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TMEFF2 在子宮內(nèi)膜癌組織中表達(dá)和甲基化水平的變化及與患者病理特征的關(guān)系

2021-08-11 14:07趙建國
醫(yī)學(xué)信息 2021年15期
關(guān)鍵詞:甲基化結(jié)構(gòu)域染色

王 鵬,趙建國,劉 靜

(天津市中心婦產(chǎn)科醫(yī)院婦瘤科,天津 300100)

子宮內(nèi)膜癌(endometrial carcinoma,EC)是女性生殖系統(tǒng)最常見的惡性腫瘤之一[1,2],早期患者5 年生存率超過95%;然而,晚期患者術(shù)后易復(fù)發(fā),并伴有陰道、盆腔和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致5 年生存率降至16%~45%[3]。因此,尋找有效的分子標(biāo)志物用于早期診斷和靶向治療對于提高生存率至關(guān)重要。具有表皮生長因子(epidermal growth factor,EGF)樣和Follistin 樣結(jié)構(gòu)域的跨膜蛋白TMEFF2(transmembrane protein with epidermal growth factor-like and two follistatin-like domains)在包括結(jié)直腸癌、胃癌等在內(nèi)的多種疾病中被證實屬于功能性因子[4],一方面胞外區(qū)Follistatin 樣功能域,可與轉(zhuǎn)化生長因子-β 家族、血管內(nèi)皮生長因子等結(jié)合,并抑制其受體活化;另一方面胞外區(qū)EGF 樣結(jié)構(gòu)可參與細(xì)胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)[5]。然而關(guān)于TMEFF2 在婦科癌癥中的研究有限。本研究利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫,對TMEFF2 在EC 中的表達(dá)進(jìn)行了客觀分析。并進(jìn)一步收集了大量臨床樣本以確定其表達(dá)及甲基化水平與EC 患者臨床和病理特征的關(guān)系,為尋找有效的生物學(xué)分子靶點提供一定的可靠數(shù)據(jù)支持。

1 資料與方法

1.1 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析 本研究中利用UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu)分析腫瘤組織及其相應(yīng)正常組織中的差異基因表達(dá)。該數(shù)據(jù)庫是用于在線分析和挖掘可靠信息的癌癥數(shù)據(jù)庫,可根據(jù)腫瘤分期、腫瘤分級或其他臨床病理特征,分析相關(guān)基因在腫瘤組織和正常組織中的相對表達(dá)量。篩選條件為:腫瘤類型:美國公共癌癥基因數(shù)據(jù)庫(The Cancer Genome Atlas,TCGA)-UCES(Uterine Corpus Endometrial Carcinoma);基因:TMEFF2;分析類型:腫瘤組織vs.正常組織;臨界值設(shè)置:P<0.05,倍數(shù)變化>2。最終通過篩選獲得了546 個EC 組織、35 個正常子宮內(nèi)膜組織的TMEFF2 基因表達(dá)的臨床數(shù)據(jù)資料。

