徐小港,徐義峰,王鈺,董辛,章德林,鄭琴,3
1 江西中醫(yī)藥大學(xué) 江西南昌 330004 2 江西中醫(yī)藥大學(xué)科技學(xué)院 江西南昌 330004 3 現(xiàn)代中藥制劑教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 江西南昌 330004
龔?fù)①t,明代御醫(yī),江西金溪人,被譽(yù)為“醫(yī)林狀元”。龔氏不僅秉承家學(xué),且博綜諸家,以制方萃味,用藥精簡著稱,廣泛涉獵臨床各科,可謂地方醫(yī)學(xué)流派的一代大家。他一生精究醫(yī)源,勤于筆耕,所撰著作達(dá)二十余種。龔氏對于中風(fēng)的病證之源、方藥之制詳審縝密,考古證今,對現(xiàn)代臨床相關(guān)疾病診療具有一定的借鑒意義。
中風(fēng)原指感受風(fēng)邪所引起的疾病,在《醫(yī)學(xué)三字經(jīng)》中有“人百病,首中風(fēng)”之稱。古代醫(yī)家對本病的理解與詮釋不盡相同,其內(nèi)涵與范疇也較為廣泛,主要以口舌歪斜、半身不遂等突發(fā)性癥狀為共同特征。隨著中醫(yī)行業(yè)規(guī)范與標(biāo)準(zhǔn)的建立,中風(fēng)的概念漸趨明確,現(xiàn)指代缺血性腦卒中及腦梗塞等疾病,屬于中醫(yī)內(nèi)科重大病證之一。本病是全球第二大死亡原因,且已成為中國成年人首要致死及致殘疾病[1], 其中40歲以上成年人中風(fēng)患病率為2.06%[2],造成了嚴(yán)重的社會負(fù)擔(dān)[3-4]。
從中風(fēng)的病因病機(jī)而論,龔?fù)①t在《萬病回春》中指出:“真中風(fēng)者,中時(shí)卒倒,皆因體氣虛弱,榮衛(wèi)失調(diào),或喜怒憂思悲恐驚,或酒色勞力所傷,以致真氣耗散,腠理不密,風(fēng)邪乘虛而入,乃其中也”。對于本病的辨證,龔氏善于通過患者脈象細(xì)審明析及判斷預(yù)后,《壽世保元》有載:“夾寒則脈帶浮遲,夾暑則脈虛,夾濕則脈澀。大法浮遲者吉,急疾大數(shù)者兇”。在中風(fēng)的治療上,他強(qiáng)調(diào)應(yīng)精準(zhǔn)辨明病因,理清中腑、中臟、中經(jīng)絡(luò)及兼夾證候,變通而治之。如對于中風(fēng)有昏冒現(xiàn)象者,《魯府禁方》主張宜用通關(guān)之藥,即“先用皂角、細(xì)辛等分為末,每用少許吹入鼻中,有嚏可治,隨用吐法”。鑒于龔?fù)①t在中風(fēng)診治方面的良好療效與鮮明特色,本研究采用現(xiàn)代信息技術(shù),通過數(shù)據(jù)挖掘闡明其治療中風(fēng)的用藥規(guī)律與學(xué)術(shù)思想,并提取核心藥物組合。采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析其生物學(xué)作用機(jī)制,以期為中風(fēng)的臨床用藥及相關(guān)實(shí)驗(yàn)提供理論參考,具體研究流程圖如下。
處方均來源于《龔延賢醫(yī)學(xué)全書》[5]中所包含的《魯府禁方》、《萬病回春》、《壽世保元》、《濟(jì)世全書》四書中治療中風(fēng)的方劑。
1.1 篩選標(biāo)準(zhǔn) ①納入所載處方有明確的藥物組成、服用方式為內(nèi)服;②排除處方為單味藥物、用藥方式為外用、《中藥學(xué)》[6]、2020版《中國藥典》[7]及《中藥大辭典》[8]均不收錄的藥物;③組成重復(fù)的處方僅記錄一次。
1.2 數(shù)據(jù)的規(guī)范與數(shù)據(jù)庫的建立 根據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn),確定納入處方,依照《中藥學(xué)》及2020版《中國藥典》,對中藥藥名進(jìn)行規(guī)范,并且作為性味、歸經(jīng)統(tǒng)計(jì)參照,《中藥大辭典》作為補(bǔ)充。如仙靈脾規(guī)范為淫羊藿,淮安陳曲規(guī)范為陳皮、神曲,當(dāng)歸尾規(guī)范為當(dāng)歸,遼五味子規(guī)范為五味子,將1.1.1提及的未收錄藥物,予以剔除,如腦末、洛陽花等,按《中藥學(xué)》對中藥功效進(jìn)行歸類,最后通過Ms Excel 2016建立龔延賢治療中風(fēng)方藥數(shù)據(jù)庫。
