李芳,陳紹基,譚純,梅四鵬,賈紅菓,周榮瓊
西南大學(xué) 動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,重慶 榮昌 402460
犬弓首蛔蟲Toxocaracanis是一種寄生在犬及犬科動(dòng)物小腸內(nèi)的寄生蟲,其感染性蟲卵或幼蟲是弓首蛔蟲病(Toxocariasis)的病原體[1].弓首蛔蟲病是一種人獸共患寄生蟲病,人和其他哺乳動(dòng)物主要通過意外攝入含有T.canis感染性幼蟲或蟲卵的食物而感染[2].作為非特異性宿主,人感染后感染性蟲卵可以在小腸內(nèi)發(fā)育成為L(zhǎng)2幼蟲,但不能發(fā)育為成蟲,L2幼蟲穿過宿主小腸壁黏膜,通過循環(huán)系統(tǒng)移行進(jìn)入機(jī)體肺臟、肝臟、肌肉和大腦等各種器官、組織中,造成器官和組織的損傷,引發(fā)宿主的免疫和炎癥反應(yīng)[3-4],從而出現(xiàn)不同的臨床癥狀,如隱性弓首蛔蟲病(covert toxocariasis,CT)、神經(jīng)弓首蛔蟲病(neurological toxocariasis,NT)、內(nèi)臟幼蟲移行癥(visceral larva migrans,VLM)及眼睛幼蟲移行癥(ocular larve migrans,OLM)等[5-6],嚴(yán)重危害人類的身體健康.
磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白(phosphatidylethanolamine binding protein,PEBP)是一個(gè)高度保守的多功能堿性胞質(zhì)蛋白,其表面具有一個(gè)狹窄的空腔,是重要的配體結(jié)合位點(diǎn),可結(jié)合膜磷脂、核苷酸、三磷酸腺苷等多種物質(zhì),參與維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài),調(diào)節(jié)細(xì)胞分化、遷移和黏附等多種生物學(xué)功能[7-9].在寄生蟲中,磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白(PEBP)可參與細(xì)胞的生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖和信號(hào)傳導(dǎo)等.如寄生惡性瘧原蟲PEBP能促進(jìn)蟲體的生長(zhǎng)、發(fā)育和繁殖等[10-11];肝片吸蟲磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白通過與CD14受體進(jìn)行結(jié)合來抑制p38蛋白、細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶(ERK)和應(yīng)激活化蛋白激酶(JNK)的磷酸化,從而抑制LPS誘導(dǎo)的炎性反應(yīng),具有免疫調(diào)節(jié)特性[12].犬弓首蛔蟲磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白(Tc-PEPB)的研究未見報(bào)道,本研究通過克隆、鑒定Tc-pebp全長(zhǎng)基因,采用qRT-PCR技術(shù)對(duì)犬弓首蛔蟲各組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄差異水平分析,以期為探討Tc-PEBP蛋白的功能奠定基礎(chǔ).
1.1.1 犬弓首蛔蟲樣本
犬弓首蛔蟲蟲體樣本采自西南大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院動(dòng)物醫(yī)院某患病犬.蟲體用37 ℃滅菌的生理鹽水洗滌去除雜質(zhì)后,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定,將成熟的T.canis雌蟲卵巢進(jìn)行解剖,收集蟲卵,在37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~4周后,蟲卵發(fā)育為L(zhǎng)2期幼蟲[13].
1.1.2 主要試劑
DH5α、EasyPure?膠回收試劑盒購(gòu)自TransGen Biotech(全式金)公司;T-Vector pMD19(simple)、PrimeScriptTM反轉(zhuǎn)錄試劑盒、Taq DNA聚合酶均購(gòu)自TaKaRa公司;Trizol試劑購(gòu)自Invitrogen(賽默飛)公司.
1.2.1 總RNA的提取與反轉(zhuǎn)錄
通過形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)的方法對(duì)雌、雄蟲進(jìn)行鑒定,解剖和分離雌、雄蟲的腸道,肌肉,體壁,生殖道等各個(gè)組織.取出液氮提前預(yù)冷研缽,分別加入雌、雄蟲體各組織和L2幼蟲,在液氮中充分研磨成粉末.取研磨好的粉末放入無(wú)RNA酶離心管中,使用傳統(tǒng)的Trizol法分別提取犬弓首蛔蟲成蟲、L2期幼蟲及各組織的RNA;采用Eppendorf核酸蛋白測(cè)定儀檢測(cè)得到總RNA的濃度和純度.以提取的T.canis及各組織的總RNA為模板,按照PrimeScriptTMRT reagent Kit反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書來反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,-20 ℃保存.
