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三維培養(yǎng)牙髓間充質(zhì)細(xì)胞外泌體微小RNA表達(dá)譜分析

2022-01-10 04:26艾曉青竇磊喬新楊德琴
關(guān)鍵詞:外泌體生長(zhǎng)因子測(cè)序

艾曉青 竇磊 喬新 楊德琴

重慶醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院牙體牙髓科 口腔疾病與生物醫(yī)學(xué)重慶市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室重慶市高校市級(jí)口腔生物醫(yī)學(xué)工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 重慶401147

牙髓間充質(zhì)細(xì)胞(dental pulp stromal cells,DPSCs)是一種從牙髓組織中分離獲得的常用的牙源性間充質(zhì)細(xì)胞,已應(yīng)用在多種組織修復(fù)和再生研究中。DPSCs來(lái)源于神經(jīng)嵴,具有自我更新和多向分化的高增殖潛力[1]。外泌體(exosomes)為細(xì)胞通過(guò)溶酶體微粒內(nèi)陷形成的小囊泡,內(nèi)含豐富的活性物質(zhì),如蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、mRNA、微小RNA(microRNA,miRNA)等,可在細(xì)胞間的信息交流與物質(zhì)交換方面發(fā)揮作用[2]。研究[3-4]發(fā)現(xiàn):牙髓間充質(zhì)細(xì)胞外泌體(dental pulp stromal cell-exosomes,DPSC-Exo)具有多種治療作用,在再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域也有一些應(yīng)用報(bào)道。微環(huán)境對(duì)外泌體的分泌有明顯影響,通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)環(huán)境可能起到優(yōu)化細(xì)胞外泌體成分的作用,從而改變外泌體的治療潛能。

細(xì)胞在體內(nèi)呈三維(three-dimension,3D)立體狀態(tài)生長(zhǎng),細(xì)胞與細(xì)胞及胞外基質(zhì)之間呈相互作用的狀態(tài),而目前多數(shù)實(shí)驗(yàn)研究均采用傳統(tǒng)的二維(two-dimension,2D)單層細(xì)胞培養(yǎng)模式,即細(xì)胞在平面單層生長(zhǎng),并且只會(huì)沿著平面延伸,不能很好地復(fù)制細(xì)胞的體內(nèi)微環(huán)境,對(duì)細(xì)胞生物學(xué)功能、基因表達(dá)、胞外囊泡分泌和分化能力都有影響。在此基礎(chǔ)上,學(xué)者們[5]嘗試在3D條件下培養(yǎng)間充質(zhì)干細(xì)胞,主要方式是將細(xì)胞植入到具有3D結(jié)構(gòu)的載體中培養(yǎng),使細(xì)胞能夠在3D立體空間結(jié)構(gòu)中生長(zhǎng)、增殖、遷移及分化,發(fā)現(xiàn)其干性、增殖及分化潛能與2D培養(yǎng)的細(xì)胞相比存在一些差異,3D培養(yǎng)可放大間充質(zhì)細(xì)胞的旁分泌效應(yīng)。外泌體作為細(xì)胞旁分泌的重要產(chǎn)物,其分泌及所含miRNA會(huì)隨著細(xì)胞自身狀態(tài)及培養(yǎng)環(huán)境的不同而變化[6]。研究[7]發(fā)現(xiàn):DPSCs微球較常規(guī)2D培養(yǎng)具有更強(qiáng)的多向分化能力,經(jīng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA sequencing,RNA-Seq)技術(shù)檢測(cè),前列腺素內(nèi)過(guò)氧化物合酶2(prostaglandin endoperoxide synthase2,PTGS2)、雙調(diào)蛋白(amphiregulin,AREG)、上皮調(diào)節(jié)蛋白(epiregulin,EREG)等與血管再生,細(xì)胞遷移、分化、增殖相關(guān)基因的表達(dá)也顯著增高。本課題組在前期研究[8]中也分析了3D培養(yǎng)條件下人DPSCs的基因表達(dá)和蛋白組學(xué),推測(cè)3D培養(yǎng)也可能會(huì)調(diào)節(jié)DPSC-Exo的miRNA成分,提高DPSC-Exo的治療潛能。

