隋夕然,王 妍,2,*,劉云根,2,張雅潔,吳麗芳
(1.西南林業(yè)大學 生態(tài)與環(huán)境學院,云南 昆明 650224;2.云南省山地農(nóng)村生態(tài)環(huán)境演變與污染治理重點實驗室,云南 昆明650224)
喀斯特生態(tài)系統(tǒng)是一個環(huán)境容量低、生態(tài)系統(tǒng)變異敏感度高、災害承受閾值低的具有生態(tài)脆弱性特征的特殊生態(tài)系統(tǒng)??λ固氐貐^(qū)的生態(tài)環(huán)境非常脆弱,土層淺薄,貯水能力差,加之人為破壞和不合理利用,石漠化問題非常突出[1]。相較于其他喀斯特地貌類型區(qū),我國西南石漠化區(qū)的治理工作在基礎(chǔ)理論研究方面相對薄弱[2],治理技術(shù)模式單一[3],效果不理想,亟需相關(guān)科學研究提供理論依據(jù)和有效技術(shù)支撐。
土壤微生物在生態(tài)系統(tǒng)中扮演著養(yǎng)分驅(qū)動者的角色,與土壤養(yǎng)分的遷移和轉(zhuǎn)化息息相關(guān)[4]。在土壤微生物中,細菌分布最廣泛,數(shù)量、類群最多,參與土壤的養(yǎng)分循環(huán)利用,維持生態(tài)系統(tǒng)的能量流動和物質(zhì)循環(huán)[5]。尹娜[6]研究顯示,在歐亞草原帶上,土壤碳、氮、磷等營養(yǎng)元素的含量對土壤細菌多樣性有顯著影響;戴雅婷等[7]發(fā)現(xiàn),庫布齊沙地自然恢復的油蒿群落根際土壤的細菌群落豐度,與土壤含水量,及氮、磷、鉀等養(yǎng)分含量密切相關(guān);韓亞飛等[8]研究顯示,在門分類水平上,變形菌門為連作楊樹人工林土壤中豐度最高的優(yōu)勢菌群;柳春林等[9]認為,土壤全氮與變形菌群具有正向的相互促進作用。目前,針對典型喀斯特區(qū)域土壤養(yǎng)分、細菌群落組成、多樣性對不同海拔梯度響應(yīng)的研究工作在本文檢索范圍內(nèi)還鮮見報道,關(guān)于不同海拔對典型喀斯特區(qū)域松林土壤微生物群落結(jié)構(gòu)的影響,及微生物與環(huán)境因子的關(guān)系等問題,尚無明確結(jié)論。
云南省建水縣是我國西南喀斯特區(qū)域的典型代表,當?shù)氐貏菸髂细摺|北低,海拔高差大,碳酸鹽分布廣泛,土地石漠化現(xiàn)象嚴重[10]。本研究深入探索該區(qū)域不同海拔對云南松林土壤理化性質(zhì)的影響,以及不同海拔梯度下云南松林土壤微生物的群落組成和多樣性特征,并基于高通量測序技術(shù),揭示微生物群落組成和多樣性對喀斯特地區(qū)海拔梯度的響應(yīng)關(guān)系,以期為我國西南典型喀斯特區(qū)域的石漠化治理、植被恢復提供理論支撐,為當?shù)氐耐寥牢⑸锒鄻有匝芯亢捅Wo提供參考。
研究區(qū)位于云南省建水縣境內(nèi),地理坐標為102°49′~103°9′E、23°18′N~23°40′N,海拔在1 300~2 100 m。該區(qū)屬南亞熱帶季風氣候,年均氣溫19.8 ℃,年均地溫20.8 ℃,年均相對濕度72%,年均日照時數(shù)2 322 h,全年無霜期307 d[11]。該區(qū)碳酸鹽巖溶地貌分布廣泛,土壤巖性以石灰?guī)r為主,基巖裸露率在30%~70%。受土壤母質(zhì)影響,當?shù)氐闹饕寥李愋蜑槭彝粒诸愋蜑閬啛釒С>G落葉闊葉混交林[12]。
2019年9月,在研究區(qū)海拔1 300~2 100 m范圍內(nèi),以高程200~300 m作為一個梯度(具體地,分別對應(yīng)于海拔1 300、1 600、1 900、2 100 m,各海拔梯度上研究區(qū)的基本情況詳見表1),在每個海拔梯度上選取3個云南松林代表性區(qū)域設(shè)置樣地,共布設(shè)12個樣地,每個樣地的大小均為20 m×20 m。同時,在每個樣地的4個角和對角線交點處再設(shè)置5個2 m×2 m的樣方,在每個樣方中心采集500 g土壤進行混合,從混合均勻的土壤中取出500 g(以下將其稱為土樣1)帶回實驗室用于理化性質(zhì)測定。同時,為了避免微生物樣品污染,嚴格按照相關(guān)要求采集10 g土樣(以下將其稱為土樣2),剔除大的石塊和雜質(zhì),而后放入無菌離心管中密封,在干冰保護環(huán)境下帶回實驗室,用于土壤微生物檢測。
