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41份木槿種質資源的AFLP遺傳多樣性分析

2021-08-31 05:54陳俊強董章凱段正洪
山東林業(yè)科技 2021年4期
關鍵詞:親緣木槿多態(tài)性

竇 霄,陳俊強,董章凱,劉 紅,段正洪

(1.山東省林木種苗和花卉站,山東濟南250014;2.山東省林業(yè)科學研究院,山東濟南250014;3.滕州市國有西崗苗圃,山東滕州277519)

木槿(Hibiscus syriacus)為錦葵科木槿屬小喬木或灌木,是我國園林綠化和庭院綠化中常用的觀賞植物,可做花籬式綠籬,孤植和叢植均可[1]。木槿開花量大,花色、花型多變,花期可由6月維持至10月,抗逆性較強,具備一定的吸附有害氣體和滯塵功能[2]。木槿種質資源豐富,栽培歷史悠久,分布范圍廣泛。但是目前我國對木槿的繁育栽培技術和園林應用研究較多[3-7],對其遺傳背景、親緣關系尚未開展深入系統(tǒng)的研究。國內方面,肖芬等[8]通過對27 個木槿品種進行ISSR-PCR 分子鑒定,聚類分析結果與形態(tài)分類和孢粉學分析的結果具有較強的一致性。趙藝璇等[9-10]使用SRAP 法擴增了39 個木槿品種的DNA 條帶,通過UPGMA 法進行聚類分析,得出了不同木槿變型及變種之間的遺傳距離較遠,不同木槿品種之間遺傳距離相對較近,木槿親緣關系遠近與木槿表型性狀之間存在一定聯(lián)系。此外,還對22 個木槿品種進行了花粉形態(tài)和分類研究,通過掃描電鏡進行形態(tài)特征及外壁紋飾觀測,然后使用R 型聚類分析和主成分分析等方法,得出木槿種內藍紫色單瓣品種之間親緣關系相對較近,半重瓣品種之間親緣關系相對較近,白色單瓣品種之間親緣關系相對較近。國際方面,Sang Hoon Kim 等[11]用AFLP 分子標記及形態(tài)學評價對127 個木槿品種進行分類,并分析了品種間的親緣關系。截至目前,只有少量木槿品種的遺傳多樣性和親緣關系比較清晰,尚有大量木槿品種的遺傳多樣性和親緣關系有待研究。本研究旨在對41 份木槿品種進行AFLP 分析,準確了解其遺傳多樣性及親緣關系,為今后進一步挖掘優(yōu)良木槿種質、培育新優(yōu)品種和開展木槿育種研究提供有益參考和物質基礎。

1 材料與方法

1.1 材料與來源

供試材料于2020年8月取自浙江省嘉善縣、江蘇省沭陽縣和山東省臨邑縣,共計種質41 份(見表1)。采集其健康、無病蟲害的嫩葉,于低溫下保存、運輸,并立即提取其基因組DNA。

表1 供試材料Table 1 Materials used in the experiment

1.2 研究方法

1.2.1 DNA 提取

采用Murray 和Thompson 的CTAB 法[12]從幼葉中提取DNA。提取后的DNA 用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測質量,剩余材料-80℃超低溫保存。

1.2.2 AFLP 分析

利用北京鼎國生物技術公司生產(chǎn)的AFLP 試劑盒(EcoR I/Mse I 型)及其操作指南進行,分析41 份木槿種質間的親緣關系。

1.2.2.1 限制性酶切及連接反應

限制性酶切及連接反應體系為20 μL,在0.5 mL離心管中依次加入對照模板DNA 4 μL (50 ng/μL),Adapter 1 μL,EcoR I/Mse I 2 μL,10×Reaction buffer 2.5 μL,ATP (10 mM) 2.5 μL,T4 Ligase 1 μL,ddH2O 7 μL。將混合液在離心管中混勻離心數(shù)秒,混勻離心數(shù)秒,37℃保溫5 h,8℃保溫4 h,4℃過夜。

