黃 瑤, 張秀玲, 王 艷, 孔桂美, 徐 勤
(1.揚州市疾病預(yù)防控制中心檢驗科,江蘇 揚州 225002;2.揚州大學(xué)醫(yī)學(xué)院,江蘇 揚州 225009)
發(fā)熱呼吸道病毒感染是全球范圍內(nèi)引起人類發(fā)病和死亡的主要原因之一[1-4],了解病原體對疾病診治和預(yù)防具有十分重要的作用。鑒于呼吸道病毒疫情防控的復(fù)雜性[5-10],本研究在揚州市住院肺炎患者中主動開展了呼吸道病毒病原學(xué)監(jiān)測,對住院肺炎患者進行流感病毒、呼吸道合胞病毒、人腺病毒、人腸道病毒及人副流感病毒Ⅲ型這5種常見呼吸道病毒的檢測,最大程度對呼吸道傳染疫情進行預(yù)測,以及時采取應(yīng)對措施,減少疫情對社會和經(jīng)濟發(fā)展的影響。
收集江蘇省蘇北人民醫(yī)院、揚州大學(xué)附屬醫(yī)院、揚州市第二人民醫(yī)院、高郵市人民醫(yī)院4家哨點醫(yī)院符合“采樣對象”定義的住院肺炎患者呼吸道咽拭子樣本,每家哨點醫(yī)院每周采集5人份樣本,每周采集1~2次。樣本采集后48 h內(nèi)送至揚州市疾病預(yù)防控制中心病毒實驗室,2~8 ℃保存;未能及時送達的樣本,-70 ℃或以下保存,并于1周內(nèi)送達;樣本應(yīng)避免反復(fù)凍融。
納入符合以下3種情況之一的住院治療的肺炎患者作為“采樣對象”:(1)發(fā)熱(腋下體溫≥38 ℃),并具有肺炎的影像學(xué)特征,發(fā)病早期白細胞總數(shù)降低或正常(或淋巴細胞分類計數(shù)減少);(2)符合呼吸道病毒感染臨床表現(xiàn)(咽部不適、咽干或咽痛,鼻塞、流涕,鼻、咽、喉明顯充血或水腫,咳嗽,咳痰,氣短,聽診呼吸音異常,胸痛)中任意1項;(3)經(jīng)規(guī)范抗菌藥物治療3 d,病情無明顯改善,或呈進行性加重,或常見病原體感染不能解釋的肺炎病例。
Kingfisher96全自動核酸提取儀、ZTLJB-Y64核酸提取試劑盒(西安天隆科技有限公司)、ABI ViiA7實時熒光定量PCR儀(美國ABI公司);磁珠法病毒(NA)提取試劑盒(RD0164D,上海醫(yī)脈賽生物科技有限公司);甲型/乙型流感病毒、甲型H1N1流感病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒Victoria/Yamagata、副流感病毒Ⅲ型、腺病毒、呼吸道合胞病毒試劑盒和腸道病毒(通用型)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)(江蘇碩世生物公司)。
將樣本震蕩處理后,采用Kingfisher96全自動核酸提取儀提取、純化核酸,采用ABI ViiA7實時熒光定量PCR儀進行分型檢測。對流感病毒陽性樣本進一步行亞型分型檢測。逆轉(zhuǎn)錄熒光聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)反應(yīng)條件:50 ℃ 30 min,95 ℃ 5 min,95 ℃ 10 s、55 ℃延伸1 min,45個循環(huán)。熒光PCR反應(yīng)條件:95 ℃ 5 min,95 ℃ 15 s、55 ℃延伸40 s,45個循環(huán)。結(jié)果判定:循環(huán)閾值(cycle threshold,Ct)≤35,且曲線呈S型為陽性;Ct>38或未檢出為陰性。
采用SPSS 20.0軟件及Excel 2019軟件進行統(tǒng)計分析,計數(shù)資料以例或率表示,組間比較采用χ2檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2017—2020年,共收到住院肺炎患者咽拭子樣本1 479例,患者男887例,女592例,年齡為<1個月~94歲。各哨點醫(yī)院各年樣本上送情況見表1。