表1 不同海拔梯度的研究區(qū)概況
土樣1在室溫下風干,研磨,分別過2、0.25 mm篩,測定土壤理化性質(zhì)。土樣2在超凈臺中剔除更小的石塊和雜質(zhì),從剩下的混合均勻的無雜質(zhì)樣本中取出5 g放入無菌離心管,加干冰低溫保存,送往上海凌恩生物科技有限公司進行DNA提取和微生物測序。
本研究測定的土壤理化性質(zhì)指標包括全碳(TC)、全氮(TN)、全磷(TP)、全鉀(TK)、速效氮(AN)、速效磷(AP)、速效鉀(AK)、pH[13]。其中:TC采用重鉻酸鉀氧化-外加熱法測定,TN采用凱氏定氮法測定,TP采用NaOH堿熔-鉬銻抗比色法測定,TK采用NaOH熔融-火焰光度法測定,AN采用堿解擴散法測定,AP采用NaHCO3浸提-鉬銻抗比色法測定,AK采用NH4OAc浸提-火焰光度法測定,pH采用酸度計法測定。
測定上述指標時用到的主要儀器包括:HWS-26型電熱恒溫油浴鍋,上海一恒科學儀器有限公司;KDN-1000型全自動凱氏定氮儀,上海昕瑞儀器儀表有限公司;T6新世紀型紫外可見光光度計,北京普析通用儀器有限責任公司;AB204-S型火焰光度計,梅特勒-托利多儀器(上海)有限公司;PHS-3C型pH計,上海儀電科學儀器股份有限公司;BL-WM100型擴散皿,北京艾維科電科技有限公司。
采用Microsoft Office Excel 2010程序進行數(shù)據(jù)錄入、整理和初步分析;采用SPSS 21.0軟件對數(shù)據(jù)進行方差分析,檢驗不同海拔云南松林的土壤養(yǎng)分差異(顯著性水平選定為α=0.05);利用Canoco 5軟件進行冗余分析(RDA),探討云南松林土壤養(yǎng)分指標和細菌群落之間的相關(guān)性。
使用QIIME 1.9.1軟件對獲得的高質(zhì)量微生物序列按97%的序列相似度進行歸并,劃分運算分類單元(OTU),基于Silva參考數(shù)據(jù)庫進行比對,得到每個OTU對應(yīng)的物種分類信息;基于OTU劃分和分類地位鑒定結(jié)果,獲得每個樣本在各分類水平的群落組成;計算測序豐富度指數(shù)(Chao1)、多樣性指數(shù)(Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù))。
利用Origin 2019軟件制圖。
研究區(qū)不同海拔云南松林地土壤理化性質(zhì)變化明顯(圖1)。隨海拔升高:土壤pH先減小后增大,海拔1 300 m處土壤pH最高(7.72),海拔1 900 m處土壤pH最低(6.34),且不同海拔間差異顯著;TC、TN、TP含量先增加后降低,且不同海拔間差異顯著,三者的含量范圍分別為11.60~48.26、1.32~3.09、0.54~0.97 g·kg-1;AN含量先顯著增加,后顯著降低,但海拔1 300 m與2 100 m處差異不顯著,含量范圍在65.27~144.52 mg·kg-1;TK含量在各海拔處差異顯著,以海拔1 900 m處最高(0.66 g·kg-1)、海拔1 600 m處最低(0.38 g·kg-1);AP含量同樣在各海拔處差異顯著,但以海拔1 600 m處最高(2.64 mg·kg-1)、海拔1 900 m處最低(1.44 mg·kg-1);AK含量以海拔1 900 m處最高(95.25 mg·kg-1)、海拔1 600 m處最低(60.40 mg·kg-1),兩者差異顯著,且均顯著高于其他海拔處,但海拔1 300 m與海拔2 100 m處的土壤AK含量無顯著差異。
TC,全碳;TN,全氮;TP,全磷;TK,全鉀;AN,速效氮;AP,速效磷;AK,速效鉀。下同。