1.3 數(shù)據(jù)分析 對數(shù)據(jù)庫中單味藥、性味、歸經(jīng),功效分類進(jìn)行頻數(shù)、頻率分析,采用IBM SPSS Modeler 18.0[9-11]軟件對藥物進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則分析并提取核心藥物組合(支持度最高),運(yùn)用IBM SPSS Statistics 26.0進(jìn)行聚類分析[12-13]。
2.1 藥物的成分及靶點(diǎn)收集 在中醫(yī)分子機(jī)理生物學(xué)信息分析工具(BATMAN-TCM,http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/)依次檢索麥冬-肉桂的有效成分及靶點(diǎn),檢索條件為Score cutoff≥20、P-value cutoff<0.05[14]。
2.2 疾病的靶點(diǎn)收集及Venny分析 因缺血性腦卒中占中風(fēng)發(fā)病率的80%以上,具有致死率和致殘率高的特點(diǎn)[15]。為更加明確藥物的作用機(jī)制,故以缺血性腦卒中為主要研究對象,并將缺血性腦卒中(cerebral ischemic stroke)、腦梗死(cerebral infarction)和腦缺血再灌注(cerebral ischemia reperfusion)為關(guān)鍵詞,在人類在線孟德爾遺傳平臺OMIM(https://omim.org/)以及DrugBank(https://www.drugbank.ca)中檢索相關(guān)基因,并與藥對中有效成分靶基因進(jìn)行映射對比篩選出藥對治療缺血性腦卒中的作用靶點(diǎn)。將藥物的靶點(diǎn)與疾病的相關(guān)靶點(diǎn)導(dǎo)入hiplot (https://hiplot.com.cn/),得到麥冬-肉桂治療中風(fēng)的潛在作用靶點(diǎn)。
2.3 “藥對-化合物-基因-疾病”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 結(jié)合藥物成分及1.2.2所得潛在作用靶點(diǎn),導(dǎo)入Cytoscape3.7.1軟件構(gòu)建 “藥對-化合物-基因-疾病”網(wǎng)絡(luò),并運(yùn)用其中Network Analysis分析有效成分的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù),以確定核心成分。
2.4 作用靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將作用靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/),生物種類設(shè)定為“Homo sapiens”,最小互相作用閾值設(shè)為“medium confidence”(>0.4),得到蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖及保存TSV格式的PPI數(shù)據(jù),將PPI數(shù)據(jù)文件導(dǎo)入Cytoscape3.7.1中的Network Analysis分析有效成分的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)。
2.5 富集分析 將作用靶點(diǎn)導(dǎo)入DAVID數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/),Select Identifier設(shè) 置 為“OFFICIAL GENE SYMBOL”,“Select species”設(shè)置為“Homo sapiens”,設(shè)定P<0.05,實(shí)現(xiàn)GO功能富集分析和KEGG通路富集分析[16-17]。
1.1 高頻藥物頻次、歸經(jīng)統(tǒng)計(jì) 共錄入94首處方,根據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn),最終納入63首處方,總計(jì)163味藥物,進(jìn)行“頻次統(tǒng)計(jì)”,藥物總頻次達(dá)1029次,高頻藥物(頻次>16,下同)共計(jì)20味,頻次最高的藥物為甘草出現(xiàn)35次,其次是茯苓、防風(fēng)、當(dāng)歸、川芎,高頻藥物歸經(jīng)以脾、肺、肝為主。見圖2。
圖2 高頻藥物頻次、歸經(jīng)分布聚類圖(頻次>16次)
