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血清核酸適配體在肺癌中的研究及其應(yīng)用進展

2020-02-28 03:13徐愛蘭趙蘊偉
臨床肺科雜志 2020年10期
關(guān)鍵詞:選擇性核酸靶向

徐愛蘭 趙蘊偉

在全球范圍內(nèi),肺癌是癌癥發(fā)病率和死亡率的主要原因,肺癌是最常見的癌癥,也是男性癌癥死亡的主要原因,其次是前列腺癌和結(jié)直腸癌(發(fā)病率)以及肝癌和胃癌(死亡率)。癌癥死亡的主要原因在不同國家和地區(qū)存在很大差異,這主要取決于社會經(jīng)濟發(fā)展程度以及相關(guān)的生活方式因素[1]。已知吸煙是導(dǎo)致肺癌的重要因素之一。但是人們在50歲以前,性別和吸煙這兩個因素對肺癌發(fā)病發(fā)展的影響并不大。我國女性的吸煙率低,但是我國女性的肺癌的發(fā)病率很高,這可能與她們長期接觸油煙、二手煙,煙霧暴露增加,以及環(huán)境的污染等因素相關(guān)[1]。在組織學(xué)分型中,肺癌主要是小細(xì)胞肺癌和非小細(xì)胞肺癌,非小細(xì)胞肺癌又可分為腺癌、鱗癌和大細(xì)胞癌。肺癌的發(fā)病機制復(fù)雜,同時存在基因以及組織學(xué)方面的異質(zhì)性,這些導(dǎo)致肺癌在治療方面具有一定的難度。盡管多年的研究和醫(yī)療方面取得進步,肺癌仍然是全球癌癥相關(guān)死亡的主要原因[2]。常規(guī)癌癥治療,如化療和放射治療,表現(xiàn)出嚴(yán)重的副作用,包括胃腸道不適、器官損害和低質(zhì)量生活[3]。在臨床中的大多數(shù)患者發(fā)現(xiàn)肺癌時,可能已經(jīng)是中晚期階段,所以肺癌的早期發(fā)現(xiàn)、早期診斷對癌癥疾病的治愈具有重要意義[4]。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的進展,核酸適配體(Aptamer)作為一種新型的高親和力、高特異性生物識別配體在生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)與臨床應(yīng)用研究中變得越來越重要。所以本文就核酸適配體在肺癌中的研究及其應(yīng)用進展的情況作一綜述。

核酸適配體

一、核酸適配體的特點

核酸適配體是單鏈DNA(SsDNA)或RNA序列,通過指數(shù)富集(SELEX)技術(shù)系統(tǒng)進化配體從隨機文庫中選擇[5-6]。它們以高親和力和特異性與相對應(yīng)的靶標(biāo)結(jié)合,并且具有快速靶向腫瘤穿透的能力[7]。核酸適配體可以應(yīng)用于各種疾病的治療,尤其包括肺癌等癌癥,因為它們具有很強的中和活性[8]。早在1990年,Tuerk等報道了一種新型的寡核苷酸篩選技術(shù),該技術(shù)與 PCR 擴增相結(jié)合,在體外人工構(gòu)建的短鏈核苷酸文庫中篩選出RNA核酸適配體[9]。核酸適配體可以折疊成三維結(jié)構(gòu),可以通過形成不同的形狀結(jié)合到目標(biāo)上,比如有發(fā)夾的結(jié)構(gòu)、呈凸環(huán)狀、還有的是四角環(huán)狀等,并通過形狀識別對應(yīng)物的方式結(jié)合到目標(biāo)上,主要是通過范德華力、氫鍵、堿基堆積力等與靶標(biāo)具有很高的特異性和親和力[8,10]。針對核酸適配體對靶點具有高度的親和力和特異性的特點,所以核酸適配體又稱為“化學(xué)抗體”,而且它的應(yīng)用范圍很廣,從目標(biāo)檢測、傳遞到藥物應(yīng)用等[11]。

