宋彬彬, 董文洲, 賈炳泉, 甄 然, 彭 宇, 楊 璇, 于 佳
(北京中醫(yī)藥大學(xué)附屬北京老年醫(yī)院,北京 100095)
蛋白質(zhì)降解是細(xì)胞重要的生命活動(dòng),具有蛋白質(zhì)量控制、清除細(xì)胞內(nèi)錯(cuò)誤折疊蛋白質(zhì)、促進(jìn)蛋白激活等作用。真核細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解通路主要有3種:泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(ubiquitin-proteasome system,UPS)、自噬(autophagy)和鈣蛋白酶(Calpain)系統(tǒng),三者降解底物或作用部位各有不同[1-2],且受到多種分子的精細(xì)調(diào)控,包括UPS中的泛素(Ubiquitin),自噬通路中的組織蛋白酶D(Cathepsin D)、溶酶體關(guān)聯(lián)膜蛋白2(lysosomalassociated membrane protein 2,LAMP2)、自噬微管相關(guān)蛋白輕鏈3A/B(microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3,LC3A/B)、自噬相關(guān)蛋白3(autophagy-related protein 3,Atg3)和Ras相關(guān)GTP結(jié)合蛋白7(Ras-related GTP-binding protein 7,Rab7),以及Calpain途徑中的Calpain和鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin)等。本實(shí)驗(yàn)通過生物化學(xué)方法,以小鼠眼、腦、脊髓、坐骨神經(jīng)和肌肉組織為材料,檢測(cè)C57BL/6J小鼠完整的神經(jīng)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中蛋白質(zhì)降解通路相關(guān)蛋白在不同組織、解剖部位和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)(胞體和軸突)的表達(dá)和分布差異。
6周齡野生型C57BL/6J小鼠,雄性4只,雌性1只,體質(zhì)量16~20 g,購(gòu)自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司[SCXK(京)2016-0011],飼養(yǎng)于北京老年醫(yī)院屏障設(shè)施[SYXK(京)2019-0012],根據(jù)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物相關(guān)管理規(guī)定進(jìn)行操作和處理。小鼠處死后迅速取眼(eye)、嗅球(olfactory bulb)、皮層(cortex)、海馬體(hippocampus)、紋狀體(striatum)、中腦(midbrain)、小腦(cerebellum)、腦干(brain stem)、脊髓(spinal cord,SC)、坐骨神經(jīng)(sciatic nerve,SN)和肌肉(muscle),凍存于-80℃冰箱。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)經(jīng)本單位動(dòng)物福利倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(2018BJLNYY-倫理-意見第2018-013號(hào))。
10%十二烷基硫酸鈉(SDS)溶液、蛋白酶抑制劑、PierceTMBCA 蛋白定量試劑盒、蛋白質(zhì)電泳預(yù)制膠和超聲波細(xì)胞破碎儀均購(gòu)自美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司;10% TGX Acrylamide Kit、Turbo小型預(yù)制轉(zhuǎn)印包和Trans-Blot Turbo轉(zhuǎn)印系統(tǒng)均購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司;兔抗Calpain1大亞基(large)多克隆抗體、兔抗Calpastatin多克隆抗體、兔抗LC3A/B多克隆抗體和兔抗Atg3多克隆抗體均購(gòu)自美國(guó)Cell Signaling Technology公司,大鼠抗LAMP2單克隆抗體、兔抗Ubiquitin單克隆抗體、鼠抗Rab7單克隆抗體和雞抗神經(jīng)絲重鏈(neurofilamen heavy polypeptide,NFH)多克隆抗體均購(gòu)自英國(guó)Abcam公司,鼠抗β-actin和Calpain小亞基(small)單克隆抗體均購(gòu)自美國(guó)Sigma-Aldrich公司,山羊抗Cathepsin D多克隆抗體購(gòu)自美國(guó)R&D Systems公司;熒光標(biāo)記二抗和Odyssey CLX雙色紅外激光成像系統(tǒng)均購(gòu)自美國(guó)LI-COR Bioscience公司。
