柴金龍,胡晟源,陳麗,王淑軍,焦豫良,楊杰,劉姝,*,房耀維
(1.江蘇海洋大學(xué)海洋生命與水產(chǎn)學(xué)院,江蘇連云港222005;2.江蘇省海洋資源開(kāi)發(fā)研究院,江蘇連云港222005;3.江蘇海洋大學(xué)海洋資源與環(huán)境學(xué)院,江蘇連云港222005)
蛋白酶是一類水解蛋白質(zhì)肽鍵并將其分解為蛋白胨、多肽、游離氨基酸的一類酶的總稱[2]。蛋白酶具有催化活性高、條件溫和、專一性強(qiáng)、選擇性高等優(yōu)點(diǎn),廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)加工、洗滌劑添加、制藥、污水處理等多種工業(yè)領(lǐng)域[2-5]。更值得關(guān)注的是蛋白酶在有機(jī)溶劑介質(zhì)中可以催化廣泛應(yīng)用于食品和醫(yī)藥的短肽的合成[6]。但是,有機(jī)溶劑對(duì)大多數(shù)天然蛋白酶具有毒性,極大地限制了其在有機(jī)合成領(lǐng)域的應(yīng)用。通過(guò)生物催化工程[7-9]和溶劑工程[10-11]可提高酶類有機(jī)溶劑耐受性,但這些方法操作復(fù)雜且成本極高。獲得天然耐受有機(jī)溶劑的蛋白酶可節(jié)約成本、提高效率[12]。另外,已報(bào)道的耐有機(jī)溶劑蛋白酶種類有限,難以滿足工業(yè)催化需要。明確蛋白酶耐受有機(jī)溶劑的分子機(jī)制,通過(guò)理性設(shè)計(jì)提高蛋白酶有機(jī)溶劑耐受性提供了解決該問(wèn)題的有效途徑。
目前,蛋白酶有機(jī)溶劑耐受性的分子機(jī)制尚不完善。通過(guò)酶基因的異源表達(dá)利于酶的純化,也為酶的理性設(shè)計(jì)奠定基礎(chǔ)。Rahman等[13]從P.aeruginosa strainK中克隆得到一段由479個(gè)氨基酸耐有機(jī)溶劑堿性蛋白酶的序列。該酶在E.coli BL21(DE3)中進(jìn)行表達(dá)。承龍飛等[14]從Bacillus cereus WQ-2中克隆獲得了566個(gè)氨基酸的耐有機(jī)溶劑中性蛋白酶序列,并將其在枯草芽孢桿菌WB600中表達(dá),重組菌的蛋白酶活力比野生菌提高了約4倍,達(dá)到17 400 U/mL。何小丹等[15]從B.licheniformis YP1A中克隆得到了一段1 264 bp的耐有機(jī)溶劑蛋白酶基因,用兩種不同啟動(dòng)子的載體將其在枯草芽孢桿菌WB800中表達(dá),最后得到的重組菌的發(fā)酵產(chǎn)酶水平達(dá)到395 U/mL。
本研究組前期篩選的菌株Bacillus sphaericus DS11分泌耐有機(jī)溶劑蛋白酶,將其在25%的正己醇、苯、二甲苯等有機(jī)溶劑中孵育14 d后仍然保持80%以上的蛋白酶活力[16-17]。擴(kuò)增該蛋白酶基因序列,BLAST發(fā)現(xiàn)該序列同B.sphaericus 2297蛋白酶基因(GenBank登錄號(hào):AJ238598.1)的氨基酸序列與其相似度達(dá)到88%。本研究全構(gòu)建了重組枯草芽孢桿菌B.subtilis WB800-pMA0911-sph,實(shí)現(xiàn)蛋白酶卵巢特異性啟動(dòng)子(ovarian-specific promoter,OSP)的胞外表達(dá),并研究了重組酶進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)和其對(duì)有機(jī)溶劑的耐受特性,為以后進(jìn)一步探索B.sphaericus DS11蛋白酶有機(jī)溶劑耐受性分子機(jī)制的研究奠定基礎(chǔ)。
