也提到，由于疫情影響，相關(guān)領(lǐng)域的研究論文呈下降態(tài)勢(shì)。但這在后疫情時(shí)代的不斷調(diào)整后會(huì)有所改善，筆者預(yù)測(cè)，在今后幾年，miRNA 相關(guān)研究發(fā)展趨勢(shì)會(huì)逐步回歸正軌。值得一提的是，我國(guó)在國(guó)際上發(fā)表的miRNA 相關(guān)論文數(shù)最多。此外，在miRNA 發(fā)表論文的基金資助機(jī)構(gòu)中，中國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金資助力度最大，說(shuō)明我國(guó)對(duì)miRNA 研究的重視。但在論文水平上，從熱點(diǎn)文章被引頻次和h 因子看，我國(guó)相對(duì)其他發(fā)達(dá)國(guó)家（如美國(guó)和德國(guó)）仍有一定差距，只有后續(xù)不斷提高研究和論文質(zhì)量，我國(guó)在國(guó)際miRNA 相關(guān)領(lǐng)域中才能更具有話語(yǔ)權(quán)。在研究主題方面，國(guó)內(nèi)外miRNA 研究側(cè)重點(diǎn)各不相同，國(guó)外研究更側(cè)重于研究miRNA 在各類(lèi)腫瘤、癌癥中的調(diào)控作用；而國(guó)內(nèi)則側(cè)重于miRNA 調(diào)控機(jī)理，如探究其“靶基因”，引起“細(xì)胞凋亡”、“細(xì)胞增殖”等。對(duì)miRNA 機(jī)理的探究固然對(duì)深入全面了解miRNA 有重要意義，但也要注意綜合其機(jī)理及其內(nèi)涵、應(yīng)用，防止出現(xiàn)對(duì)領(lǐng)域內(nèi)涵理解不深刻，盲目追求研究熱點(diǎn)，過(guò)度強(qiáng)調(diào)細(xì)胞信號(hào)通路等微觀分子機(jī)制問(wèn)題[22]。在國(guó)內(nèi)研究方面，miRNA 研究學(xué)科分布較廣，miRNA 在各系統(tǒng)的研究都有涉及。此外，通過(guò)關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類(lèi)分析可知，miRNA 相關(guān)研究熱點(diǎn)仍與腫瘤、癌癥相關(guān)，說(shuō)明未來(lái)miRNA 相關(guān)研究重點(diǎn)可能仍與腫瘤和癌癥相關(guān)，miRNA 很可能通過(guò)相似的機(jī)制對(duì)腫瘤、癌癥的發(fā)生發(fā)展進(jìn)行調(diào)控，研究miRNA 部分調(diào)控機(jī)制，可以為miRNA 在其他疾病的研究提供可靠思路。此外，根據(jù)關(guān)鍵詞聚類(lèi)分析結(jié)果，再灌注損傷作為現(xiàn)階段miRNA 相關(guān)研究的熱點(diǎn)之一（僅次于腫瘤），很可能在未來(lái)發(fā)展為miRNA 主要的研究主題。

目前，國(guó)內(nèi)外對(duì)miRNA 的研究大部分還停留在理論層面，在實(shí)踐應(yīng)用方面還有待進(jìn)一步的提升。只有將miRNA 相關(guān)研究理論應(yīng)用到實(shí)踐，為疾病診斷和治療提供新技術(shù)，才能深化miRNA 相關(guān)的研究意義，進(jìn)一步造福人類(lèi)。