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2019—2020年山東省中西部地區(qū)鴨源禽腺病毒病原學檢測及遺傳進化分析

2021-06-05 11:48宋一諾劉奎昊趙伊然牛玉娟劉思當
中國動物檢疫 2021年6期
關(guān)鍵詞:鴨群腺病毒毒株

宋一諾,邱 楊,劉奎昊,趙伊然,趙 君,牛玉娟,李 寧,劉思當

(1.山東農(nóng)業(yè)大學動物科技學院,山東泰安 271018;2.山東省泰安第二中學,山東泰安 271001;3.青島大學生物醫(yī)學研究院,山東青島 266071)

禽腺病毒(fowl adenovirus,F(xiàn)AdV)是全球流行的常見禽類病原,可感染雞、鴨等禽類,導致其出現(xiàn)不同的臨床癥狀[1]。根據(jù)FAdV特異性抗原的不同,可分為I、II和III 3個群。其中,I群FAdV根據(jù)病毒基因組特征可進一步分為5個種(A、B、C、D、E),根據(jù)血清中和試驗可分為12個血清型(1~7、8a、8b和9~11),各血清型之間交叉保護性較低或無交叉保護性。目前,我國流行的FAdV主要為I群,以血清4型(FAdV-4)、8a型(FAdV-8a)、8b型(FAdV-8b)和11型(FAdV-11)為主[2]。

FAdV-4引起的雞心包積液綜合征2015年在我國大規(guī)模暴發(fā)并廣泛流行,感染雞出現(xiàn)精神萎靡、低頭呆立等癥狀;剖檢可見心包內(nèi)有大量淡黃色液體或膠凍樣物質(zhì),肝臟出現(xiàn)明顯壞死灶,伴有出血點或出血斑,肺、腎水腫,偶爾可見花斑腎[3-6];組織學檢測發(fā)現(xiàn),肝細胞內(nèi)形成明顯的核內(nèi)包涵體,具有特征性病變。臨床上,F(xiàn)AdV-4常與雞傳染性貧血、傳染性法氏囊病等免疫抑制性疾病病原發(fā)生混合感染[7],導致其致病性增強,發(fā)病率和死亡率上升[8]。FAdV具有較強的水平傳播和垂直傳播能力,所以短時間內(nèi)給我國養(yǎng)雞業(yè)造成了重大經(jīng)濟損失[9-10]。

FAdV-4為雙股線性DNA病毒,呈球形,無囊膜,外殼蛋白主要由六鄰體(Hexon)、五鄰體(Penton)和纖維蛋白(Fiber)構(gòu)成,其中Hexon蛋白是FAdV-4的主要結(jié)構(gòu)蛋白,含主要抗原決定簇,能誘導產(chǎn)生中和抗體,并且該蛋白與FAdV-4的致病性密切相關(guān)[11]。研究顯示,F(xiàn)AdV不僅造成雞群大規(guī)模感染發(fā)病,鴨群也同樣受到嚴重威脅。早在2015年6月,有研究學者就在我國鴨群中發(fā)現(xiàn)了類似心包積液綜合征的病癥,感染鴨心包內(nèi)有淡黃色或無色積液,肝臟變性腫脹或表面有出血點[9],后進一步研究證實為FAdV-4感染所致[5]。近年來,鴨場FAdV感染愈加頻繁,給養(yǎng)鴨場造成了較大經(jīng)濟損失,但具體發(fā)病原因尚不清楚,因此在鴨群中開展FAdV流行病學調(diào)查迫在眉睫。本研究于2019—2020年,針對山東省中西部地區(qū)鴨群進行FAdV病原學檢測,并針對分離病毒的關(guān)鍵蛋白Hexon進行遺傳進化和氨基酸位點分析,并將分離病毒進行純化和全基因組測序,以期進一步豐富鴨群中FAdV流行病學數(shù)據(jù),從而對該病綜合防控提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

SimplyP總病毒核酸提取試劑盒,購自北京博邁斯科技發(fā)展有限公司;培養(yǎng)基DMEM,購自Gibco;胎牛血清,購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;雞肝癌細胞系LMH,為本實驗室保存。

1.2 樣品采集及處理

2019年1月—2020年12月,定期收集山東省中西部泰安、濟寧、菏澤、棗莊、濟南、德州、臨沂、聊城等8個地市鴨場的疑似FAdV感染病例組織樣品237份。剖檢病死鴨,取適量肝、脾組織于潔凈的1.5 mL離心管內(nèi),加適量PBS及滅菌小鋼珠,充分研磨,反復凍融3次后,于4 ℃,9 000 r/min離心3 min,取上清;經(jīng)0.22 μm濾器過濾后接種于LMH細胞,培養(yǎng)3 d后觀察細胞病變(CPE);若沒有出現(xiàn)明顯CPE,則盲傳3代,繼續(xù)觀察;最后收取細胞及上清,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 引物設(shè)計及PCR檢測

