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Alicycliphilus denitrificans Ylb10的Cr(VI)還原性質(zhì)研究

2021-12-20 10:53呂育財(cái)宋婷薇郭金玲任立偉龔大春
生物學(xué)雜志 2021年6期
關(guān)鍵詞:靜置丁酸底物

左 群, 呂育財(cái), 宋婷薇, 郭金玲, 任立偉, 龔大春

(1. 湖北省生物酵素工程技術(shù)研究中心(三峽大學(xué)),宜昌 443002;2. 中國(guó)輕工業(yè)功能酵母重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(三峽大學(xué)),宜昌 443002; 3. 三峽大學(xué) 生物與制藥學(xué)院,宜昌 443002)

鉻鹽、皮革、印染以及電鍍等涉及鉻工業(yè)的發(fā)展造成土壤鉻污染的事件逐漸增多,鉻環(huán)境污染也越來(lái)越嚴(yán)重,逐漸威脅到人類的健康。Cr(VI)易溶于水,氧化性強(qiáng),被列入致癌物質(zhì)[1],人體長(zhǎng)期暴露于鉻污染環(huán)境會(huì)引起神經(jīng)系統(tǒng)、肝臟、腎臟等損害,皮膚接觸可能導(dǎo)致過(guò)敏或遺傳性基因缺陷[2],而Cr(VI)對(duì)環(huán)境也具有持久性的危害。Cr(III)溶解性小,移動(dòng)性弱,是人體和動(dòng)物體所必需的微量元素,主要參與糖和脂肪的代謝過(guò)程[3]。

微生物法為鉻(VI)污染土壤及工業(yè)含鉻(VI)廢水的處理開(kāi)辟了一個(gè)極具潛力的新領(lǐng)域。微生物能不斷地生長(zhǎng)繁殖,具有很強(qiáng)的適應(yīng)環(huán)境能力,且用微生物處理鉻污染具有投資成本低、能耗小、無(wú)二次污染等特點(diǎn)。目前很多能夠修復(fù)Cr(VI)污染的微生物被分離得到。包括Pseudomonasmandelii[4]、Bacilluspumilus[5]、Cellulosimicrobiumcellilans[6]、Sulfatereducingbacteria[7]、Desulfovibriodesulfuricans[8]、Morganellamorganii[9]等。微生物將Cr(VI)還原為Cr(III),其修復(fù)方式主要是NADH作為還原劑的細(xì)菌酶系統(tǒng),將Cr(VI)轉(zhuǎn)化為可溶性NAD+-Cr(III)絡(luò)合物[10]。然而,Cr(VI)對(duì)微生物有毒害作用,很多微生物在高濃度的Cr(VI)環(huán)境中無(wú)法有效還原鉻或生長(zhǎng),因此,從環(huán)境中分離或通過(guò)基因工程手段獲取高性能Cr(VI)還原菌株仍是重金屬生物修復(fù)領(lǐng)域的重要課題。本研究以獲得有效Cr(VI)還原菌株為目標(biāo),從求索溪底泥中,分離到一株Cr(VI)還原菌,并對(duì)該菌的底物利用特征、最適還原條件及Cr(VI)還原能力進(jìn)行研究。

1 材料和方法

1.1 Ylb10菌的分離和培養(yǎng)基

YEM001(富集于三峽大學(xué)求索溪底泥)是一組有效還原Cr(VI)的菌群,由多種細(xì)菌組成,其中包括Cr(VI)還原細(xì)菌和非Cr(VI)還原細(xì)菌。以YEM001為菌源,利用梯度稀釋涂布平板法分離Cr(VI)還原菌株,并經(jīng)純化分離,最終獲得具有Cr(VI)能力的純培養(yǎng)菌株Ylb10。分離和培養(yǎng)所用培養(yǎng)基為PCS-Cr培養(yǎng)基,主要成分:蛋白胨5 g/L,酵母浸粉1 g/L,氯化鈉5 g/L, pH 8.5~9.0,K2Cr2O7100 mg/L。菌株培養(yǎng)于28 ℃生化培養(yǎng)箱。固體培養(yǎng)基則加入質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.5%的瓊脂粉(索萊寶,北京)。