本研究擬對(duì)3D培養(yǎng)模式下的DPSC-Exo miRNA進(jìn)行表達(dá)譜分析,并與2D培養(yǎng)模式下的DPSCExo miRNA進(jìn)行比較,結(jié)合生物信息學(xué)技術(shù),探索2種培養(yǎng)條件下DPSC-Exo miRNA的表達(dá)差異,并對(duì)部分差異miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),評(píng)估3D培養(yǎng)調(diào)節(jié)外泌體的治療應(yīng)用潛能。

1 材料和方法

1.1 主要試劑和儀器

α-MEM細(xì)胞培養(yǎng)基(Hyclone公司,美國(guó));培養(yǎng)皿、孔板(Corning公司,美國(guó));0.22μm注射式過(guò)濾器、超濾管(Millipore公司,美國(guó));低熔點(diǎn)瓊脂糖(Sigma公司,美國(guó));exoEasy Maxi Kit試劑盒(Qiagen公司,德國(guó));BCA試劑盒、增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光試劑、RIPA裂解液(上海碧云天生物技術(shù)有限公司);兔抗人CD63、CD9抗體(南京巴傲得生物科技有限公司);Goat Anti-rabbit IgG/HRP抗體(ThermoFisher公司,美國(guó));顯影儀(Bio-Rad公司,美國(guó));倒置顯微鏡(Nikon公司,日本);透射電子顯微鏡(transmission electron microscope,TEM)(Hitachi公司,日本);納米顆粒追蹤分析儀(ZetaView公司,德國(guó))。

1.2 細(xì)胞培養(yǎng)及無(wú)血清上清收集

1.2.1 DPSCs的2D培養(yǎng)與上清液收集 經(jīng)患者及家屬知情同意后,收集重慶醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院頜面外科門診因正畸拔除的健康前磨牙。本項(xiàng)目倫理方案經(jīng)重慶醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),批準(zhǔn)號(hào)為CQHS-REC-2020(LSNo.68)。從釉牙骨質(zhì)界將牙齒截?cái)?,在超凈臺(tái)里取出牙髓,改良酶消化法分離培養(yǎng)DPSCs,取第3代細(xì)胞接種到培養(yǎng)皿,當(dāng)細(xì)胞融合率達(dá)到80%左右時(shí),換不含血清的α-MEM培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h,收集上清液,離心去除沉淀,0.22μm注射式過(guò)濾器過(guò)濾后置于-80℃保存。

1.2.2 DPSCs的3D培養(yǎng)與上清液收集 取同一個(gè)體第3代生長(zhǎng)狀態(tài)良好的DPSCs,以密度為每毫升6×106個(gè)細(xì)胞的懸液與1.5%低熔點(diǎn)瓊脂糖按體積比1∶1混合,接種至12孔板(每孔5×105個(gè)細(xì)胞)。靜置30 min待其結(jié)膠后,加入含10%胎牛血清的α-MEM培養(yǎng)基1 mL,3 d后換不含血清的α-MEM培養(yǎng)基培養(yǎng)24h,收集上清液,過(guò)濾后置于-80℃保存。

1.3 DPSC-Exo提取

采用exoEasy Maxi Kit試劑盒提取外泌體。將收集的上清液4℃條件下解凍,使用超濾管濃縮,按試劑盒說(shuō)明書要求,依次加X(jué)BP(XBPbinding buffer)和XWP(XWPwash buffer),離心后棄濾液,最后加X(jué)E(XE elution buffer)洗脫重懸,即為外泌體溶液。

1.4 DPSC-Exo鑒定

1.4.1 TEM觀察DPSC-Exo形態(tài) 取新鮮提取的2D和3D培養(yǎng)條件下DPSC-Exo懸液20μL滴于銅網(wǎng)上,10 min后加10μL 2%的醋酸雙氧鈾于銅網(wǎng)上作用1 min,清洗,室溫干燥,樣品上機(jī),TEM鏡下觀察拍照。

1.4.2 蛋白免疫印跡法檢測(cè)2D及3D條件下DPSCExo標(biāo)記蛋白CD63、CD9 以體積比外泌體∶RIPA裂解液為2∶1的比例提取外泌體蛋白,采用BCA試劑盒檢測(cè)蛋白濃度,5×蛋白上樣緩沖液混勻后變性10 min,凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜,根據(jù)說(shuō)明書稀釋兔抗人CD63、CD9抗體,4℃孵育過(guò)夜,室溫下孵二抗1 h。洗膜后加入增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光試劑顯影。

