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一株煙草赤星病拮抗細(xì)菌Y6的篩選?鑒定及生長(zhǎng)條件優(yōu)化

2021-05-11 16:42楊德政孫光軍桑維鈞
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年8期

楊德政 孫光軍 桑維鈞

摘要為獲得能有效抑制煙草赤星病菌的拮抗菌,通過(guò)平板對(duì)峙法,篩選出一株對(duì)煙草赤星病菌有較強(qiáng)抑制作用的生防菌,通過(guò)形態(tài)、生理生化特征以及16SrRNA、gyrA序列分析等方法對(duì)其進(jìn)行鑒定,并對(duì)其生長(zhǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化。結(jié)果表明,Y6菌株對(duì)煙草赤星病菌有較好的抑制作用,其與貝萊斯芽孢桿菌(BacillusvelezensisLF01)的同源性最高,形態(tài)和生理生化特征與貝萊斯芽孢桿菌基本相符。經(jīng)過(guò)測(cè)試,Y6菌株的最佳培養(yǎng)條件:溫度30°C、pH6.0、轉(zhuǎn)速180r/min,碳源選擇葡萄糖,氮源選擇酵母膏。該試驗(yàn)結(jié)果可為貝萊斯芽孢桿菌在生產(chǎn)工藝中的應(yīng)用提供參考。

關(guān)鍵詞煙草赤星病;貝萊斯芽孢桿菌;篩選鑒定;生長(zhǎng)條件

中圖分類號(hào)S435.72文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A

文章編號(hào)0517-6611(2021)08-0130-04

doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.08.034

開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):

Screening,IdentificationandGrowthConditionOptimizationofanAntagonisticBacteriaStrainY6againstTobaccoBrownSpot

YANGDe-zheng1,SUNGuang-jun2,SANGWei-jun1,3(1.CollegeofTobacco,GuizhouUniversity,Guiyang,Guizhou550025;2.GuizhouBranchofChinaTobaccoCorporation,Guiyang,Guizhou550025;3.GuizhouKeyLaboratoryforTobaccoQualityStudy,GuizhouUniversity,Guiyang,Guizhou550025)

AbstractInordertoobtaintheantagonisticbacteriastrainwhichcouldeffectivelyinhibittobaccobrownspotdisease,thebiocontrolbacteriawerescreenedbygrowthinhibitionmethodonmedium.Isolatedstrainswereidentifiedbymorphological,physiologicalandbiochemicalcharacteristics,aswellas16SrRNAandgyrAsequence.Theirgrowthconditionswereoptimizedafterward.TheresultsshowedthatY6strainhadstronginhibitoryeffectonAlternariatabacionmediumplate,andhadthehighesthomologywithBacillusvelezensisstrainLF01.Itsmorphological,physiologicalandbiochemicalcharacteristicswerebasicallyconsistentwiththatofBacillusvelezensis.TheoptimumcultureconditionsofY6wereasfollows:30°C,pH=6.0,180r/min,carbonsourceglucose,nitrogensoureyeastextract.ThetestresultscanprovidevaluablereferenceforthemassproductionprocessofBacillusvelezensis.

KeywordsTobaccobrownspotdisease;Bacillusvelezensis;Screeningandidentification;Growthcondition