1 479例咽拭子樣本中,檢出病毒陽性195例,陽性檢出率為13.18%,其中2種病毒混合感染7例(0.47%)。195例病毒陽性樣本中,流感病毒檢出率最高(5.54%),以下依次為呼吸道合胞病毒(2.63%)、人腸道病毒(1.89%)、人副流感病毒Ⅲ型(1.62%)、人腺病毒(1.01%)。7例混合感染病例中,人腺病毒合并人腸道病毒感染2例,人副流感病毒Ⅲ型合并人腸道病毒感染1例,呼吸道合胞病毒合并人腸道病毒感染2例,呼吸道合胞病毒合并人副流感病毒Ⅲ型感染2例。見表2。
2017—2020年,各家哨點醫(yī)院樣本上送數(shù)量穩(wěn)定。2017年陽性檢出率最高,達19.83%(68/343),以下依次為2018年(13.40%,43/321)、2019年(17.44%,60/344)、2020年(5.10%,24/471),不同年份病毒檢出率比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=45.60,P<0.01)。
2017年呼吸道病毒檢出高峰時間集中在3~5月和11~12月,2018年集中在7月和9月,2019年集中在1~3月和12月,2020年僅有9月1個小高峰。2017年3~5月檢出病毒以B型Victoria流感病毒為主,11~12月則以新甲型H1N1流感病毒及人腸道病毒為主;2018年7月的高峰以呼吸道合胞病毒(12.50%)、人副流感病毒Ⅲ型(12.5%)、人腸道病毒(4.17%)和人腸道病毒與人副流感病毒Ⅲ型混合感染(4.17%)為主,陽性檢出率達到33.34%,9月的高峰則以人腸道病毒為主(37.5%),人腺病毒、人副流感病毒Ⅲ型、人腺病毒+人腸道病毒混合感染及呼吸道合胞病毒+人腸道病毒混合感染檢出率僅為4.17%,病毒陽性檢出率高達54.18%;2019年1~3月主要為新甲型H1N1流感病毒感染,12月的高峰由H1N1流感病毒,B型Victoria流感病毒及呼吸道合胞病毒構(gòu)成;2020年9月小高峰主要由呼吸道合胞病毒和人副流感病毒Ⅲ型構(gòu)成。
887例男性患者中,101例病原檢測陽性,陽性檢出率為11.39%;592例女性患者中,94例病原檢出陽性,陽性檢出率為15.88%。男性、女性陽性檢出率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=6.4.26,P<0.05)。
根據(jù)患者年齡進行分組,不同年齡患者呼吸道病毒陽性檢出率分別為:0~6歲組16.57%(90/543),7~18歲組18.00%(18/100),19~59歲組12.72%(44/346),≥60歲組8.78%(43/490)。不同年齡組陽性檢出率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=15.87,P<0.01)。
2017、2018、2019 、2020年住院肺炎患者病毒病原譜有所不同(χ2=72.63,P<0.01)。2017年以流感病毒、人腸道病毒、人呼吸道合胞病毒為主,分別占所有檢出病原體的54.41%、16.18%、16.18%;其中流感病毒共檢出4個亞型,以B型Victoria為優(yōu)勢毒株,H1N1亞型同期共存,H7N9與H3N2亞型交替檢出。2018年病毒病原譜則以人腸道病毒、呼吸道合胞病毒、人副流感病毒Ⅲ型為主,分別占所有檢出病原體的32.56%、25.58%、13.95%,流感病毒檢出率則大大降低,僅為13.95%,甲型流感病毒僅有新甲型H1N1檢出,乙型流感病毒僅有B型Yamagata檢出,分別占4.65%與9.30%。2019年病原譜以流感病毒為主(67.60%),除H7N9亞型之外,其余4種亞型均有檢出,以新甲型H1N1與B型Victoria為主。2020年以呼吸道合胞病毒和人副流感Ⅲ型病毒為主(各占37.5%),流感病毒僅占8.34%。見表3。