1.4.3 納米顆粒追蹤分析(nanoparticle tracking analysis,NTA) 取新鮮提取的2D及3D培養(yǎng)條件下的DPSC-Exo 50μL準(zhǔn)備檢測(cè):1)以去離子水清洗樣本池,2)儀器以聚苯乙烯微球(110 nm)校準(zhǔn),3)以1×PBS buffer(Biological Industries公司,以色列)清洗樣本池,4)樣本以1×PBSbuffer稀釋后進(jìn)樣檢測(cè)。每個(gè)樣本重復(fù)檢測(cè)3次,該檢測(cè)由重慶榮達(dá)生物技術(shù)有限公司合作完成。

1.5 DPSC-Exo miRNA高通量測(cè)序

本實(shí)驗(yàn)中的DPSC-Exo miRNA高通量測(cè)序由武漢華大醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司合作完成,使用BGISEQ-500進(jìn)行樣本測(cè)序。采用BCA法進(jìn)行外泌體蛋白濃度校正,然后進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建。文庫(kù)構(gòu)建具體流程為:1)總RNA分離,連接5’端和3’端;2)去接頭后cDNA合成;3)cDNA擴(kuò)增,分離目的片段;4)文庫(kù)定量及混合后pooling環(huán)化;5)質(zhì)量檢測(cè),上機(jī)測(cè)序。通過(guò)對(duì)測(cè)序所得原始數(shù)據(jù)去接頭、去低質(zhì)量、去污染等得到可信的備用分析的目標(biāo)序列,對(duì)其進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

1.6 生物信息學(xué)分析

應(yīng)用華大基因旗下的Dr.Tom平臺(tái)對(duì)miRNA表達(dá)譜進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,對(duì)差異倍數(shù)取對(duì)數(shù),設(shè)置當(dāng)︱log2(3D/2D)︱≥1并Qvalue≤0.001時(shí)視為顯著差異miRNA。選擇基因本體論(gene ontology,GO)功能富集分析生物過(guò)程、細(xì)胞組分和分子功能,選擇京都基因和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)對(duì)差異miRNA進(jìn)行通路富集分析,根據(jù)TargetScan靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)部分miRNA進(jìn)行再生修復(fù)相關(guān)的靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè)。

2 結(jié)果

2.1 DPSCs的培養(yǎng)及外泌體的提取鑒定

2D培養(yǎng)條件下,DPSCs貼壁生長(zhǎng),呈長(zhǎng)梭狀的成纖維細(xì)胞樣結(jié)構(gòu)(圖1A);3D培養(yǎng)條件下,DPSCs細(xì)胞呈球形,分布于膠內(nèi)(圖1B)。通過(guò)柱膜法成功從培養(yǎng)上清中分離出外泌體,TEM檢測(cè)結(jié)果顯示:2D與3D培養(yǎng)DPSC-Exo均呈典型的茶托狀雙層膜結(jié)構(gòu)(圖1C、D)。蛋白免疫印跡法檢測(cè)顯示:2D-DPSC-Exo與3D-DPSC-Exo均表達(dá)CD63、CD9膜蛋白標(biāo)記物(圖1E、F)。NTA檢測(cè)結(jié)果顯示:2D及3D組外泌體粒徑值為30~150 nm(圖1G、H),符合外泌體特征。

圖1 2D及3D培養(yǎng)條件下DPSCs與Exo的培養(yǎng)鑒定Fig 1 Culture and identifite of DPSCs and Exo under 2D and 3D culture conditions