煙草赤星病是由鏈格孢菌屬的幾種真菌(Alternariaspp.)引起的一種病害,主要發(fā)生于煙草生長(zhǎng)中后期,是煙草葉片的主要病害之一,具有潛育期短、流行速度快等特點(diǎn),直接影響煙葉的品質(zhì)和產(chǎn)量[1]。赤星病1892年在美國(guó)首次被報(bào)道,1916年在我國(guó)北京附近發(fā)現(xiàn)后,80年代初我國(guó)各大煙區(qū)都出現(xiàn)了此病,給煙草行業(yè)造成了巨大損失[2]。利用生物防治來(lái)防治煙草赤星病是一種有效且具有較大發(fā)展?jié)摿Φ姆乐畏椒?,周棱波等[3]從健康煙葉上分離出了對(duì)煙草赤星病病原菌具有較好拮抗作用的短芽孢桿菌B12,其在離體葉片上的防效達(dá)66.7%。馬志遠(yuǎn)等[4]利用平板對(duì)峙法從煙草根際土壤和煙草葉圍上篩選出了一株解淀粉芽孢桿菌,其在煙草赤星病菌上抑菌條帶寬度為14.2mm,在用該菌的活性物質(zhì)粗提物與煙草赤星病病原菌孢子液進(jìn)行抑制試驗(yàn)后,發(fā)現(xiàn)粗提物對(duì)病原菌孢子的萌發(fā)抑制率高達(dá)85.6%。筆者從煙草根際土壤中篩選到了一株對(duì)煙草赤星病病原菌有一定拮抗作用的細(xì)菌菌株Y6,通過(guò)16SrRNA、gyrA基因序列、形態(tài)學(xué)和生理生化特征分析,確定其種類,并對(duì)其發(fā)酵條件進(jìn)行優(yōu)化,為評(píng)價(jià)該菌株是否能成為煙草赤星病生防菌提供參考,同時(shí)豐富了防治赤星病的微生物資源。

1材料與方法

1.1試驗(yàn)菌株煙草赤星病病原菌,由貴州大學(xué)煙草學(xué)院桑維鈞教授提供;Y6分離自貴州省遵義市綏陽(yáng)縣浦場(chǎng)鎮(zhèn)有赤星病嚴(yán)重病害發(fā)生的煙田根際土壤中。

1.2培養(yǎng)基及試劑盒馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA),用于赤星病菌的生長(zhǎng)培養(yǎng);Luria-Bertani培養(yǎng)基(LB),用于Y6菌株的分離和培養(yǎng);碳源基礎(chǔ)培養(yǎng)基:酵母膏3g,蛋白胨10g,氯化鈉5g,蒸餾水1000mL;氮源基礎(chǔ)培養(yǎng)基:優(yōu)化后的碳源5g,氯化鈉5g,蒸餾水1000mL。百泰克細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒;PCR引物及反應(yīng)試劑,由生工生物技術(shù)有限公司合成。

1.3拮抗菌的分離將采自上述地點(diǎn)的土樣各取一小部分充分混勻,稱取10g,放入盛有90mL無(wú)菌水的250mL三角瓶(有玻璃珠)內(nèi),放在搖床上充分振蕩(180r/min)靜置后,用移液器吸取1mL土壤懸液加至盛有9mL無(wú)菌水的大試管中混勻,即為10-1稀釋液。同樣方法,制成10-2、10-3、10-4、10-5、10-6土壤稀釋液。用移液器取200μL的10-4、10-5、10-63個(gè)稀釋度的土壤懸液放在LB培養(yǎng)基平板上,用滅過(guò)菌的涂布棒涂勻。28℃培養(yǎng)24h,挑出形態(tài)大小不同的單菌落,用平板劃線法純化,移接在新的LB培養(yǎng)基平面上培養(yǎng)及保存。

1.4拮抗菌的篩選拮抗菌的初步篩選利用平板對(duì)峙法[5]。在PDA培養(yǎng)基中央接入直徑5mm的煙草赤星病菌菌落,在赤星病菌四周20mm處接待測(cè)細(xì)菌,細(xì)菌接種點(diǎn)的位置與赤星病菌相對(duì)呈十字形,在培養(yǎng)皿底部標(biāo)記各菌株編號(hào)。28℃培養(yǎng)5d后觀察是否出現(xiàn)抑制效果。復(fù)篩采用上述同樣方法,培養(yǎng)5d后觀察抑菌效果。

1.5拮抗菌的鑒定

1.5.1形態(tài)特征和生理生化特征。用平板劃線法將菌種接種于平板培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)24h,按常規(guī)方法觀察菌落形態(tài)(大小、形狀、邊緣、表面、凹凸度、透明程度和菌落及培養(yǎng)基顏色等),并進(jìn)行革蘭氏染色。

參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》[6]、《伯杰細(xì)菌鑒定手冊(cè)》(第9版)[7]對(duì)菌株進(jìn)行生理生化鑒定,包括碳源利用、葡萄糖氧化發(fā)酵、硝酸鹽還原、甲基紅、V.P試驗(yàn)、淀粉水解反應(yīng)、明膠液化反應(yīng)測(cè)定、H2S的產(chǎn)生等試驗(yàn)。