E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞、B.subtilis WB800感受態(tài)細(xì)胞:杭州寶賽生物科技有限公司;大腸桿菌-枯草芽孢桿菌穿梭質(zhì)粒pMA0911-H3:江南大學(xué);環(huán)己烷、正丁醇、二甲苯:阿拉丁試劑有限公司;DNA Marker、T4 DNA 連接酶、限制性內(nèi)切酶 BamH I、ECOR I、質(zhì)粒小抽試劑盒、Lysis Buffer for Microorganism to Direct PCR、鎳離子金屬親和層析柱:寶生物工程有限公司(TaKaRa)。試驗(yàn)所用試劑均為分析純?cè)噭?/p>
Q5000微量核酸蛋白檢測(cè)儀:美國(guó)Quawell公司;T100TMThermal Cycler PCR儀、Sub-Cell GT1704481凝膠電泳槽、Gel DocTMEZ凝膠成像儀:美國(guó)Bio-RAD公司;Thermo多功能酶標(biāo)儀:南京寶誠(chéng)生物技術(shù)有限公司。
1.3.1 培養(yǎng)基
LB 培養(yǎng)基(L):蛋白胨10g,酵母粉5g,NaCl 10g。
LB奶粉固體培養(yǎng)基(L):蛋白胨10 g,酵母粉5 g,NaCl 10 g,奶粉 5 g,瓊脂 20 g。
脫脂奶粉等培養(yǎng)基其余成分121℃,20 min滅菌后,直接加入未凝固的培養(yǎng)基中,搖勻后倒平板(注意不要產(chǎn)生氣泡和塊狀沉淀)。
1.3.2 引物的設(shè)計(jì)與合成
設(shè)計(jì)擴(kuò)增osp上下游引物,分別在上下游引物添加BamH I、ECOR I酶切位點(diǎn),在下游引物添加His標(biāo)簽。
PpMa09-F1 CCGGAATCCATGGATAGCGAAGATAGCTTAGG 和 PpMa09-R1 CGCGGATCCTAATGATGATGATGATGATGTTGAACACGAGCGAAG,由南京思普金生物科技公司合成。
1.3.3 重組表達(dá)菌株的構(gòu)建
將斜面4℃保藏的B.sphaericus DS11在LB固體平板三區(qū)劃線,37℃倒置過(guò)夜培養(yǎng)。在1.5 mL EP管中加入 50 μL Lysis Buffer for Microorganism to Direct PCR,挑取單菌落加入EP管中,80℃水浴15 min,4 000 r/min離心后上清液作為模板,添加引物擴(kuò)增蛋白酶基因osp。將osp和載體質(zhì)粒pMA0911-H3分別用ECOR I、BamH I兩種限制性內(nèi)切酶進(jìn)行雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳回收目的基因sph片段和載體質(zhì)粒,T4 DNA連接酶16℃過(guò)夜連接,轉(zhuǎn)化到克隆載體E.coil DH5α感受態(tài)細(xì)胞,并涂布于Amp抗性(100 μg/mL)的 LB平板,37℃倒置過(guò)夜培養(yǎng),挑取單菌落轉(zhuǎn)接到含有Amp抗性(100 μg/mL)液體培養(yǎng)基中,37℃,180 r/min搖床培養(yǎng)后抽提質(zhì)進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證。利用質(zhì)粒提取試劑盒提取陽(yáng)性重組質(zhì)粒pMA0911-sph,然后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)B.subtilis WB800,涂布于卡那抗性(50 μg/mL)的 LB奶粉平板上,37℃倒置過(guò)夜培養(yǎng)。挑取周?chē)忻黠@透明圈的轉(zhuǎn)化子單菌落進(jìn)行菌落聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)驗(yàn)證并進(jìn)行基因測(cè)序。
1.3.4 osp的表達(dá)、純化及電泳分析
