蔡阮鴻,鄭 強(qiáng),陳曉煒,徐大鵬,王 煜,駱庭偉,張 銳
(廈門大學(xué)海洋與地球?qū)W院,近海海洋環(huán)境科學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建省海洋碳匯重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海洋微型生物與地球圈層研究所,福建 廈門 361102)
人類活動(dòng)正從多時(shí)空尺度上影響著地球系統(tǒng).政府間氣候變化專門委員會(huì)(Intergovernmental Panel on Climate Change,IPCC)特別評估報(bào)告[1]以及相關(guān)研究成果均指出:自工業(yè)革命以來,人類活動(dòng)(以石化能源燃燒為主)導(dǎo)致了大氣中溫室效應(yīng)氣體濃度顯著增加[2].以二氧化碳(CO2)為主的溫室效應(yīng)氣體的激增導(dǎo)致全球變暖和海洋酸化,改變了生態(tài)系統(tǒng)和地球各碳庫之間的平衡[3-6].地球各圈層碳庫間的變化量影響了氣候變化的程度、范圍及人類生存[7-8].
海洋占地球總表面積近71%,總儲碳量(含有機(jī)和無機(jī))超過380 000億t,是地球表面最大的活躍碳庫,是大氣碳庫的近50倍、陸地碳庫的近20倍[6,9-10].自工業(yè)革命以來,近1/3人類活動(dòng)排放的CO2被海洋以物理、化學(xué)、生物的機(jī)制吸收和儲藏,在一定程度上緩解了全球變暖及其他氣候變化[11].開闊大洋儲存大氣CO2至深層海洋,當(dāng)時(shí)間尺度達(dá)百年甚至千年時(shí),即可起到減緩大氣CO2壓力而調(diào)節(jié)氣候的作用.目前已知的3種海洋儲碳機(jī)制(圖1)分別是:溶解度泵(solubility pump,SP)、生物泵(biological pump,BP)和微型生物碳泵(microbial carbon pump,MCP).
SP(圖1左)介導(dǎo)無機(jī)碳封存,可從化學(xué)海洋學(xué)和物理海洋學(xué)角度解釋海洋維持溶解無機(jī)碳(通常指溶解的CO2、HCO3-和CO32-)從表層到深海的濃度梯度,將寒冷、高密度、富含溶解無機(jī)碳的水輸送至海洋深部(主要發(fā)生在北大西洋高緯度地區(qū)),貢獻(xiàn)無機(jī)碳至近380 000億t的海洋巨大溶解無機(jī)碳庫[12].
BP(圖1中)通過重力沉降輸送顆粒有機(jī)質(zhì)(particulate organic matter,POM)至海底沉積物形成長期儲碳,其通量主要依賴于生活在海洋表層的浮游植物固定無機(jī)碳所生成的POM沉降[13-14].然而,海洋中POM在總有機(jī)碳庫中所占比例不足5%,且絕大部分POM在沉降過程中被轉(zhuǎn)化為溶解有機(jī)質(zhì)(dissolved organic matter,DOM),或經(jīng)微生物呼吸作用迅速分解為無機(jī)碳;據(jù)估算,現(xiàn)代海洋中浮游植物每年固定的有機(jī)碳總量約580億t,通過BP最終沉降至永久躍層而儲藏的POM總量每年僅3億~7億t[9,15],約占初級生產(chǎn)力的0.5%~1.2%.
圖1 海洋三大儲碳機(jī)制:溶解度泵、生物泵和微型生物碳泵Fig.1 The three ocean carbon sequestration mechanisms:solubility pump,biological pump,and microbial carbon pump
海洋有機(jī)碳的主體組分(>95%)為DOM形式,且絕大部分DOM耐受生物降解,周期可長達(dá)5 000年[16-17],被稱為惰性溶解有機(jī)質(zhì)(recalcitrant DOM,RDOM).有別于BP介導(dǎo)的POM沉積,海洋中RDOM庫的儲量巨大,儲碳量近6 600億t[18],接近大氣CO2的總儲碳量.研究表明巨大的RDOM庫的儲量變化影響著全球氣候[7,19-20].新提出的MCP儲碳機(jī)制(圖1右)闡述了通過微型生物活動(dòng)將活性溶解有機(jī)質(zhì)(labile DOM,LDOM)轉(zhuǎn)化為RDOM的生態(tài)過程,具體包括異養(yǎng)微生物代謝轉(zhuǎn)化、病毒裂解宿主生物、原生動(dòng)物捕食微型生物等[9,18],累積的RDOM進(jìn)入長周期(平均5 000年)儲碳[18].這一新興儲碳機(jī)制于2010年首次提出并被廣泛關(guān)注[21].該理論一定程度解釋了1968年美國科學(xué)家針對海洋這一巨大RDOM庫形成過程和機(jī)制的“難解之謎”[22].本文回顧自MCP理論提出后近10年關(guān)于其過程機(jī)制的研究進(jìn)展.
