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基于考慮居家隔離的新型冠狀病毒的動力學(xué)建模與分析

2022-03-17 05:56楊煥青馬慧蓮
關(guān)鍵詞:傳染居家上海市

梁 娟,張 偉,楊煥青,馬慧蓮

(1.太原工業(yè)學(xué)院理學(xué)系,山西太原 030008;2.山西大學(xué)復(fù)雜系統(tǒng)研究所,山西太原 030006)

2019 年12 月爆發(fā)的新型冠狀病毒,是一種冠狀病毒。新冠肺炎被認(rèn)為是一種與SARS 病毒不同的冠狀病毒,它可能是通過蝙蝠或其他宿主傳播的,而突變賦予了它感染人類的能力[1]。為控制疫情的繼續(xù)蔓延,中國政府于2020 年1 月23 日對武漢采取了封城舉措,全國控制人口流動,這有效的減緩了疾病的發(fā)展態(tài)勢[2]。2019 年12 月12 日,中國衛(wèi)生健康委員會在武漢確診的第一例冠狀病毒感染以來,至2020 年3 月16 日,中國共確診病例81 000 余例。而世界100多個國家現(xiàn)在也面臨著挑戰(zhàn),并以每日數(shù)千的病例增加。該冠狀病毒的傳播性和危害性已經(jīng)嚴(yán)重影響到了人類的安全。對該病毒的研究和預(yù)測已尤為重要。

為了更好地控制和預(yù)測新型冠狀病毒的傳播,國內(nèi)外很多科研工作者已經(jīng)對該病有了很多研究。Chinazzi 等人使用一個全球超人口疾病傳播模型來預(yù)測旅行限制對該病毒在國內(nèi)和國際傳播的影響。研究表明,在武漢的旅游禁令開始時,中國大多數(shù)城市已經(jīng)有了受感染的人群,中國大陸的整體疫情進(jìn)展推遲了3~5d,在國際范圍內(nèi)的影響更為明顯[3]。一些建模工作者給出了新的模型預(yù)測疾病的流行勢態(tài)[4]。黃森忠等提出了符合實際的SEIR模型,并通過模型對COVID-19進(jìn)行了預(yù)測,同時評估了控制策略的效率[5]。將干預(yù)效果進(jìn)行參數(shù)化加入模型中,更有助于對疾病的預(yù)測[6]。一些學(xué)者根據(jù)流行病學(xué)分析方法將2019 年的新冠肺炎與2003 年的SARS 做了比較,建立了多元函數(shù)模型,得到了新冠肺炎的致死率要低于SARS、發(fā)病主要集中在30~50 歲之間的結(jié)論。

自新冠肺炎疫情暴發(fā)以來,中國政府全力抗擊疫情,使得新冠疫情在我國得到了有效的控制。主要考慮居家隔離對新型冠狀病毒傳播的影響。以上海市為例,研究了新冠肺炎疫情在上海市的傳播動力學(xué)。通過運用最小二乘法對SEIR模型中的傳染率系數(shù)進(jìn)行了參數(shù)估計,并對基本再生數(shù)進(jìn)行了靈敏度分析。對研究疾病發(fā)展和控制病毒傳播給出了一定的理論指導(dǎo),同時也證明了我國政府在抗擊疫情中采取的正確有效的措施。

1 動力學(xué)模型構(gòu)建

主要考慮到COVID-19 通過人與人之間傳播,且該病潛伏期具有傳染性。將人群分為兩大部分:一部分為“出門的人群”(活躍度較高的人群即活躍態(tài)的人群),S1(易感者),E1(處于潛伏期的人群),I1(染病人群);另一部分為“居家自行隔離的人群”(活躍度較低的人群即隔離狀態(tài)的人群),S2,E2,I2。R為移出的總的活躍人群與不活躍人群。模型假設(shè)如下:

(1)主要考慮采用居家隔離措施對新型冠狀病毒傳播的影響,不考慮自然出生和死亡;

(2)假設(shè)S2只要處于“隔離”狀態(tài)就不會被傳染。

根據(jù)以上分析,我們給出了這幾類人群的倉室流程圖,如圖1所示。

圖1 疾病傳播流程圖

動力學(xué)模型

其中β1為潛伏期的傳染率;β2為染病者的傳染率;α為潛伏率,1/α為潛伏期;γ為移出率;m為從活躍度較高的人群進(jìn)入活躍度較低的人群的轉(zhuǎn)化率;p為活躍度較低的人群進(jìn)入活躍度較低的人群轉(zhuǎn)化率.以上考慮的時間都以天為單位。

定理1設(shè)系統(tǒng)(1)的初始條件S1(0),S2(0),I1(0),I2(0),E1(0),E2(0),R(0)為非負(fù)的,則?t>0,系統(tǒng)(1)的解的正不變集和吸引域為Γ={(S1,S2,…,R) ∈R+|0≤S1,S2…,R,S1+S2+…+R≤N}。

證明將(1)的7個方程相加得

可知N為常數(shù),即總?cè)丝诒3植蛔儭亩?S1+S2+…+R)≤N。

因此,具有非負(fù)初始條件的系統(tǒng)(1)的解將始終在集合Γ中。給出基本再生數(shù)R0[7]

將無病平衡點帶入(2)式可求Jacobian矩陣為:

通過計算,得到基本再生數(shù)為:

2 主要結(jié)果

2.1 參數(shù)估計

以上海市為例,對模型(1)進(jìn)行了參數(shù)估計。該市于2020 年1 月20 日出現(xiàn)感染者病例,考慮到正值春節(jié)前夕,絕大部分人處于非隔離階段。分如下幾步將模型中初值和參數(shù)的數(shù)據(jù)給出:

