韓英鵬，楊振紅

（東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆研究所/大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部東北大豆生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，哈爾濱 150030）

1 大豆分子標(biāo)記及分子輔助育種研究的重要性

大豆是我國最重要的糧食和油料作物之一，近年來，我國大豆的需求量逐步增加，僅2019年，需求總量就高達(dá)10 500萬t，但國產(chǎn)大豆產(chǎn)量僅為1 809萬t，需求缺口高達(dá)8 700萬t左右，并有不斷擴(kuò)大的趨勢。面對進(jìn)口大豆依賴度越來越高的窘?jīng)r，合理運(yùn)用多種育種手段培育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、多抗大豆新品種，來提高大豆產(chǎn)量和品質(zhì)，填補(bǔ)產(chǎn)需缺口是大豆育種家們的首要任務(wù)[1]。

相較傳統(tǒng)育種手段，分子標(biāo)記輔助育種具有育種年限短、效率高、準(zhǔn)確性強(qiáng)等特點(diǎn)，成為大豆育種研究的熱點(diǎn)[2]。近年來基因組技術(shù)的發(fā)展和DNA標(biāo)記逐步整合到大豆遺傳連鎖圖譜中，目前已鑒定出大量與重要性狀相關(guān)的QTL，其部分QTL已應(yīng)用于大豆分子輔助標(biāo)記育種[3]。王傳之等[4]利用抗病標(biāo)記對自然群體材料進(jìn)行基因型鑒定，篩選出符合預(yù)期的抗花葉病毒病SC7株系的大豆新品系；葉俊華等[5]利用大豆抗胞囊線蟲病基因和耐鹽基因的5個(gè)KASP標(biāo)記及大豆抗花葉病毒的1個(gè)SCAP標(biāo)記，對1 489份大豆品種的基因型進(jìn)行了鑒定，篩選出多個(gè)抗病耐鹽新種質(zhì)。李瓊等[6]以周豆25號和周豆18號雜交后自交獲得F2群體為材料，運(yùn)用BSA方法從144對大豆高蛋白基因SSR分子標(biāo)記中，鑒定出貢獻(xiàn)率高的satt182并驗(yàn)證了其在分子輔助選育高蛋白品系中的作用。充分了解與大豆重要性狀相關(guān)的QTL及其分子標(biāo)記，及時(shí)掌握大豆分子輔助育種方面的最新動態(tài)，對加快大豆育種進(jìn)程及提高育種準(zhǔn)確性十分有利。綜述匯總了2021年分子標(biāo)記及抗病育種的主要進(jìn)展，對大豆分子標(biāo)記和抗病育種前景進(jìn)行展望，期望總結(jié)前人的研究成果，為大豆分子輔助育種提供有力工具。

2 國際相關(guān)研究動態(tài)

對2021年國內(nèi)外大豆分子標(biāo)記及分子輔助育種方面的研究報(bào)告進(jìn)行查閱匯總，發(fā)現(xiàn)主要集中于抗病、抗逆、產(chǎn)量和品質(zhì)性狀上，這些研究大多通過連鎖分析、關(guān)聯(lián)分析及BSA等策略之間的結(jié)合，獲得與重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的QTL和SNP標(biāo)記。通過對挖掘的遺傳位點(diǎn)精細(xì)定位，將鑒定出與性狀相關(guān)的候選基因應(yīng)用于分子輔助育種中，為驗(yàn)證基因功能，梳理表達(dá)機(jī)制提供便利。通過開發(fā)與其連鎖的分子標(biāo)記再利用，能夠改進(jìn)遺傳圖譜的精度，定位新的性狀相關(guān)候選基因。

