張澤鑫, 林瑞婷, 劉雪婷, 李菁, 林麗珠
1.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,廣東 廣州 510405;2.湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,湖南 長沙 410000;3.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,廣東 廣州 510405
放射性腸炎(radiation enteritis,RE)是盆腹腔及腹膜后惡性腫瘤患者,接受放射線治療后,最常出現(xiàn)的并發(fā)癥之一。其臨床表現(xiàn)為腹痛腹瀉、惡心嘔吐、黏液膿血樣便等,嚴(yán)重者可見腸腔狹窄、局部膿腫、穿孔、出血、瘺管形成等[1]。據(jù)統(tǒng)計,全球約有30萬名盆腔惡性腫瘤患者接受放療[2],高達(dá)90%的患者接受腹盆腔放射治療后,會出現(xiàn)胃腸道癥狀,排便習(xí)慣發(fā)生改變,生活質(zhì)量顯著下降[3]。其中,3%~10%左右的患者出現(xiàn)嚴(yán)重放射性腸損傷[4],1/3的病人需進(jìn)行外科手術(shù)治療,死亡率高達(dá)10%~22%[5]。目前放射性腸炎治療較為棘手,中醫(yī)藥基于辨證論治原則,通過長期的臨床實(shí)踐,探索出一大批有效方劑,日益成為研究的重點(diǎn)[6]。
放射性腸炎按其癥狀,可歸屬于中醫(yī)“泄瀉”“痢疾”“腸澼”等范疇。癌瘤之毒,內(nèi)伏機(jī)體,正氣不足,外受放射線輻射肌腠,而致濕熱內(nèi)蘊(yùn),日久生瘀。放射線屬“火”“熱”“毒”邪。本病治當(dāng)以清熱解毒、利濕化瘀為主[7]。祛瘀解毒方(Qu Yu Jie Du Formula,QYJDF)為林麗珠教授治療放射性腸炎的有效驗方,已獲得國家發(fā)明專利(專利號ZL 2014 1 0216376.6),并取得廣州市科技計劃立項支持。祛瘀解毒方的功效為清熱利濕,祛瘀解毒,主要用于濕熱毒瘀型放射性腸炎及腸癌的治療。該方由8味中藥組成,分別為土鱉蟲、桃仁、苦參、地榆、槐花、薏苡仁、土茯苓、蒲公英。其中土鱉蟲與桃仁是林麗珠教授治療放射性腸炎的常用藥對,取《金匱要略》下瘀血湯之義,土鱉蟲破血入絡(luò),桃仁強(qiáng)化其活血之效。地榆、槐花兩藥相合,共奏清肝瀉火、涼血止血之功。土茯苓、薏苡仁、苦參,清熱祛濕解毒。蒲公英擅清熱解毒,消腫散結(jié),止瀉痢、除腸垢,兼攻癌毒。諸藥合用,可治療癌毒及放射線邪引起的腹痛泄瀉、便血、黏液膿血便等癥狀?,F(xiàn)代研究表明,運(yùn)用活血化瘀藥,可提高機(jī)體對放射治療的敏感性,提高免疫力和減少機(jī)體的纖維化,從而降低放療的毒副反應(yīng)。其中土鱉蟲、桃仁含有效成分苦杏仁苷、尿嘧啶,具有抗炎及保護(hù)腸道黏膜功能[8]。地榆、槐花中含有多種天然活性物質(zhì),被開發(fā)用于抗腫瘤、止血、保護(hù)胃腸及增強(qiáng)免疫等[9]?,F(xiàn)代藥理學(xué)揭示了本方潛在有效成分,然而中藥復(fù)方含有多個有效成分,其篩選十分復(fù)雜。且該方治療放射性腸炎的療效機(jī)制尚未闡明,涉及多靶點(diǎn)、多通路,仍需進(jìn)一步的研究。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)可詮釋藥物“成分—靶點(diǎn)—通路”的整體調(diào)節(jié)機(jī)制,能對藥物與疾病的相關(guān)性進(jìn)行預(yù)測,對研究中藥的多角度作用機(jī)制意義重大。基于上述問題,本研究運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究方法,充分挖掘本方潛在的分子靶點(diǎn)和機(jī)制,探究其靶向的器官,以及完善相關(guān)中醫(yī)的診斷證候。