1.2 方法

1.2.1 Cr(Ⅵ)的測(cè)定

采用二苯碳酰二肼分光光度法[11]。

1.2.2 Cr(Ⅵ)還原率計(jì)算

Cr(VI)還原率公式:R=(1-Cf/Ci)×100%

式中:R為Cr(VI)的還原率,%;Ci為Cr(VI)初始濃度,mg/L;Cf為處理一定時(shí)間后Cr(VI)的實(shí)測(cè)濃度,mg/L。

1.2.3 Ylb10菌的16S rDNA測(cè)序鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析

將Ylb10菌培養(yǎng)48 h左右,收集3OD菌體量,使用TaKaRaMiniBEST Bacteria Genomic DNA Extraction Kit Ver.3.0(寶生物,大連)提取細(xì)菌總DNA,所獲DNA進(jìn)行16S rDNA PCR。引物:27F:5′-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3′,1492R:5′-TACGGYTACCTTGTTACGACTT-3′。50 μL的反應(yīng)體系:PremixTaq25 μL,27F 2 μL,1492R 2 μL,DNA 10 μL,無(wú)菌水11 μL。PCR條件:95 ℃ 預(yù)變性10 min,1個(gè)循環(huán);94 ℃ 變性30 s, 55 ℃ 退火30 s, 72 ℃ 延伸1 min, 30個(gè)循環(huán);72 ℃ 再延伸5 min,1個(gè)循環(huán)。

PCR產(chǎn)物使用Fast Pure Gel DNA Extraction Mini kit DC301 03/04(諾唯贊,南京)進(jìn)行產(chǎn)物回收?;厥蘸蟮漠a(chǎn)物由生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。將細(xì)菌的16S rDNA測(cè)序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中已有的16S rDNA序列進(jìn)行比對(duì),并利用MEGA X進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析。

1.2.4 Ylb10菌生長(zhǎng)曲線的測(cè)定

將Ylb10菌接入無(wú)鉻的PCS培養(yǎng)基中,pH 8.0,定時(shí)檢測(cè)菌體OD600,并設(shè)置無(wú)菌的空白。

1.2.5 Ylb10菌底物利用分析

利用Biolog的GEN Ⅲ鑒定板,分析Ylb10菌利用的底物。用TSA培養(yǎng)基,活化Ylb10菌,使用Inoculatorz棉簽在瓊脂平板中有細(xì)胞生長(zhǎng)的地方沾取直徑3 mm的菌落,加入IF-A接種液中,使細(xì)胞濃度為90%~98%T。將菌懸液按每孔100 μL的量加入GEN Ⅲ鑒定板的所有孔中并蓋好,將接種Ylb10菌的GEN Ⅲ鑒定板置于33 ℃培養(yǎng)箱孵育,定時(shí)檢測(cè)GEN Ⅲ鑒定板中底物變化情況。

1.2.6 Ylb10菌Cr(Ⅵ)還原性質(zhì)實(shí)驗(yàn)

(1)氧氣對(duì)Ylb10還原Cr(VI)的影響。將在固體培養(yǎng)基上的Ylb10菌,挑至液體PCS培養(yǎng)基[含100 mg/L的Cr(VI)],置于28 ℃培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)3 d, 8 000 r/min離心5 min,收集菌體,接種于新鮮PCS-Cr培養(yǎng)基,Cr(VI)濃度為100 mg/L,分別在搖床(200 r/min)和靜置條件下培養(yǎng),溫度均為28 ℃,每組設(shè)置3個(gè)重復(fù),定時(shí)檢測(cè)OD600以及Cr(VI)含量變化。

(2)不同起始pH值對(duì)Ylb10還原Cr(VI)的影響。將Ylb10菌分別接種于pH 5、6、7、8和9共5個(gè)pH值梯度的PCS-Cr[100 mg/L Cr(VI)]培養(yǎng)基中,定時(shí)檢測(cè)樣品中的pH值,Cr(VI)濃度及OD600。

(3)不同Cr(Ⅵ)濃度對(duì)Ylb10還原Cr(VI)的影響。將Ylb10菌分別接種于含有0、50、100、200和300 mg/L K2Cr2O7的PCS培養(yǎng)液中,其起始培養(yǎng)OD600為0.2,定時(shí)檢測(cè)樣品中的Cr(VI)濃度及OD600。

2 結(jié)果與討論

2.1 Ylb10菌的分離和鑒定

Ylb10菌株分離于Cr(VI)還原菌群YEM001,再連續(xù)在含Cr(VI)的定向富集下,獲得較好的Cr(VI)還原能力。分離的Ylb10菌能夠生長(zhǎng)于含Cr(VI)的PCS培養(yǎng)基。菌落透明,圓形,偏小見(jiàn)圖1(a),革蘭氏陰性菌見(jiàn)圖1(b)。

圖1 Ylb10菌在含鉻的PCS培養(yǎng)基上的生長(zhǎng)形態(tài)(a)和Ylb10菌的革蘭氏染色(b)

Ylb10菌株的16S rDNA基因被測(cè)序(上海生工),所獲的序列提交到NCBI網(wǎng)站(GenBank MT678829),用BLAST數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行序列比對(duì),并構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)(圖2)。結(jié)果顯示,Ylb10菌與Alicycliphilusdenitrificans的16S rDNA相似率為98.07%。Alicycliphilus菌株能夠降解某些污染物,如丙酮、環(huán)己醇和N-甲基吡咯烷酮,苯,甲苯和蒽,以及聚氨酯清漆和泡沫,它們還可以將Cr(VI)轉(zhuǎn)化至Cr(III)[12]。