2.1 國際大豆抗病性狀研究

大豆疫霉根腐病方面，Li等[7]通過酵母雙雜交和雙分子熒光互補(bǔ)（BIFC）實(shí)驗(yàn)，證明大豆疫霉效應(yīng)因子Avr1b與E3泛素連接酶GmPUB1的相互作用是被攜帶抗性-b和-k基因大豆識別的前提。大豆菌核病方面，草酸（OA）是核盤菌導(dǎo)致大豆菌核病發(fā)生的重要毒力因子，McCaghey等[8]以草酰乙酸乙酰水解酶（Ssoah1）缺失突變體是OA缺陷型且對大豆無致病性為切入點(diǎn)，將靶向Ssoah1的BPMV載體（pBPMV-OA）接種大豆。結(jié)果顯示，與空載體對照植物相比，pBPMV-OA接種的植物對核盤菌的抗性增強(qiáng)。大豆胞囊線蟲方面，Kofsky等[9]從野生大豆資源種鑒定出SCN抗性生態(tài)型NRS100，同時(shí)解析了該生態(tài)型通過抑制茉莉酸信號通路，允許水楊酸（SA）信號激活SCN抗性反應(yīng)，并通過多胺的合成過程促進(jìn)根細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)的完整性。Ravelombola等[10]通過全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）和基因組選擇（GS）結(jié)合的方法，驗(yàn)證了大豆耐受指數(shù)（TI）對SCN感染的大豆基因型之間存在差異；SMR、GLM（PCA）和MLM（PCA+K）模型分別鑒定到35，21和6個(gè)SNP與SCN耐受性相關(guān)，其中6個(gè)SNP在模型之間重疊，適合精細(xì)定位抗SCN候選基因。

2.2 國際大豆抗逆性狀研究

大豆耐澇方面，Sharmin等[11]利用243個(gè)品種中獲得的34718個(gè)SNP進(jìn)行GWAS分析，通過混合線性模型（MLM）和多位點(diǎn)隨機(jī)SNP效應(yīng)混合線性模型（mrMLM），分別定位到2個(gè)與種子淹水耐受性相關(guān)的SNP位點(diǎn)。耐旱方面，Chuong等[12]利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)，將大豆GmHP08基因?qū)霐M南芥異源表達(dá)。在缺水條件下，與野生型（WT）比較，轉(zhuǎn)GmHP08基因擬南芥存活率更高，抗氧化酶編碼基因的表達(dá)明顯增強(qiáng)。相反，衰老相關(guān)基因之一的GmSAG13基因和幾種脫落酸（ABA）相關(guān)基因的表達(dá)受到抑制。Chamarthi等[13]以6個(gè)環(huán)境條件下種植的200份不同成熟度組（MG）IV材料和6個(gè)檢驗(yàn)品種為材料，利用34 680個(gè)單核苷酸多態(tài)性（SNPs）進(jìn)行關(guān)聯(lián)作圖，識別出188個(gè)與冠層萎蔫（CW）相關(guān)的顯著SNP，其附近共鑒定出183個(gè)候選基因，其中57個(gè)SNP存在于直接或間接地與蒸騰或節(jié)水有關(guān)的基因中。

2.3 國際大豆產(chǎn)量性狀研究

大豆豆莢種子數(shù)方面，Jeong等[14]以Sowon（窄小葉和高豆莢粒數(shù)）和V94-5152（寬小葉和低豆莢粒數(shù)）的雜交后代BC3F2種群為研究材料，通過高分辨率作圖法劃定到一個(gè)66 kb控制窄葉形狀和NSPP（每莢豆莢粒數(shù)）性狀的基因組區(qū)域，該區(qū)域包含3個(gè)與豆莢粒數(shù)相關(guān)的候選基因。百粒重方面，Ravelombola等[15]通過全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）和基因組選擇（GS）方法評估了250個(gè)種質(zhì)和10 259個(gè)高質(zhì)量SNP，鑒定出37個(gè)與種子重量相關(guān)的SNP，23個(gè)與大豆產(chǎn)量相關(guān)的SNP。KIX結(jié)構(gòu)域蛋白家族成員在植物中負(fù)調(diào)控細(xì)胞增殖，Nguyen等[16]利用正向遺傳方法和CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)使大豆中GmKIX8-1基因不表達(dá)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)功能缺失的GmKIX8-1突變體顯著增加了大豆種子的氣生器官。

2.4 國際大豆品質(zhì)性狀研究

大豆異黃酮含量方面，Knizia等[17]以SNP位點(diǎn)繪制了Williams 82重組自交系（RIL）群體的遺傳連鎖圖譜，NC-2018和IL-2020 2個(gè)環(huán)境條件下在染色體（Chrs.）2、4、5、6、10、12、15、19 和 20上，共鑒定了27個(gè)控制種子異黃酮性狀的QTL，其中Chrs.2、4、5、12、15和19上的6個(gè)QTL為新位點(diǎn)，剩余21個(gè)QTL已通過GWAS方法得到鑒定。風(fēng)味方面，大豆籽粒中的脂氧合酶（Lox1，Lox2和Lox3）會使大豆制品產(chǎn)生豆腥味，影響大豆在食品加工中的利用。Carpentieri等[18]利用編碼Lox1，Lox2和Lox3三種酶的遺傳標(biāo)記分析發(fā)現(xiàn)，品種BRS213中存在純合的空等位基因Lx3，與BR36雜交地F2分離群體中鑒定出雜合子雜合和純合Lx3系。另外，通過遺傳標(biāo)記Satt090和Satt417確認(rèn)出親本品種BRS 213中存在純合子Lx2空等位基因。此外，Kumar等[19]利用改良標(biāo)記輔助回交技術(shù)，培育出遺傳上不含脂氧合酶-2的基因型NRC132，以期提高大豆在制造食品中的利用率。