1.5.216SrDNA序列分析。采用百泰克細(xì)菌基因組DNA提試劑盒提取,使用細(xì)菌16SrDNA通用引物[8]27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)、1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系:上、下游引物各1μL,12.5μL2×PCRMastermix,9.5μLddH2O,1μLDNA模板,共計(jì)25μL。PCR擴(kuò)增程序:94℃5min,94℃30s,54℃退火30s,72℃90s,35個(gè)循環(huán),72℃7min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后送上海生工進(jìn)行Sanger測(cè)序,結(jié)果在NCBI上進(jìn)行BLAST相似序列檢索比對(duì),將待測(cè)拮抗菌確定到屬。

1.5.3gyrA序列分析。采用前一步提取的DNA,使用gyrA引物[8]gyrA-5P(5′-CAGTCAGGAAATGCGTACGTCCTT-3′)、gyrA-3P(5′-CAAGGTAATGCTCCAGGCATTGCT-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系同“1.5.2”。PCR擴(kuò)增程序:94℃5min,94℃30s,53℃退火30s,72℃90s,35個(gè)循環(huán),72℃7min。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè)后進(jìn)行Sanger測(cè)序。從NCBI的GenBank下載芽孢桿菌屬的gyrA序列6條,以鏈球菌(Streptococcus)作為外祖,采用mega7.0軟件進(jìn)行Muscle多序列同源性分析,并通過(guò)鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

1.6種子液的制備將篩選出的拮抗菌接種至LB培養(yǎng)液中培養(yǎng),30℃、180r/min下培養(yǎng)24h待用。

1.7生長(zhǎng)曲線測(cè)定將液體種子液按1%的接種量接入裝有100mLLB培養(yǎng)液的三角瓶中,在30℃、180r/min下培養(yǎng),每隔2h取樣一次,測(cè)定600nm的光密度值(OD600)。

1.8拮抗菌生長(zhǎng)條件優(yōu)化

1.8.1不同溫度對(duì)拮抗菌生長(zhǎng)的影響。將種子液按照1%的接種量接種于100/250mL的LB培養(yǎng)液(pH7.0)中,分別放置于不同溫度(20、25、30、35、40℃)的恒溫培養(yǎng)箱(180r/min)培養(yǎng),以不加種子液的LB培養(yǎng)液為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次,24h后測(cè)定其在波長(zhǎng)600nm下的OD值。

1.8.2不同pH對(duì)拮抗菌生長(zhǎng)的影響。將滅菌后的LB液按每瓶100mL裝入三角瓶中(250mL),分別將pH調(diào)至3、4、5、6、7、8、9、10、11。將菌懸液按1%接種量接種于不同pH的培養(yǎng)液中,按上一步試驗(yàn)結(jié)果調(diào)整恒溫振蕩培養(yǎng)箱溫度,恒溫振蕩培養(yǎng)(180r/min),24h后測(cè)定其在波長(zhǎng)600nm下的OD值,以不加種子液的LB培養(yǎng)液為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次。

1.8.3不同轉(zhuǎn)速對(duì)拮抗菌生長(zhǎng)的影響。以上述2步的結(jié)果調(diào)整LB培養(yǎng)液的pH及培養(yǎng)箱的溫度,將種子液按照1%的接種量接種于調(diào)制好的pH培養(yǎng)液中,分別放入不同轉(zhuǎn)速150、180、210r/min恒溫振蕩培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h后,測(cè)定其在波長(zhǎng)600nm下的OD值,以不加種子液的LB培養(yǎng)液為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次。

1.8.4不同碳源對(duì)拮抗菌生長(zhǎng)的影響。將不同碳源(麥芽糖、葡萄糖、果糖、蔗糖、甘露醇)按照10g/mL加入碳源基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,按照上述三步的結(jié)果調(diào)整培養(yǎng)液pH與振蕩培養(yǎng)溫度和轉(zhuǎn)速,將菌懸液以1%的接種量分別接種于滅好菌的碳源培養(yǎng)基中,恒溫培養(yǎng),以不加種子液的碳源基礎(chǔ)培養(yǎng)液為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次,24h后測(cè)定其在波長(zhǎng)600nm下的OD值。