1.2.2Tc-pebp基因的克隆及分析
(1)引物的設(shè)計(jì)與合成
根據(jù)Tc-PEBP全長(zhǎng)基因序列(GenBank No:AAC46843.1),用Primer Premier 6.0 和Primer-BLAST軟件設(shè)計(jì)基因特異性引物并克隆其完整編碼序列.引物序列信息為F:5’-TTAGGCCTGCGATCGATAGAA-3’;5’-AAGATAGCTAGCGTCCGGATT-3’.引物序列送擎科興業(yè)生物技術(shù)有限公司(重慶)進(jìn)行合成.
(2)Tc-pebp基因的PCR擴(kuò)增
以反轉(zhuǎn)錄合成的T.canis成蟲及L2期幼蟲的cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增.?dāng)U增體系為50 μL:上、下游引物(10 μM)各1 μL;Mg2+(25 mM)5 μL;10×PCR buffer(不含Mg2+)4.0 μL;dNTPs(2.5 mM)4 μL;模板(cDNA)2 μL;r×Taq酶(5 U/μL)1 μL;dd H2O 32.0 μL[14].
PCR反應(yīng)條件為:94 ℃ 3 min,94 ℃ 40 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min,擴(kuò)增產(chǎn)物置于4 ℃保存.
(3)克隆及測(cè)序
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,按照EasyPure?膠回收試劑盒說明書對(duì)目的PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收.將回收得到的目的基因片段與pMD19-T(simple)載體進(jìn)行連接,并轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細(xì)胞中.在37 ℃ 220 r/min的條件下震蕩培養(yǎng)60~90 min,培養(yǎng)結(jié)束后使用“L”型涂菌棒涂布于LB/Amp+固體培養(yǎng)基上(含有X-Gal和IPTG),在37 ℃恒溫培養(yǎng)箱靜置30 min后倒置,過夜培養(yǎng)12~16 h.培養(yǎng)結(jié)束后,在平板上用接種環(huán)挑取單個(gè)白色菌落于含有900 μL LB/Amp+液體培養(yǎng)基的EP管中,在37 ℃ 220 r/min的搖床中過夜培養(yǎng)14~16 h.
(4)序列分析
重組菌液經(jīng)PCR鑒定為陽(yáng)性菌液的,將其送至擎科興業(yè)生物技術(shù)有限公司(重慶)進(jìn)行測(cè)序.將測(cè)序結(jié)果通過生物大分子序列比對(duì)搜索工具(BLAST)進(jìn)行同源性比對(duì);登錄美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)網(wǎng)站查找Tc-PEBP蛋白序列,并使用MAFFT,Clustal Omega和MUSCLE等軟件對(duì)Tc-pebp基因進(jìn)行多重序列比較,通過使用MEGA 7.0軟件中的鄰接法(Neighbour-joining,NJ法)來對(duì)Tc-PEBP蛋白序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹的構(gòu)建,用Bootstrap對(duì)進(jìn)化樹的可靠性進(jìn)行分析,共1 000個(gè)重復(fù);并使用蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)SMART、PORTER和I-TASSER等軟件預(yù)測(cè)Tc-PEBP蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)構(gòu)域.
1.2.3Tc-pebp基因的組織表達(dá)分析
根據(jù)T.canis基因組數(shù)據(jù) (GenBank:AAC46843.1 ),用Primer Premier (Version 6.0 )軟件設(shè)計(jì)特異性引物并克隆其完整編碼序列,引物序列信息為F:5’-CGCATGTCAGTTGTACACAAA-3’,R:5’-GGTTAGGCCTGCGATCGATAGAA-3’.以18S 1:5’-AAAGGGCAGGGACGTAGTCAA-3’;18S 2:5’-AATTGTTGGTCTTCAACGAGGA-3’作為內(nèi)參基因[15].引物序列由擎科興業(yè)生物技術(shù)有限公司(重慶)合成.