2.2 DPSC-Exo miRNA高通量測(cè)序結(jié)果

2.2.1 miRNA差異表達(dá) 共檢測(cè)出253個(gè)miRNA,其中3D組檢測(cè)出222個(gè),表達(dá)量前5位的miRNA分別為hsa-miR-34a-5p、hsa-let-7g-5p、hsa-let-7a-5p、hsa-miR-302b-3p和hsa-miR-100-5p;2D組檢測(cè)出154個(gè),表達(dá)量最高的為let-7家族及hsa-miR-34a-5p;兩組共同表達(dá)的123個(gè),3D-DPSC-Exo特有表達(dá)的99個(gè)(圖2A),其中顯著差異表達(dá)miRNA 60個(gè),與2D組相比,3D組表達(dá)上調(diào)27個(gè),下調(diào)33個(gè)[(︱log2(3D/2D)︱≥1,Qvalue≤0.001](圖2B)。上調(diào)基因中,hsa-miR-302a/b/c/d-3p家族均顯著增高,差異倍數(shù)(log)分別為5.23、3.04、4.27、4.74倍;同時(shí),hsa-miR-24-3p(5.37倍)、hsamiR-27b-3p(1.44倍)、hsa-miR-34a-5p(1.38倍)、hsa-miR-100-5p(1.23倍)等均為本底表達(dá)量較高且在3D培養(yǎng)條件下表達(dá)量顯著增高的miRNA(表1);下調(diào)基因中,本底表達(dá)量均較低,且變化不大。表達(dá)量聚類熱圖見(jiàn)圖3。

圖2 差異miRNA表達(dá)Fig 2 Differential miRNA expression

圖3 2D-DPSC-Exo和3D-DPSC-Exo顯著差異表達(dá)miRNA聚類熱圖Fig 3 Significantly differentially expressed miRNAs in 2D DPSC-Exo and 3D DPSC-Exo

表1 部分上調(diào)差異miRNATab 1 Partial up-regulated miRNA

2.2.2 靶基因預(yù)測(cè) 根據(jù)TargetScan靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)差異倍數(shù)最大的2個(gè)miRNA進(jìn)行再生修復(fù)有關(guān)的靶基因預(yù)測(cè):hsa-miR-302的候選靶基因有成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子(fibroblastgrowthfactor,F(xiàn)GF)19和表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)等;hsa-miR-24-3p的候選靶基因包括神經(jīng)再生相關(guān)和血管再生、細(xì)胞遷移生長(zhǎng)等相關(guān),其中神經(jīng)再生相關(guān)的基因包括神經(jīng)元分化因子(neuronal differentiation,NEUROD)2、神經(jīng)上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)化因子(neuroepithelial cell transforming,NET)1、NEUROD1、神經(jīng)元再生相關(guān)蛋白(neuronal regeneration-related protein,NREP),而血管再生和細(xì)胞遷移生長(zhǎng)等相關(guān)的基因包括FGF11、FGF結(jié) 合 蛋 白(FGF binding protein,F(xiàn)GFBP)3、FGF受體(FGF receptor,F(xiàn)GFR)3、血小板衍生生長(zhǎng)因子受體β多肽(platelet-derived growth factor receptor beta polypeptide,PDGFRB)、血小板衍生生長(zhǎng)因子受體α多肽(platelet-derived growth factor receptor alpha polypeptide,PDGFRA)、血管生成素(angiopoietin,ANGPT)4、胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白(insulin-like growth factor binding protein,IGFBP)5等,部分靶基因見(jiàn)表2。

表2 TargetScan網(wǎng)站預(yù)測(cè)hsa-miR-302a/b/c/d-3p與hsa-miR-24-3p部分靶基因Tab 2 TargetScan website predicts partial target gene of hsa-miR-302a/b/c/d-3p and hsa-miR-24-3p

2.2.3 GO分析 GO分析結(jié)果顯示:差異miRNA靶基因主要參與的生物學(xué)過(guò)程包括細(xì)胞過(guò)程(cellular process)、生物調(diào)節(jié)(biological regulation)等,主要涉及的分子功能為結(jié)合(binding),且這些差異基因大多為細(xì)胞成分(cell part)(圖4),分別在RNA聚合酶Ⅱ?qū)D(zhuǎn)錄的調(diào)控(regulation of transcription by RNA polymeraseⅡ)、蛋白結(jié)合(protein binding)、膜(membrane)等方面出現(xiàn)顯著性GO富集(圖5)。

圖4 2D-DPSC-Exo與3D-DPSC-Exo顯著差異表達(dá)miRNA靶基因的GO注釋分類Fig 4 GO annotation classification of target genesof differential miRNA in 2D and 3D-DPSC-Exo

圖5 2D-DPSC-Exo與3D-DPSC-Exo顯著差異表達(dá)miRNA靶基因分別在生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞組分和分子功能的GO富集情況(Qvalue≤0.05)Fig 5 GOterm histogram of enrichment of target genesof differential miRNAin biological process,cell component and molecular function of 2D-DPSC-Exo and 3D-DPSC-Exo(Qvalue≤0.05)