二、核酸適配體與抗體的比較

有研究表明,一般在動物身上開發(fā)的單克隆抗體,這種單克隆抗體在臨床應(yīng)用前是人源化的[11]。因此,生產(chǎn)治療性單克隆抗體需要使用非常大的哺乳動物細(xì)胞培養(yǎng),而且需要在良好生產(chǎn)規(guī)范的條件下進行廣泛的純化,生產(chǎn)成本高??贵w需要體外或體內(nèi)生產(chǎn),這可能會增加批次之間的差異。總的來說,高生產(chǎn)成本、安全性和短保質(zhì)期,限制了這些抗體的廣泛使用[11]。所以,在許多方面,核酸適配體相對抗體來說具有多種優(yōu)勢,它們是中等分子大小,介于抗體和小分子之間[8]。它在體外化學(xué)合成時會減少批次之間的差異[12],并且主要是以低成本,比單克隆抗體便宜數(shù)千倍,以及以高純度來進行化學(xué)合成[11],可以作為生物特異性識別分子成功地與抗體競爭,并且可以針對幾乎任何靶標(biāo)進行選擇,而且核酸適配體具有低分子量、無毒性和非免疫原性等特點[13]。非免疫原性和無毒的原因主要是由于核酸適配體的組成部分是核酸[14-15]。與大的單克隆抗體(約150 kDa)相比,核酸適配體的一個重要優(yōu)勢是它們的大小(5~15 kDa)[16]。因為核酸適配體比抗體小得多,所以核酸適配體具有更好的組織穿透能力以及更強的腫瘤組織內(nèi)化能力[12,17]。而且,核酸適配體分子量小,可以結(jié)合那些較大的抗體無法發(fā)現(xiàn)的隱藏的表位[18]。

三、核酸適配體的篩選

核酸適配體的體外篩選的方式是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進化技術(shù)(SELEX)產(chǎn)生的。核酸適配體的SELEX篩選技術(shù)發(fā)展很迅速。比如混合SELEX[19]、消減SELEX、毛細(xì)管電泳SELEX[20]等。由于核酸適配體是通過指數(shù)富集的配體的系統(tǒng)進化(SELEX)產(chǎn)生的,所以核酸適配體對靶目標(biāo)具有高度的親和力和特異性。核酸適配體的產(chǎn)生需要經(jīng)歷反復(fù)的孵化、洗滌、分離、擴增的一系列步驟[21]。最初的文庫由隨機的RNA和DNA分子組成,與目標(biāo)物、生物標(biāo)記物、蛋白質(zhì)甚至整個細(xì)胞一起培養(yǎng)孵育。在孵育后,洗去未結(jié)合的序列,來分離和分離結(jié)合的序列。將結(jié)合序列從目標(biāo)中洗脫出來,用聚合酶聯(lián)反應(yīng)(PCR)(基于RNA的逆轉(zhuǎn)錄PCR)進行擴增,這樣可以產(chǎn)生序列豐富的序列庫[18]。產(chǎn)生的序列庫要經(jīng)歷一輪又一輪的選擇和擴增等循環(huán)步驟,每一輪的循環(huán)都會降低序列庫的異質(zhì)性來進一步增加核酸適配體的親和力和特異性[18],在進行親和力分析后,把具有最好的親和力和特異性的序列池進行克隆和測序,或者進行下一代測序,來確保核酸適配體的敏感性和特異性。

四、核酸適配體的修飾

核酸適配體在實際應(yīng)用中有一些局限性。在人血清中,由于核酸酶的存在,未經(jīng)修飾的RNA和DNA核酸適配體都容易降解,其中RNA更敏感,因為核糖位置有20個羥基[18,21]。所以人體血清中的核酸酶加大對核酸適配體降解的敏感性,由于核酸適配體是相對較小的分子(5~15 kDa),它們很容易被腎臟排泄[15]。這些問題都制約著核酸適配體的進一步研究及應(yīng)用。