1.2 臨床資料 選擇2018 年1 月~2021 年3 月在天津市中心婦產(chǎn)科醫(yī)院婦科接受初次手術(shù)的44~74歲的患者,共采集了302 例石蠟包埋的子宮內(nèi)膜標(biāo)本保存于我院病理科。按照病檢結(jié)果分為EC 組117例,包括子宮內(nèi)膜樣腺癌65 例、漿液性癌24 例、黏液性癌19 例、透明細(xì)胞癌6 例、未分化癌和去分化癌3 例;癌前病變組95 例,包括82 例子宮內(nèi)膜非典型性增生、13 例子宮內(nèi)膜上皮內(nèi)瘤;正常子宮內(nèi)膜組90 例,包括分泌型子宮內(nèi)膜55 例,增生型子宮內(nèi)膜35 例,正常子宮內(nèi)膜樣本來自入院接受診刮或由于子宮良性疾病而接受全子宮切除術(shù)的患者。所有惡性病例均按照國際婦產(chǎn)科聯(lián)合會(International Federation of Gynecology and Obstetrics,F(xiàn)IGO)系統(tǒng)(2009)[6]的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行診斷、分級和分期。檢測腫瘤分化程度、肌層浸潤深度、雌激素受體(estrogen receptor,ER)和前列腺素孕激素受體(progestrone receptor,PR)的表達(dá)。本研究和所有人類樣本的收集都得到了我院機(jī)構(gòu)倫理委員會的批準(zhǔn),且所有患者都給予了書面知情同意。納入標(biāo)準(zhǔn):①經(jīng)手術(shù)和病理組織學(xué)診斷符合相應(yīng)的診斷標(biāo)準(zhǔn)[5];EC 組患者均為原發(fā)性病變;癌前病變及正常子宮內(nèi)膜組均無子宮肌瘤、卵巢巧克力囊腫及其他雌激素依賴性疾??;②術(shù)前未接受過放療、化療、生物免疫治療等;③對于EC患者,包括子宮切除術(shù)和盆腔/腹主動脈旁淋巴結(jié)切除術(shù)。將伴有嚴(yán)重基礎(chǔ)性疾?。ㄈ绺文I功能嚴(yán)重不全、心力衰竭、急性心肌梗死、腦梗死等)、合并自身免疫性疾病、血液系統(tǒng)疾病或其他部位原發(fā)惡性腫瘤者排除在本研究之外。EC 組、癌前病變組、正常子宮內(nèi)膜組年齡分別為(56.00±11.16)歲、(54.29±13.92)歲及(55.29±11.38)歲,三組年齡比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。由2 位病理學(xué)家對腫瘤組織學(xué)切片進(jìn)行篩選,選擇具有代表性的腫瘤細(xì)胞,并從每個腫瘤標(biāo)本中取出一個直徑2 mm 的組織核,置于新的受體石蠟塊中進(jìn)行免疫組織化學(xué)染色。

1.3 免疫組化法檢測組織TMEFF2 蛋白定位和表達(dá)取子宮內(nèi)膜組織標(biāo)本連續(xù)切片(約4 μm)。應(yīng)用免疫組化鏈霉親和素-過氧化物酶法檢測TMEFF2 蛋白表達(dá)。將切片經(jīng)二甲苯二次浸潤和乙醇分級浸潤脫蠟再水化后,進(jìn)行抗原微波修復(fù)和內(nèi)源性過氧化物酶阻斷。用10%山羊血清在37 ℃下阻斷載玻片15 min,然后用1∶75 的TMEFF2 抗體(美國Abcam公司)在4 ℃的濕箱中孵育過夜,接著用辣根過氧化物酶標(biāo)記的二級抗體在37 ℃結(jié)合30min,然后用二氨基聯(lián)苯胺試劑染色,觀察TMEFF2 蛋白表達(dá)。用等體積的PBS 代替TMEFF2 抗體作為陰性對照。根據(jù)Gao LL 等[7]對染色結(jié)果進(jìn)行判讀:染色強(qiáng)度為0、1、2、3 分,分別對應(yīng)無染色、弱染色、中染色、強(qiáng)染色;以陽性細(xì)胞百分比為標(biāo)準(zhǔn),染色范圍為0、1、2、3、4 分,分別對應(yīng)<5%、5~25%、26~50%、51~75%、>75%。以上2 個分?jǐn)?shù)相乘得出最終分?jǐn)?shù)如下:0~2 分(-)、≥3 分為陽性染色。為了控制誤差,將組化圖片由2 位經(jīng)驗豐富的病理醫(yī)師獨立觀察。