QYJDF組成:地榆,槐花,苦參,蒲公英,桃仁,土鱉蟲,土茯苓,薏苡仁;限定篩選條件:口服生物有效度(OB)≥30%,類藥性(DL)≥0.18;通過TCMSP數(shù)據(jù)庫,篩選QYJDF中藥有效活性成分和靶點(diǎn)。其中土鱉蟲,蒲公英在TCMSP數(shù)據(jù)庫沒有收錄,使用BATMAN數(shù)據(jù)庫,搜集一批土鱉蟲和蒲公英的中藥成分,在PUBCHEM數(shù)據(jù)庫獲取其化合物的3D結(jié)構(gòu),使用PharmMapper數(shù)據(jù)庫進(jìn)行靶點(diǎn)預(yù)測。
在Genecards和OMIM數(shù)據(jù)庫,以“Radiation enteritis”為關(guān)鍵詞,篩選獲取QYJDF的疾病靶點(diǎn)。
使用R語言的"VennDiagram"包和“Upset”包,分別導(dǎo)入QYJDF和RE的疾病靶點(diǎn),通過兩者相互映射,獲取QYJDF治療RE靶點(diǎn)。
將QYJDF治療RE的有效活性成分和靶點(diǎn)導(dǎo)入cytoscape3.7.2,構(gòu)建QYJDF治療RE分子靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),尋找重要的候選成分。
將QYJDF治療RE的靶點(diǎn)導(dǎo)入到STRING數(shù)據(jù)庫,設(shè)定物種為Homo sapiens,相互作用參數(shù)設(shè)置為0.400,導(dǎo)出為.tsv文件,利用cytoscape3.7.2軟件,通過計算degree值大小,繪制蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。
使用DAVID數(shù)據(jù)庫,將QYJDF治療RE的靶點(diǎn)注釋,進(jìn)行GO和KEGG富集分析,設(shè)置P<0.05,根據(jù)靶點(diǎn)富集數(shù)目多少進(jìn)行排序,使用R語言進(jìn)行可視化。
在SymMap數(shù)據(jù)庫檢索QYJDF治療RE的中藥成分,獲取其相對應(yīng)的靶點(diǎn),疾病,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)癥狀和中醫(yī)證候,保留在以上5種選項中有連線的部分,構(gòu)建中藥-成分-靶點(diǎn)-現(xiàn)代醫(yī)學(xué)癥狀-中醫(yī)證候網(wǎng)絡(luò),達(dá)到以證測方,以方測證,相互驗證的效果。
利用BioGPS數(shù)據(jù)庫,導(dǎo)入蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的前20個核心靶點(diǎn)(步驟1.5),分析其在各個器官中的表達(dá)量,單個靶點(diǎn)存在于多個探針中,通過計算均值的方式進(jìn)行降序處理,從而篩選出排名在前5的器官,并且這些器官在中醫(yī)系統(tǒng)中都存在相對應(yīng)的內(nèi)容。
使用AutoDock4.2對分子靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)(1.4)結(jié)果的重要化合物以及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(1.5)排名靠前的3個核心基因進(jìn)行對接,使用分子可視化工具Pymol對其對接結(jié)果進(jìn)行處理,并以圖片形式展現(xiàn)。
共篩選得到QYJDF治療RE的71個有效中藥成分(見表1,其中地榆9個,槐花5個,苦參23個,蒲公英3個,桃仁12個,土鱉蟲2個,土茯苓12個,薏苡仁5個),以及QYJDF靶點(diǎn)4 506個,RE靶點(diǎn)176個,QYJDF治療RE靶點(diǎn)129個(見圖 1)。