測序結(jié)果顯示,各樣品文庫的覆蓋率(coverage)在98.11%~99.01%(表2),說明測序結(jié)果能夠代表土壤中細菌群落的真實情況。從Chao1指數(shù)和OTU數(shù)來看,研究區(qū)內(nèi)各海拔的細菌群落豐度從高到低依次為1 900 m>1 600 m>2 100 m>1 300 m。Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)都是用來估算樣本中微生物多樣性的指標,在生態(tài)學中常用來定量描述一個區(qū)域的生物多樣性。Shannon指數(shù)值越大,說明群落多樣性越高;Simpson指數(shù)值越大,說明群落多樣性越低。在本研究中,Shannon指數(shù)值在海拔1 900 m最大,Simpson指數(shù)值在海拔1 900 m最小,說明云南松林土壤細菌的群落多樣性在該海拔處最高。這一結(jié)果表明,不同海拔梯度對土壤細菌多樣性的影響是不同的。
表2 不同海拔云南松林土壤的細菌豐度與多樣性
在門分類水平上(圖2),相對豐度較大的有變形菌門(Proteobacteria)、酸桿菌門(Acidobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)和綠彎菌門(Chloroflexi),分別占總測序序列的33.37%、24.40%、19.82%、12.06%,且在4個海拔梯度上均有;疣微菌門(Verrucomicrobia)和棒狀桿菌門(Rokubacteria)分別占總測序序列的3.57%和1.22%,僅在海拔1 300、1 900、2 100 m上共有;芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)占總測序序列的2.06%,在海拔1 300、1 600、1 900 m上共有;Patescibacteria占總測序序列的1.07%,在海拔1 900、2 100 m上共有;其他相對豐度不足1.5%的細菌合計占總測序序列的3.69%。在4個海拔共有的細菌中,變形菌門、酸桿菌門的相對豐度在海拔1 900 m處最大,綠彎菌門的相對豐度在海拔2 100 m處最大,放線菌門的相對豐度在海拔1 600 m處最大。除上述優(yōu)勢菌群外,其他相對豐度較低的細菌群落在不同海拔下相對豐度變化不大。
Proteobacteria,變形菌門;Acidobacteria,酸桿菌門;Chloroflexi,綠彎菌門;Actinobacteria,放線菌門;Verrucomicrobia,疣微菌門;Gemmatimonadetes,芽單胞菌門;Rokubacteria,棒狀桿菌門;Bacteroidetes,擬桿菌門;Latescibacteria,匿桿菌門。Blastocatellia(Subgroup 4),母鏈菌綱;Bacteroidia,擬桿菌綱;Actinobacteria,放線菌綱;Deltaproteobacteria,δ-變形菌綱;Rubrobacteria,紅桿菌綱;Acidimicrobiia,酸微菌綱;Chloroflexia,綠彎菌綱;Gemmatimonadetes,芽單胞菌綱;Thermoleophilia,嗜熱油菌綱;Verrucomicrobiae,疣微菌綱;Gammaproteobacteria,γ-變形菌綱;Ktedonobacteria,纖線桿菌綱;Alphaproteobacteria,α-變形菌綱;Acidobacteriia,酸桿菌綱。
在綱分類水平上,相對豐度較大的集中于酸桿菌綱(Acidobacteriia)、α-變形菌綱(Alphaproteobacteria)、γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)、δ-變形菌綱(Deltaproteobacteria),合計占總測序序列的44.18%。其中,酸桿菌綱、α-變形菌綱和γ-變形菌綱在4個海拔梯度上共有,而δ-變形菌綱在海拔1 300、1 900、2 100 m上共有。α-變形菌綱、γ-變形菌綱的相對豐度在海拔1 900 m處最大,而酸桿菌綱的相對豐度在海拔1 900 m處最低,δ-變形菌綱的相對豐度在不同海拔間無顯著差異。在綱分類水平上,其他細菌群落在不同海拔的相對豐度變化不大。