MCP是以“微型生物(浮游植物、細(xì)菌、古菌、病毒、原生動(dòng)物等)介導(dǎo)DOM轉(zhuǎn)化”為核心的理論機(jī)制,因此研究微型生物生態(tài)過程和DOM組分的關(guān)系對深入探索MCP至關(guān)重要.DOM常指可被孔徑為0.2 μm濾膜(或平均孔徑為0.75 μm的玻璃纖維濾膜)濾過的有機(jī)質(zhì).自20世紀(jì)中葉開始,海洋中巨大的DOM庫的形成原因、惰性機(jī)制和分子結(jié)構(gòu)特征引發(fā)關(guān)注.色譜、質(zhì)譜、光化學(xué)等傳統(tǒng)分析技術(shù)揭示海洋DOM呈現(xiàn)高度多樣化,不僅含有碳水化合物、氨基酸、多肽、蛋白質(zhì)等微生物易于降解利用的活性DOM,還含有結(jié)構(gòu)組成極其復(fù)雜多樣的未知組分.
海洋DOM庫中絕大多數(shù)都是復(fù)雜的天然RDOM,將其解析至單一組分是一項(xiàng)巨大的挑戰(zhàn).DOM在水環(huán)境中的濃度極低,1 L深層海水所含DOM的碳量不足500 μg[18],且具有極高的分子多樣性.運(yùn)用超高分辨率質(zhì)譜,如傅里葉變換離子回旋共振質(zhì)譜(Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry,F(xiàn)T-ICR MS)或靜電場軌道阱質(zhì)譜(orbitrap MS),可從海水DOM樣本中解析出成千上萬個(gè)化學(xué)分子式,每個(gè)分子式背后有多種結(jié)構(gòu)可能[23].此外,由于海水無機(jī)鹽濃度高,分析DOM前通常需先將其濃縮并除去鹽分,以避免無機(jī)鹽干擾DOM離子化.固相萃取、反滲透和超濾等技術(shù)被廣泛運(yùn)用于濃縮DOM并除鹽,然而這些技術(shù)均無法完整回收所有DOM[24],使得解析RDOM的分子組成和結(jié)構(gòu)信息成為海洋學(xué)研究的難題.
現(xiàn)有研究對RDOM的解析仍多集中于混合物水平.早期研究發(fā)現(xiàn)表層與深層海水中DOM的化學(xué)特征具有很大差異:表層海水多含活性有機(jī)質(zhì),如胞外多糖和小分子氨基酸等物質(zhì);而深海富含未知的難降解DOM[25-27].水體中小部分的天然DOM帶有發(fā)熒光基團(tuán),如芳香氨基酸、色素以及分子組成和結(jié)構(gòu)復(fù)雜的木質(zhì)素、腐殖酸和黑碳等,可在給定激發(fā)光的刺激下發(fā)生分子內(nèi)電子能量躍遷,因此釋放的熒光可被捕獲解析.基于此原理,激發(fā)發(fā)射矩陣(excitation emission matrix,EEM)熒光光譜被廣泛運(yùn)用于天然DOM的研究[28].EEM熒光光譜可鑒定出若干類具有相似熒光特性的溶解有機(jī)質(zhì)(fluorescent DOM,FDOM),典型物質(zhì)如相對活性的類蛋白質(zhì)和相對惰性的類腐殖質(zhì)組分[29-30].越來越多的生物降解實(shí)驗(yàn)證實(shí):類蛋白質(zhì)FDOM可快速被微生物降解利用,產(chǎn)生一些相對惰性的類腐殖質(zhì)FDOM信號[31-32].對海洋水柱中FDOM組分的空間分布調(diào)查發(fā)現(xiàn):表層海水含有更多的活性FDOM信號,如類蛋白和氨基酸組分;而深海中富集更多的惰性FDOM信號,如類腐殖有機(jī)質(zhì)[30,33].這種分布規(guī)律受控于物理和生物機(jī)制的共同作用:類腐殖質(zhì)FDOM容易受到光降解(或紫外光漂白)而不易在海洋真光層累積,但可通過MCP的作用產(chǎn)生并累積至黑暗的海洋深部[34-36];類蛋白質(zhì)FDOM主要來源于浮游植物的光合產(chǎn)物且容易被微生物降解,因此在海洋表層可檢出較高的信號豐度,在海洋深層的信號強(qiáng)度更低,整體分布規(guī)律與類腐殖質(zhì)FDOM相反[35,37].