表1 祛瘀解毒方中藥活性成分Table 1 Traditional Chinese medicine active ingredients of QYJDF
(續(xù)表1)
圖1 QYJDF治療RE疾病的靶點(diǎn)Figure 1 QYJDF targets for treatment of RE disease
在Cytoscape3.7.2中導(dǎo)入QYJDF治療RE的有效中藥成分和靶點(diǎn),構(gòu)建分子靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖(見圖2)。此網(wǎng)絡(luò)包括了個209節(jié)點(diǎn),672條邊。其中紅色表示“放射性腸炎”,綠色表示組成QYJDF的中藥,天藍(lán)色表示QYJDF治療RE的有效中藥成分,黃色表示QYJDF治療RE的靶點(diǎn)。由圖可以看出,MOL000006(木犀草素)、MOL000098(槲皮素)對應(yīng)RE的大部分靶點(diǎn),可認(rèn)為是QYJDF治療RE的主要中藥成分。
根據(jù)degree值大小進(jìn)行靶點(diǎn)排序,得到了蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(見圖3),其中圓形的大小代表互作關(guān)系的多少,代表該靶點(diǎn)與其他靶點(diǎn)的互作關(guān)系越多,在網(wǎng)絡(luò)中處于核心地位。其中IL6、VEGFA、MAPK8 degree值位居前三,故可認(rèn)為是QYJDF治療RE的核心靶點(diǎn)。
圖3 QYJDF治療RE的PPI網(wǎng)絡(luò)Figure 3 PPI network of QYJDF treatment of RE
根據(jù)顯著性和靶點(diǎn)富集數(shù)目,篩選出了主要的15條GO過程(見圖4),其中nucleus是靶點(diǎn)富集數(shù)目最多,顯著性最明顯的GO細(xì)胞成分,提示QYJDF治療RE發(fā)揮作用的部位可能位于細(xì)胞核中。RNA聚合酶Ⅱ(positive regulation of transcription from RNA polymeraseⅡpromoter)是靶點(diǎn)富集數(shù)目最多,顯著性最明顯的GO生物過程,提示QYJDF治療RE發(fā)揮作用可能通過RNA聚合酶Ⅱ啟動子的轉(zhuǎn)錄正調(diào)控。Transcription factor activity,sequencespecific DNA binding是靶點(diǎn)富集數(shù)目最多、顯著性最明顯的GO分子功能,提示QYJDF治療RE發(fā)揮作用可能通過轉(zhuǎn)錄因子活性,序列特異性DNA結(jié)合。
圖4 QYJDF治療RE的GO富集分析(BP;CC;MF)Figure 4 QYJDF treatment of GO enrichment analysis(BP;CC;MF)
根據(jù)顯著性和靶點(diǎn)富集數(shù)目,篩選出了主要的10條KEGG通路(見圖5),QYJDF藥物成分相關(guān)靶點(diǎn)富集結(jié)果最多的為PI3K-Akt信號通路,提示QYJDF可能是參與通過該通路的調(diào)節(jié)從而起到治療RE的作用。
圖5 QYJDF治療RE的KEGG富集分析Figure 5 KEGG enrichment analysis of QYJDF treatment of RE
