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偽狂犬病毒分子生物學(xué)檢測方法研究進展

2021-11-27 20:44:10萬娟
北方牧業(yè) 2021年9期
關(guān)鍵詞:探針核酸特異性

萬娟

(貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院,貴州貴陽550025)

偽狂犬病(porcine pseudorabies, PR)又稱奧耶斯基病,是由偽狂犬病毒(pseudorabies virus,PRV)引起的可以導(dǎo)致豬、牛、羊等多種動物死亡的一種急性、熱性、高度接觸性傳染病。其臨床癥狀為體溫升高、全身瘙癢、多器官功能衰竭、癱瘓等。雖然PRV 可以感染多種動物,但是豬是其唯一的自然貯存宿主。幾乎所有階段的豬都可感染該病毒,該病嚴重危害我國養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展,國際動物衛(wèi)生組織已將其列為法定報告?zhèn)魅静 ?/p>

2011 年起我國各地開始陸續(xù)在傳統(tǒng)疫苗免疫的豬場暴發(fā)PRV,說明PRV 開始出現(xiàn)了變異,而傳統(tǒng)疫苗對于變異株不能起到良好的免疫保護作用。在2018 年報道了一例關(guān)于PRV 感染人的事件說明了該病毒已經(jīng)具有感染人類的能力,能夠及時診斷出PRV 是控制PR 的前提。病毒分離鑒定是實驗室診斷中最經(jīng)典可靠的診斷方法,但該方法過于繁瑣并且診斷所需時間過長不能滿足生產(chǎn)實際需求。在分子生物學(xué)方法方面,人們建立了q-PCR,減少了檢測所需時間,為了基層檢測需要,建立了不需要特殊儀器設(shè)備的環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴增技術(shù),近幾年,隨著納米PCR 方法的出現(xiàn),人們又建立PRV 納米PCR 檢測方法顯著提高了反應(yīng)靈敏度,PCR-LFD 技術(shù)將PCR 與橫向流動試紙條、核酸探針相結(jié)合,不僅增加了其特異性還消除了電泳對環(huán)境造成的污染。本文從PRV 的分子生物學(xué)檢測方法進行綜述,以期為臨床快速診斷PRV 所用方法的選擇提供一定的依據(jù)。

1 分子生物學(xué)檢測方法

1.1 熒光定量PCR

熒光定量PCR 在常規(guī)PCR 基礎(chǔ)上引入了熒光探針,從而提高特異性和敏感性,并且不需要進行凝膠電泳從而降低了開蓋點樣時的污染,可直接通過電腦觀察到實時結(jié)果大大降低檢測所需時間,在2 個小時左右就可以完成。徐黎輝等通過制備并純化PRV g E 蛋白單克隆抗體,成功建立了能夠快速檢測PRV 野毒的直接免疫熒光檢測方法。李曉菲等根據(jù)PRV g E 基因設(shè)計引物和探針建立了能夠區(qū)分野毒和疫苗毒的TaqMan 熒光定量檢測方法。李艷等根據(jù)PRV g E 基因保守區(qū)域設(shè)計特異性引物和LNA-TaqMan 探針,建立了基于LNA-TaqMan探針的豬偽狂犬病毒野毒熒光定量PCR 檢測方法。TaqMan 熒光定量方法與常規(guī)PCR 相比其特異性高10~100 倍,不存在交叉污染且能夠?qū)怂徇M行定量檢測,不需要進行電泳這一步,縮短了檢測所需時間,但該方法加入了探針因此提高了檢測成本,并且需要特殊的設(shè)備才能觀察到反應(yīng)結(jié)果,故并不適合基層診斷PRV 使用。

1.2 環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴增技術(shù)

環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴增(LAMP)是一種在恒定溫度下利用Bst DNA 聚合酶和內(nèi)外兩對引物對靶序列上的六個獨立區(qū)域進行特異性識別,而后啟動循環(huán)鏈置換反應(yīng)產(chǎn)生啞鈴狀DNA,再以該DNA 為模板進行延伸形成莖-環(huán)DNA 結(jié)構(gòu)的新型核酸擴增技術(shù)。該技術(shù)操作簡單且特異性強、反應(yīng)所需時間短、對設(shè)備要求不高,目前在多種病原體的快速檢測中已經(jīng)開始廣泛使用。陳珍金等根據(jù)PRV gB 基因序列的保守區(qū)域設(shè)計了4 對特異性引物并篩選出特異性強的引物PRV-1,縮短了反應(yīng)時間,建立了能夠通用檢測PRV 的環(huán)介導(dǎo)等溫核酸擴增技術(shù)。許宗麗等根據(jù)PRV gB 基因的保守序列設(shè)計了一套特異性引物建立了PRV LAMP 可視化檢測方法。