1.4 組織TMEFF2 基因甲基化水平檢測 采用巢式甲基化特異性PCR(methylation-specific PCR,MSP)法檢測組織TMEFF2 基因甲基化水平將石蠟包埋組織在37 ℃放置過夜,隨后浸泡于二甲苯中2 次15 min,然后用一系列乙醇分級脫水。用Qiagen DNA FFPE 組織提取試劑盒分離組織樣本中的DNA。EZ DNA 甲基化試劑盒用于DNA 亞硫酸氫鹽修飾。引物片段5’-GAGTTTAGTTTTTGGATGTTG-3’和5’-TACAACTCTACAACAACAAAC-3’,以亞硫酸氫鹽修飾后的DNA 樣品(1:250 稀釋)為模板,進(jìn)行MSP:甲基化引物(上游)5’-AAATTTTCGAGATTATGCGC-3’和(下游)5’-CCGAAAAACACAAAATCGCG-3’;非甲基化引物(上游)5’-AAATTTTTGAGATTATGTGT-3’和(下游)5’-CCAAAAAACACAAAATCACA-3’。該反應(yīng)包括在95 ℃初始化10 min,隨后35 個周期循環(huán)(95 ℃變性30 s,57 ℃冷卻59 s,72 ℃延伸30 s)。上述過程使用GeneAmp DNA 擴(kuò)增試劑盒配制25 μl 反應(yīng)體系,在PTC-100 熱循環(huán)儀上完成,CpGenomTM 通用甲基化和非甲基化DNA 作為陽性和陰性對照,將PCR 產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行分離,溴化乙錠染色,用紫外成像系統(tǒng)觀察。甲基化或非甲基化PCR 產(chǎn)物中只有一條帶表明兩個等位基因分別為甲基化或非甲基化;同時出現(xiàn)甲基化和非甲基化PCR 產(chǎn)物表明存在部分甲基化。將甲基化或部分甲基化并入甲基化組,否則為非甲基化。

1.5 統(tǒng)計學(xué)方法 所有數(shù)據(jù)采用SPSS 21.0 軟件進(jìn)行分析,計量資料以()表示,計數(shù)資料使用[n(%)]表示。采用單因素方差分析和χ2檢驗評估組間差異。雙側(cè)P<0.05 時表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 基于TCGA 數(shù)據(jù)庫分析 TMEFF2 在UCEC 組織中的表達(dá)情況及與預(yù)后的關(guān)系原發(fā)性CESC 組織中TMEFF2 表達(dá)低于正常組織[TPM:0.001(0.001,0.036)vs 0.018(0.011,0.059),P<0.05],但是基因啟動子甲基化水平高于正常組織[β 值:0.139(0.050,0.320)vs 0.094(0.078,0.109),P<0.05]。此外,TMEFF2 表達(dá)與UCES 患者無病生存率時間和總生存時間比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),低表達(dá)亞組患者中位無病生存時間和總生存時間均長于高表達(dá)亞組患者,見圖1。

圖1 基于TCGA 數(shù)據(jù)庫挖掘TMEFF2 在UCEC 組織中的表達(dá)情況以及與預(yù)后的關(guān)系

2.2 不同組織中TMEFF2 蛋白表達(dá)和基因甲基化狀態(tài) 經(jīng)免疫組化法和MSP 法分析,TMEFF2 蛋白主要染色于細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì),細(xì)胞核也偶有染色。EC組織中TMEFF2 蛋白陽性表達(dá)率低于正常組宮內(nèi)膜組和癌前病變組,同時基因高甲基化率高于正常組宮內(nèi)膜組和癌前病變組(P<0.05);另外癌前病變組織中TMEFF2 蛋白陽性表達(dá)率亦高于正常子宮內(nèi)膜組,且基因啟動子甲基化率低于正常子宮內(nèi)膜組(P<0.05),見表1、圖2、圖3。

表1 不同組織中TMEFF2 表達(dá)和甲基化狀態(tài)比較[n(%)]

圖2 免疫組化法分析TMEFF2 蛋白在各組織中的典型表達(dá)情況(×400)

圖3 MSP 法和瓊脂糖凝膠電泳法檢測TMEFF2 基因甲基化狀態(tài)

2.3 EC 患者組織中TMEFF2 基因啟動子甲基化狀態(tài)與TMEFF2 蛋白表達(dá)的關(guān)系 81 例TMEFF2 基因高甲基化組織中TMEFF2 蛋白陽性表達(dá)率低于非甲基化組織[4.94%(4/81)vs 83.33%(30/36)],差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=74.299,P<0.05)。

2.4 EC 患者組織TMEFF2 基因甲基化狀態(tài)、蛋白表達(dá)水平與臨床病理特征的關(guān)系 EC 組織中TMEFF2基因高甲基化與FIGO 分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、肌層浸潤≥1/2 有關(guān),同時TMEFF2 蛋白陽性表達(dá)亦與FIGO 分期Ⅲ~Ⅳ期、肌層浸潤≥1/2 有關(guān)(P<0.05),見表2。

