顧斌濤,熊大維
(江西省科學院微生物研究所,江西南昌 330096)
根癌農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)是一種存在于土壤中的革蘭氏陰性菌,在自然條件下能感染植物的受傷部位,可以轉(zhuǎn)移腫瘤誘導質(zhì)粒的片段T-DNA(Transfer DNA)導入到植物基因組中。根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化法不僅用于植物的轉(zhuǎn)化,而且能用于酵母、曲霉、木霉和蘑菇等真菌的轉(zhuǎn)化,根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化法比傳統(tǒng)聚乙二醇介導的原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法效率更高[1-4]。
里氏木霉(Trichoderma reesei)是工業(yè)上重要的產(chǎn)酶菌種,其在纖維素基質(zhì)上生長迅速、培養(yǎng)簡便,發(fā)酵工藝成熟,胞外分泌蛋白能力強,產(chǎn)物分離成本低,在產(chǎn)酶條件下不產(chǎn)生毒素,具有良好的安全性[5]。里氏木霉具有纖維二糖水解酶基因的強啟動子,大量同源或異源的酶基因在里氏木霉中獲得表達并應用于工業(yè)生產(chǎn)[6-7]。用里氏木霉作為宿主菌進行基因工程改造越來越受到重視,目前對里氏木霉進行轉(zhuǎn)化效率較高的方法為根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化法[8]。一般研究常用里氏木霉的分生孢子作為其轉(zhuǎn)化受體細胞,本研究利用里氏木霉的原生質(zhì)體作為轉(zhuǎn)化受體材料,以期提高根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化的效率,方便對里氏木霉遺傳改造時進行大通量的篩選。
菌株:里氏木霉H7和根癌農(nóng)桿菌AGL-1為實驗室保存。
質(zhì)粒:pCAM-pht01為實驗室保存,根癌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化載體,含潮霉素基因表達盒。
PDA培養(yǎng)基:稱取PDA干粉(英國Oxoid公司CM0139)39 g,加入1 L去離子水,攪拌至樣品分散,高壓蒸汽滅菌后傾注平板。
PDA抗性培養(yǎng)基:PDA培養(yǎng)基中加入潮霉素B(150 μg/mL)和頭孢霉素(400 μg/mL)。
IM培養(yǎng)基:取1.25 mol/L磷酸緩沖液800 μL,MgSO4-NaCl緩沖液 20 mL,10 mg/mL CaCl2·2H2O溶液1 mL,1 mg/mL FeSO4·7H2O溶液1 mL,微量元素溶液5 mL,200 mg/mL NaNO3溶液2 mL,50%甘油10 mL,1 mol/L MES溶液40 mL,200 mg/mL葡萄糖溶液5 mL,混勻后加入900.7 mL無菌水[9-10]。
1.2.1 根癌農(nóng)桿菌感受態(tài)的制備
將根癌農(nóng)桿菌接至含60 μg/mL利福平的LB液體培養(yǎng)基,28 ℃、180 r/min培養(yǎng)48 h,按接種量為10%轉(zhuǎn)接至LB液體培養(yǎng)基中,28 ℃、180 r/min培養(yǎng)至OD600達到0.6左右。將菌液分裝并冰浴15 min,離心棄上清。將根癌農(nóng)桿菌重懸于500 μL預冷的0.1 μmol/L MgCl2溶液,冰浴10 min。離心棄上清,加入100 μL預冷的0.02 μmol/L的CaCl2溶液重懸菌液,冰浴20 min。
1.2.2 質(zhì)粒導入根癌農(nóng)桿菌
在農(nóng)桿菌中加入5 μL的質(zhì)粒輕輕混合,冰浴15 min后放入液氮冷凍1 min。冷凍后在37 ℃的水浴中放置3 min,再立即冰浴2 min,加入450 μL的LB液體培養(yǎng)基。在100 r/min和28 ℃的搖床上孵育3 h。然后4 000 r/min離心3 min。棄去約400 μL上清,剩下的液體與菌體沉淀混合,涂布至LB固體抗性平板。在28 ℃條件下培養(yǎng)至轉(zhuǎn)化子長出。
1.2.3 根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化里氏木霉
根癌農(nóng)桿菌接LB液體培養(yǎng)基(含利福平25 μg/mL和卡那霉素60 μg/mL)培養(yǎng)36 h;離心收集菌,用IM液體培養(yǎng)基重懸菌至OD660為0.15,添加乙酰丁香酮400 μmol/L,鋁膜避光,在28 ℃和180 r/min的搖床培養(yǎng)至OD660為0.5左右。
里氏木霉接到PDA平板上28 ℃培養(yǎng)7 d,用無菌水從平板上洗下木霉孢子,過濾得孢子液。血球計數(shù)板對孢子計數(shù),8 000 r/min離心2 min,棄去上清,用無菌生理鹽水調(diào)節(jié)孢子液的濃度到106個/mL。
取上述根癌農(nóng)桿菌和里氏木霉孢子液按體積1∶1混合,然后涂布在IM平板的硝酸纖維素膜上,暗處共培養(yǎng)。將硝酸纖維素膜反鋪到含150 μg/mL潮霉素B和400 μg/mL頭孢霉素的PDA抗性平板上,30 ℃培養(yǎng)至里氏木霉轉(zhuǎn)化子長出。