圖2 基于Ylb10菌16S rDNA測(cè)序的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

2.2 Ylb10菌株利用底物的分析

33 ℃孵育24 h后,測(cè)定GEN III 鑒定板底物的利用情況(表1)。Ylb10主要利用的底物有丙酮酸甲酯、α-羥基-丁酸、L-乳酸、α-酮-丁酸、丙酸、乙酸、β-羥基-D,L丁酸、L-丙氨酸、L-天冬氨酸、L-谷氨酸、L-絲氨酸等,而對(duì)葡萄糖、半乳糖、乳糖、麥芽糖、蔗糖、糊精和甘露糖等多種糖都未表現(xiàn)出代謝能力。AlicycliphilusdenitrifificansK601T可以利用一元羧酸(C2-C7)、檸檬酸、琥珀酸、蘋果酸、乳酸、丙酮酸和富馬酸等[13]。小分子有機(jī)酸對(duì)Cr(VI)還原有一定影響,如在還原態(tài)綠脫石-有機(jī)酸-六價(jià)鉻共存的體系中,酒石酸和蘋果酸等會(huì)促進(jìn)綠脫石中結(jié)構(gòu)亞鐵還原Cr(VI),含有α-羥基/羰基的有機(jī)酸,可提供電子來(lái)還原Cr(VI)[14]。Ylb10對(duì)Cr(VI)的還原能力,可能與有機(jī)酸的利用有關(guān)。

表1 菌株 Ylb10 Gen III 鑒定板反應(yīng)結(jié)果

2.3 Ylb10菌的生長(zhǎng)特性

Ylb10菌在無(wú)鉻的PCS培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)趨勢(shì)見(jiàn)圖3。當(dāng)以0.15 OD600接種于新鮮PCS培養(yǎng)液中,菌株在很短時(shí)間內(nèi)開(kāi)始復(fù)蘇生長(zhǎng),并在40 h內(nèi)結(jié)束指數(shù)生長(zhǎng)期,進(jìn)入生長(zhǎng)的穩(wěn)定期,87 h進(jìn)入衰亡期。表明該菌具有較快生長(zhǎng)能力,這對(duì)處理環(huán)境污染物是有利的。

圖3 Ylb10菌無(wú)鉻條件下生長(zhǎng)曲線

2.4 Ylb10菌還原Cr(Ⅵ)的能力

2.4.1 氧氣對(duì)Ylb10還原Cr(VI)的影響

比較Ylb10在不同氧含量條件下生物量(OD600)和還原Cr(VI)的效率(圖4)。結(jié)果顯示:Ylb10在搖床條件下的生物量顯著高于靜置培養(yǎng),充足的氧氣更有利Ylb10的生長(zhǎng),見(jiàn)圖4(a)。與生物量趨勢(shì)相反,Ylb10在搖床條件下,Cr(VI)還原能力非常弱,72 h將100 mg/L 的Cr(VI)還原18.24%,而靜置培養(yǎng)36 h還原98.70%,見(jiàn)圖4(b)??梢?jiàn),氧氣對(duì)Ylb10還原Cr(VI)具有抑制作用。Cr(VI)還原可以分為酶還原和非酶還原,酶還原發(fā)生在厭氧或好氧條件下,Ylb10菌在厭氧條件下還原Cr(VI),這可能與鉻酸鹽作為電子受體的膜還原酶有關(guān)[15],而厭氧條件還原Cr(VI),在實(shí)際應(yīng)用Cr(VI)污染的水和土壤時(shí),也更有優(yōu)勢(shì)。

圖4 Ylb10菌在靜置與搖床培養(yǎng)條件下對(duì)六價(jià)鉻還原對(duì)比

2.4.2 不同起始pH值對(duì)Ylb10還原Cr(VI)的影響

pH對(duì)Ylb10生長(zhǎng)和還原Cr(VI)的能力具有明顯影響。Ylb10最適生長(zhǎng)的pH值為7。而當(dāng)pH值低于6,菌株的生長(zhǎng)嚴(yán)重受到抑制,見(jiàn)圖5(a)。在培養(yǎng)過(guò)程中,菌株的生長(zhǎng)影響培養(yǎng)液的pH值,最終pH值趨向于8~9,見(jiàn)圖5(b)。表明培養(yǎng)液具有代謝酸的能力,這與GEN III鑒定板檢測(cè)結(jié)果相對(duì)應(yīng)。