表2 EC 組織中TMEFF2 基因甲基化狀態(tài)和蛋白水平與臨床病理特征的關(guān)系[n(%)]

表2(續(xù))

3 討論

EC 是發(fā)生于子宮內(nèi)膜的一類上皮性惡性腫瘤,其發(fā)生發(fā)展是多因素的生物學(xué)過程,涉及多個基因、多個階段[8]。然而,其準(zhǔn)確的發(fā)病機(jī)制尚不清楚,也缺乏特異性的分子標(biāo)記物用于早期診斷。因此,研究影響EC 發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制和治療靶點尤為重要。TMEFF2 是一種單通道跨膜蛋白,由于其獨特的結(jié)構(gòu)特征,在機(jī)體的許多生理和病理過程中發(fā)揮著重要作用[9]。在本研究證實TMEFF2 蛋白在EC 組織中較正常子宮內(nèi)膜組織和癌前病變組織下降,而且EC 組織中TMEFF2 蛋白陽性表達(dá)率降低與基因啟動高甲基化狀態(tài)有關(guān)。此外EC 組織中TMEFF2 基因高甲基化與FIGO 分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、肌層浸潤≥1/2 有關(guān),說明TMEFF2 可能在EC 發(fā)生和進(jìn)展過程中屬于功能性分子。

TMEFF2 基因位于染色體2q32-q33 上,可編碼374 個單位長度的Ⅰ型跨膜蛋白聚糖,其主要功能已被廣泛報道,一方面可刺激腦垂體前葉分泌促腎上腺皮質(zhì)激素釋放激素,并且通過結(jié)合淀粉樣蛋白衍生物提供神經(jīng)保護(hù)作用[10];另一方面可通過激活JAK-STAT 通路[9]、調(diào)節(jié)一碳代謝[11]等參與多種細(xì)胞的癌變過程。TMEFF2 是一種多結(jié)構(gòu)域蛋白,其N 端含有一個信號肽,其次是兩個卵泡抑素樣結(jié)構(gòu)域、一個EGF 樣結(jié)構(gòu)域、一個跨膜結(jié)構(gòu)域和一個短胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域,其中EGF 樣結(jié)構(gòu)域由于重要的精氨酸殘基(Arg39)被組氨酸替代而顯示出功能上的無效性,而胞外區(qū)域的類卵泡抑素結(jié)構(gòu)域則被認(rèn)為是TMEFF2相關(guān)功能的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)域,例如可結(jié)合并調(diào)節(jié)各種生長因子,包括TGF 家族、血小板衍生因子和血管內(nèi)皮生長因子等[12]。由于TMEFF2 涉及多種癌癥和不同的功能,自本世紀(jì)初被發(fā)現(xiàn)以來,已經(jīng)引起了各個領(lǐng)域的學(xué)者相當(dāng)大的興趣;然而,不同的研究結(jié)果似乎不一致,有時甚至相互矛盾。例如Mo HY 等[13]證實胃癌組織和結(jié)腸癌組織中TMEFF2 表達(dá)明顯降低,且其低表達(dá)與病理分期不良、腫瘤體積大、預(yù)后不良有關(guān);除此以外,根據(jù)TCGA 和GSEA 數(shù)據(jù)集分析,在TMEFF2 低表達(dá)的胃癌組織中,與細(xì)胞增殖、凋亡和DNA 損傷等相關(guān)的基因表達(dá)更豐富,例如蛋白酪氨酸磷酸酶SHP-1 被鑒定為TMEFF2 的結(jié)合蛋白和TMEFF2 功能的中介體[14]。說明TMEFF2 在腫瘤發(fā)生中可通過增加細(xì)胞凋亡和阻斷細(xì)胞周期來抑制腫瘤細(xì)胞的增殖。此外Li K 等[15]在對35 例人胰腺組織及鄰近正常胰腺組織標(biāo)本,以及5 例人胰腺癌細(xì)胞系進(jìn)行了研究,結(jié)果顯示與正常胰腺組織相比,胰腺癌組織中TMEFF2 蛋白和基因均表達(dá)下調(diào)。而且上調(diào)胰腺癌細(xì)胞中TMEFF2 表達(dá),可抑制細(xì)胞增殖和促進(jìn)細(xì)胞凋亡,同時抑制了p-STAT3、VEGF 表達(dá),并增加了SHP-1 蛋白的表達(dá),說明TMEFF2 可通過靶向結(jié)合SHP-1 調(diào)節(jié)STAT3/VEGF通路,進(jìn)而在胰腺癌中發(fā)揮抑癌作用。然而Elahi A等[16]發(fā)現(xiàn)TMEFF2 在正常大腸黏膜、大腸腺瘤和大腸癌組織中均無表達(dá),并推測TMEFF2 在大腸癌中表達(dá)缺失,可能不參與大腸腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程。在本研究中,TMEFF2 蛋白在EC 組織中表達(dá)量普遍下調(diào),且陽性表達(dá)率明顯低于正常子宮內(nèi)膜組織或癌前病變組織,說明在子宮內(nèi)膜癌變過程中,TMEFF2 扮演著重要角色,可能是EC 發(fā)生的一個潛在的生物標(biāo)志物。