21世紀(jì)初以來,F(xiàn)T-ICR MS逐漸被一些歐美國家和我國的研究人員應(yīng)用于天然DOM的解析和比對[38-40],提供了指紋圖譜信息和預(yù)測DOM的結(jié)構(gòu)信息[41-42].核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)結(jié)合FT-ICR MS從一定程度上解析出一類典型的RDOM復(fù)合物,它們具有相似的化學(xué)結(jié)構(gòu)特征,即主體呈環(huán)烷狀且側(cè)鏈富含羧基,因此被稱為富羧基不飽和脂環(huán)族化合物(carboxyl-rich alicyclic molecules,CRAM)[43-44].CRAM也被認(rèn)為是類腐殖質(zhì)的重要組成部分[45].Arakawa等[46]通過氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(gas chromatography-MS,GC-MC)和NMR等方法,解析出一類浮游植物色素(類胡蘿卜)的降解產(chǎn)物,該物質(zhì)具有典型的芳香環(huán)頭部結(jié)合戊二烯尾巴結(jié)構(gòu)特征,廣泛存在于海洋DOM中,碳-14定年法測得其循環(huán)周期大于1 500年,是一類典型的生源(即生物產(chǎn)生的)化合物降解產(chǎn)生的RDOM.此外,Zhao等[47]等結(jié)合FT-ICR MS、NMR和EEM熒光光譜也解析出一種生源DOM——熒光藻膽色素降解產(chǎn)物,其與深海RDOM組分對比顯示出分子組成上的高度一致性.以上研究均采用多種分析技術(shù)手段結(jié)合生物分析途徑解析生源RDOM的信息,證實(shí)了浮游植物有機(jī)質(zhì)是RDOM的重要來源[21].借助FT-ICR MS,越來越多的實(shí)驗(yàn)表明微生物可代謝的簡單有機(jī)質(zhì)(如葡萄糖和寡肽等)或復(fù)雜有機(jī)底物(如沉積物有機(jī)質(zhì)、浮游植物細(xì)胞破碎物和大型海藻等)為惰性CRAM組分,在培養(yǎng)體系中存在累積效應(yīng)[32,48-50],證實(shí)了生源RDOM分子對海洋天然RDOM庫的貢獻(xiàn),也從微生物生態(tài)和分析化學(xué)角度證實(shí)了10年前提出的MCP理論.
MCP理論在提出之初被認(rèn)為不僅是一個(gè)生態(tài)學(xué)理論,更闡述了許多有待驗(yàn)證的過程細(xì)節(jié),如:微生物和DOM如何相互作用產(chǎn)生RDOM?病毒顆粒如何侵染宿主釋放DOM而影響儲碳?原生動(dòng)物的捕食作用如何影響有機(jī)碳的歸宿和RDOM的生成?這些問題早期均未有明晰的答案,越來越多的研究在一定程度上作出了解釋.
與海洋DOM類似,天然微生物種群也具有極高的物種豐富度和功能多樣性,在不同海區(qū)、水團(tuán)、深度等具有明顯的分布差異,同一海區(qū)不同季節(jié)也顯著不同.深入闡釋海洋微生物與DOM分子組成之間的耦聯(lián)關(guān)系是解釋微生物吸收-轉(zhuǎn)化-釋放DOM的重要途徑,也是揭開MCP產(chǎn)生RDOM主動(dòng)過程(即浮游植物化合作用胞外分泌RDOM和異養(yǎng)細(xì)菌轉(zhuǎn)化過程)的關(guān)鍵[21,51].
近5年來,相關(guān)研究揭示海洋微生物群落對海洋DOM庫的組成和變化具有重要影響.病毒裂解超微型藍(lán)細(xì)菌所產(chǎn)生的DOM與微生物群落具有顯著的共變關(guān)系,異養(yǎng)微生物進(jìn)一步降解過程可促使DOM向惰性轉(zhuǎn)變[52].在自然環(huán)境中DOM的多樣性與惰性均會(huì)隨著時(shí)間推移而增加,這一過程與微生物的降解和轉(zhuǎn)化密不可分[53-54].在開闊大洋寡營養(yǎng)海水中,浮游植物釋放出多樣化的有機(jī)分子,這些有機(jī)分子的碳、氮、磷元素占比通常較低,經(jīng)過微生物的連續(xù)降解和不斷改造,DOM的多樣性、惰性和碳、氮、磷元素占比均進(jìn)一步增加[55-57].在空間分布上,沿北海(North Sea)經(jīng)度斷面的DOM分子組成與微生物群落組成研究展示了活躍微生物群落與活性DOM之間的耦聯(lián)關(guān)系[58].此外,Osterholz等[59]對特拉華灣(Delaware Bay)的DOM組成與微生物群落耦聯(lián)關(guān)系的研究發(fā)現(xiàn):DOM分子組成相對于微生物群落具有更高的穩(wěn)定性.可見在不同時(shí)空尺度上,海洋微生物與DOM的相互作用關(guān)系對巨大的海洋DOM庫產(chǎn)生重要影響.