1.2 藥物功效分類統(tǒng)計(jì) 將涉及的163味藥物功效分類和頻次統(tǒng)計(jì)分析,共涵蓋19種功效分類,主要集中在補(bǔ)虛藥(255次,24 .78%),解表藥(163次,15.84%)。見圖3。
1.3 藥物性味統(tǒng)計(jì) 將涉及的163味藥物進(jìn)行性味統(tǒng)計(jì)分析。同一味藥物的多個(gè)藥性、藥味分別統(tǒng)計(jì)入內(nèi)。藥性中主要集中在溫(552次,33.22%)>寒(195次,28.10%)>平(187次,25.34%),藥味主要集中在辛(565次,54.33%)>甘(195次,19.15%)>苦(187次,18.41%),見圖4。
圖4 藥物性味頻次分布圖
1.4 藥物歸經(jīng)統(tǒng)計(jì) 將涉及的163味藥物進(jìn)行歸經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析。按照頻數(shù)由高到低的順序進(jìn)行排序,歸經(jīng)前3位為脾經(jīng)、肺經(jīng)、肝經(jīng),累計(jì)頻次均>400,其頻率依次為18.83%,15.65%,14.13%,其排名與2.1.1中高頻藥物結(jié)果相符,可驗(yàn)證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性,見圖5。
圖5 藥物歸經(jīng)頻次分布圖
1.5 關(guān)聯(lián)規(guī)則 運(yùn)用IBM SPSS Modeler 18.0軟件進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則分析,并建立“數(shù)據(jù)源(EXCEL)→類型→網(wǎng)絡(luò)”數(shù)據(jù)流,設(shè)置支持度為30%,置信度為80%,最大前項(xiàng)數(shù)為3,提升度>1等條件進(jìn)行關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)可視化,再使用Apriori 算法建模,挖掘藥物之間的配伍規(guī)律,得到龔?fù)①t治療中風(fēng)的潛在核心藥物組合(麥冬-肉桂),見圖6。
圖6 藥物關(guān)聯(lián)圖
1.6 聚類分析 采用SPSS Statistics 26.0中的組間聯(lián)接,選擇皮爾遜相關(guān)性,對20味高頻藥物進(jìn)行系統(tǒng)聚類分析,生成樹狀圖(圖7),和冰柱圖(圖8)。結(jié)合專業(yè)知識,分析出5個(gè)多味藥物聚類組合,類1:陳皮、半夏、甘草、茯苓;類2:白術(shù)、黃芩;類3:防風(fēng)、川芎、當(dāng)歸、白芍;類4:白芷、細(xì)辛、天麻;類5:生地黃、熟地黃、羌活,見圖7、圖8。
圖7 高頻藥物聚類樹狀圖
圖8 高頻藥物聚類冰柱圖
2.1 藥物的成分及靶點(diǎn)收集 從BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫中得到麥冬、肉桂有效活性成分共34個(gè),其中麥冬18個(gè),肉桂16 個(gè)。同時(shí)收集活性成分相關(guān)作用靶點(diǎn),其中麥冬305個(gè),肉桂559個(gè),去除重復(fù)靶點(diǎn)后,共得到靶點(diǎn)547個(gè)。
2.2 疾病的靶點(diǎn)收集及Venny分析 疾病靶點(diǎn)共收集到200個(gè)人,其中DrugBank59個(gè),OMIM141個(gè),去除重復(fù)靶點(diǎn),共得到靶點(diǎn)194個(gè),將麥冬-肉桂作用靶點(diǎn)與疾病相關(guān)靶點(diǎn)進(jìn)行Venny分析,獲得麥冬-肉桂活性成分作用靶點(diǎn)映射于疾病的潛在作用靶點(diǎn)27個(gè),見圖9。
圖9 麥冬-肉桂治療中風(fēng)靶點(diǎn)venny圖
2.3 “藥對-化合物-基因-疾病”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 運(yùn)用Cytoscape3.7.1軟件構(gòu)建“藥物-化合物-基因-疾病”網(wǎng)絡(luò)圖, 可直觀地顯示藥物與基因之間的關(guān)系,圖形節(jié)點(diǎn)(紫色)為活性成分,正方形(藍(lán)色)為藥物與疾病,菱形(綠色)為基因,面積越大說明該節(jié)點(diǎn)越重要。共包含34個(gè)化合物,根據(jù)結(jié)果顯示,豆甾醇(Stigmasterol)、鳥嘌呤核苷(Guanosine hydrate)、茴香烯(Anethole)等34個(gè)成分為治療中風(fēng)的潛在活性成分,見圖10。
