賀興龍,張一君,曾青華,3,張 旭,馬海明*
(1.寧鄉(xiāng)現(xiàn)畜牧獸醫(yī)水產(chǎn)局,湖南 寧鄉(xiāng) 410600;2.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南 長沙 410128;3 湖南楚溈香農(nóng)牧股份有限公司,湖南 寧鄉(xiāng) 410600)
寧鄉(xiāng)豬是著名的地方豬品種,先后被列入“湖南省家畜家禽品種志和品種圖譜”和“中國豬品種志”,1984年對其制定了國家標(biāo)準(GB/T2773-1981)。寧鄉(xiāng)豬因主要分布在寧鄉(xiāng)縣流沙河、草沖一帶而得名。其突出特點是早熟易肥、蓄脂力強、肌肉細嫩和肉味鮮美。隨著寧鄉(xiāng)豬產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展,對其進行親子血緣關(guān)系鑒定顯得十分重要。微衛(wèi)星DNA屬于第三代遺傳標(biāo)記,具有多態(tài)性豐富、呈共顯性和簡單易行等特點,可用于親子血緣關(guān)系鑒定。本研究利用14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記,通過計算排除概率可進行親子血緣鑒定,以期為寧鄉(xiāng)豬的保種選育提供理論依據(jù)。
用耳鉗剪取257頭寧鄉(xiāng)豬小塊耳組織,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
按常規(guī)酚-氯仿法提取基因組DNA。聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)擴增條件為:95 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,56 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸30 s,共計40 個循環(huán),最后60 ℃延伸30 min。
利用全自動測序儀對PCR產(chǎn)物進行測序,確定等位基因片段大小,毛細管電泳后分型,參照DNA分子量標(biāo)記,利用ABI遺傳分析儀對熒光標(biāo)記的DNA片段進行檢測。微衛(wèi)星DNA標(biāo)記SWC59如圖 1 所示。
通過14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記研究了124頭后代個體與133個候選母本的親子關(guān)系。共獲得14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的172個等位基因,SW2496、SW1400和 SW1047等位基因數(shù)分別為20個、19個和18個。各個基因座的基因雜合度也不同,SW1918最高,其雜合度是0.846,SW963最低,其雜合度是0.288,各個基因座的平均雜合度是0.625。親子鑒定部分結(jié)果如表1所示。
由于混合授精、多次授精和記錄錯誤等原因,在豬場進行親子鑒定十分重要。親子鑒定的方法很多,包括利用第一代、第二代和第三代遺傳標(biāo)記,但第三代遺傳標(biāo)記——微衛(wèi)星DNA標(biāo)記效果最好。本研究利用14個微衛(wèi)星DNA標(biāo)記對267頭寧鄉(xiāng)豬進行了親子鑒定,結(jié)果可靠準確。