微生物對DOM的利用和轉(zhuǎn)化受其生理特征和生化途徑的制約,不同微生物類群所介導(dǎo)的DOM轉(zhuǎn)換過程和最終產(chǎn)物也不盡相同,不同微生物對底物有不同的選擇傾向.在富含活性有機(jī)質(zhì)的環(huán)境中,玫瑰桿菌(Roseobacter)傾向于利用碳水化合物,而浮游細(xì)菌SAR11類群主要以氨基酸等富含有機(jī)氮的DOM為底物[60].異養(yǎng)細(xì)菌在改造病毒裂解超微型藍(lán)細(xì)菌所產(chǎn)生DOM的過程中,γ變形桿菌(Gammaproteobacteria)和黃桿菌(Flavobacteria)與較大分子質(zhì)量的DOM顯著相關(guān),暗示這些微生物傾向于利用較大的DOM分子,并釋放較小的DOM分子以供其他微生物類群生長代謝,這種DOM選擇機(jī)制有利于有機(jī)質(zhì)的轉(zhuǎn)化[51].在近岸羅斯基勒(Roskide)峽灣中,β變形桿菌(Betaproteobacteria)與類腐殖質(zhì)DOM存在顯著的相關(guān)性,暗示該類群對這類DOM有利用潛能[61].而在寡營養(yǎng)的開闊大洋中,交替單胞菌(Alteromonas)、海綿菌(Spongiibacteraceae)、泉古菌(Crenarchaeota)和廣古菌(Euryarchaeota)均能氧化相對惰性的富含羧基DOM[62],其中海綿菌被歸類為寡營養(yǎng)生物,其可以將甾體等相對難降解的化合物代謝為更難降解的惰性有機(jī)質(zhì)[63],表明這種生長緩慢的微生物可代謝半惰性DOM并釋放更加惰性的DOM,這預(yù)示著MCP的過程機(jī)制還包含將相對惰性的有機(jī)質(zhì)改造得更加惰性,使水體中的RDOM成為惰性連續(xù)體(recalcitrant continuum)[49,64-65].此外,在黑暗海洋中,分布廣泛的浮游細(xì)菌SAR202和SAR11兩大微生物類群被認(rèn)為在改造半惰性DOM過程中發(fā)揮重要作用[66,62].特別是Landry等[66]發(fā)現(xiàn):SAR202類群包含多個(gè)編碼核黃素單核苷酸或F420-依賴性單加氧酶的基因,其中多數(shù)被預(yù)測屬于Ⅱ型Baeyer-Villiger單加氧酶,主要催化氧原子插入脂環(huán)烷烴結(jié)構(gòu);這些酶在分解代謝固醇類有機(jī)質(zhì)的途徑中與其他酶家族發(fā)揮互補(bǔ)作用,表明部分SAR202類群可能是催化一些半活性有機(jī)質(zhì)(如固醇類物質(zhì))轉(zhuǎn)化為惰性有機(jī)質(zhì)CRAM的關(guān)鍵.
化能自養(yǎng)微生物也被證實(shí)是RDOM的重要來源.厭氧氨氧化古菌特別是奇古菌(Thaumarchaeota)屬于典型的化能自養(yǎng)氨氧化古菌,可在培養(yǎng)中產(chǎn)生相當(dāng)數(shù)量的活性有機(jī)質(zhì)(如氨基酸、多肽、碳水化合物及飽和脂肪酸等)和部分類似CRAM的惰性分子,預(yù)示這些古菌在黑暗海洋中的化能自養(yǎng)作用不僅提供活性DOM用于異養(yǎng)微生物的生長代謝,更為深海碳庫提供了直接的RDOM來源[67].Zhang等[68]的最新研究發(fā)現(xiàn)黑暗深海中氨氧化古菌和亞硝氧化細(xì)菌具有顯著不同的代謝策略,并揭示了硝化作用與黑暗固碳耦合的生理生態(tài)學(xué)機(jī)制,為量化深海物質(zhì)與能量循環(huán)的研究提供了新參數(shù).綜上可見,微生物群落在功能上“多才多藝”,其在對DOM吸收、轉(zhuǎn)化、釋放的過程中影響有機(jī)碳循環(huán)(如從活性到惰性的過程)和深海RDOM的多樣性,對海洋巨大的DOM庫產(chǎn)生極其重要的影響.