根癌瘤農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化不同宿主菌的能力不同,過高或過低的農(nóng)桿菌濃度對轉(zhuǎn)化效率有直接的影響,一般處于對數(shù)生長期的農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化能力較強,實驗選擇不同濃度的農(nóng)桿菌(OD660=0.4~1.0)進行研究,結(jié)果(圖1)表明根癌農(nóng)桿菌的濃度對轉(zhuǎn)化效率有顯著的影響,根癌農(nóng)桿菌OD660為0.8時的轉(zhuǎn)化效率最高,當OD660超過0.8時,轉(zhuǎn)化效率反而降低,可能由于過高的菌濃使得培養(yǎng)基中營養(yǎng)不足,降低了農(nóng)桿菌的介導能力。因此實驗最適宜的根癌農(nóng)桿菌菌液OD660為 0.8。
圖1 根癌瘤農(nóng)桿菌濃度對轉(zhuǎn)化效率的影響
乙酰丁香酮是一種由受傷植物產(chǎn)生的酚類物質(zhì),在遺傳轉(zhuǎn)化中誘導能力較強,其作用機制在于能誘導農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄和表達,刺激腫瘤誘導質(zhì)粒的T-DNA轉(zhuǎn)移并整合到植物或真菌細胞的基因組中。使用不同濃度的乙酰丁香酮進行農(nóng)桿菌和木霉的共培養(yǎng),結(jié)果如圖2所示。乙酰丁香酮濃度對轉(zhuǎn)化效率的影響是顯著的,在一定范圍內(nèi),隨乙酰丁香酮濃度的增加轉(zhuǎn)化效率也增加。但過高濃度的乙酰丁香酮影響了轉(zhuǎn)化效率。當乙酰丁香酮濃度80 μg/mL時,轉(zhuǎn)化效率最高,因此后續(xù)實驗采用乙酰丁香酮濃度為80 μg/mL。
圖2 乙酰丁香酮濃度對轉(zhuǎn)化效率的影響
研究不同共培養(yǎng)時間對轉(zhuǎn)化效率的影響,結(jié)果顯示(圖3)共培養(yǎng)12 h時沒有獲得轉(zhuǎn)化子,隨著共培養(yǎng)時間的延長,轉(zhuǎn)化效率逐漸提高,共培養(yǎng)48 h轉(zhuǎn)化率最高。共培養(yǎng)時間過長時,轉(zhuǎn)化效率反而有些下降,這可能是農(nóng)桿菌過度生長,一方面消耗了培養(yǎng)基的營養(yǎng),另一方面在后續(xù)培養(yǎng)中產(chǎn)生物理屏障,限制了木霉菌的生長。另外,過長的共培養(yǎng)時間可能導致轉(zhuǎn)化子菌落會相互重疊,給下一步的篩選帶來困難,因此共培養(yǎng)時間選擇48 h為宜。
圖3 共培養(yǎng)時間對轉(zhuǎn)化效率的影響
共培養(yǎng)溫度對農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化有一定的影響,采用 20 ℃、22 ℃、24 ℃、26 ℃、28 ℃和 30 ℃進行實驗,如圖4的結(jié)果顯示,在一定溫度范圍內(nèi),轉(zhuǎn)化效率隨著溫度的上升而增加,當溫度24 ℃時轉(zhuǎn)化效率最高,當溫度過高時,轉(zhuǎn)化效率隨著溫度的上升而下降??赡苡捎诘蜏赜绊懥死锸夏久购娃r(nóng)桿菌的生長,高溫影響了農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化過程中的T-DNA轉(zhuǎn)移機制。因此實驗選取共培養(yǎng)溫度為24 ℃。
圖4 共培養(yǎng)溫度對轉(zhuǎn)化率的影響
共培養(yǎng)基的pH對菌體的生長和代謝有很大的影響,使用根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化一般需要較低的pH值。采用不同的共培養(yǎng)基pH進行實驗,圖5的結(jié)果顯示,當共培養(yǎng)基pH為5.2~5.6,具有較高的轉(zhuǎn)化效率,其中以pH在5.4時轉(zhuǎn)化效率最高,達到87個轉(zhuǎn)化子(每106個細胞),是以孢子為受體(轉(zhuǎn)化效率46個轉(zhuǎn)化子/106個孢子)的1.9倍[11]。
圖5 共培養(yǎng)pH對轉(zhuǎn)化率的影響
絲狀真菌在生產(chǎn)有機酸、抗生素、酶制劑及藥物活性物質(zhì)中發(fā)揮著重要的作用。作為異源蛋白表達的細胞工廠,絲狀真菌具有蛋白分泌能力強、營養(yǎng)需求低、翻譯后修飾加工和產(chǎn)物分離成本低等優(yōu)勢。絲狀真菌有著良好的生物安全性,黑曲霉、里氏木霉和米曲霉等已在食品行業(yè)有長期應用。里氏木霉是生產(chǎn)工業(yè)酶制劑的重要菌株,本身能分泌大量的纖維素酶,其纖維素酶酶系組成較為齊全,通過遺傳改造里氏木霉進行同源或異源表達的研究越來越受重視。本研究利用里氏木霉的分生孢子作為其根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化的受體細胞,獲得轉(zhuǎn)化的適宜條件為:根癌農(nóng)桿菌菌液OD660為0.8,乙酰丁香酮濃度為80 μg/mL,共培養(yǎng)時間選擇48 h,共培養(yǎng)溫度為24 ℃,共培養(yǎng)基pH在5.4。在此條件下,根癌農(nóng)桿菌介導轉(zhuǎn)化的效率達87個轉(zhuǎn)化子(每106個細胞),高于傳統(tǒng)以分生孢子作為受體細胞的轉(zhuǎn)化效率。