QYJDF治療RE的中藥-成分-靶點(diǎn)-現(xiàn)代醫(yī)學(xué)癥狀-中醫(yī)證候網(wǎng)絡(luò)提示了,患者以腹痛、腹瀉、便血、便秘、便痛、里急后重等為主要癥狀,可能出現(xiàn)瘡毒、濕疹、癢等皮膚癥狀,眩暈、頭痛等頭面部癥狀,見圖6(天藍(lán)色代表QYJDF,紫色代表藥物組成,黃色代表中藥成分,綠色代表靶點(diǎn),粉色代表現(xiàn)代醫(yī)學(xué)癥狀,紅色代表中醫(yī)證候特征)。
圖6 QYJDF治療RE的中藥-成分-靶點(diǎn)-現(xiàn)代醫(yī)學(xué)癥狀-中醫(yī)證候網(wǎng)絡(luò)Figure 6 QYJDF treatment of RE in traditional Chinese medicine-ingredients-targets-modern medical symptoms-TCM syndrome network
如圖7所示,紅色代表心臟靶點(diǎn),綠色代表肝臟靶點(diǎn),灰色代表大腸、小腸靶點(diǎn),黑色代表腎臟靶點(diǎn),粉紅色代表子宮靶點(diǎn),白色代表前列腺靶點(diǎn)。上標(biāo)“1-4”代表靶點(diǎn)存在于器官的數(shù)目。由圖7可以看出,QYJDF治療RE的靶點(diǎn)大多數(shù)分布在“大腸”“小腸”“肝”“前列腺”“子宮”,這印證了QYJDF治療RE具有靶向性,其中病位主要在下焦。
圖7 QYJDF治療RE靶點(diǎn)的器官定位Figure 7 QYJDF treatment of RE target organ location
從PDB數(shù)據(jù)庫下載了蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中(圖3)的前三位核心靶點(diǎn)IL6、MAOK8和CASP3的結(jié)構(gòu),然后將分子靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)中的主要候選化合物(圖2)槲皮素和木犀草素與核心靶點(diǎn)IL6、MAPK8、CASP3使用Autodock和Pymol軟件進(jìn)行分子對接和可視化處理,對接結(jié)果評分顯示其具有良好的結(jié)合能力(見圖8,表2)。
圖8 QYJDF治療RE分子對接圖Figure 8 QYJDF treatment of RE molecular docking diagram
表2 祛瘀解毒方治療RE分子對接結(jié)果Table 2 QYJDF treatment of RE molecular docking results
放射性腸炎根據(jù)其累及部位,可分為放射性直腸炎、結(jié)腸炎和小腸炎。根據(jù)起病時間和病程,可分為急、慢性放射性腸炎[10]。其放療毒性與放射劑量、放射面積相關(guān),同時也與接受放療患者的遺傳、年齡等自身因素有關(guān)[11]?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)可通過口服藥物與外科治療進(jìn)行干預(yù),但存在較多的不良反應(yīng)與高手術(shù)復(fù)發(fā)率。傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)從全局出發(fā)進(jìn)行辨證施治,內(nèi)外合兼,恢復(fù)臟腑功能。內(nèi)治以辨病辨證相結(jié)合,清熱解毒、滋陰養(yǎng)血、調(diào)和脾胃等多法進(jìn)行祛邪扶正,外治多采用針刺、艾灸和中藥灌腸等法改善臨床癥狀[12],多能取得良好的效果,減輕患者毒副反應(yīng)。
放射性腸炎患者臨床常見腹痛腹瀉,黏液膿血樣便等癥狀,在中醫(yī)屬“腸澼”“痢疾”“泄瀉”等范疇?!饵S帝內(nèi)經(jīng)》中“飲食不節(jié),起居不時者,陰受之……陰受之則入五臟……入五臟,則滿閉塞,下為飧泄,久為腸澼”,《傷寒論》記載“熱利下重者,白頭翁湯主之”“下利,便膿血者,桃花湯主之”[13],治以清熱利濕解毒,活血化瘀為主。