參照GenBank發(fā)表的FAdV、鴨圓環(huán)病毒(DuCV)、鴨流感病毒(AIV)、新型鴨呼腸孤病毒(NDRV)、鴨坦布蘇病毒(DTMUV)以及I型、III型鴨肝炎病毒(DHV-I/III)設(shè)計檢測引物(表1),以提取的核酸為模板進行PCR檢測。DNA病毒反應(yīng)條件:94 ℃預變性 5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火45 s,72 ℃延伸30 s,30個循環(huán);72 ℃延伸7 min。RNA病毒反應(yīng)條件:50 ℃反轉(zhuǎn)錄30 min,94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火45 s,72 ℃延伸30 s,30個循環(huán);72 ℃延伸7 min。

1.4 分離毒株遺傳進化、氨基酸位點分析及全基因組測序

擴增分離毒株的Hexon蛋白基因(引物見表1),連接到pMD-18T載體,轉(zhuǎn)化、挑菌,將菌液PCR陽性產(chǎn)物送公司測序。從NCBI數(shù)據(jù)庫下載不同類型FAdV參考病毒序列,用MEGA 7軟件通過最大似然法繪制遺傳進化樹。以當前雞FAdV-4流行毒株SDDM-15為參考毒株,分析本研究獲得的分離毒株氨基酸位點變異情況。將分離得到的16株FAdV-4毒株與下載的8株FAdV-4參考毒株使用在線服務(wù)器Adaptive Evolution Server,采用3種方法(SLAC、FEL、MEME)分析其氨基酸位點受到的免疫選擇壓力。選取本研究分離的CHSD-2毒株進行蝕斑純化,提取病毒核酸送上海生工生物工程有限公司進行全基因組測序分析。

表1 本研究中使用的檢測引物

2 結(jié)果與分析

2.1 病原學檢測

2019—2020年,在山東省中西部的泰安、濟寧、菏澤和棗莊等地市(圖1)共采集疑似腺病毒感染鴨病料237份,其中68份檢出FAdV病原學陽性,陽性檢出率為28.69%;鴨群全年四季均有FAdV陽性檢出,其中6—8月份的炎熱夏季和12月—次年2月的寒冷冬季陽性檢出最多(圖2),說明該病在冬季和夏季發(fā)病率較高。

圖1 陽性樣品地市分布

圖2 FAdV不同月份陽性檢出率變化

2.2 病毒分離及其遺傳進化和氨基酸突變分析

將檢測的陽性樣品處理后接種LMH細胞,進行病毒分離。結(jié)果顯示,樣品接種72 h或盲傳3代后,部分接毒組可觀察到明顯的CPE,如細胞聚集、變圓等(圖3)。收集細胞及其上清,再次通過PCR檢測FAdV,可見明亮的目的條帶,說明成功分離到該病毒。本研究中,共分離到16株鴨源FAdV。

圖3 接種腺病毒36 h后LMH細胞病變

為進一步了解目前鴨群中流行的鴨源與雞源FAdV的差異性,將本研究獲得的16株病毒Hexon蛋白基因進行克隆、測序,然后與其他22株參考毒株進行系統(tǒng)進化樹分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有鴨源FAdV分離株與雞源I群FAdV-4的親緣關(guān)系最近,處在同一個分支,而與鴨源FAdV-1、FAdV-2型親緣關(guān)系較遠(圖4)。

圖4 基于Hexon蛋白基因序列的鴨源FAdV遺傳進化分析結(jié)果

將所有鴨源FAdV分離株的Hexon蛋白與目前流行的雞源FAdV-4參考毒株SDDM-15(登錄號KU877426.1)進行同源性比對和氨基酸位點分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)16株分離病毒與參考毒株的氨基酸同源性極高(99.1%~99.9%),分離毒株彼此之間的氨基酸同源性也為98.6%~100%。分離毒株有1~7個數(shù)量不等的氨基酸突變位點,包括23、93、145、201、207、243等。值得注意的是,與雞源SDDM-15相比,所有鴨源FAdV分離株第243位氨基酸均由絲氨酸突變?yōu)樘於0罚ū?),且通過SLAC、FEL、MEME算法分析,發(fā)現(xiàn)243位點至少在兩種方法的顯著值內(nèi)(表3),表明其受到了正向免疫選擇壓力。