1.2.2.2 預擴增反應

預擴增反應體系為25 μL,在0.2 mL 離心管中依次加入模板DNA 2 μL,Pre-ampmix 1 μL,dNTPs 1 μL,10×PCR buffer2.5 μL,Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 18 μL。離心數(shù)秒,按照下列參數(shù)進行PCR擴增循環(huán)30 輪:94℃變性2 min;94 ℃變性30 s,56℃復性30 s,72℃延伸80 s;72℃延伸5 min。預擴增產(chǎn)物稀釋20 倍,- 80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2.3 選擇性擴增反應

從64 對EcoRⅠ/MseⅠ引物對中篩選出帶型清晰且多態(tài)性帶較好的引物對9 對(表2)。擴增體系為25 μL,其中預擴增產(chǎn)物稀釋后的DNA 樣品2.0 μL,10 × PCR buffer 2.5 μL,EcoRI 引物和MseI 引物各1.0 μL (各8 種),dNTPs 0.5 μL,TaqDNA 聚合酶0.5 μL,ddH2O 17.5 μL。以上混勻,離心數(shù)秒,進行PCR 循環(huán)。第1 輪擴增參數(shù):94℃30 s,65℃30 s,72℃80 s,以后每輪循環(huán)溫度遞減0.7℃,擴增12輪。接著按下列參數(shù)擴增23 輪:94℃30 s,55℃30 s,72℃80 s,最后延伸5 min。

1.2.3 數(shù)據(jù)處理與分析

使用ABI377 自動測序儀對擴增產(chǎn)物進行電泳分離檢測,DNA 測序儀將自動保存膠圖。運用GENESCAN 3.1 分析軟件打開膠圖,對膠圖進行數(shù)據(jù)提取。運用NTSYSpc2.1 軟件,將原始數(shù)據(jù)轉變?yōu)椤?,1”矩陣(根據(jù)記錄帶的有無,有帶的記為“1”,無帶的記為“0”)。使用POPGEN 32 軟件計算標記位點的多態(tài)性條帶(PPB)、多態(tài)信息量(PIC)和有效等位基因數(shù)(Ne)。運用NTSYSpc2.1 軟件,并根據(jù)相似性系數(shù)對41 份木槿種質采用非加權配對類平均法(UPGMA)進行聚類分析。

2 結果與分析

2.1 AFLP 擴增結果分析

從64 對AFLP 引物組合中篩選出9 對帶型清晰穩(wěn)定、呈多態(tài)性的引物,對41 份木槿種質的DNA進行選擇性擴增(見表2),獲得了較好的擴增效果。共擴增出733 條DNA 條帶,多態(tài)性條帶699 條,多態(tài)性位點平均95%,表明不同木槿種質之間存在一定的遺傳差異。9 對引物中,擴增位點最多的是EACG/M-CAA 組合,為162 個;最少的是E-AGG/MCTT 組合,為114 個。擴增的多態(tài)性位點比率最高的是E-ACG/M-CAA,為100%;最低的是E-AGC/M-CAA 組合,為92%。

表2 木槿AFLP 分析結果Table 2 Results of AFLP analysis of Hibiscus syriacus

2.2 遺傳多樣性分析

Nei′s 基因多樣性指數(shù)(H)和Shannon 信息指數(shù)(I)是度量遺傳多樣性水平的常用指標。41 份木槿種質的Nei′s 基因多樣性指數(shù)為1.1801~1.2515,平均1.2076;Shannon 信息指數(shù)為0.1863~0.2445,平均0.2035,表明供試木槿種質有較高的遺傳多樣性。

2.3 遺傳相似性分析

采用Nei- Li 相似系數(shù)(GS)對擴增結果進行計算,得到41 份木槿種質的遺傳相似性矩陣。通過AFLP 檢測結果分析,41 份木槿種質的遺傳相似系數(shù)的變異范圍為0.702~0.932。通過相似系數(shù)矩陣看出,在供試的木槿種質中,其中38(雙豐4)和40(雙豐6)的遺傳相似系數(shù)最大,為0.932,且兩者均位于山東省臨邑縣,其遺傳距離最小,親緣關系最近;20(紅心)與34(小木槿)的遺傳相似系數(shù)最小,為0.702,且兩者分別位于浙江省嘉善縣和江蘇省沭陽縣,其遺傳距離最大,親緣關系最遠。