3 國內(nèi)相關(guān)研究動態(tài)

3.1 國內(nèi)大豆抗病性狀研究

大豆疫霉根腐病方面，Lin等[20]以易感E13390與抗性E13901雜交獲得的228個(gè)F4∶5家系為遺傳定位群體，采用ICIM作圖法定位了qPsan5.1和qP-san16.1 2個(gè)QTL位點(diǎn)，2個(gè)位點(diǎn)之間產(chǎn)生加性互作作用，應(yīng)對MPS17-22疫霉菌株的感染。過氧化物酶相關(guān)基因GmSPOD編碼蛋白能夠使細(xì)胞加快積累活性氧（ROS），破壞細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)，影響作物的生長，bHLH轉(zhuǎn)錄因子GmPIB1可以抑制GmSPOD的表達(dá)，提高毛狀根對大豆疫霉根腐病的抗性，Liu等[21]利用Co-IP和MS對過表達(dá)GmPIB1的轉(zhuǎn)基因大豆分析，鑒定出392個(gè)可能與GmPIB1互作的蛋白，利用熒光素酶互補(bǔ)和酵母雙雜交方法發(fā)現(xiàn)只有26S蛋白酶體調(diào)節(jié)亞基GmSPOD與GmPIB1相互作用；過表達(dá)GmSPOD-OE毛狀根中26S蛋白酶體活性顯著高于對照，對大豆疫霉菌的抗性顯著提高；GmSPOD-RNAi毛狀根中26S蛋白酶體活性顯著低于對照，對大豆疫霉菌的敏感性增強(qiáng)，上述結(jié)果解釋了大豆26S蛋白酶體調(diào)控病原菌反應(yīng)的重要機(jī)制。花葉病毒方面，Yuan等[22]利用祁黃-1×南農(nóng)1138-2雜交組合中近等基因系R（RSC3Q）和S（RSC3Q）接種SMV后，發(fā)現(xiàn)感染早期SC3介導(dǎo)的抗性中茉莉酸抑制基因（TIFY/JAZ）和脫落酸誘導(dǎo)基因（PP2C3a）在R系上調(diào)，表明茉莉酸和脫落酸激素在大豆抗SMV的響應(yīng)中扮演著角色。相較Yuan[22]等的通路研究，Liu等[23]以表型定位基因的方法，將抗BCMV和SMV的大豆變異品種V94-5152與敏感品種Williams 82雜交的F2接種BCMV分離株HZZB011，定位到一個(gè)位于BARCSOYSSR_02_0617下游0.2 cM處的抗BCMV-HZZB011的分子標(biāo)記，其附近分布有10個(gè)候選基因。大豆孢囊線蟲方面，Zhou等[24]從地方品種PI567516C中鑒定的QTL位點(diǎn)qSCN10被證實(shí)對多種SCN有抗性，精細(xì)定位到的區(qū)域內(nèi)含有51個(gè)候選基因，其中4個(gè)與防御相關(guān)的基因受SCN侵染的調(diào)節(jié)。對該位點(diǎn)進(jìn)行進(jìn)一步分析時(shí)，發(fā)現(xiàn)其結(jié)構(gòu)，進(jìn)化關(guān)系以及變異程度均有別于已報(bào)道的QTL，田間試驗(yàn)中，該位點(diǎn)同樣表現(xiàn)出較好的性狀，確定PI567516C作為新穎遺傳抗性大豆資源的可能性。Shi等[25]通過SNP標(biāo)記及SCN抗性的GWAS分析，在菜豆pv01、03、06、07、09、10和11上同樣檢測到12個(gè)與生理小種HG型抗性相關(guān)的SNPs。還有Jiang等[26]的研究表明，在大豆孢囊蟲脅迫下，東農(nóng)L-10（SCN 4抗性品種）和黑農(nóng)37（SCN 4易感品種）之間差異表達(dá)基因數(shù)量不同，東農(nóng)L-10中PR蛋白家族基因GmRSCN4-1（Glyma.05G204800）和細(xì)胞色素P450家族基因GmRSCN4-2（Glyma.16G195600）的相對表達(dá)水平顯著高于黑農(nóng)37。