2.2.4 KEGG通路富集分析 KEGG通路富集分析的前20條通路見(jiàn)圖6:代謝通路(metabolic pathways)的富集程度最高,所含靶基因數(shù)目最多,為1 610個(gè);其次為癌癥相關(guān)通路(pathways in cancer),含靶基因632個(gè);此外,在Hippo信號(hào)通路(Hippo signaling pathway)、自噬(autophagy)等通路上也存在顯著富集。

圖6 2D-DPSC-Exo與3D-DPSC-Exo顯著差異表達(dá)miRNA靶基因KEGG通路分析(Qvalue≤0.05)Fig 6 KEGGenrichment pathway of target genesof differential miRNA in 2D-DPSC-Exo and 3D-DPSC-Exo(Qvalue≤0.05)

3 討論

外泌體作為細(xì)胞分泌囊泡中的一類功能成分,避免了直接應(yīng)用細(xì)胞的弊端,具有較高的研究和臨床轉(zhuǎn)換價(jià)值。牙源性干細(xì)胞外泌體已被證明在多種疾病治療中存在作用,如新型的仿生蓋髓術(shù)[9]、創(chuàng)傷后的腦損傷功能恢復(fù)[10]等,但絕大多數(shù)研究都是應(yīng)用2D培養(yǎng)的細(xì)胞外泌體。本研究獲得了3D-DPSC-Exo miRNA表達(dá)譜,證明其與2D培養(yǎng)存在一些差異,為優(yōu)化DPSC-Exo生物功效提供了依據(jù),也是一次重要嘗試。本研究共檢測(cè)出253個(gè)miRNA,3D組222個(gè),2D組154個(gè),其中60個(gè)存在顯著差異,對(duì)其中部分通路相關(guān)的差異miRNA進(jìn)行初步探討,并進(jìn)行生物學(xué)分析和組織再生修復(fù)相關(guān)靶基因預(yù)測(cè)。

miR-302a/b/c/d家族能夠通過(guò)雙調(diào)控細(xì)胞周期和凋亡途徑來(lái)調(diào)控人胚胎干細(xì)胞的自我更新,是一類在干細(xì)胞發(fā)育、增殖、分化等方面都有顯著作用的miRNA[11-12]。本研究發(fā)現(xiàn)miR-302a/b/c/d在3D培養(yǎng)下表達(dá)量均顯著增高,可靶向FGF19與EGFR的表達(dá),發(fā)揮組織再生與修復(fù)功能。FGF19與脂質(zhì)、葡萄糖等多種代謝途徑相關(guān),而人體中表皮生長(zhǎng)因子(epidermal growth factor,EGF)與腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor-α,TGF-α)是EGFR最重要的兩種配體,發(fā)揮著細(xì)胞增殖、血管生成、抑制凋亡等生理功能[13]。miR-302家族在腫瘤疾病中也具有重要的調(diào)控作用。有研究[14]報(bào)道:外泌體來(lái)源的miR-302b可通過(guò)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子βⅡ型受體(transforming growth factor beta typeⅡreceptor,TGFβRⅡ)/細(xì)胞外蛋白調(diào)節(jié)信號(hào)激酶(extra cellular signal-regulated protein kinase,ERK)途徑抑制肺癌細(xì)胞的增殖和遷移,為人類肺癌治療提供了潛在靶點(diǎn)。綜上所述,miR-302家族具有干細(xì)胞特性及腫瘤抑制因子特性,3D培養(yǎng)可優(yōu)化DPSC-Exo miR-302a/b/c/d表達(dá)。

miR-24-3p作為一個(gè)表觀遺傳調(diào)控因子,在血管內(nèi)皮細(xì)胞的增殖、凋亡、炎癥反應(yīng)等方面均可發(fā)揮調(diào)節(jié)作用[15],是被廣泛深入研究的miRNA之一。靶基因預(yù)測(cè)顯示,hsa-miR-24-3p可靶向多個(gè)mRNA發(fā)揮組織再生功能,如與神經(jīng)再生相關(guān)的NEUROD2、NET1、NEUROD1和NREP,與血管再生和細(xì)胞遷移生長(zhǎng)等相關(guān)的FGF11、FGFBP3、FGFR3、PDGFRB、PDGFRA、ANGPT4、IGFBP5等。本研究中,3D培養(yǎng)DPSC-Exo表達(dá)量顯著增加,表明3D培養(yǎng)模式可有效提高miR-24-3p的表達(dá),為其在再生修復(fù)相關(guān)領(lǐng)域的深入研究奠定基礎(chǔ)。