以雌、雄蟲的肌肉、體壁、腸道及生殖道等各組織的cDNA為模板,分別用Tc-PEBP和18S rRNA引物進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR.反應(yīng)體系為50 μL:包括25 μL的SYBR Premix Ex Taq I;4 μL的 cDNA;上、下游引物各 2.0 μL;17 μL的ddH2O.PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性30 s,95 ℃變性5 s,60 ℃退火32 s,共40個(gè)循環(huán),循環(huán)結(jié)束后收集數(shù)據(jù)進(jìn)行分析.
M:2 000 bp DNA相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn); 1.雄蟲;2.雌蟲;3.L2期幼蟲;4.陰性對(duì)照.圖1 Tc-pebp基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),Tc-pebp在約800 bp處可見相應(yīng)條帶,與理論大小相符;陰性對(duì)照沒有條帶出現(xiàn)(圖1).將測(cè)序獲得的堿基序列進(jìn)行分析,結(jié)果顯示Tc-pebp基因的完整編碼區(qū)序列為789 bp,該序列含有一個(gè)完整編碼區(qū),共編碼262個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白相對(duì)分子質(zhì)量為2.6×104,功能結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示1~20個(gè)氨基酸為信號(hào)肽,第22~58位、第59~94位為2個(gè)重復(fù)的ShKT結(jié)構(gòu)域,第123~257位有PBP保守結(jié)構(gòu)域(圖2).
圖2 Tc-PEBP蛋白的結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
通過WormBase ParaSite[16]和GenBank檢索,將Tc-PEBP蛋白氨基酸序列與4個(gè)線蟲的PEBP蛋白氨基酸序列進(jìn)行多重序列比對(duì).這些序列分別是豬蛔蟲Ascarissuum(GenBank No.AEUI03000057.1)、貝拉中桿線蟲Mesorhabditisbelari(GenBank No.UZWA01000301.1)、秀麗隱桿線蟲Caenorhabditiselegans(GenBank No.NP_001300105.1)、異尖線蟲Anisakissimplex(GenBank No.UYRR01001265.1),結(jié)果發(fā)現(xiàn)均具有PBP保守結(jié)構(gòu)域(圖3).
圖3 Tc-PEBP蛋白氨基酸序列多重比對(duì)
將Tc-pebp編碼的氨基酸序列與通過WormBase ParaSite[16]和GenBank收錄的十二指腸鉤蟲Ancylostomaduodenale(GenBank No.KIH55180.1)、豬蛔蟲A.suum(GenBank No.AEUI03000057.1)、秀麗隱桿線蟲C.elegans(GenBank No.NP_001300105.1)、有齒食道口線蟲Oesophagostomumdentatum(GenBank No.KHJ93726.1)、貝拉中桿線蟲M.belari(GenBank No.UZWA01000301.1)、異尖線蟲A.simplex(GenBank No.UYRR01001265.1)、中華按蚊Anophelessinensis(GenBank No.KFB38652.1)、家蠅Muscadomestica(GenBank No.AFP60570.1 )、環(huán)紋背帶線蟲Teladorsagiacircumcincta(GenBank No.PIO76166.1)、致倦庫(kù)蚊Culexquinquefasciatus(GenBank No.EDS31592.1)、錫蘭鉤蟲Ancylostomaceylanicum(GenBank No.EPB80812.1)、毛首鞭形線蟲Trichuristrichiura(GenBank No.CDW52734.1)和豬鞭蟲Trichurissuis(GenBank No.KHJ46160.1)進(jìn)行多重序列比對(duì)并構(gòu)建進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Tc-PEBP與貝拉中桿線蟲M.belari(GenBank No.PRJEB30104)形成一個(gè)單獨(dú)的分支,其進(jìn)化關(guān)系較近(圖4).
圖4 Tc-pebp編碼氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
利用I-TASSER構(gòu)建Tc-PEBP蛋白的三維空間,其TM最高值為0.69±0.12,標(biāo)準(zhǔn)差為6.3±3.8?(圖5a).根據(jù)I-TASSER顯示的空間結(jié)構(gòu)及功能注釋,發(fā)現(xiàn)Tc-PEBP蛋白的結(jié)合位點(diǎn)為D159,F(xiàn)162,R173,H175,S198,T199,P200,H207和Y209(圖5b).酶活性位點(diǎn)為G129,A165和T241(圖5c).基因本體論注釋表明Tc-PEBP蛋白的分子功能為結(jié)合磷脂酰乙醇胺(GO:0008429),生物學(xué)過程為調(diào)控有絲分裂(GO:0045840)和蛋白磷酸化(GO:0001933),細(xì)胞組分為粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的必要組分(GO:0005791).