(I) 根據(jù)上海市衛(wèi)健委數(shù)據(jù)可知,在1 月20 日首次出現(xiàn)兩例病例,過五天后即1 月24 日為除夕,所以平均5d 后進(jìn)入不活躍狀態(tài),但在其中部分人有工作的需要,假設(shè)有60%的人居家隔離,所以m=1/5*0.6=0.12。根據(jù)當(dāng)時數(shù)據(jù)得,一個多月后上海市沒有新增病例(除國外輸入),基本解除隔離,在不活躍人群平均停留時間為40 d,所以p=1/40。

(II) 上海市人口共有24 237 800 人(數(shù)據(jù)來源上海市統(tǒng)計局),根據(jù)上述分析,居家隔離比例為m=0.12,所以S2=24 237 800 × 0.12=2 908 536。

(III)根據(jù)中國疾控中心文件《新型冠狀病毒肺炎公眾防護(hù)指南》(第二版),潛伏期為1~14 d,多為3~7 d,我們?nèi)? d,則α=1/3。根據(jù)上海市衛(wèi)健委數(shù)據(jù),第二天的確診累積病例有9例,第三天的確診累積病例有16例,所以潛伏期的人數(shù)不超過16,但多余9。假設(shè)潛伏 期人數(shù) 為10,其中E1=5,E2=5。因此,S1=24237800 -2908536 -10 -1=21329 252。

為了估計模型(1)中的參數(shù)β1和β2,通過最小二乘估計對上海市2020 年1 月20 日-2020 年2 月19 日的染病者累計確診人數(shù)進(jìn)行了擬合(含外來人口,不含境外輸入)并對2020年2月20日-2020年3月14日累計病例數(shù)進(jìn)行預(yù)測。上海市累計確診人數(shù)的擬合結(jié)果和預(yù)測結(jié)果由圖2 給出。從圖2 可以看出,模擬結(jié)果符合真實的數(shù)據(jù)走勢,說明所研究的模型以及通過擬合得到的參數(shù)值可以較好的反應(yīng)真實的疾病發(fā)展態(tài)勢。同時從該圖可以得到,在30 d 后,疾病預(yù)測結(jié)果與實際相符。累積病例數(shù)并無增長,表明了疾病得到了較好控制。

圖2 上海市累計確診病例擬合結(jié)果與累積確診病例的預(yù)測結(jié)果

2.2 對各參數(shù)的靈敏度分析

進(jìn)行靈敏度分析,以確定對基本再生數(shù)影響較大的參數(shù)[8-9]。使用Matlab 軟件,計算了R0和參數(shù)之間的偏秩相關(guān)系數(shù)(PRCC)和對應(yīng)值。偏秩相關(guān)系數(shù)(PRCC)反映在控制其他變量時,兩變量之間的相關(guān)關(guān)系,其計算公式如下:

圖3 給出了模型(1)中各個參數(shù)與R0的相關(guān)性。通過圖3 可以看出,影響疾病傳播較大的參數(shù)有m,α,β1和β2,且參數(shù)m的影響最大。參數(shù)β1和β2對R0有正的影響,說明隨著β1和β2的增加,R0會增加。反之,m和α對R0有負(fù)的影響,即隨著m和α的增加,R0會減少[10]。通過靈敏度分析,得出結(jié)論

圖3 模型(1)中各個參數(shù)與基本再生數(shù)的相關(guān)性

(1)盡量增大參數(shù)m的值,擴(kuò)大“不活躍人群”的比例,即采取居家隔離,減少社交活動等措施是最有效的控制新型冠狀病毒的措施之一。

(2)盡量降低傳染率β1和β2,避免與感染者和潛伏者的有效接觸。本著“早發(fā)現(xiàn)早隔離”的原則,盡量切斷傳染源是降低傳染率的有效方法。比如,可以通過外出戴口罩降低有效接觸。

3 結(jié)論

通過考慮帶有居家隔離的SEIR 動力學(xué)模型,以上海市為例,研究了新型冠狀病毒在該地區(qū)的傳播情況。通過數(shù)學(xué)分析,得到了基本再生數(shù)R0。由已有的上海市55 d 的感染者確診病例數(shù),通過最小二乘法對模型(1)中傳染率進(jìn)行了參數(shù)估計,得到了最優(yōu)的符合實際情形的傳染率。最后將參數(shù)關(guān)于基本再生數(shù)進(jìn)行了靈敏度分析并且模擬了各個參數(shù)對染病者累計確診病例的影響。

模擬結(jié)果發(fā)現(xiàn),傳染率β1和β2、活躍人群向不活躍人群的轉(zhuǎn)化率m以及潛伏期β1,對疾病傳播有較大的影響。其中,參數(shù)m的影響最大。所以,盡量減少傳染率同時盡量擴(kuò)大不活躍人群的比例是控制疾病的有效方法。所以,在實際中應(yīng)當(dāng)采取居家隔離策略,盡量避免外界接觸,減少社交活動。同時為了降低傳染率,應(yīng)當(dāng)對疾病早發(fā)現(xiàn)早隔離,盡早切斷傳染源。出門帶口罩也可很大程度降低被感染的機(jī)率。

對新冠肺炎疫情的控制提供了一定的指導(dǎo)意義,同時也證明了中國控制疫情采措施的有效性。在新型冠狀病毒傳播的過程中,還會受到很多因素的影響,比如:社交距離、環(huán)境、擴(kuò)散、年齡等[11]。目前,世界很多國家疫情還未得到控制,在未來的工作中,我們會將這些因素加入傳染病模型中,研究它們對疾病的影響,進(jìn)一步探討新型冠狀病毒的傳播動力學(xué)。

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