KEGG通路富集分析顯示:2D與3D條件下DPSC-Exo差異miRNA的靶基因富集于多個(gè)通路,具有一定的研究前景。最顯著的是代謝通路(metabolic pathways),所含靶基因數(shù)目最多,該通路在次生代謝物的生物合成和嘌呤代謝通路上也存在富集作用,這可能與細(xì)胞在2D與3D培養(yǎng)條件下不同的生長(zhǎng)環(huán)境有關(guān)。3D條件下,細(xì)胞成球形生長(zhǎng),增殖緩慢,部分miRNA表達(dá)顯著增高,如上述的miR-302和miR-24-3p等;同時(shí),顯著差異表達(dá)的miRNA靶基因在癌癥通路也存在富集作用,如miR-27b-3p與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān)[16-17];差異miRNA在Hippo信號(hào)通路、自噬等通路上同樣存在富集。Hippo信號(hào)通路在器官大小、癌癥發(fā)生、組織再生等功能上均有重要作用[18];而自噬是一種細(xì)胞保護(hù)機(jī)制,也是近年來(lái)的研究熱點(diǎn)之一。miR-34a-5p與miR-100-5p在2D及3D中表達(dá)量均較高,多項(xiàng)研究[19-20]已證明它們?cè)谘装Y抑制方面具有顯著作用,且與自噬相關(guān)。miR-34a-5p與miR-100-5p在一些炎癥疾病的治療中可能發(fā)揮一定的作用。

近年來(lái),隨著組織工程技術(shù)的興起,多項(xiàng)研究[21-23]表明3D培養(yǎng)比2D培養(yǎng)更適合用于多種領(lǐng)域,包括組織再生及癌癥生物學(xué)。如3D培養(yǎng)Hertwig上皮 性 根 鞘 細(xì) 胞(Hertwig’s epithelial root sheath,HERS)促進(jìn)了細(xì)胞的擴(kuò)張率,產(chǎn)生了更多的礦化組織并促進(jìn)了牙本質(zhì)樣組織的形成,這可能會(huì)開創(chuàng)牙齒相關(guān)組織再生領(lǐng)域的新時(shí)代[21];過(guò)表達(dá)血小板源性生長(zhǎng)因子BB(platelet-derived growth factor-BB,PDGF-BB)并包裹在熱敏水凝膠中的人牙周膜干細(xì)胞(human periodontal ligament stem cells,hPDLSCs)可以更好地發(fā)揮治療牙槽骨缺損的作用[22]。而通過(guò)3D培養(yǎng)技術(shù),成功發(fā)現(xiàn)MG53(mitsugumin-53)可通過(guò)調(diào)節(jié)磷脂酰肌醇3激酶(phosphatidylinositol 3 kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinaseB,AKT)信號(hào)通路抑制舌癌細(xì)胞的發(fā)展[23]。隨著3D培養(yǎng)技術(shù)及外泌體應(yīng)用領(lǐng)域的發(fā)展,二者結(jié)合將有更廣闊的運(yùn)用前景。

綜上,本研究利用高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)分析,對(duì)2D-DPSC-Exo及3D-DPSC-Exo miRNA表達(dá)譜進(jìn)行了分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):3D-DPSCExo中部分miRNA表達(dá)量顯著升高,差異miRNA主要富集在代謝、腫瘤、Hippo與自噬等相關(guān)通路,可能靶向多種mRNA從而起到促進(jìn)組織修復(fù)再生的治療作用。3D培養(yǎng)條件下DPSC-Exo可能更具有潛在的應(yīng)用價(jià)值,在今后采用DPSC-Exo進(jìn)行組織再生修復(fù)、腫瘤、發(fā)育代謝等研究時(shí),不妨提取3D生長(zhǎng)條件下的細(xì)胞外泌體。

利益沖突聲明:作者聲明本文無(wú)利益沖突。

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