圖5 Tc-PEBP蛋白的結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)
使用18S rRNA引物作為內(nèi)參基因,對(duì)T.canis雌、雄蟲的肌肉、體壁、腸道及生殖道等各個(gè)組織中Tc-pebp基因的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在雌蟲的卵巢、輸卵管、子宮、體壁、腸道和肌肉中均檢測(cè)到Tc-pebp基因的表達(dá),其中卵巢的轉(zhuǎn)錄水平最高,其次是輸卵管,肌肉最低(圖6a);雄蟲的Tc-pebp基因在腸道中表達(dá)量最高,在貯精囊中轉(zhuǎn)錄水平較低(圖6b).
圖6 犬弓首蛔蟲Tc-pebp組織差異表達(dá)分析
磷脂酰乙醇結(jié)合蛋白(PEBP)在許多生理和病理過程中有著重要的作用.如在哺乳動(dòng)物體內(nèi),PEBP作為一種內(nèi)源性Raf-1激酶抑制蛋白,可通過抑制細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶(ERK)通路的激活并與核轉(zhuǎn)錄因子-κB(NF-κB)上游信號(hào)分子進(jìn)行結(jié)合,從而參與細(xì)胞的增殖、遷移、分化和機(jī)體的免疫防御反應(yīng)等[17-19].在植物體內(nèi),PEBP蛋白能夠長(zhǎng)距離運(yùn)輸,在頂端分生組織中誘導(dǎo)植物的開花并調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育[20-22].在昆蟲體內(nèi),PEBP可抵御外界微生物的入侵,被證明與昆蟲的先天免疫防御有關(guān)[23].
本研究發(fā)現(xiàn),Tc-PEBP具有ShKT結(jié)構(gòu)域(ShKT domain)和PBP結(jié)構(gòu)域(PBP domain)(圖3).ShKT結(jié)構(gòu)域由6個(gè)保守的半胱氨基酸(SXC)組成,能夠促進(jìn)其他分泌蛋白如黏蛋白的形成和聚合,參與寄生蟲的免疫逃避[24].多重序列比對(duì)顯示,Tc-PEBP與豬蛔蟲A.suum、秀麗隱桿線蟲C.elegans、貝拉中桿線蟲M.belari、異尖線蟲A.simplex等均具有保守的PBP結(jié)構(gòu)域,但N,C末端的保守性較差,這可能與不同物種與小分子物質(zhì)結(jié)合有關(guān)[25].PEBP可通過與膜結(jié)合對(duì)脂質(zhì)進(jìn)行轉(zhuǎn)運(yùn)[26],而T.canis中PEBP的結(jié)構(gòu)和功能預(yù)測(cè)顯示Tc-PEBP在脂質(zhì)運(yùn)輸中具有一定的作用,這為今后Tc-PEBP的功能研究奠定了基礎(chǔ).
磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白在寄生蟲的生長(zhǎng)、繁殖和胚胎發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用.在秀麗隱桿線蟲中PEBP存在于蟲體的肌肉、體壁、陰道等部位,推測(cè)其參與早期蟲體的生長(zhǎng)發(fā)育及外陰形態(tài)的發(fā)生[27].在曼氏血吸蟲中,磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白分布于雌蟲子宮、卵巢、輸卵管等部位,表明其與蟲體的發(fā)育繁殖有關(guān)[28];在豬蛔蟲體內(nèi),磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白存在于雌蟲的子宮、卵巢等生殖組織中,參與維持胚胎的穩(wěn)態(tài)發(fā)育[29-31].在本試驗(yàn)中,qRT-PCR結(jié)果顯示雌蟲體內(nèi)Tc-pebp在卵巢中高量表達(dá),說明Tc-pebp參與了T.canis雌蟲的繁殖過程.此外,在T.canis雌、雄蟲腸道中均檢測(cè)到Tc-pebp的表達(dá).Gobert等[32]在日本血吸蟲體內(nèi)發(fā)現(xiàn)磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白也存在于成蟲腸道中,主要起攝取、運(yùn)輸宿主體內(nèi)脂質(zhì)的作用,而Tc-pebp是否參與對(duì)蟲體脂質(zhì)的攝取、運(yùn)輸過程,有待后續(xù)進(jìn)一步研究.