除此以外,TMEFF2 在其啟動子區(qū)存在CpG島,從TSP 開始跨度從-650 到+1 個堿基;而且TMEFF2 基因啟動子及其5’-上游CpG 島在許多癌癥中被證實存在高甲基化[17-19]。如Chen E 等[20]通過MSP 法檢測,發(fā)現(xiàn)59.5%的腎透明細(xì)胞癌組織中存在TMEFF2 基因高甲基化情況,而且TMEFF2 基因甲基化多發(fā)生于中晚期腫瘤組織中,且與患者預(yù)后不良有關(guān)。早在本世紀(jì)初,Young J 等[21]通過RTPCR 法分析顯示,TMEFF2 在28/30 例正常黏膜組織中呈陽性表達(dá),而在結(jié)直腸癌組織中僅有7/30 例表達(dá),且經(jīng)雜合性缺失(LOH)分析顯示僅有1 例結(jié)直腸癌出現(xiàn)TMEFF2 基因LOH。另外46 例結(jié)直腸癌組織在49 個CpG 位點上的DNA 甲基化程度超過30%。這與本研究結(jié)果基本一致,在本研究中EC組織普遍存在TMEFF2 基因啟動高甲基化狀態(tài),且與TMEFF2 蛋白表達(dá)缺失有關(guān)。張文濤等[22]利用DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑-5-氮雜-2’脫氧胞苷(5-aza-2-deoxycytidine,5-Aza-DC)處理Bca 細(xì)胞系后,TMEFF1 mRNA 和蛋白表達(dá)得到恢復(fù),細(xì)胞增殖、遷移和侵襲明顯被抑制。此外Young J 等[23]團(tuán)隊對對大腸癌體細(xì)胞和生殖系突變的全基因搜索,在63 個腫瘤和相應(yīng)的正常組織中沒有發(fā)現(xiàn)TMEFF2基因的致病突變;而Chen E 等[20]團(tuán)隊對子宮內(nèi)膜病變?nèi)V中的5 個基因進(jìn)行了定量甲基化分析,證實EC 組織中TMEFF2 基因甲基化指數(shù)高于正常子宮內(nèi)膜組織。上述這些結(jié)果均表明DNA 甲基化而非LOH 是抑制TMEFF2 表達(dá)的主要影響因素,這也解釋了本研究結(jié)果。此外也說明TMEFF2 基因的啟動子甲基化是EC 中常見的表觀遺傳事件。檢測TMEFF2 基因的表觀甲基化可能是一個有價值的標(biāo)記,用于鑒別診斷癌前病變中未檢測到的EC 患者。

綜上所述,EC 組織中普遍存在TMEFF2 蛋白表達(dá)缺失以及TMEF22 基因高甲基化狀態(tài),而且TMEFF2 基因啟動子甲基化可能是導(dǎo)致EC 組織中TMEFF2 蛋白表達(dá)降低的主要原因之一。本研究結(jié)果對于探討EC 的發(fā)病機(jī)制以及尋找早期診斷的有效生物標(biāo)志物具有重要意義,并有助于確定EC 的潛在治療靶點。

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