將重組菌和含有空質(zhì)粒pMA0911的WB800菌株分別挑取單菌落接入到含有50 μg/mL卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,180 r/min、37℃振蕩過(guò)夜培養(yǎng)。將菌液于4℃下,8 000 r/min離心30 min,得到的上清液即為粗酶液。利用鎳柱根據(jù)說(shuō)明書(shū)方法對(duì)粗酶液進(jìn)行純化,并進(jìn)行十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)檢測(cè)[18]。
1.3.5 蛋白酶活性測(cè)定
利用福林酚法測(cè)定蛋白酶活力[19]。在試管中加入的1 mL的酶液、1 mL 2%pH 8.0的酪蛋白底物(需要在40℃先預(yù)熱),于40℃水浴鍋中水浴反應(yīng)10 min,加入2 mL 0.4 mol/L的三氯乙酸(trichloroacetic acid,TCA),充分振蕩混勻,靜置10 min(終止反應(yīng))后,用濾膜過(guò)濾,取1 mL濾液,加入5 mL 0.4 mol/L的碳酸鈉溶液和1 mL的福林酚試劑搖勻后,置于40℃水浴鍋中顯色20 min,測(cè)定上清液的吸光度(A680)。酶活測(cè)定時(shí)需要設(shè)置一個(gè)對(duì)照組,對(duì)照組需要直接先在酶液中加入TCA,反應(yīng)10 min后,再加入底物靜止10 min后過(guò)濾后取1 mL濾液,后續(xù)操作同試驗(yàn)組。酶活單位(U/mL):在40℃條件下,每分鐘水解酪蛋白底物產(chǎn)生1 μg酪氨酸所需的酶量定義為1個(gè)酶活單位。
1.3.6 重組OSP酶學(xué)性質(zhì)研究
1.3.6.1 溫度對(duì)重組OSP酶活性和穩(wěn)定性的影響
用2%pH 8.0的酪蛋白溶液作為底物,與酶液混勻后,置于 20、30、40、50、60、70 ℃下水解反應(yīng) 10 min,TCA終止反應(yīng),測(cè)定酶活力。將酶液分別在20、30、40、50、60 ℃下保溫 2、4、6、7、10 h后,測(cè)定其剩余酶活力。
1.3.6.2 pH值對(duì)重組OSP酶活性和穩(wěn)定性的影響
以2%的酪蛋白為底物,分別在pH 5.0~6.0的檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液、pH 6.0~8.0的磷酸鹽緩沖液、pH 8.0~9.0的Tris-HCl緩沖液、pH 9.0~10.0的甘氨酸-NaOH緩沖液中,在最適溫度下水解反應(yīng)10 min,測(cè)定酶活力。將酶液于pH 5.0~10.0的不同緩沖體系中孵育24 h后,測(cè)定其剩余酶活力。
1.3.6.3 金屬離子對(duì)重組蛋白酶活力的影響
乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)終濃度為1 mmol/L,各種金屬離子溶液與酶液混至終濃度分別為1 mmol/L和2.5 mmol/L,并且設(shè)置對(duì)照組不添加金屬離子,在最適條件和pH值條件下反應(yīng)10 min后測(cè)定剩余酶活力。
1.3.6.4 重組OSP的有機(jī)溶劑穩(wěn)定性
將酶液與終濃度為25%正丁醇、環(huán)己烷、二甲苯、乙醇混勻,30 ℃、180 r/min 分別孵育 30 min、1、2、24 h、6 d,按最適反應(yīng)條件測(cè)定剩余酶活力。
將蛋白酶基因sph連接到載體pMA0911-H3,得到重組質(zhì)粒pMA0911-osp。將重組質(zhì)粒pMA0911-osp轉(zhuǎn)化E.coil DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽(yáng)性克隆,搖菌后用質(zhì)粒小抽試劑盒抽提質(zhì)粒并雙酶切驗(yàn)證,重組質(zhì)粒pMA0911-osp雙酶切結(jié)果見(jiàn)圖1。