對不同海拔土壤細菌豐度、多樣性與土壤理化因子的相關(guān)關(guān)系進行分析(表3),結(jié)果顯示:土壤pH值與Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)呈極顯著(P<0.01)負相關(guān),與Simpson指數(shù)呈顯著(P<0.05)正相關(guān);土壤TC、TN、TP、AN、AP分別與Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)呈極顯著(P<0.01)正相關(guān),土壤TC、TP、AP與Simpson指數(shù)呈極顯著(P<0.01)負相關(guān);土壤TN、AN與Simpson指數(shù)呈顯著(P<0.05)負相關(guān)。
表3 土壤理化性質(zhì)與細菌豐富度指數(shù)、多樣性指數(shù)的相關(guān)性
對細菌群落組成與土壤養(yǎng)分指標進行冗余分析,結(jié)果顯示:pH、TC、TN和AN對細菌群落組成的影響程度較強。土壤pH與綠彎菌門、疣微菌門、棒狀桿菌門、Patescibacteria、芽單胞菌門的相對豐度正相關(guān),與變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、擬桿菌門、匿桿菌門(Bacteroidetes)的相對豐度負相關(guān);TC、TN和TP與放線菌門、酸桿菌門、擬桿菌門、變形菌門、匿桿菌門的相對豐度正相關(guān),與綠彎菌門、疣微菌門、棒狀桿菌門、Patescibacteria、芽單胞菌門的相對豐度負相關(guān);AP和AN與放線菌門和芽單胞菌門的相對豐度正相關(guān),與綠彎菌門、疣微菌門、棒狀桿菌門的相對豐度負相關(guān);TK、AK與變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、擬桿菌門、匿桿菌門、綠彎菌門、疣微菌門、棒狀桿菌門、Patescibacteria的相對豐度正相關(guān),與放線菌門、芽單胞菌門的相對豐度負相關(guān)。綜上所述,土壤pH、TC、TN、AN和TP是細菌群落組成變化的主要驅(qū)動因子,對變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、擬桿菌門、匿桿菌門等幾種優(yōu)勢菌門的影響最大。
Proteobacteria,變形菌門;Acidobacteria,酸桿菌門;Chloroflexi,綠彎菌門;Actinobacteria,放線菌門;Verrucomicrobia,疣微菌門;Gemmatimonadetes,芽單胞菌門;Rokubacteria,棒狀桿菌門;Bacteroidetes,擬桿菌門;Latescibacteria,匿桿菌門。圖3 細菌門分類群落與養(yǎng)分指標的冗余分析
研究發(fā)現(xiàn),典型喀斯特區(qū)不同海拔云南松林的土壤pH值,及全量養(yǎng)分和速效養(yǎng)分含量存在顯著差異。土壤pH值對土壤養(yǎng)分的理化性質(zhì)和有效性、微生物群落結(jié)構(gòu),以及植物生長發(fā)育都有很大的影響[14]。在本研究中,隨著土壤pH值升高,土壤養(yǎng)分的有效性降低,這與王艷艷等[15]的研究結(jié)果相似。土壤碳、氮含量是反映土壤肥力的重要指標[16]。本研究發(fā)現(xiàn),土壤TC、TN、AN含量隨海拔升高呈先上升后下降的趨勢,這與吳玥等[17]在戴云山研究的結(jié)果一致。原因可能是,本研究海拔梯度間跨度較大,溫度差異影響了土壤養(yǎng)分含量的積累[18]。在一定范圍內(nèi),隨海拔升高,氣溫降低,動植物殘體的分解速率減慢,造成土壤有機碳、氮礦化速率降低[19],相應(yīng)地,土壤中的碳、氮積累量增加,因此土壤養(yǎng)分含量先相應(yīng)升高。馬維偉等[20]認為,土壤養(yǎng)分含量的變化與溫度、水分的相關(guān)性很高,土壤養(yǎng)分的積累需要相對適宜的溫度,溫度過高或者過低都會產(chǎn)生負效應(yīng)。當海拔高度超過1 900 m后,溫濕度等因素共同作用下的環(huán)境已經(jīng)超出了喀斯特區(qū)云南松林土壤養(yǎng)分積累的閾值,因而土壤TC、TN、AN含量隨海拔升高反而呈現(xiàn)下降的趨勢。本研究中,土壤磷素含量在低海拔處較低。這可能是因為,低海拔區(qū)的溫度相對較高,磷素在土壤中的遷移轉(zhuǎn)化能力較強[21],更易流失,因而積累量較低。本研究中,土壤全鉀和速效鉀含量在不同海拔間無明顯規(guī)律,這可能與土壤的空間異質(zhì)性和人為因素有關(guān)[22]。