圖1 研究流程圖
圖10 “藥物-化合物-基因”網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析 用STRING數(shù)據(jù)庫得到27個(gè)作用靶點(diǎn)之間的關(guān)系,并保存TSV文件,將其導(dǎo)入Cytoscape3.7.1,得到PPI網(wǎng)絡(luò)圖,利用內(nèi)置Network Analysis分析有效成分的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù),發(fā)現(xiàn)TNF、PTGS2、ACE、ADRA1A、PDE4A、PTGS1、PDE5A等節(jié)點(diǎn)度值較高,其中TNF和其他基因的相互作用最強(qiáng),提示其可能參與的藥理作用最為明顯,見圖11。
圖11 共同基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖
2.5 富集分析 通過DAVID數(shù)據(jù)庫對麥冬-肉桂藥對作用靶點(diǎn)進(jìn)行GO富集分析與KEGG通路富集分析,設(shè)置閾值P<0.05,利用Hiplot對結(jié)果進(jìn)行可視化。GO富集分析得到88個(gè)條目,包括生物學(xué)過程(BP)50條、細(xì)胞組成(CC)17條和分子功能(MF)21條,主要有3', 5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity(3',5'-環(huán)核苷酸磷酸二酯酶活性)、3', 5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity(3',5'-環(huán)-GMP磷酸二酯酶活性)、alpha1-adrenergic receptor activity (α1-腎上腺素受體活性)等,見圖12。KEGG 通路富集分析得到22條通路,主要涉及cGMP-PKG信號通路、Arachidonic acid metabolism(花生四烯酸代謝)等,見圖13。
圖12 GO功能富集分析
圖13 KEGG通路富集分析
本文基于數(shù)據(jù)挖掘和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,對龔?fù)①t治療中風(fēng)的63首處方進(jìn)行配伍規(guī)律研究,并將其核心藥對進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析。祖國醫(yī)學(xué)認(rèn)為,本病由于腦絡(luò)受損,神機(jī)失用導(dǎo)致氣血逆亂、臟腑功能失調(diào)而發(fā)。因此,中風(fēng)多為本虛標(biāo)實(shí)之證,其病位在腦,與五臟密切相關(guān),在本為肝腎陰虛、氣血衰少等,在標(biāo)為風(fēng)火相煽、痰濕壅盛、瘀血阻滯及氣血逆亂等,治療則根據(jù)中經(jīng)絡(luò)、中臟腑和后遺癥辨證論治?,F(xiàn)代研究表明,中風(fēng)發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,主要與腦組織能量代謝障礙、炎癥反應(yīng)、神經(jīng)內(nèi)分泌紊亂等密切相關(guān)[18-19]。本文通過采用現(xiàn)代信息技術(shù),以期能為中風(fēng)的臨床用藥及相關(guān)實(shí)驗(yàn)提供依據(jù)與思路。
根據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果,龔?fù)①t治療中風(fēng)的63首方藥,以補(bǔ)虛藥為先,正如其在《壽世保元·中風(fēng)》中強(qiáng)調(diào):“予觀古人之方,多用攻擊之劑,施于北方風(fēng)土剛勁之人,間或可也,用于南方風(fēng)土柔弱之人,恐難當(dāng)耳”,反映了龔氏善用補(bǔ)虛藥治療中風(fēng)的學(xué)術(shù)特點(diǎn)。高頻藥物共計(jì)20味,除甘草外,排名靠前依次為茯苓、防風(fēng)、當(dāng)歸、川芎等,高頻藥物多入脾、肺、肝三經(jīng),且理氣藥使用占比較大,體現(xiàn)了龔?fù)①t治風(fēng)主張理氣的學(xué)術(shù)思想,如《萬病回春·中風(fēng)》指出:“蓋治風(fēng)先理氣,氣順則痰消,徐理其風(fēng),庶可收斂”。