隨著核酸化學(xué)的發(fā)展,可以進一步對核酸適配體進行合成和修飾,增強對肺腺癌等惡性腫瘤具有高度特異性的分子顯像功能,增加選擇性和特異性,以及與癌癥生物標(biāo)記物結(jié)合的能力,更有助于靶向成像[22]。防止核酸外切酶降解核酸適配體的一種常見方法是限制核酸鏈的30和/或50端[23],研究延緩核酸適配體從血液中排泄,以及改善它的藥代動力學(xué)的解決方案是與膽固醇或聚乙二醇結(jié)合,稱為聚乙二醇化,通過二者結(jié)合來增加低分子物質(zhì)的血清保留時間[15,24]。為了增加對核酸內(nèi)切酶介導(dǎo)的降解的穩(wěn)定性,可以用硫取代磷酸骨架來修飾核苷酸間連接,創(chuàng)建硫代磷酸鍵,增加核酸適配體的穩(wěn)定性[24-25]。RNA核酸適配體,可以通過修飾核糖的高度核酸酶敏感的20-羥基來增加血清半衰期和核糖核酸酶抗性[18,21],這些修飾包括用氟(F)、烷基、氨基(NH2)或硫基取代20-羥基。修飾的核苷酸可以在SELEX的篩選過程之前或者之后進行,因為修飾的核苷酸和SELEX的步驟不能同時進行,而且在篩選之后的修飾更容易、更便宜,但可能會對核酸適配體的結(jié)合屬性和功能產(chǎn)生一定的影響[22]。

核酸適配體的遞送系統(tǒng)

