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桃抗白粉病基因Vr3候選基因的精細(xì)定位與鑒定

2020-12-09 05:26:57
三農(nóng)資訊半月報(bào) 2020年22期
關(guān)鍵詞:扁桃白粉病抗性

(2020.11.20 園藝研究)

桃(Prunus persica (L.)Batsch)是薔薇科中最具特征的物種之一,是溫帶地區(qū)重要的核果作物,2018年全球桃子、油桃和扁平果產(chǎn)量超過(guò)2400萬(wàn)噸。大多數(shù)商業(yè)桃品種易受不同種類的病蟲(chóng)害影響,其中最主要的一種病害是由子囊菌Podosphaera pannosa引起的桃白粉?。≒PM)。幾乎所有的商業(yè)桃品種都不同程度地對(duì)PPM敏感,病原菌侵染果實(shí)、葉片、芽和莖,菌絲在表面形成灰白色斑點(diǎn),對(duì)果實(shí)和葉片的嚴(yán)重侵染可導(dǎo)致其過(guò)早脫落。目前控制白粉病的方法主要是從花瓣凋落時(shí)開(kāi)始,按期噴灑殺菌劑。但殺菌劑會(huì)對(duì)環(huán)境安全造成一定的影響,另一種替代方法是開(kāi)發(fā)具有抗性的桃品種。

近日,Horticulture Research在線發(fā)表了西班牙農(nóng)業(yè)基因組學(xué)研究中心,農(nóng)業(yè)食品研究技術(shù)研究所Iban Eduardo團(tuán)隊(duì)的題為Fine mapping and identification of candidate genes for the peach powdery mildew resistance gene Vr3的研究論文,為桃育種中Vr3候選基因的研究提供有價(jià)值的信息并有助于桃育種中的標(biāo)記輔助選擇。

先前的研究在扁桃(‘Texas)和桃(‘Earlygold)的種間種群中定位了一個(gè)抗性基因(Vr3)。為了獲得與Vr3高度連接的分子標(biāo)記并減少候選基因的數(shù)量,研究人員基于親本系的重序列,設(shè)計(jì)了新的分子標(biāo)記,包括4個(gè)SSRs、14個(gè)Indels和4個(gè)SNPs。利用這些標(biāo)記對(duì)重組個(gè)體進(jìn)行基因分型,以縮小Vr3所在的基因組區(qū)域。使用近等基因系(NILs)對(duì)有癥狀或無(wú)癥狀葉片中的位置候選基因進(jìn)行表達(dá)分析。新的基因分型信息將Vr3精細(xì)定位到一個(gè)有27個(gè)注釋基因的270kb基因組區(qū)域(在Pp02: 16,912,811和Pp02: 17,184,692之間)。

在27個(gè)候選基因中,5個(gè)被注釋為參與植物防御,另外5個(gè)編碼結(jié)構(gòu)功能,10個(gè)被預(yù)測(cè)參與植物代謝,7個(gè)被注釋為未知。參與植物防御的五個(gè)候選基因中,Prupe.2G112700和Prupe.2G113200被特異性包含在植物R基因TIR-NBS-LRR類中。此外,5個(gè)基因(Prupe.2G112600, Prupe.2G112800, Prupe.2G112900, Prupe.2G113000和Prupe.2G113500)被預(yù)測(cè)編碼蛋白Eceriferum 1,參與表皮蠟質(zhì)的生物合成。之后研究人員對(duì)候選基因進(jìn)行表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)抗性和易感個(gè)體之間差異表達(dá)的基因,被注釋為抗病蛋白R(shí)GA2(Purpe.2G111700)和涉及表皮蠟生物合成的Eceriferum 1蛋白(Prupe.2G112800)。與易感個(gè)體相比,只有RGA2(Prupe.2G111700)含有一個(gè)產(chǎn)生終止密碼子的高效變異體,并且在含有Vr3扁桃等位基因的雜合子和純合子個(gè)體中都過(guò)量表達(dá)。因此,RGA2(Prupe.2G111700)被認(rèn)為是Vr3最強(qiáng)的候選基因。該研究中使用的NILs將促進(jìn)該基因單獨(dú)或與其他已知抗性基因如桃粉病抗性基因Vr2協(xié)同,以提高對(duì)PPM的耐受性,培育優(yōu)質(zhì)桃抗性品種。

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