病毒是海洋中豐度最高的生命粒子,其中裂解性病毒侵染宿主作用可導(dǎo)致部分(20%~40%)海洋微生物死亡,調(diào)控微型生物的群落結(jié)構(gòu)和遺傳進(jìn)化[69].宿主生物被病毒裂解后,釋放的有機(jī)物重新被環(huán)境中的微生物吸收利用,因此病毒能夠通過“病毒回路”作用影響有機(jī)碳在海洋微食物網(wǎng)中的通量和途徑[21,70-71].越來越多研究揭示了病毒裂解宿主后釋放的DOM的化學(xué)組成和進(jìn)一步的生物地球化學(xué)效應(yīng).不同于浮游植物分泌的有機(jī)物,病毒裂解產(chǎn)物富含更多生物活性的蛋白類有機(jī)物[72].Ma等[73]利用高分辨率MS比較病毒裂解性產(chǎn)物和浮游植物分泌物的組分差異,發(fā)現(xiàn)病毒裂解產(chǎn)生的DOM組分更復(fù)雜且更容易被微生物利用,是海洋中高分子質(zhì)量(>1 000 ku)溶解有機(jī)氮化合物的重要來源.此外,不同病毒種群裂解特定宿主得到的有機(jī)物在成分上也有所不同[74].Zhao等[47]發(fā)現(xiàn)富含氮的病毒裂解性產(chǎn)物是海洋DOM庫的重要來源,并可能在深海里持續(xù)累積和儲存.Zheng等[75]利用FT-ICR MS等方法分析發(fā)現(xiàn),病毒裂解海洋微型“初級生產(chǎn)者”(浮游植物)產(chǎn)生了大量含氮類有機(jī)質(zhì)如氨基酸、寡肽、蛋白質(zhì)等,也產(chǎn)生了小分子有機(jī)酸、核苷酸、脂類、生物胺、卟啉等,這些活性物質(zhì)可為異養(yǎng)生物繁殖代謝提供能量,也調(diào)控海洋碳循環(huán)途徑.培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)也表明病毒裂解產(chǎn)物能被自然微生物群落快速利用,而小部分有機(jī)物組分能抵御微生物的降解,驗(yàn)證了MCP理論中“病毒裂解產(chǎn)物也是海洋RDOM的重要來源之一”這一推測[21].因此,病毒裂解宿主調(diào)控有機(jī)碳的歸宿,稱為MCP的被動(dòng)過程[21,51],在海洋碳循環(huán)中發(fā)揮重要的作用.
病毒侵染策略的生態(tài)重要性也得到了更好的認(rèn)識.不同于裂解性侵染,病毒還會(huì)通過溶原性侵染將自身整合到宿主的基因組中,并隨著宿主的復(fù)制而復(fù)制,在避免外界各種環(huán)境因子對病毒顆粒產(chǎn)生脅迫的同時(shí),也避免了宿主的裂解死亡,進(jìn)而影響宿主群落的動(dòng)態(tài)變化和結(jié)構(gòu),并影響微生物對有機(jī)物的利用[76-77].這一過程影響了有機(jī)碳的歸宿.如在河口生境從大潮到小潮的轉(zhuǎn)化過程中,病毒群落會(huì)從裂解性侵染向溶原性侵染轉(zhuǎn)換,在降低病毒降解率的同時(shí)也能促進(jìn)細(xì)菌的生存,促使碳量向高營養(yǎng)級傳遞而非被裂解釋放到環(huán)境中[78].綜合多方面的數(shù)據(jù),Knowles等[79]提出了“Piggyback-the-Winner”假說,認(rèn)為環(huán)境中微生物豐度的增加會(huì)驅(qū)使病毒從裂解性侵染向溶原性侵染轉(zhuǎn)換,并通過溶原性侵染影響宿主的群落結(jié)構(gòu)和代謝.Chen等[80]進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)病毒的高溶原性侵染會(huì)抑制微生物群落的多樣性,而溶原性侵染向裂解性侵染轉(zhuǎn)換則會(huì)殺死群落里的高豐度類群,給原本的稀有類群提供生長機(jī)會(huì),最終促進(jìn)宿主群落的多樣性,揭示了新的“Piggyback-the-Winner”和經(jīng)典的“Kill-the-Winner”病毒侵染模式在時(shí)間尺度上存在相互轉(zhuǎn)化并共同發(fā)揮作用.此外,有研究發(fā)現(xiàn)在白令海(Bering Sea)次表層沉積物中,病毒從溶原性侵染向裂解性侵染的轉(zhuǎn)化能夠增加環(huán)境中20%~56%的DOM、復(fù)合單糖和氨基酸的含量,且50%以上產(chǎn)生的有機(jī)物能被微生物在培養(yǎng)過程中持續(xù)利用和轉(zhuǎn)化[81].這些過程體現(xiàn)了病毒適應(yīng)環(huán)境所展現(xiàn)出的不同生存和生態(tài)策略,而這些策略對MCP的碳轉(zhuǎn)化機(jī)制影響的研究有待深入開展.