住院肺炎患者中,男性、女性病毒病原譜差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=7.68,P>0.05),主要病原均為流感病毒和呼吸道合胞病毒。
4個年齡組中,所占比例最大的均為流感病毒和呼吸道合胞病毒,其次為人腸道病毒和副流感病毒Ⅲ型。4個年齡組病毒病原譜構(gòu)成差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=27.33,P<0.05)。見表4。
表4 不同年齡患者病毒病原譜 例(%)
本研究通過對揚州市住院肺炎患者開展常見呼吸道病毒主動監(jiān)測,初步了解了揚州地區(qū)住院肺炎患者病毒病原構(gòu)成及流行情況。2017—2020年,揚州地區(qū)住院肺炎患者呼吸道病毒總檢出率為13.18%,低于相關(guān)文獻中發(fā)熱呼吸道人群監(jiān)測中的病毒總陽性率[11-12],可能是住院肺炎患者病程已經(jīng)進展了一段時間,多數(shù)經(jīng)過了抗病毒藥物治療,導(dǎo)致病毒檢出率有所下降;除此之外,本研究病原學(xué)監(jiān)測只針對常見的5種呼吸道病毒,病毒檢測范圍小于相關(guān)文獻的8~9種,可能會使病毒檢出率有所下降。本研究病毒檢出時間分布結(jié)果顯示,2017年住院肺炎患者中呼吸道病毒陽性檢出高峰主要集中在3~5月和11~12月,2018年集中在7月和9月,2019年集中在1~3月和12月,2020年僅有9月1個小高峰,這和相應(yīng)病毒的流行高發(fā)季節(jié)基本能夠一一對應(yīng)。流感病毒的流行季節(jié)以冬春季為主,人腸道病毒的流行季節(jié)為夏秋季,人副流感病毒Ⅲ型則是全年都有流行。本研究中,呼吸道合胞病毒為秋冬季流行,與相關(guān)文獻報道的流行季節(jié)為冬春季[11-12]略有不同,可能與地域、樣本來源、樣本基數(shù)不同有關(guān)。本研究由于病毒總體陽性檢出率不高,各病毒流行趨勢無法根據(jù)數(shù)據(jù)描述發(fā)病與年齡、季節(jié)等相關(guān)的流行病學(xué)特征,有待于日后進一步監(jiān)測,擴充數(shù)據(jù)后進行描述。本研究結(jié)果顯示,揚州地區(qū)2020年呼吸道病毒陽性檢出率顯著下降,流感病毒在1~3月零星出現(xiàn)過后一直未有檢出,可能與2020年新型冠狀病毒肺炎疫情發(fā)生后采取的嚴格隔離防范措施密切相關(guān)。
本研究不同性別住院肺炎患者呼吸道病毒檢出結(jié)果顯示,男性患者病毒陽性檢出率低于女性,與相關(guān)文獻報道的男性更易感呼吸道病毒[13-15]的結(jié)論不一致,這可能是因為樣本來源不同導(dǎo)致的。但也有研究結(jié)果表明,女性感染呼吸道病毒,其臨床癥狀可能更為嚴重,住院肺炎患者一般處于呼吸道感染癥狀較為嚴重的階段,本研究結(jié)果是否可提示女性感染呼吸道病毒更易發(fā)展為肺炎,需要進一步的監(jiān)測結(jié)果加以驗證。
本研究不同年齡患者病毒檢出率差異極顯著,0~6歲兒童的陽性檢出率最高,表明學(xué)齡前兒童免疫力較低,在幼托機構(gòu)等場所容易交叉感染呼吸道病毒,與文獻報道[16-19]一致,且易進展為肺炎,而≥60歲老年患者病例數(shù)僅次于0~6歲兒童,但陽性檢出率最低,表明≥60歲老年人由于抵抗力下降,呼吸道感染容易進展為肺炎,但病毒性感染不是主要原因。
綜上所述,2017—2020年揚州地區(qū)住院肺炎患者呼吸道病毒流行季節(jié)及病原譜每年均有所不同,但主要病原為流感病毒和呼吸道合胞病毒,應(yīng)加強呼吸道病毒監(jiān)測,將流感病毒及呼吸道合胞病毒作為呼吸道感染防控重點。