2.4 聚類分析

在遺傳相似性系數(shù)基礎上,通過UPGMA 法對41 份木槿種質進行聚類分析并繪制樹狀圖(圖1)。以相似系數(shù)0.87 為界,可將供試材料分為5 大類:第1 類僅含1 份種質,為1(柔粉紅心重瓣),來源于浙江省嘉善縣;第2 類有29 份種質,包括2(粉色雪紡)、3(木橋)、31(紫色絨球)、4(紫色法國酒館)、9(牡丹)、24(千絲絆)、25(雪紡)、26(中國雪紡)、28(長苞重瓣紫粉)、5 (藍莓冰沙)、15 (白花單瓣木槿)、7(雅致)、18(粉紅巨人)、8(薰衣草雪紡)、10(紫柱)、11(花葉木槿)、14(薄荷)、21(紫玉)、6(玫瑰)、16(胭脂紅)、17(單瓣紫通紫粉)、22(藍色雪紡)、23(馬麗娜)、13(阿芙羅狄)、20(紅心)、27(白花重瓣木槿)、30(夏威夷)、12(樹莓冰沙)、19(漢帛),其中25 份種質來源于浙江省嘉善縣,4 份種質來源于江蘇省沭陽縣;第3 類僅含1 份種質,為29(紅色法國酒館),來源于浙江省嘉善縣;第4 類有9份種質,包括32(紫裙)、36(雙豐2)、38(雙豐4)、40(雙豐6)、39(雙豐5)、37(雙豐3)、41(雙豐7)、35(雙豐1)、33(星光雪紡),其中7 份種質來源于山東省臨邑縣,2 份種質來源于江蘇省沭陽縣;第5 類僅含1 份種質,為34(小木槿)。從聚類分析結果可以看出,41 份木槿種質資源的分類與其地理分布位置關系較大,同一來源地的木槿種質具有較高的遺傳相似性,親緣關系較近。

圖1 41 份木槿樣品的AFLP 分子聚類圖Figure 1 The dendrogram of 41 Hibiscus syriacus samples by clustering analysis with AFLP fingerprint

3 結論與討論

遺傳多樣性是生物生存、發(fā)展和進化的前提,是物種長期進化產(chǎn)生的結果[13]。本研究采用AFLP分子標記技術,獲得了41 份供試木槿種質間的遺傳變異情況及親緣關系等信息。結果顯示,41 份木槿種質間的遺傳相似系數(shù)(GS) 為0.702~0.932,多態(tài)性位比率、Nei 基因多樣性指數(shù)、Shannon 信息指數(shù)、遺傳多樣性的平均值分別為95%、1.2076、0.2035 和0.1282,表明41 份木槿種質資源具有較高的遺傳多樣性。同時,通過聚類分析得出,在遺傳相似系數(shù)0.87 處可以將供試木槿種質劃分為5 大類,且大部分來源于同一地區(qū)的木槿種質基本處于同一類,表明從浙江省嘉善縣、江蘇省沭陽縣、山東省臨邑縣收集的木槿種質資源,在遺傳多樣性及親緣關系方面與地理分布有著較為明顯的關系。此外,34(小木槿)與其他木槿種質的親緣關系均較遠,是否與其他供試種質屬于同一品種群還有待進一步試驗證明。

木槿作為我國常用的園林綠化植物,具備花期長、花色艷、抗性強等特點,其資源的種類和數(shù)量繁多,分布范圍廣泛。本研究在分子水平上研究分析了木槿種質資源的遺傳多樣性,為木槿品種選育、良種保護等方面提供了參考依據(jù)。但是本研究所收集的41 份木槿種質資源僅涉及浙江、江蘇、山東的3 個縣,收集范圍相對集中,因此研究結果在取材范圍上有著一定的局限性。今后,還需進一步明確木槿種質資源的分布情況,擴大資源收集范圍,并結合分子標記、形態(tài)學、孢粉學等鑒定方法,更加全面、準確地研究木槿種質資源的遺傳多樣性。

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