1.8.5不同氮源對(duì)拮抗菌生長(zhǎng)的影響。將不同的碳源(牛肉膏、蛋白胨、酵母膏、玉米粉)按照10g/mL加入氮源基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,按照上述三步的結(jié)果調(diào)整培養(yǎng)液pH、振蕩培養(yǎng)溫度、轉(zhuǎn)速、碳源,將種子液以1%的接種量分別接種于滅好菌的氮源培養(yǎng)基中,恒溫培養(yǎng),以不加種子液的氮源基礎(chǔ)培養(yǎng)液為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次,24h后測(cè)定其在波長(zhǎng)600nm下的OD值。

1.9數(shù)據(jù)處理采用DPS數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)單因素方差分析法的Duncans新負(fù)極差法進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和差異顯著性檢驗(yàn)(P<0.05),利用MicrosoftExcel2010軟件進(jìn)行作圖。

2結(jié)果與分析

2.1拮抗菌的篩選通過(guò)初篩獲得21株具有拮抗作用的菌株,對(duì)這21株菌進(jìn)行復(fù)篩后,有6株菌對(duì)煙草鏈格孢有一定的抑制作用。其中Y6對(duì)煙草鏈格孢菌的抑制作用明顯,故對(duì)Y6進(jìn)行進(jìn)一步研究。

2.2拮抗細(xì)菌種類鑒定

菌株Y6在LB培養(yǎng)基上28℃培養(yǎng)24h后,菌落為乳白色,呈圓形,直徑在0.35~0.55cm,表面有褶皺,中間部分凹陷呈火山狀,邊緣為鋸齒狀,不透明(圖1)。生理生化結(jié)果見表1。

以此菌株的基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增后經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),產(chǎn)物長(zhǎng)度約在1000bp,菌株的16SrDNA、gyrA序列經(jīng)測(cè)定,分別為1076和1001bp。

將該16SrDNA序列進(jìn)行BLAST分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),該序列與芽孢桿菌屬菌株具有較高的相似率,能夠確定該菌株屬于芽孢桿菌屬(Bacillus.sp),但不能根據(jù)BLAST確定到種。

為了確定Y6的種,首先將Y6菌株的gyrA序列于GenBank中進(jìn)行Blast分析,結(jié)果表明,該序列與貝萊斯芽孢桿菌(B.velezensis)具有非常高的相似性。然后利用從GenBank中下載的7條序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2),結(jié)果表明Y6菌株與貝萊斯芽孢桿菌(B.velezensis)的菌株LF01(CP058216)在同一分支上,該分支可信度為90%,與其他幾個(gè)種,如16SrDNA的Blast結(jié)果不能區(qū)分的解淀粉芽孢桿菌(B.amyloliquefaciens)都有一定距離。

2.3菌株Y6生長(zhǎng)曲線

Y6菌株的生長(zhǎng)曲線見圖3,接入LB培養(yǎng)基10h后該菌株的OD600快速上升,進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,18~20h為對(duì)數(shù)期末期,OD600達(dá)到最大,20h后菌體數(shù)量趨于穩(wěn)定,OD600基本穩(wěn)定。由此可知,該菌生長(zhǎng)速度較快,接種培養(yǎng)18h后達(dá)到最大。

2.4菌株Y6的生長(zhǎng)條件優(yōu)化

2.4.1不同溫度對(duì)Y6菌株生長(zhǎng)的影響。由圖4可知,溫度在20~35℃時(shí),Y6菌株的OD600均能達(dá)到2,說(shuō)明長(zhǎng)勢(shì)較好。其中,在溫度30℃時(shí)OD600顯著高于其他溫度,說(shuō)明該溫度最適宜Y6菌株生長(zhǎng)。

2.4.2不同pH對(duì)Y6菌株生長(zhǎng)的影響。由圖5可知,在培養(yǎng)溫度為30℃時(shí),在參加測(cè)試的pH范圍內(nèi),在pH5~8時(shí),Y6菌株可以生長(zhǎng),OD600均能達(dá)到2,pH為3、4、9、10時(shí)菌株幾乎不能生長(zhǎng),OD600接近于0,其中,pH6時(shí)生長(zhǎng)最好,增減pH其OD600顯著降低。