前人研究表明,海拔對土壤細菌組成和多樣性的影響不盡相同。Fierer等[23]發(fā)現(xiàn),細菌多樣性沒有顯著的海拔梯度差異;Bryant等[24]發(fā)現(xiàn),微生物多樣性隨海拔梯度上升而增加。本研究中,隨海拔升高,Chao1指數(shù)和Shannon指數(shù)整體趨勢為先增大后減小,而Simpson指數(shù)的整體趨勢為先減小而后增大,且細菌多樣性與土壤pH值,及全碳、全氮、全磷和相應(yīng)的速效養(yǎng)分含量有顯著相關(guān)性。林耀奔等[25]發(fā)現(xiàn),有機質(zhì)含量高、pH值低的環(huán)境更適于微生物的生存和繁殖;楊立賓等[26]發(fā)現(xiàn),有機碳、氮、磷含量高的土壤中微生物數(shù)量最多,原因是細菌分解主要發(fā)生在有機質(zhì)含量高的土壤中。本研究中,在1 300~1 900 m,土壤有機碳、氮、磷含量逐漸升高,細菌的數(shù)量與多樣性也隨之增加。
本研究在土壤中檢測出變形菌門、酸桿菌門、放線菌門、綠彎菌門等優(yōu)勢細菌類群,其中,變形菌門的相對豐度最大,這與趙愛花等[27]在落葉闊葉林土壤上的研究結(jié)果一致。李艷春等[28]發(fā)現(xiàn),在福建茶園土壤中,變形菌門是最主要的細菌類群,其代謝活動是土壤中最主要的細菌活動,隨著土壤氮素含量增加,變形菌門的豐度增加。這與本研究中土壤全氮含量與變形菌門細菌相對豐度正相關(guān)的結(jié)果一致。Jangid等[29]發(fā)現(xiàn),在熱帶森林和農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)中,變形菌、酸桿菌占比很大;Fierer等[30]發(fā)現(xiàn),在溫帶森林土壤中豐度最大的細菌為酸桿菌;Yuan等[31]在青藏高原草地土壤、Liu等[32]在東北黑土中也發(fā)現(xiàn),含量最豐富的細菌類群是酸桿菌。但在本研究中,酸桿菌門、放線菌門的相對豐度低于變形菌門。這說明,不同類型土壤中微生物的優(yōu)勢類群不盡相同,不同環(huán)境的微生物既具有豐富多樣性的特點,又具有類群相似性的特點[33]。
土壤細菌群落組成對土壤理化性質(zhì)的變化較為敏感,尤其是土壤碳庫和pH值對細菌群落組成的影響最為明顯[34]。本研究發(fā)現(xiàn),土壤pH值與酸桿菌門細菌的相對豐度負相關(guān),而土壤全碳、全氮、全磷含量與酸桿菌門正相關(guān)。這是因為,酸桿菌屬于嗜酸菌,更適宜在酸性環(huán)境中生存[35]。同時,酸桿菌門細菌具有編碼纖維素酶和淀粉水解酶的基因序列,可加速分解動植物殘體產(chǎn)生有機質(zhì)等養(yǎng)分[36]。綠彎菌門細菌需要消耗有機質(zhì)來供應(yīng)代謝活動所需要的能量[37],因此綠彎菌門與土壤全碳、全氮、全磷含量負相關(guān)。本研究中,全碳、速效氮、全磷和速效磷與放線菌門正相關(guān)。這是因為,放線菌門具有促進土壤碳、氮、磷等養(yǎng)分轉(zhuǎn)化和積累、提高土壤質(zhì)量的作用[38]。
綜上所述,典型喀斯特區(qū)云南松林土壤養(yǎng)分與細菌群落組成和多樣性對不同海拔的響應(yīng)顯著,土壤養(yǎng)分含量是影響土壤細菌群落組成與多樣性的主要因子,不同海拔土壤養(yǎng)分含量的變化會導致細菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯的規(guī)律性變化。