表2 鴨源分離株和參考毒株SDDM-15 Hexon蛋白氨基酸突變位點分析結(jié)果

表3 FAdV-4 Hexon蛋白氨基酸受到正向免疫選擇壓力位點的不同算法分析結(jié)果

由于16株鴨源FAdV之間的同源性極高,因此隨機選取1株,將其命名為CHSD-2,通過蝕斑純化后,利用高通量測序獲得其全基因組序列,發(fā)現(xiàn)該分離株全基因長43 724 bp(登錄號MW349185);進一步將其與雞源FAdV-4代表毒株GDMZ(MG856954.1)、AH-F18(MN781665.1)和CH/AHWH/2018(MN606302.1)進行全基因組序列比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)4個毒株的同源性為100%,進一步證實本研究分離的鴨源FAdV與當前流行的雞FAdV-4為同一種病毒。

3 討論

I群FAdV具有廣泛的自然宿主,不僅導致雞、鴨、鵝等家禽發(fā)病,也感染鴿、稚雞、鸚鵡等野生禽類[12]。自2015年FAdV-4在雞群中引起的心包積液綜合征暴發(fā)流行后,鴨群腺病毒的檢出率越來越高。本研究對山東省中西部地區(qū)疑似腺病毒感染的237份病鴨樣品進行病原學檢測,發(fā)現(xiàn)FAdV陽性檢出率為28.69%。呂恒欣等[13]對山東省部分地區(qū)的鴨胚、雛鴨等樣品進行腺病毒PCR檢測,發(fā)現(xiàn)陽性檢出率從23.00%到57.40%不等,表明腺病毒在山東省部分地區(qū)鴨群中普遍存在。該病全年均可發(fā)生,但以冬、夏兩季的發(fā)病率較高,分析原因可能是腺病毒對外界環(huán)境抵抗能力強,可耐高溫和嚴寒,在冬、夏兩季環(huán)境應(yīng)激影響下鴨更易發(fā)病[14]。

整個試驗中,共分離到16株鴨源FAdV。通過遺傳進化分析發(fā)現(xiàn),這16株鴨源FAdV與雞源FAdV-4的親緣關(guān)系最近,處于同一進化分支?;贔AdV主要毒力蛋白Hexon的氨基酸同源性分析發(fā)現(xiàn):分離的鴨源FAdV與雞源FAdV-4代表毒株SDDM-15具有極高的同源性,為99.1%~99.9%;每個毒株有1~7個數(shù)量不等的氨基酸突變位點,但僅243位點受到了正向免疫選擇壓。因此認為,此次分離到的16株鴨源FAdV和引起雞心包積液綜合征的FAdV-4屬于同一種病毒。同時,進一步將分離的鴨源FAdV分離株CHSD-2全基因組(43 724 bp)與雞源FAdV-4參考毒株GDMZ(MG856954.1)、AH-F18(MN781665.1)和CH/AHWH/2018(MN606302.1)進行全序列比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)CHSD-2毒株與雞源FAdV-4參考毒株核苷酸同源性均為100%,也進一步佐證了上述論點。

據(jù)報道[13-14],多數(shù)FAdV可以在健康禽體內(nèi)存在,使感染禽不表現(xiàn)臨床癥狀或僅表現(xiàn)輕微癥狀,但當與其他病原發(fā)生混合感染或機體抵抗力下降時,F(xiàn)AdV會引起相關(guān)疾病。關(guān)于鴨源FAdV-4對鴨的致病性報道不一,同一血清型不同分離株的致病性也存在不同[15]。粟元文等[16]使用鴨源FAdV-4 SC株感染雛鴨,發(fā)現(xiàn)該毒株可引起鴨群發(fā)病,且日齡越小越易感,死亡率也越高,其中對10日齡雛鴨的致死率可達到90%;而Li等[17]使用FAdV-4 SD0828分離株感染SPF雛鴨后未見任何臨床癥狀和剖檢病變,通過熒光定量方法也未檢測到組織病毒載量。本研究中,16株鴨源FAdV-4分離株的Hexon蛋白氨基酸與雞源參考毒株相比均有不同數(shù)量的突變,但這些突變的氨基酸能否影響病毒致病性,其重要的生物學意義如何,仍需要進一步試驗證明。

由于我國部分商品肉鴨、蛋鴨場存在養(yǎng)殖條件差、管理水平落后、防范意識淡薄等問題,導致鴨病復雜化[20],如鴨源FAdV檢出率快速提升,并出現(xiàn)較高的混合感染率,使鴨病防控難度進一步增加。對于該病防控,首先要完善飼養(yǎng)管理,注重生物安全,利用有效手段切斷腺病毒的水平傳播及垂直傳播;其次要選擇高效疫苗,建立有效的免疫程序,這對鴨群腺病毒病防控十分必要。

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