速凍的小鼠組織稱質(zhì)量后,按30 μL/mg加入 1% SDS裂解液,迅速剪碎,超聲破碎,室溫16 800 ×g離心10 min,收集上清液為總蛋白提取液。用BCA試劑盒測(cè)定蛋白含量,取各組等量蛋白提取液,經(jīng)10% SDS-PAGE(Bio-Rad TGX acrylamide kit)或4%~12% NuPAGE Bis-Tris預(yù)制凝膠電泳分離,再將凝膠中的蛋白質(zhì)電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上。將硝酸纖維素膜放入5%脫脂牛乳中室溫封閉1 h或Odyssey封閉液中室溫封閉30min后,加入山羊抗Cathepsin D(1∶1 000)、大鼠抗LAMP2(1∶1 000)、兔抗LC3A/B(1∶1000)、兔抗Atg3(1∶1000)、鼠抗Rab7(1∶1 000)、兔抗Ubiquitin(1∶500)、兔抗Calpain1 large(1∶1 000)、鼠抗Calpain small(1∶500)、兔抗 Calpastatin(1∶1 000)、雞抗NFH(1∶5 000)、鼠抗β-actin(1∶10 000)一抗,4 ℃孵育過夜。PBST(含0.1% Tween-20的磷酸鹽緩沖液)漂洗3次(每次5 min)后,將膜放入熒光素IRDye標(biāo)記的山羊抗兔或山羊抗鼠IgG(1∶5 000)二抗中,室溫避光孵育1 h,PBST充分漂洗后,采用Odyssey凝膠成像系統(tǒng)檢測(cè)蛋白條帶的顯色情況,使用Image J軟件分析蛋白條帶的相對(duì)灰度。
使用統(tǒng)計(jì)軟件GraphPad Prism 7(美國(guó)GraphPad Software公司)進(jìn)行分析。數(shù)據(jù)以表示,空間分布用柱形圖表示,兩組均數(shù)間差異比較采用t檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
蛋白質(zhì)印跡法檢測(cè)結(jié)果顯示,Cathepsin D、LAMP2、LC3A/B、Atg3、Rab7、Calpain大小亞基和Calpastatin在小鼠眼、嗅球、皮層、海馬、紋狀體、中腦、小腦、腦干、SC、SN和肌肉中都有一定表達(dá)(圖1A),但含量具有組織和解剖部位差異性(圖1B)。肌動(dòng)蛋白β-actin為非肌肉型肌動(dòng)蛋白,在神經(jīng)系統(tǒng)中廣泛表達(dá),在肌肉中不表達(dá)。
圖 1 蛋白質(zhì)印跡法檢測(cè)自噬和鈣蛋白酶途徑調(diào)控分子在小鼠組織中表達(dá)Figure 1 Expression of autophagy and Calpain pathway molecules in the tissues of mice detected by Western blotting
圖 2 蛋白質(zhì)印跡法檢測(cè)蛋白質(zhì)降解通路調(diào)控分子在小鼠脊髓和坐骨神經(jīng)中表達(dá)和分布Figure 2 Expression of protein degradation pathway molecules in the spinal cord and sciatic nerve of mice detected by Western blotting
蛋白質(zhì)印跡法檢測(cè)結(jié)果顯示,蛋白質(zhì)降解通路調(diào)控分子在小鼠SC和SN中有差異性表達(dá)(圖2A)。與SC相比,小鼠SN中UPS關(guān)鍵蛋白Ubiquitin和自噬通路中的Cathepsin D、LAMP2、總LC3A/B、Atg3、Rab7含量均明顯下降(P<0.01),且未檢測(cè)到LC3A/B-Ⅱ蛋白;鈣蛋白酶途徑中的Calpain1 large總含量(包含全長(zhǎng)相對(duì)分子量80 000和剪切型相對(duì)分子量75 000)明顯下降(P<0.05),但剪切型Calpain1 large含量相對(duì)增加;而Calpain small總含量(包含全長(zhǎng)相對(duì)分子量26 000和剪切型相對(duì)分子量18 000)明顯增加(P<0.001),且剪切型Calpain small含量增加相對(duì)明顯;Calpastatin含量無(wú)明顯差異(P>0.05)(圖2B)。