將驗(yàn)證正確的重組質(zhì)粒pMA0911-osp轉(zhuǎn)化B.subtilis WB800感受態(tài)細(xì)胞中,轉(zhuǎn)化后涂布于卡那抗性(50 μg/mL)LB奶粉平板。挑取有透明圈的單菌落PCR擴(kuò)增驗(yàn)證,重組枯草芽孢桿菌B.subtilis WB800-pMA0911-osp菌落PCR鑒定結(jié)果見(jiàn)圖2。進(jìn)一步序列測(cè)定表明序列準(zhǔn)確,表明重組枯草芽孢桿菌工程菌B.subtilis WB800-pMA0911-osp構(gòu)建成功。
圖1 重組質(zhì)粒pMA0911-osp雙酶切結(jié)果Fig.1 Recombinant plasmid pMA0911-osp Double digestion results
圖2 重組枯草芽孢桿菌B.subtilis WB800-pMA0911-osp菌落PCR鑒定結(jié)果Fig.2 Results of PCR identification of recombinant B.subtilis WB800-pMA0911-osp colonies
將B.subtilis WB800-pMA0911-osp發(fā)酵粗酶液用鎳柱進(jìn)行蛋白純化,并進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測(cè),重組菌B.subtilis WB800-pMA0911-His6-osp發(fā)酵上清SDS-PAGE電泳結(jié)果見(jiàn)圖3。表達(dá)的蛋白酶大小約為33 kDa。
2.3.1 重組蛋白酶的最適溫度及熱穩(wěn)定性
溫度對(duì)蛋白酶活力的影響見(jiàn)圖4,溫度對(duì)蛋白酶穩(wěn)定性的影響見(jiàn)圖5。
圖3 重組菌B.subtilis WB800-pMA0911-His6-osp發(fā)酵上清SDS-PAGE電泳結(jié)果Fig.3 SDS-PAGE analysis of the recombinant B.subtilis WB800-pMA0911-sph fermentation supernatant
圖4 溫度對(duì)蛋白酶活力的影響Fig.4 Effects of temperature on protease activity
圖5 溫度對(duì)蛋白酶穩(wěn)定性的影響Fig.5 Effects of temperature on protease stability
重組OSP的最適反應(yīng)溫度為40℃,在20℃~40℃范圍內(nèi),蛋白酶OSP的活性隨溫度的升高而上升,40℃時(shí),酶活力達(dá)到最高,當(dāng)溫度從40℃升高到70℃時(shí),酶活力逐漸降低,70℃時(shí),酶活下降約70%。蛋白酶OSP在低溫條件下(20℃~30℃)有較好的穩(wěn)定性,可以保持較高的酶活性。溫度高于30℃后,酶穩(wěn)定性迅速下降,當(dāng)保溫溫度為60℃時(shí),僅2h,酶活下降約70%。
2.3.2 重組蛋白酶的最適pH值及pH值穩(wěn)定性
pH值對(duì)蛋白酶活力的影響見(jiàn)圖6,pH值對(duì)蛋白酶穩(wěn)定性的影響見(jiàn)圖7。
圖6 pH值對(duì)蛋白酶活力的影響Fig.6 Effects of pH value on protease activity
圖7 pH值對(duì)蛋白酶穩(wěn)定性的影響Fig.7 Effects of pH value on protease stability
由圖6可知,重組蛋白酶OSP的最適反應(yīng)pH值為8.0。pH值為5.0~8.0時(shí),蛋白酶OSP的酶活隨著pH值的升高而增加,pH值為8.0時(shí),酶活力達(dá)到最高;當(dāng)pH值從8.0升到10.0時(shí),酶活力逐漸下降;且由圖6可知,酸性條件下,酶活下降較快,而pH值為10.0時(shí),仍能保持75%左右的酶活,說(shuō)明蛋白酶OSP為弱堿性蛋白酶。