環(huán)境的pH值也影響Ylb10對(duì)Cr(VI)的還原效率。當(dāng)培養(yǎng)液pH值為5、6時(shí),Ylb10未表現(xiàn)出Cr(VI)的還原能力;當(dāng)pH值為7、8、9時(shí)均表現(xiàn)出還原Cr(VI)的能力;且當(dāng)pH值為8和9時(shí),Ylb10還原Cr(VI)的效率最高,36 h還原Cr(VI)的效率分別為98.47%和95.54%,而當(dāng)pH值為7時(shí),48 h能還原94.78%[圖5(c)]。由此可見(jiàn),Ylb10菌株六價(jià)鉻還原最適的pH值范圍為8~9。弱堿性條件下,更有利于Ylb10菌還原Cr(VI),結(jié)果與報(bào)道的基本一致[16-17]。嗜堿菌體內(nèi)pH值在7~9時(shí),細(xì)胞膜上的Na+/H+反向運(yùn)輸系統(tǒng),可以將細(xì)胞質(zhì)的pH值維持在一定生理范圍內(nèi)[18]。

圖5 不同pH值條件下Ylb10菌OD600,六價(jià)鉻含量和pH變化

2.4.3 不同Cr(VI)濃度對(duì)Ylb10還原Cr(VI)的影響

Ylb10還原Cr(VI)能力結(jié)果見(jiàn)圖6。當(dāng)培養(yǎng)液中Cr(VI)的濃度為50 mg/L時(shí),18 h Cr(VI)可以還原96.45%;Cr(VI)的濃度為100 mg/L時(shí),24 h可以還原93.83%;200 mg/L時(shí),60 h可以還原99.06%;300 mg/L時(shí),96 h可以還原2.15%。全部還原所需要的時(shí)間隨著Cr(VI)濃度的升高而延長(zhǎng)。當(dāng)培養(yǎng)液中Cr(VI)濃度達(dá)到300 mg/L時(shí),該菌株無(wú)法還原Cr(VI)。李維宏等[19]分離出的一株Enterobacterhormaechei菌株,可以將200、400和800 mg/L的Cr(VI)分別還原85.6%、82.1%和58.2%。何元等[20]分離的Serratiasp.S2還原能力達(dá)到20 mg/L。Sanjay等[21]分離得到的KlebsiellapneumoniaeMS 1.5和MangrovibacteryixingensisMS 2.4能夠還原80 mg/L和100 mg/L的Cr(VI)。Banerjee等[22]分離的Pseudomonasbrenneri菌株在Cr(VI)濃度為60 mg/L時(shí)得到最大修復(fù)。Sarankumar等[23]分離出的BacilluscohniiSR2和BacilluslicheniformisSR3能25 h將550 mg/L的Cr(VI)分別還原82%和90%。可見(jiàn)Ylb10菌與其他鉻還原菌株相比,較短時(shí)間具有較高的Cr(VI)還原能力。

圖6 不同六價(jià)鉻起始濃度Ylb10菌還原影響Figure 6 Effects of different hexavalent chromium initial concentrations on Ylb10 reduction ability

3 結(jié)論

(1)從YEM001菌群中成功分離得到一株Cr(VI)還原菌株Ylb10,經(jīng)鑒定為脫氮嗜脂環(huán)物菌(Alicycliphilusdenitrificans),革蘭氏陰性菌。(2)Ylb10對(duì)氨基酸和有機(jī)酸有很好的利用。主要利用的底物有丙酮酸甲酯、α-羥基-丁酸、L-乳酸、β-羥基-D,L丁酸、丙酸、乙酸、α-酮-丁酸、L-谷氨酸、L-丙氨酸、L-天冬氨酸等,而對(duì)葡萄糖、半乳糖、甘露糖、蔗糖、乳糖、糊精和麥芽糖等多種糖都未表現(xiàn)出代謝能力。(3)Ylb10靜置培養(yǎng)條件更有利于Cr(VI)的還原。搖床(好氧)條件Ylb10菌生物量生長(zhǎng)迅速,但是難以還原Cr(VI),72 h 100 mg/L的Cr(VI)僅還原18.24%。靜置培養(yǎng)條件下,36 h能將100 mg/L的Cr(VI)還原98.70%。(4)Ylb10對(duì)Cr(VI)有很高的還原能力。Ylb10菌最適生長(zhǎng)pH值為7,最佳還原Cr(VI)的pH值為8~9。在Cr(VI)的濃度為50 mg/L時(shí),18 h Cr(VI)可以還原96.45%;Cr(VI)的濃度為100 mg/L時(shí),24 h可以還原93.83%;200 mg/L時(shí),60 h可以還原99.06%。

結(jié)果表明,Ylb10菌具有較高Cr(VI)還原能力,有望應(yīng)用于鉻污染的水樣及土壤。

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