3.2 國內(nèi)大豆抗逆性狀研究

大豆耐旱方面，Chen等[27]通過酵母雙雜交、免疫共沉淀和雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)，發(fā)現(xiàn)在干旱脅迫下細(xì)胞核中的GmNTF2B-1能夠與氧化還原酶GmOXR17相互作用，促進(jìn)后者從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核，增強(qiáng)核內(nèi)活性氧（ROS）的清除，進(jìn)而提高大豆抗旱性。耐鹽方面，Xun等[28]通過構(gòu)建GmADR1基因啟動子的過表達(dá)載體，研究發(fā)現(xiàn)被轉(zhuǎn)化大豆植株的耐鹽基因GmCaM4的表達(dá)得到增強(qiáng)；與未轉(zhuǎn)化的野生型相比，轉(zhuǎn)基因植物具有顯著的耐鹽性。表明通過轉(zhuǎn)基因手段引入內(nèi)源啟動子可以驅(qū)動大豆特定組織和器官中功能基因的表達(dá)。Gm-CIPK是鹽過度敏感（SOS2-like）蛋白，Ketehouli等[29]研究表明在鹽水、干旱或脫落酸（ABA）脅迫GmPKS4表達(dá)上調(diào)，GmPKS4的過表達(dá)增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因擬南芥和大豆毛根體內(nèi)活性氧的清除、滲透物的合成和應(yīng)激相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。耐鋁方面，Wang等[30]首先通過GO和KEGG富集分析，發(fā)現(xiàn)未處理組和鋁處理組之間的729個(gè)差異表達(dá)基因（DEG）主要富集于防御反應(yīng)、質(zhì)膜和分子轉(zhuǎn)導(dǎo)活性途徑。通過加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析維恩圖篩選出的815個(gè)DEG，鑒定出未處理組和鋁處理組之間差異最大的5個(gè)DEG。

3.3 國內(nèi)大豆產(chǎn)量性狀研究

大豆莢數(shù)方面，Ln是擬南芥JAGGED（JAG）在大豆中的同源基因GmJAGGED1，屬于鋅指蛋白家族，對Ln的近等基因系表型研究發(fā)現(xiàn)，NIL-Ln的豆莢一般為3粒莢和2粒莢，NIL-ln系中通常具有較多的4粒莢和3粒莢，說明Ln是莢粒數(shù)的相關(guān)基因[31]。杜浩等[32]為了將Ln基因應(yīng)用于低緯度地區(qū)大豆育種中，通過開發(fā)Ln基因的分子標(biāo)記，連續(xù)回交后將Ln基因代換到圓葉型品種Williams 82和華夏3中，獲得了4粒莢較多的大豆新材料。裂莢方面，豆莢開裂性狀在大豆成熟后期對大豆產(chǎn)量影響較大，有效控制豆莢的開裂，可以防止自然環(huán)境和機(jī)械因素所造成的減產(chǎn)。Han等[33]首先對黑河43（抗裂型）和黑河18（抗裂型）2個(gè)品種子代的落粒率進(jìn)行遺傳分析，鑒定出黑河43的抗裂性遺傳力高，進(jìn)一步利用黑河43×黑河18的RIS群體構(gòu)建的分離群體進(jìn)行定位分析，發(fā)現(xiàn)包含19個(gè)基因的qPD05-1位點(diǎn)，此研究為大豆抗裂基因的篩選鑒定提供了可靠的標(biāo)記。百粒重方面，Zhang等[34]在4環(huán)境下133個(gè)中國大豆品種的百粒重（100-SW）表型數(shù)據(jù)，并利用82187個(gè)SNPs進(jìn)行GWAS分析，至少兩壞境中重復(fù)檢測到27個(gè)SNP，其中有7個(gè)是百粒重（100-SW）的大效應(yīng)標(biāo)記，通過對標(biāo)記附近的潛在基因進(jìn)行qRT-PCR，發(fā)現(xiàn)有3個(gè)候選基因與百粒重相關(guān)性緊密。Zhang等[35]對國內(nèi)283個(gè)大豆種質(zhì)中獲得的大量高質(zhì)量SNP及進(jìn)行GWAS分析，確定了5個(gè)與種子重量相關(guān)的基因座，其中qHSW-16區(qū)域中Soy-ZH13_16G122400鑒定為控制種子重量的新型候選基因。遠(yuǎn)月麗[36]對氮高效大豆坡黃、低氮敏感大豆84-70以及雜交后的RILs群體225個(gè)子代進(jìn)行HiSeq測序，構(gòu)建了高密度遺傳圖譜，結(jié)合115個(gè)家系4個(gè)氮效率相關(guān)表型性狀進(jìn)行QTL定位分析。檢測到16個(gè)主效QTLs，均位于11號染色體。qTDW-20位點(diǎn)在正常氮條件和低氮脅迫下同時(shí)被檢測到，對定位到的主效QTLs所在區(qū)間進(jìn)行基因功能注釋，預(yù)測到16個(gè)與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳導(dǎo)、氨基酸合成和能量轉(zhuǎn)換等性狀相關(guān)的候選基因。