最新研究發(fā)現(xiàn)病毒顆粒自身可能直接影響海洋的碳循環(huán)過程.作為有機(jī)物的復(fù)合體,病毒顆粒的降解向周圍環(huán)境釋放有機(jī)碳和營養(yǎng)元素[82].據(jù)最新研究統(tǒng)計(jì),病毒顆粒在海洋中的總數(shù)量達(dá)到1.4 × 1030,有機(jī)碳總量可達(dá)32 Tg,這些有機(jī)碳若釋放到環(huán)境中,將為微生物群落提供豐富的營養(yǎng)物質(zhì)[83].據(jù)估算,深海沉積物生境中的病毒會(huì)降解宿主,每年釋放37~50 Mg有機(jī)碳到環(huán)境中,其總量相當(dāng)于上層海洋光合作用產(chǎn)物通過沉降到達(dá)深海沉積物碳量的(3±1)%[84].此外,這些高豐度的病毒顆粒能夠被原生動(dòng)物直接攝食,貢獻(xiàn)了原生動(dòng)物的有機(jī)物食物來源,直接進(jìn)入高營養(yǎng)級的海洋食物鏈而非進(jìn)入“微食物環(huán)”,進(jìn)而影響海洋碳流的途徑[83,85].近年來發(fā)現(xiàn)還存在一種“病毒穿梭”機(jī)制,能夠通過促進(jìn)顆粒有機(jī)物的富集和沉降,從而提高POM從上層海洋沉降到深海并儲存的效率[86-87].Tian等[88]和Zhang等[89]發(fā)現(xiàn)沉降到深海的上層海洋病毒仍具有侵染活性,對深海微生物類群的動(dòng)態(tài)變化和群落結(jié)構(gòu)具有重要影響.因此,病毒不僅在MCP中扮演重要角色,更協(xié)同BP在生物地球化學(xué)中發(fā)揮重要作用.
病毒侵染對宿主生理狀態(tài)和代謝機(jī)制的影響也已得到更直接的證據(jù).被病毒侵染后的宿主會(huì)重新調(diào)整細(xì)胞內(nèi)的代謝通路來促進(jìn)病毒顆粒的復(fù)制和釋放[87].如病毒侵染光合自養(yǎng)微生物后會(huì)抑制宿主體內(nèi)的有機(jī)碳固定過程,并促進(jìn)戊糖磷酸代謝,進(jìn)而促進(jìn)病毒顆粒所需核酸的合成[90-91].在侵染過程中,病毒攜帶的輔助宿主代謝基因(auxiliary metabolic genes,AMGs)也可能直接影響到宿主的代謝過程.隨著純病毒株和病毒宏基因組序列庫的不斷擴(kuò)展,越來越多的AMGs被發(fā)現(xiàn),病毒對宿主的碳代謝、營養(yǎng)物質(zhì)如氮磷硫的循環(huán)、脂肪酸代謝、光合作用、蛋白質(zhì)合成、細(xì)胞膜與囊泡的形成等過程都具有重要的潛在貢獻(xiàn)[92-94],進(jìn)而在各方面直接影響病毒在海洋碳循環(huán)過程中所扮演的角色.
病毒在MCP儲碳和全球碳循環(huán)中發(fā)揮的作用遠(yuǎn)超想象,期待更多未知過程在不斷深入的研究中被發(fā)現(xiàn).Cai等[32]近期的研究指出:病毒侵染作用可調(diào)控微生物群落,釋放微生物體細(xì)胞內(nèi)含物以供給異養(yǎng)細(xì)菌群落.正是病毒這種“Kill-the-Winner”的生態(tài)策略促進(jìn)了微生物群落的演替,加速了活性有機(jī)質(zhì)向RDOM轉(zhuǎn)化,使得碳循環(huán)在生物介導(dǎo)的過程中盡可能“轉(zhuǎn)動(dòng)”起來.這也印證了Jiao等[49]對MCP機(jī)制的補(bǔ)充,即微生物群落的演替對于有機(jī)質(zhì)的轉(zhuǎn)化至關(guān)重要,而病毒生態(tài)正是調(diào)整群落演替的關(guān)鍵因素之一[95].因此,病毒對碳循環(huán)的作用不容忽視.