1.3 納米PCR 方法

PRV G+C 含量高達74%,引物的Tm 值很高,因此采用常規(guī)PCR 法可能會對敏感性產(chǎn)生影響。納米PCR 作為一種新型PCR,在普通PCR 的基礎(chǔ)上加入了1~100 納米的納米粒子,在反應(yīng)液中當(dāng)反應(yīng)體系溫度發(fā)生變化時形成納米流體從而提高升降溫的速度,提高了引物和模板配對的效率,由此減少了退火溫度對體系的影響。張悅勇等參照PRV gB 基因的保守序列設(shè)計特異性引物建立納米PCR 方法擴增出了338bp 的特異性目的片段。納米PCR 相比于普通PCR 來說,由于有納米粒子的參與,因此其靈敏度顯著升高,特異性也提高許多,并且目前已有納米PCR 試劑盒的售賣。

1.4 PCR-LFD 技術(shù)

PCR-LFD 技術(shù)是將PCR 技術(shù)、核酸探針雜交技術(shù)與橫向流動試紙條(lateral flow dipstick,LFD)三項技術(shù)相結(jié)合,應(yīng)用試紙條直接檢測PCR 擴增產(chǎn)物的技術(shù),該方法不需要電泳從而減少了檢測所需時間,提高了工作效率,目前在口蹄疫病毒、結(jié)核分支桿菌等方面有報道。張莉等根據(jù)PRV g E 基因設(shè)計兩對特異性引物和其相應(yīng)的探針,并將下游引物標(biāo)記熒光素、探針標(biāo)記生物素,建立了特異性檢測PRV 的PCR-LFD檢測方法。廖文軍等用純化的抗人紅細胞單鏈抗體-PRV g E 蛋白雙功能融合蛋白為檢測線和膠體金標(biāo)記物,以羊抗豬Ig G 作為質(zhì)控線,采用雙抗原夾心法制備了檢測PRV gE 抗體的雙抗原膠體金試紙條。隨后,王華俊等將單克隆抗體技術(shù)和熒光微球免疫層析技術(shù)相結(jié)合,制備PRV g E 抗原檢測試紙卡。該方法利用試紙條代替電泳避免了溴化乙錠等核酸染料對環(huán)境的污染,用試紙條檢測是否出現(xiàn)兩個條帶以此來判斷PCR 產(chǎn)物的陰陽性,假陽性時也不會有兩條條帶的產(chǎn)生,并且目前已有偽狂犬病毒PCR-LFD 檢測試劑盒的售賣。該試劑盒可用于進出口檢疫、實驗室、飼養(yǎng)場等的臨床樣品檢測。

2 小結(jié)

目前,我國大多數(shù)豬偽狂犬疫苗為基因缺失疫苗,而目前偽狂犬變異毒株大多數(shù)也為基因缺失株,使得野毒株的診斷變得更加困難。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,目前科學(xué)家們建立了許多PRV 分子生物學(xué),如qPCR,雖然精確度更高且操作簡單,但需要特定的設(shè)備和儀器,不適合臨床上使用;LAMP 是近幾年興起的一種方法,該方法由于對設(shè)備沒有很高的要求,因此可以廣泛應(yīng)用于基層且結(jié)果可以直接觀察到,節(jié)省了檢測所需時間,但該方法容易有假陽性的出現(xiàn);納米PCR 方法是一種新型技術(shù),該方法由于有納米粒子的加入,特異性比普通PCR 提高了100 倍左右;橫向流動試紙條不需要電泳減少了污染,且特異性和靈敏度與PCR 法相比,由于自身設(shè)備條件的不同因此選擇的方法也不同。相信隨著科學(xué)家們研究的不斷深入,將會有更好的檢測PRV 的方法,從而為PR 的診斷和防控提供更加良好的條件和保障。

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