核酸適配體在臨床治療及應(yīng)用中的研究越來越深入,核酸適配體需要相應(yīng)的遞送系統(tǒng)來發(fā)揮其治療作用。

在之前的報道中,mRNA-29b在mRNA 29家族中表達(dá)最豐富[26]。mRNA-29b通過控制細(xì)胞分化、凋亡和增殖在肺癌治療中發(fā)揮關(guān)鍵作用[27-30]。mRNA 29b在肺癌細(xì)胞中下調(diào)或者沉默,可以抑制腫瘤生長,所以mRNA 29b是一種很大潛力的癌癥候選基因。但是,它們的治療應(yīng)用由于缺乏有效的遞送系統(tǒng)而受到限制。所以,Wu[31]等人利用合成的CuO(氧化銅)納米顆粒開發(fā)了一種新的核酸適配體連接的雜交遞送系統(tǒng),利用香鞘提取物制備CuO納米粒子,將CuO納米顆粒與MUC1(粘蛋白1)核酸適配體偶聯(lián),體外將miRNA29b導(dǎo)入肺癌細(xì)胞。將miRNA-29b遞送到A549細(xì)胞。這種遞送系統(tǒng)可以有效地將miRNAs遞送到癌細(xì)胞,成為細(xì)胞內(nèi)傳遞miRNA的有效平臺,進一步改善肺癌的治療結(jié)果。此外,Perepelyuk[32]等人研究的是核酸適配體-雜化納米顆粒生物偶聯(lián)遞送系統(tǒng),同樣是選擇性地將miRNA-29b遞送到表達(dá)MUC1(粘蛋白1)的癌細(xì)胞。因為MUC1是一種跨膜蛋白,在NSCLC(非小細(xì)胞肺癌)中異常過表達(dá)[33],在大約80%的肺腺癌中過表達(dá)。所以可以利用它在NSCLC中的過表達(dá),通過將MUC1核酸適配體偶聯(lián)到混合納米顆粒表面,實現(xiàn)miRNA-29b對NSCLC的最佳靶向治療。Rab蛋白是調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)受體轉(zhuǎn)運的GTPase家族之一,MUC-1核酸適配體是NSCLC A549細(xì)胞強有力的結(jié)合配體,在Liu[34]等人的研究中,利用精確定制的DNA棱鏡將GTPase Rab26作為新的潛在治療靶點用于肺癌的靶向治療。通過設(shè)計合成了一種具有可調(diào)靶向和siRNA負(fù)載能力的DNA棱鏡平臺。通過交換兩個短的單鏈DNA,核酸適配體和siRNA的數(shù)目和位置都可以在每個納米棱鏡的1到6之間調(diào)節(jié)。因為MUC-1核酸適配體是NSCLC A549細(xì)胞的結(jié)合配體,其靶向效率與棱鏡結(jié)構(gòu)上的核酸適配體數(shù)目呈正相關(guān)。精確控制納米結(jié)構(gòu)上核酸適配體的能力對開發(fā)靶向遞送系統(tǒng)起著重要作用。所以在研究中,Rab26siRNA與MUC-1核酸適配體聯(lián)合應(yīng)用對非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)具有良好的抗腫瘤作用[34]。肺癌干細(xì)胞(CSCs)被認(rèn)為是肺癌的種子細(xì)胞,CD133是肺CSCs的標(biāo)志物,在Huang[35]等人的研究中,通過DSPE-PEG2000制成的納米膠束作為藥物輸送系統(tǒng),增加吉非替尼的溶解性和對肺CSCs的靶向性。該團隊[35]開發(fā)了載吉非替尼的聚乙二醇2000-二硬脂酰磷脂酰乙醇胺納米膠束和CD133核酸適配體(M-Gef-CD133)來消除CD133+的肺CSCs。通過研究,M-Gef-CD133能有效地將吉非替尼轉(zhuǎn)運至CD133+肺CSCs,并誘導(dǎo)對CD133+肺CSCs的選擇性殺傷作用[35]。APT是單鏈寡核苷酸的核酸適配體,是腫瘤細(xì)胞靶向的優(yōu)良核酸適配體,S15-APTs是一種有效的腫瘤細(xì)胞靶向配體,即單鏈寡核苷酸為基礎(chǔ)的S15核酸適配體(S15-APTs),S15-APTs修飾納米顆粒(NPs),可以實現(xiàn)選擇性的NSCLC靶向。APT修飾的量子點對靶細(xì)胞A549具有選擇性結(jié)合和內(nèi)化作用[36]。針對APT作為主動藥物靶向腫瘤細(xì)胞的應(yīng)用,Engelberg[36]等人研究了S15-APT內(nèi)化到人非小細(xì)胞肺癌A549細(xì)胞的機制,即人類NSCLC細(xì)胞選擇性內(nèi)化這些S15-APT量子點是通過經(jīng)典的依賴于籠蛋白的受體介導(dǎo)的內(nèi)吞作用實現(xiàn)的。這一發(fā)現(xiàn)可用于開發(fā)基于S15 APT修飾的NPs的主動靶向給藥和診斷系統(tǒng),這些NPs可以通過受體介導(dǎo)的內(nèi)吞作用選擇性地進入NSCLC,從而繞過MDR(多重耐藥)外排轉(zhuǎn)運體,這些新的發(fā)現(xiàn)對于APT靶向藥物傳遞NPs具有重要的意義。生物相容性嵌段共聚物peg-pcl包埋疏水性化療藥物紫杉醇(Ptx)的NPs,該納米顆粒以人NSCLC細(xì)胞為靶點,它的基礎(chǔ)是聚乙二醇(PEG)與聚己內(nèi)酯(PCL)形成PEG-PCL膠束,并以APTS為靶向基團[37]。這些APT-NPs選擇性地將PTX靶向NSCLC A549細(xì)胞,對人A549非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞有較高的選擇性,以及較強的殺滅作用。所以通過研究表明,這些修飾的納米粒在不損害正常組織的情況下,在選擇性靶向和根除人類非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞方面具有巨大的臨床前景[37]。

核酸適配體在臨床醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用

通過SELEX技術(shù)篩選得到的高親和力和特異性的核酸適配體,由于自身相對于抗體來說對環(huán)境溫度更加穩(wěn)定、無毒、非免疫原性,以及具有更強的腫瘤組織穿透能力,在從治療、藥物遞送、診斷、功能基因組學(xué)到生物傳感等多種應(yīng)用中的潛力越來越突出。