UPS是高效、高度選擇的蛋白降解途徑,其廣泛參與機(jī)體多種代謝活動(dòng),主要降解短壽命蛋白質(zhì)和應(yīng)激條件下細(xì)胞內(nèi)異常蛋白。UPS由Ubiquitin、泛素激活酶(E1)、泛素結(jié)合酶(E2)、泛素連接酶(E3)、蛋白酶體和去泛素化酶組成。在ATP作用下,Ubiquitin被活化后與E1結(jié)合,轉(zhuǎn)移到E2,再通過E3與靶蛋白結(jié)合,泛素化的靶蛋白進(jìn)入26S蛋白酶體(ATP依賴性蛋白水解復(fù)合體)被降解為多肽或氨基酸。去泛素化酶可將Ubiquitin從底物上解離下來(lái),繼續(xù)識(shí)別其他待降解蛋白質(zhì)[3-4]。Pasquini等[5]早期研究提出,SN中不易形成泛素-蛋白質(zhì)偶聯(lián)物。本研究發(fā)現(xiàn),與SC相比,SN中Ubiquitin含量明顯減少,這可能使蛋白質(zhì)泛素化過程受阻,從而引起軸突束中UPS降解蛋白質(zhì)功能減弱。
自噬是真核細(xì)胞中廣泛存在的一種溶酶體依賴的降解途徑,較UPS具有更強(qiáng)的降解能力,可降解長(zhǎng)壽命蛋白質(zhì)(錯(cuò)誤折疊蛋白、蛋白質(zhì)復(fù)合物、積聚物)以及受損細(xì)胞器和細(xì)胞內(nèi)病原體[6]。自噬過程分為3個(gè)階段:?jiǎn)⑹?、成熟和降解[7]。自噬起始復(fù)合物(ULK1、ULK2、ATG13、FIP200和ATG101)磷酸化后激活,活化的ULK1可以招募自噬相關(guān)蛋白(Atg)到自噬體形成位點(diǎn),觸發(fā)自噬體形成[8]。前自噬體結(jié)構(gòu)(pre-autophagosomal structure,PAS)初步延伸可包裹待降解物,隨后形成Atg5-Atg12-Atg16復(fù)合物,與3-磷酸磷脂酰肌醇結(jié)合且定位到自噬體膜上使膜延伸;或者Atg8經(jīng)泛素樣酶Atg7和Atg3加工后,與磷脂酰乙醇胺(phosphatidyl ethanolamine,PE)結(jié)合形成Atg8-PE,Atg8-PE位于自噬體膜,促進(jìn)自噬體膜延伸和招募待降解物[9]。細(xì)胞質(zhì)內(nèi)Atg4家族蛋白還可以剪切LC3前體生成LC3Ⅰ,LC3Ⅰ可通過Atg7和Atg3與PE偶聯(lián)后形成LC3Ⅱ,故LC3Ⅱ特異性與自噬體結(jié)合,LC3Ⅱ水平與自噬體數(shù)量正相關(guān),可作為自噬體形成的標(biāo)志物[10]。包裹待降解蛋白質(zhì)或細(xì)胞器的自噬體(autophagosome)被運(yùn)輸?shù)饺苊阁w中被降解,且降解產(chǎn)物可供細(xì)胞再循環(huán)利用,以維護(hù)細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)。Cathepsin D是溶酶體中主要水解酶[11]。LAMPs是溶酶體膜上含量豐富的跨膜蛋白,LAMP1和LAMP2共占溶酶體膜蛋白的約80%,可維持溶酶體膜完整性[12]。LAMPs在溶酶體腔面的氨基末端高度糖基化,以防止溶酶體腔內(nèi)酸性水解酶對(duì)其自身結(jié)構(gòu)造成破壞[13]。細(xì)胞內(nèi)吞形成內(nèi)體,晚期內(nèi)體也可攜帶特定待降解蛋白質(zhì),與溶酶體融合后進(jìn)行降解。Rab7既位于晚期內(nèi)體,也定位于自噬體,參與調(diào)控自噬體與溶酶體的結(jié)合,影響自噬體成熟和運(yùn)輸[14]。本研究發(fā)現(xiàn),與SC相比,SN中Cathepsin D、LAMP2、總LC3A/B、Atg3和Rab7含量均明顯減少,且未檢測(cè)到LC3A/B-Ⅱ。這說明自噬體和溶酶體主要分布在神經(jīng)元胞體,軸突束中自噬體形成和溶酶體分布均相對(duì)減少。有研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)SN受到損傷的早期,LC3-Ⅱ蛋白含量顯著增加,自噬水平提高可促進(jìn)軸突、髓鞘再生和運(yùn)動(dòng)功能恢復(fù)[15-16]。