林麗珠教授是國內(nèi)著名腫瘤專家,經(jīng)過多年的臨床實(shí)踐和研究,開創(chuàng)了祛瘀解毒方用于濕熱瘀毒型放射性腸炎及腸癌的治療。祛瘀解毒方由八味中藥組成,功能清熱利濕解毒,活血化瘀。其中,藥物主要?dú)w肝,大腸,脾胃和心經(jīng)。心主血,肝主藏血,脾主統(tǒng)血,對便血癥狀,能起到良好的調(diào)理作用。胃主受納,脾主運(yùn)化,大腸主傳導(dǎo),對腹痛腹瀉、便秘、里急后重等癥狀,能有針對性作用。
祛瘀解毒方治療RE的KEGG富集結(jié)果顯示,其主要通過作用于PI3K-AKT信號通路發(fā)揮作用。研究顯示,該通路廣泛存在細(xì)胞中,參與炎癥、凋亡、氧化應(yīng)激等多種生命活動[14],是典型的自噬通路,可抑制自噬的激活[15-16]。有研究發(fā)現(xiàn),NADH在正常腸細(xì)胞中可通過PI3K-AKT信號通路來抑制炎癥和增強(qiáng)自噬作用,為其對放射性腸炎具有保護(hù)作用提供了證據(jù)[16-17]。越來越多的研究證明了該信號通路可在腸道介導(dǎo)異常炎癥反應(yīng),引起腸道黏膜損傷,在腸炎發(fā)病中發(fā)揮著重要作用[18]。
祛瘀解毒方治療RE的“中藥-成分-靶點(diǎn)-現(xiàn)代醫(yī)學(xué)癥狀-中醫(yī)證候”網(wǎng)絡(luò)提示了,患者以腹痛、腹瀉、便血、便秘、便痛、里急后重等為主要癥狀,這與臨床經(jīng)驗和現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的認(rèn)識高度一致。并且,我們發(fā)現(xiàn),患者可能出現(xiàn)瘡毒、濕疹、癢等皮膚癥狀,眩暈、頭痛等頭面部癥狀?;颊邼駸岫攫鰞?nèi)蘊(yùn),在內(nèi)可見腹痛腹瀉等癥狀,在外可見瘡毒、濕疹、癢等癥狀。邪氣久居,氣機(jī)不暢,擾亂神明,可見眩暈、頭痛等癥狀?!坝兄T形于內(nèi),必形于外”,我們的研究不僅與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)相互佐證,也完善了一些對放射性腸炎的中醫(yī)診療思維。
本研究中,因為土鱉蟲,蒲公英在數(shù)據(jù)系統(tǒng)尚未收錄,仍需要進(jìn)一步完善。此外,祛瘀解毒方治療RE的相關(guān)靶點(diǎn)的BioGPS定位在了大腸、小腸,肝等下焦器官,部分定位于心、肺,這也印證了中醫(yī)藥的歸經(jīng)學(xué)說,中醫(yī)藥治病具有一定的靶向性。祛瘀解毒方不僅對于RE有治療效果,而且對于盆腹腔臟器或存在保護(hù)機(jī)制和療效,需要下一步繼續(xù)深入研究。
分子對接結(jié)果顯示了,祛瘀解毒方治療RE的主要候選化合物槲皮素和木犀草素與核心靶點(diǎn)IL6、MAPK8、CASP3具有良好的結(jié)合能力,這進(jìn)一步驗證了我們的結(jié)果。后期需要在動物和細(xì)胞層面,進(jìn)行組學(xué)、生物芯片、作用機(jī)制等方面進(jìn)行深入研究。
綜上,本文基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接的方法,探究了祛瘀解毒方治療RE的分子機(jī)制和靶點(diǎn),祛瘀解毒方治療RE主要通過抑制PI3K-Ark信號通路發(fā)揮抗炎、調(diào)節(jié)自噬等作用,并保護(hù)胃腸道黏膜,促進(jìn)黏膜修復(fù)。其靶向病位在“大腸”“小腸”“肝”“前列腺”“子宮”等下焦臟腑,臨床以腹痛、腹瀉、便血、便秘、便痛、里急后重為主要癥狀及可能出現(xiàn)瘡毒、濕疹、癢等皮膚癥狀及眩暈、頭痛等頭面部癥狀。