3.4 國內(nèi)大豆品質(zhì)性狀研究

大豆豆莢顏色方面，Chang等[37]將187份材料組成的大豆關(guān)聯(lián)組（SAP）與284份RIL材料結(jié)合進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析，鑒定出豆莢顏色相關(guān)位點(diǎn)qPC3和qPC19，分別位于第3和第19染色體，12個(gè)莢果大小相關(guān)的穩(wěn)定QTL。在種皮形態(tài)方面，Liu等[38]以改良野生大豆染色體片段代換系（SojaCSSLP5）群體為研究材料，利用基因重測序，得到1 366個(gè)SNPLDB（SNP連鎖-不平衡塊）的物理圖譜，利用SNPLDB-map，鑒定出2個(gè)與種皮顏色連鎖相關(guān)的基因座，6個(gè)與開花期相關(guān)的基因座。此外結(jié)合親本RNA-seq和DNA-重測序，對2個(gè)SCC和6個(gè)DTF候選基因[包括3個(gè)已克隆的（G、E2和GmPRR3B）和5個(gè)新檢測的]進(jìn)行了核苷酸突變水平的預(yù)測和驗(yàn)證，發(fā)現(xiàn)8個(gè)親本等位基因中有6個(gè)與303份種質(zhì)材料相同的等位基因，表明野生品種與栽培品種組合形成的染色體片段代換系可以作為鑒定野生和栽培候選基因等位基因的有效平臺。營養(yǎng)成分方面，主要體現(xiàn)上油分、蛋白和異黃酮含量等物質(zhì)成分。選取含油量存在差異的大豆品種：合農(nóng)75（23.40%）、高油大豆品種合豐50（22.57%）以及低油分含量大豆品種抗線蟲4號，采用毛細(xì)管電泳技術(shù)對合農(nóng)25個(gè)油分相關(guān)SSR分子標(biāo)記進(jìn)行分析，結(jié)果顯示，有21個(gè)SSR由母本合豐50遺傳，10個(gè)SSR來源于父本抗線蟲4號，油份超親累加性狀的分子標(biāo)記4個(gè)[39]。Sung等[40]利用GC儀測定多環(huán)境下621份品種的FAs譜，參照已公開的SoySNP50K基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行GWAS關(guān)聯(lián)分析，確定了43個(gè)與脂肪酸顯著相關(guān)的基因組區(qū)域，其中包括9種新的環(huán)境特異性FA相關(guān)基因組區(qū)域。Zhang等[41]同樣利用SoySNP50K基因型數(shù)據(jù)對211份大豆材料的油分、蛋白質(zhì)以及水溶性蛋白性狀進(jìn)行GWAS關(guān)聯(lián)分析，分別鑒定出3個(gè)蛋白質(zhì)、4個(gè)油脂、5個(gè)水溶性蛋白質(zhì)含量相關(guān)的QTL，多環(huán)境下5個(gè)QTL被檢測到，進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，各QTL位點(diǎn)處的基因與3種性狀的關(guān)系為負(fù)相關(guān)。這表明通過分子標(biāo)記所篩選的候選基因，既可表現(xiàn)為促進(jìn)作用，也能起抑制作用。Li等[42]首先根據(jù)（墾豐14×墾豐15）×（河農(nóng)48×墾豐19）的重組自交系獲得2 232個(gè)SNP構(gòu)建了分子遺傳圖譜，整理10個(gè)環(huán)境條件下蛋白質(zhì)和油分表型數(shù)據(jù)，采用ICIM法進(jìn)行QTL分析，最終篩選出6個(gè)QTN衰減區(qū)基因，其中有4個(gè)候選基因與大豆蛋白的合成代謝相關(guān)。而劉家伶等[43]為了構(gòu)建脂肪和蛋白含量性狀上存在顯著差異的大豆高密度遺傳圖，首先利用吉農(nóng)45和綏農(nóng)76雜交的F2代分離群體獲得SNP標(biāo)記進(jìn)行構(gòu)建，然后結(jié)合群體籽粒脂肪和蛋白含量表型數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析和基因注釋，最后篩選到222個(gè)與脂肪和蛋白貯藏、油脂生物合成、油分代謝過程、脂肪酸生物合成、種子發(fā)育和種子萌發(fā)相關(guān)的基因。楊紅燕等[44]利用川渝地區(qū)主要的232份品種材料在2個(gè)環(huán)境中的表型數(shù)據(jù)進(jìn)行整理，然后結(jié)合大豆20條染色體上的SSR標(biāo)記通過混合線性模型進(jìn)行GWAS分析，最后篩選出與蛋白質(zhì)含量顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有16個(gè)，貢獻(xiàn)率與油脂含量相關(guān)的位點(diǎn)有19個(gè)，貢獻(xiàn)率最高分別為4.02%、4.67%。在異黃酮含量方面，Yang等[45]對來自各國250個(gè)地方品種和栽培品種進(jìn)行重測序，篩選鑒定出3個(gè)與異黃酮含量相關(guān)的候選基因。