與細(xì)菌、古菌、病毒等微生物相似,原生生物也在時(shí)刻影響著海洋碳循環(huán),在MCP過程機(jī)制中扮演重要角色[21].根據(jù)五界系統(tǒng)理論,真核生物中除植物、動(dòng)物、真菌外的所有生物均屬原生生物界(Protista).已有研究表明原生生物并不形成單系,而是散布于整個(gè)真核生物的各大進(jìn)化支[96].其種類繁多,至今尚無統(tǒng)一的形態(tài)學(xué)特征來定義這一類群.目前被業(yè)內(nèi)學(xué)者普遍接受的定義為:能夠獨(dú)立生存的單細(xì)胞或群體真核生物[97].原生生物具有多樣性高、結(jié)構(gòu)功能復(fù)雜和分布廣泛等特點(diǎn),是海洋微型浮游生物群落的重要組成部分,在維持海洋生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)與功能中發(fā)揮重要作用.原生生物功能類群一般可簡單劃分為具有光合自養(yǎng)能力的原生植物和具有異養(yǎng)能力的原生動(dòng)物.
海洋原生植物的光合作用貢獻(xiàn)了約全球50%的初級生產(chǎn)力[98],是有機(jī)碳循環(huán)的第一步,也為驅(qū)動(dòng)MCP提供了能源物質(zhì)[21].一般認(rèn)為,無論是近岸還是遠(yuǎn)海,原生植物(如硅藻、綠藻和甲藻等微型真核藻類)由于具有比單細(xì)胞藍(lán)藻更大的粒徑和與之相似(甚至更高)的生長率,對海洋初級生產(chǎn)力的貢獻(xiàn)超過海洋中其他光合生物[99],其形成的生物量是通過BP沉降作用的POM向深海儲藏的重要輸出者[100-101];同時(shí),藻類生長過程中所釋放的DOM可被異養(yǎng)細(xì)菌快速吸收利用,經(jīng)細(xì)菌轉(zhuǎn)化后的有機(jī)質(zhì)貢獻(xiàn)于海洋RDOM庫[102].
異養(yǎng)原生動(dòng)物(如微型異養(yǎng)鞭毛蟲和纖毛蟲等)通過攝食細(xì)菌與微藻將碳及其他元素經(jīng)微食物環(huán)傳遞至經(jīng)典食物鏈,在微食物環(huán)能流與元素循環(huán)中發(fā)揮重要作用,如原生動(dòng)物可攝食約62%藻類和25%~100%細(xì)菌的日生產(chǎn)量[103].同時(shí),原生動(dòng)物攝食過程中通過排泄與分泌所釋放的物質(zhì)中含有DOM,如尾絲蟲(Uronemasp.)和游仆蟲(Euplotessp.)兩種纖毛蟲在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)條件下能分別將其所攝食細(xì)菌碳量的9%和3%以DOM的形式釋放,調(diào)控碳分餾[104].在另一培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),纖毛蟲Strombidinopsisacuminatum和甲藻Oxyrrhismarina可通過攝食作用釋放16%~37%的藻類碳量[105];在異養(yǎng)鞭毛蟲攝食細(xì)菌的實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),攝食活動(dòng)可釋放惰性大分子有機(jī)質(zhì)[106].因此,原生動(dòng)物的攝食活動(dòng)是包括RDOM在內(nèi)的海洋DOM的重要來源之一,印證了MCP理論中原生生物的作用.
在相當(dāng)長一段時(shí)間里,光合自養(yǎng)與異養(yǎng)被認(rèn)為是原生生物僅有的兩種營養(yǎng)方式.然而,Bird等[107]研究發(fā)現(xiàn)很多原生生物具有混合營養(yǎng)能力,這為生物參與碳循環(huán)提出了新的研究方向.原生生物主要包括兩種混合營養(yǎng)模式:1) 某些能進(jìn)行光合作用的藻類可進(jìn)行吞噬營養(yǎng)[108];2) 某些進(jìn)行異養(yǎng)生活的原生動(dòng)物可攝食藻類,將其部分消化,但保留其質(zhì)體(葉綠體)并在原生動(dòng)物體內(nèi)進(jìn)行光合作用[109].混合營養(yǎng)模式的發(fā)現(xiàn)改變了海洋物質(zhì)循環(huán)與能流的經(jīng)典模型.大西洋混合營養(yǎng)模式的藻類可攝食約37%~95%的細(xì)菌生產(chǎn)量[110];基于模型的研究發(fā)現(xiàn),將混合營養(yǎng)模式納入食物網(wǎng)后,橈足類通過捕食所能獲取的微型浮游動(dòng)物的生物量是沒有混合營養(yǎng)模式條件下的2倍[111].混合營養(yǎng)模式不僅對物質(zhì)在營養(yǎng)級間的傳遞影響很大,也影響水體中DOM的組成.Tranvik等[112]比較了一種具有混合營養(yǎng)能力的金藻Poterioochromonasmalhamensis在光合自養(yǎng)及異養(yǎng)(即攝食細(xì)菌)條件下所分泌的溶解及膠狀有機(jī)碳,發(fā)現(xiàn)異養(yǎng)比光合自養(yǎng)條件下釋放更多粒徑>0.02 μm的膠質(zhì)顆粒,且異養(yǎng)條件釋放的DOM具有更高的生物惰性.