2.4.3不同轉(zhuǎn)速對(duì)Y6菌株生長(zhǎng)的影響。由圖6可知,在30℃、pH6的條件下,培養(yǎng)箱轉(zhuǎn)速為180r/min時(shí)OD600顯著高于150和210r/min,因此,180r/min是最適應(yīng)Y6菌株的培養(yǎng)條件。

2.4.4不同碳源對(duì)Y6菌株生長(zhǎng)的影響。由圖7可知,麥芽糖、葡萄糖、果糖、蔗糖、甘露醇均能被Y6菌株利用,其中葡萄糖的利用率最高,OD600達(dá)3.04,且顯著高于其他4種,麥芽糖與甘露醇次之,果糖的利用率最低,OD600為1.3,且顯著低于其他。

2.4.5不同氮源對(duì)Y6菌株生長(zhǎng)的影響。由圖8可知,參與測(cè)試的4種氮源,Y6菌株能夠較好地利用牛肉膏、蛋白胨、酵母膏3種,其中酵母膏的利用率最高,OD600達(dá)3.18,且顯著高于其他,牛肉膏次之,基本不能利用玉米粉生長(zhǎng),OD600接近于0。

3結(jié)論與討論

拮抗細(xì)菌在植物病害的生物防治中起著非常重要的作用。其中芽孢桿菌具有較高的生防潛力,所產(chǎn)生的芽孢有耐熱抗逆的特性,有利于生防菌劑的生產(chǎn)、劑型加工和菌種在工業(yè)生產(chǎn)的環(huán)境中存活,是植物病害生防微生物的重要組成部分[9]。

貝萊斯芽孢桿菌是2005年由Ruiz-Garcia等[10]新命名的芽孢桿菌屬的一個(gè)新種。貝萊斯芽孢桿菌能通過(guò)產(chǎn)生抗菌蛋白[11]、脂肽類抗生素[12]等物質(zhì)來(lái)抑制病菌。研究表明貝萊斯芽孢桿菌對(duì)棉花黃萎病菌[11]、白菜黑斑病菌[13]、香蕉枯萎病菌[14]、西瓜枯萎病菌[15]等有拮抗作用。此外,還發(fā)現(xiàn)貝萊斯芽孢桿菌能促進(jìn)胡椒、馬鈴薯、蘿卜、南瓜、番茄、蘿卜、芝麻等作物的生長(zhǎng)[16]。

該研究從煙田土壤分離得到對(duì)煙草赤星病有抑菌效果的Y6菌株,根據(jù)形態(tài)和生理生化特征,結(jié)合16SrDNA、gyrA2個(gè)位點(diǎn)序列的比對(duì)確定為貝萊斯芽孢桿菌(B.velezensis)。經(jīng)過(guò)測(cè)試,Y6菌株的最佳培養(yǎng)條件為溫度30℃、pH6、轉(zhuǎn)速180r/min,Y6菌株能利用多種碳源和氮源,其中碳源為葡萄糖、氮源為酵母膏時(shí)生長(zhǎng)最好。碳源利用的結(jié)果與羅楚翔等[17]的研究中碳源蔗糖最優(yōu),葡萄糖其次的結(jié)果不同,可能是因?yàn)樨惾R斯芽孢桿菌株菌之間的個(gè)體差異造成的。在氮源利用的試驗(yàn)中,Y6菌株在玉米粉為氮源的培養(yǎng)液中幾乎不能生長(zhǎng),這可能是因?yàn)榧尤胗衩追酆?,培養(yǎng)液濃度過(guò)高,阻礙了菌株的生長(zhǎng)。

該試驗(yàn)結(jié)果為烤煙赤星病的綠色防控提供了新的選擇,相關(guān)培養(yǎng)條件也是普通生產(chǎn)條件下能達(dá)到的,為該菌株的生產(chǎn)工藝提供了參考數(shù)據(jù),也為進(jìn)一步研究菌株抑制的作用機(jī)制、活性物質(zhì)的提取及實(shí)際防治效果奠定了基礎(chǔ)。

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