4 發(fā)展與建議

大豆是我國主糧作物之一，對穩(wěn)定糧食安全起著重要作用。由于國內(nèi)大豆產(chǎn)量低，品質(zhì)差，自2004年，我國開始從國外進(jìn)口大豆，截至2021年，進(jìn)口總量約占國內(nèi)大豆總需的85%。如何有效且快速地選育出產(chǎn)量高、品質(zhì)優(yōu)及抗性強(qiáng)的大豆品種成為難題。隨著信息化的發(fā)展，分子生物技術(shù)得到廣泛應(yīng)用，以指導(dǎo)性強(qiáng)、操作簡單、育種年限短等特點(diǎn)成為首選工具，并隨著各種輔助型技術(shù)的開發(fā)和利用，在分子范疇上，大豆的遺傳機(jī)理被普遍研究。分子標(biāo)記和分子輔助育種手段的應(yīng)用使大量的大豆抗性相關(guān)基因被鑒定，豐富了大豆抗性基因庫。

通過對2021年大豆分子標(biāo)記的研究和應(yīng)用的總結(jié)，發(fā)現(xiàn)分子標(biāo)記的相關(guān)研究逐漸遍及大豆多個(gè)性狀，每年通過測序和關(guān)聯(lián)分析所定位鑒定的基因較多，形成了熱潮。不過分子標(biāo)記在育種中的應(yīng)用仍存在著一些問題。首先，遺傳位點(diǎn)的定位易受環(huán)境和研究方法等諸多因素的影響，造成結(jié)果存在精確度差的問題。其次，基因的重組會破壞與遺傳位點(diǎn)連鎖分子標(biāo)記。再者，大豆的大多數(shù)性是由多基因控制的，分子標(biāo)記對其的設(shè)計(jì)還存在難度。最后，分子標(biāo)記的研究在不斷深入，但應(yīng)用于實(shí)際的卻很少。為了更好地進(jìn)行基礎(chǔ)研究，新穎定位技術(shù)的研發(fā)必不可少；設(shè)計(jì)更加牢固的分子標(biāo)記也是努力的方向；多組學(xué)層面上的聯(lián)合是揭示基因功能最為準(zhǔn)確的方法；如何將分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)從基礎(chǔ)拓展到實(shí)際應(yīng)用需要處理好與傳統(tǒng)育種之間的關(guān)系。面對作物種植面積、品種退化以及抗性不顯著等關(guān)鍵問題，分子標(biāo)記輔助育種的應(yīng)用依然是首選，相信隨著技術(shù)的不斷更新，大豆育種工作會更加簡捷，育種成效會更加顯著。