當(dāng)細(xì)胞受損、刺激等引起細(xì)胞質(zhì)中鈣離子水平升高時(shí),Calpain被活化,發(fā)揮蛋白降解功能。Calpain可水解細(xì)胞骨架蛋白、膜相關(guān)蛋白、激酶和磷酸酶、轉(zhuǎn)錄因子和凋亡相關(guān)蛋白等百余種蛋白質(zhì),參與維護(hù)細(xì)胞結(jié)構(gòu)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、死亡等過程[17-18]。根據(jù)激活所需鈣離子濃度差異可將Calpain分為μ-Calpain(Calpain1)和m-Calpain(Calpain2),二者是哺乳動(dòng)物普遍表達(dá)類型,均由具有催化活性的大亞基和具有調(diào)節(jié)活性的小亞基組成[19]。Calpain大亞基具有4個(gè)主要結(jié)構(gòu)域:當(dāng)Calpain大亞基被鈣離子激活后,結(jié)構(gòu)域Ⅰ發(fā)生自溶,可暴露水解活性域;結(jié)構(gòu)域Ⅱ是蛋白質(zhì)水解的主要功能域,可分為Ⅱa和Ⅱb,鈣離子水平較低時(shí),兩亞區(qū)域分離,抑制蛋白質(zhì)水解;結(jié)構(gòu)域Ⅲ為調(diào)節(jié)中心,參與Calpain膜轉(zhuǎn)移過程;結(jié)構(gòu)域Ⅳ含有5個(gè)EF手性結(jié)構(gòu)域,直接與鈣離子結(jié)合后,酶構(gòu)象改變,大小亞基分離,逐步暴露水解活性結(jié)構(gòu)域Ⅱa和Ⅱb,參與底物水解[20]。本研究中Calpain1 large抗體可檢測(cè)全長(zhǎng)(相對(duì)分子量80 000)和28位亮氨酸自剪切后(相對(duì)分子量75 000)的Calpain1large蛋白。與SC相比,SN中總Calpain1large含量明顯減少,但剪切型Calpain1large蛋白(相對(duì)分子量75 000)含量相對(duì)增加。Calpain1和Calpain2具有相同的Calpain small,Calpain small為調(diào)節(jié)亞基,具有Ⅰ、Ⅱ兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,對(duì)于維持Calpain活性具有重要作用。本研究中Calpian small抗體可檢測(cè)全長(zhǎng)(相對(duì)分子量26 000)和自溶剪切型(相對(duì)分子量18 000)Calpain small。研究發(fā)現(xiàn),與SC相比,SN中總Calpain small含量明顯增加,且剪切型Calpain small含量增加相對(duì)明顯,提示Calpain small較活化。Calpain活性隨鈣離子濃度提高而增加,當(dāng)Calpain過度活化時(shí),Calpastatin可特異性抑制Calpain活性[21]。Baudry[22]研究提出,Calpain廣泛分布于機(jī)體各組織。本研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),在神經(jīng)系統(tǒng)中,SC與SN相比,Calpastatin含量無(wú)明顯差異;而SC和SN中Calpain大小亞基含量和活性具有明顯差異,提示Calpain調(diào)節(jié)的蛋白質(zhì)降解主要發(fā)生在神經(jīng)元軸突,較少發(fā)生于胞體。當(dāng)SN受損時(shí),軸突內(nèi)鈣離子水平迅速升高可激活Calpain[23],降解細(xì)胞骨架蛋白使軸突變性[24],而Calpastatin對(duì)軸突和突觸結(jié)構(gòu)及功能具有保護(hù)作用[25]。
蛋白質(zhì)合成與降解平衡是維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)的重要條件,蛋白質(zhì)降解通路受損引起蛋白質(zhì)異常積聚可導(dǎo)致多種神經(jīng)退行性疾病。本研究發(fā)現(xiàn),與SC相比,小鼠SN中UPS和自噬通路相關(guān)蛋白含量明顯降低,而依賴于鈣離子的Calpain系統(tǒng)中Calpain small含量明顯增加,這提示UPS和自噬主要降解神經(jīng)元胞體中蛋白質(zhì),而軸突束中主要通過Calpain途徑降解底物。在正常生理?xiàng)l件下,Calpain參與調(diào)節(jié)細(xì)胞遷移和軸突發(fā)育等;但在氧化應(yīng)激、創(chuàng)傷、興奮毒性等病理?xiàng)l件下,鈣離子大量?jī)?nèi)流,Calpain高度活化,可能導(dǎo)致軸突變性、斷裂,甚至神經(jīng)元死亡。蛋白質(zhì)降解通路異常與疾病發(fā)生發(fā)展緊密相關(guān),深入研究蛋白質(zhì)降解通路及其關(guān)鍵分子可為神經(jīng)系統(tǒng)疾病的治療提供新的思路。