綜合評估11個(gè)藥對和2個(gè)藥組,發(fā)現(xiàn)“麥冬-肉桂”為高頻核心藥對,麥冬配伍肉桂可清心養(yǎng)陰,補(bǔ)火助陽,一陰一陽,清補(bǔ)兼施,為《石室秘錄》倒陽湯結(jié)構(gòu)。聚類分析共包含5個(gè)多味藥物聚類組合,其組方規(guī)律含有燥濕化痰之二陳湯(類1)、和中活血之白術(shù)黃芩湯(類2)、養(yǎng)血活血之四物湯(類3)等結(jié)構(gòu),以及細(xì)辛-白芷、生地黃-熟地黃(類4、類5)之配伍,其整體治法與中風(fēng)本虛標(biāo)實(shí)病機(jī)相符。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)果顯示,豆甾醇、鳥嘌呤核苷、茴香烯等34個(gè)成分為治療中風(fēng)的潛在活性成分。實(shí)驗(yàn)表明,豆甾醇可以有效改善腦缺血再灌注引起的神經(jīng)功能損傷,進(jìn)而減少組織病理學(xué)缺損[20],鳥嘌呤核苷亦被證實(shí)在缺血性腦卒中動物模型中具有神經(jīng)保護(hù)作用[21]。根據(jù)PPI網(wǎng)絡(luò)發(fā)現(xiàn)TNF、PTGS2、ACE等為關(guān)鍵靶點(diǎn)。研究表明,缺血性腦卒中患者在癥狀發(fā)作后12、24、72小時(shí)血液中TNF水平均有所升 高[22-24],并于發(fā)病后1~6天在神經(jīng)元中表達(dá),且在2~3天達(dá)到峰值[25]。PTGS2是維持機(jī)體穩(wěn)態(tài)和調(diào)節(jié)炎癥的主要應(yīng)答基因,與缺血性腦卒中的發(fā)病密切相關(guān),實(shí)驗(yàn)結(jié)果亦證實(shí)PTGS2的陽性蛋白在大腦中動脈阻塞(MCAO)小鼠模型中的表達(dá)顯著增高[26]。ACE基因表達(dá)失調(diào)起到了推動本病發(fā)生發(fā)展的作用,其通過影響AngⅡ的水平,導(dǎo)致神經(jīng)元、神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞及血管平滑肌細(xì)胞中的下游信號傳導(dǎo)異常,引發(fā)高血壓和炎癥,從而提高中風(fēng)的患病風(fēng)險(xiǎn)[27]。
KEGG 通路富集分析發(fā)現(xiàn)麥冬-肉桂治療缺血性中風(fēng)主要涉及cGMP-PKG信號通路、NF-κB信號通路及Arachidonic acid metabolism(花生四烯酸代謝)等。多項(xiàng)研究表明,炎癥反應(yīng)與缺血性腦卒中的急慢性階段密切相關(guān),cGMP可調(diào)節(jié)細(xì)胞生長和炎癥等多種細(xì)胞生物學(xué)過程[28]。此外,Phosphodiesterase-5 Inhibitor(磷酸二酯酶-5抑制劑)可增加腦血流量以促進(jìn)其功能恢復(fù),往往依賴于NO-cGMP-PKG通 路[29]。NF-κB信號通路亦與炎癥反應(yīng)有關(guān),并通過降低細(xì)胞的凋亡率及改善腦細(xì)胞的細(xì)胞周期而作用于缺血性腦卒中[30]。Rink Cameron[31]等研究發(fā)現(xiàn),花生四烯酸代謝在缺血性腦卒中病理機(jī)制中具有重要作用。因在缺血性腦卒中環(huán)境下,腦部的血液運(yùn)行被阻滯,此時(shí)缺氧的腦組織開始從膜磷脂雙層中迅速裂解花生四烯酸,而花生四烯酸能同時(shí)進(jìn)行非酶依賴性和酶介導(dǎo)的氧化代謝,并形成多種有助于缺血性腦卒中病理改善的生物活性代謝物。
本文采用數(shù)據(jù)挖掘結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,初步闡述了旴江醫(yī)家龔?fù)①t治療中風(fēng)的用藥規(guī)律,得出相關(guān)核心藥對及新方組合,并進(jìn)一步分析“麥冬-肉桂”藥對治療中風(fēng)的潛在靶點(diǎn)、活性成分、生物過程及關(guān)鍵信號通路,發(fā)現(xiàn)其主要通過cGMP-PKG信號通路、NF-κB信號通路及花生四烯酸代謝等途徑發(fā)揮作用。綜上,本研究可為傳承和弘揚(yáng)旴江名醫(yī)治療中風(fēng)的臨證經(jīng)驗(yàn)與學(xué)術(shù)思想,以及新藥研發(fā)提供參考借鑒。