綜上,原生生物尤其是混合營養(yǎng)原生生物,在海洋生態(tài)系統(tǒng)包括碳在內(nèi)的元素循環(huán)中(如營養(yǎng)級間的傳遞對海洋DOM庫,尤其是RDOM庫)發(fā)揮重要作用.然而,目前混合營養(yǎng)原生生物的研究仍有較大不足,亟待開展深入的研究以補(bǔ)充關(guān)鍵性數(shù)據(jù),進(jìn)一步揭示原生生物在海洋碳循環(huán)中的作用.此外,雖然原生生物在MCP的過程機(jī)制中同時(shí)包含“主動(dòng)過程”(即一些浮游植物光合作用后直接釋放的DOM中含有惰性成分)和“被動(dòng)過程”(即原生生物分泌或排泄的代謝產(chǎn)物中含有RDOM)[21],原生動(dòng)物攝食作用被證實(shí)改變了碳流(如微食物環(huán)作用調(diào)整POM為DOM),但是并無明確的研究指出這種過程是否產(chǎn)生RDOM.因此,無論是原生生物中浮游植物分泌的DOM,還是原生動(dòng)物攝食作用產(chǎn)生的DOM,其分子組成都亟待研究.近10年來光分析化學(xué)、超高分辨MS分析和高場NMR分析技術(shù)的發(fā)展和融合,為這一研究提供了充分的基礎(chǔ).早在2006年,Gruber等[113]發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)體系中有無原生動(dòng)物捕食行為介入的情況下,其碳轉(zhuǎn)化方式顯著不同.然而,目前仍不明確原生動(dòng)物的攝食作用是否類似于病毒的“Kill-the-Winner”作用,即調(diào)控微生物群落結(jié)構(gòu)和釋放“被攝食者”的有機(jī)碳,進(jìn)而促進(jìn)活性有機(jī)質(zhì)向RDOM轉(zhuǎn)化并影響碳循環(huán).
基于上述MCP理論提出10年來的研究進(jìn)展,MCP的過程與機(jī)制總結(jié)于圖2.
經(jīng)過10年的研究,MCP理論框架得到了細(xì)化和完善,已被應(yīng)用于解釋海洋碳匯通量與氣候變化的關(guān)系[9,114].此外,MCP被認(rèn)為不僅適用于水體,也適用于解釋土壤環(huán)境[115]及海洋沉積物[116]的儲碳過程;MCP概念以及基于MCP的陸海統(tǒng)籌近海增匯和養(yǎng)殖區(qū)增匯路徑也被納入IPCC特別評估報(bào)告[1].
由于MCP過程機(jī)制的復(fù)雜性和應(yīng)用潛力,其研究仍需進(jìn)一步深入.基于現(xiàn)有研究進(jìn)展,提出未來研究方向如下:1) MCP產(chǎn)物RDOM組分和化合物結(jié)構(gòu)的解析,以及對應(yīng)微生物功能類群吸收、胞內(nèi)轉(zhuǎn)化、釋放這些RDOM的機(jī)制;2) RDOM在不同環(huán)境(河口、近海、開闊大洋表層、中層和深層帶)的通量;3) 黑暗深海和低(缺)氧海區(qū)微生物和RDOM的動(dòng)態(tài)變化及其碳匯效應(yīng);4) 古海洋MCP與氣候變化的關(guān)系、未來海洋MCP效應(yīng)的變化趨勢及其對氣候的調(diào)控作用[117];5) 基于MCP的跨學(xué)科(生物-化學(xué)-物理-沉積)“負(fù)排放”對“碳中和”的潛力[118].
致謝:感謝MCP理論提出人焦念院士對本文的啟發(fā),及周文楚對繪圖的幫助.
圖2 MCP過程與機(jī)制Fig.2 Processes and mechanisms of MCP