由圖7可知,當(dāng)重組酶在其最適反應(yīng)pH值的緩沖液中有較高的穩(wěn)定性,用pH8.0的緩沖液處理酶液24h,仍能保持98%左右的酶活。用pH 5.0的緩沖液處理酶液24 h后,蛋白酶活性下降超過(guò)90%,而堿性條件對(duì)酶活影響相對(duì)較弱,用pH 10.0的緩沖液處理酶液24 h后,剩余蛋白酶活力約為30%左右。
2.3.3 金屬離子對(duì)重組蛋白酶活力的影響
金屬離子重組蛋白酶OSP的酶活力影響如圖8所示。
Sr2+、K+、Mg2+對(duì)酶活有促進(jìn)作用,其中 K+的促進(jìn)作用最強(qiáng),能使酶活提高約1.5倍;低濃度的Co2+對(duì)酶活有促經(jīng)作用,而高濃度的Co2+則會(huì)抑制蛋白酶活性;Fe3+、Ba2+、Ca2+對(duì)酶活有抑制作用;Cd2+、Na+對(duì)蛋白酶酶活影響很小。Gupta等[20]報(bào)道Ca2+對(duì)Pseudomonasaeruginosa PseA所產(chǎn)的耐有機(jī)溶劑蛋白酶有抑制作用,試驗(yàn)結(jié)果與本研究結(jié)果一致;Sasithorn Uttatree等[21]篩選出一株耐有機(jī)溶劑蛋白酶的菌株Bacillus megaterium,試驗(yàn)結(jié)果顯示Mg2+對(duì)酶活有促進(jìn)作用,而本研究結(jié)果表明Mg2+對(duì)蛋白酶OSP酶活同樣顯示出促進(jìn)作用。
2.3.4 重組OSP有機(jī)溶劑穩(wěn)定性
用log POW值不同的4種有機(jī)溶劑處理蛋白酶OSP后,酶活力剩余情況如表1所示。
表1 有機(jī)溶劑對(duì)蛋白酶活力的影響Table 1 Effects of different organic solvents on protease activity
由表中可以看出蛋白酶OSP在不同極性常數(shù)的 有機(jī)溶劑中,耐受性差異很大。其在log POW值為0.8~3.1的3種有機(jī)溶劑中孵育6 d后,仍能保持53%以上的酶活性,但log POW值小于0.8后,酶活下降較快,其在log POW值為-0.24的乙醇溶液中孵育6 d后,酶活下降約70%。且有機(jī)溶劑孵育時(shí)間不同,對(duì)酶活性的影響也很大。當(dāng)孵育時(shí)間為30 min時(shí),4種有機(jī)溶劑孵育的蛋白酶剩余酶活力均顯著性差異;當(dāng)孵育時(shí)間為1 h~2 h時(shí),用環(huán)己烷和正丁醇孵育的兩組蛋白酶的剩余酶活力無(wú)顯著性差異,但其結(jié)果與另外兩組的結(jié)果存在顯著性差異;當(dāng)孵育時(shí)間為24 h~6 d時(shí),4種有機(jī)溶劑孵育的蛋白酶剩余酶活力均有顯著性差異。Divakar等[22]研究發(fā)現(xiàn),菌株Aeromonas veronii PG01所產(chǎn)的耐有機(jī)溶劑蛋白酶用極性常數(shù)較小的乙醇中(log POW-0.24)孵育5 h后,剩余酶活力僅剩25.3%左右,而蛋白酶OSP用乙醇孵育6 d后,剩余酶活力仍能達(dá)到33%,說(shuō)明蛋白酶OSP對(duì)親水性有機(jī)溶劑有著更好的耐受性。
將源于B.sphaericus DS11蛋白酶osp在B.subtilis WB800中胞外分泌表達(dá),并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)和有機(jī)溶劑耐受特性進(jìn)行研究。重組酶的最適反應(yīng)溫度為40℃,最適反應(yīng)pH值為8.0,且其在中低溫(20℃~30℃)、弱堿性(pH 7.0~9.0)。蛋白酶OSP為耐有機(jī)溶劑蛋白酶,且其對(duì)log POW值在0.8~3.1范圍的有機(jī)溶劑有較好的耐受性。