一、核酸適配體作為傳感元件

在Bashmakova[13]等人的研究中,主要以DNA核酸適配體作為發(fā)光傳感元件,以高靈敏度和特異性去區(qū)分肺癌患者和健康病例,它主要以重組Ca2+(鈣離子)調(diào)節(jié)的光蛋白(obelin)作為高靈敏的生物發(fā)光報告分子,來檢測肺部血液中的腫瘤元素。該研究也表明了核酸適配體作為發(fā)光傳感元件在肺癌檢測方面的應(yīng)用價值很大,以及在未來的研究中將會有更大的潛力。

二、核酸適配體作為載體

Abnous[38]等人通過在研究中發(fā)現(xiàn)兩種核酸適配體組成的十字形DNA納米結(jié)構(gòu),這兩種核酸適配體是AS1411(26聚體DNA核酸適配體)和FOXM1(ssDNA核酸適配體與Forkhead Box蛋白M1結(jié)合),這種十字納米結(jié)構(gòu)有助于將抗癌藥物阿霉素(Dox)靶向傳遞給癌細(xì)胞,同時減少對非靶細(xì)胞的損害和毒性作用。而且還表明FOXM1蛋白的過表達(dá)與腫瘤的發(fā)生、轉(zhuǎn)移和細(xì)胞增殖有關(guān)[38].

三、核酸適配體作為靶向及放射性藥物

靶向癌癥治療可以提高治療選擇性和療效。在Russo[39]等人的研究中,將核酸適配體miR-34c和核酸適配體GL21.T相結(jié)合,二者的結(jié)合對非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖有一定的影響。核酸適配體(GL21.T),結(jié)合并抑制AXL(跨膜受體酪氨酸激酶家族(RT Ks)的Axl亞家族)跨膜受體。而且,將miR-34c偶聯(lián)到GL21.T核酸適配體作為靶向部分,以選擇性傳遞給表達(dá)AXL的NSCLC細(xì)胞,可以影響NSCLC細(xì)胞增殖,并能夠通過靶向AXL受體克服了獲得性RTK(受體型酪氨酸激酶)抑制劑的耐藥性。因此,GL21.T/miR-34c嵌合體在轉(zhuǎn)錄水平上對AXL具有雙重抑制作用,是治療NSCLC的一種新的治療工具[39]。

在Hamamoto[8]等人研究得出了FGF2(成纖維細(xì)胞生長因子2)核酸適配體抑制FGF2-FGFR途徑驅(qū)動的肺癌細(xì)胞生長,即FGF2核酸適配體對FGF2依賴性肺癌細(xì)胞的治療是有效的,這些發(fā)現(xiàn)提供了臨床前的證據(jù),證明核酸適配體對癌癥的治療是有作用的,并且在臨床的應(yīng)用潛力很大。

Zhao等人的團隊已經(jīng)為A549腺癌(非小細(xì)胞肺癌最常見的亞型)開發(fā)了S6核酸適配體探針[40],核酸適配體探針對NSCLC腺癌和NSCLC大細(xì)胞癌細(xì)胞有選擇性結(jié)合,但與正常細(xì)胞的結(jié)合特性很小。這對于檢測癌細(xì)胞很重要。Zhang[41]等人的研究采用抗A549肺癌細(xì)胞的核酸適配體S6對漿膜腔積液中的癌細(xì)胞進行分化,而且研究證實細(xì)胞特異性核酸適配體可成功應(yīng)用于ICC(免疫細(xì)胞化學(xué))快速診斷腺癌細(xì)胞,它具有更高的特異性和敏感度。

在Nuzzo[42]等人的研究中提供了由核酸適配體(GL21.T)和miR-137組成的核酸適配體-microRNA(MiR)復(fù)合物(AMIC),該核酸適配體能夠結(jié)合和拮抗致癌受體Axl,減少細(xì)胞遷移和腫瘤生長的能力。通過研究表明,GL21.T-137復(fù)合物能有效抑制NSCLC小鼠移植瘤的體內(nèi)生長。并且GL21.T-137復(fù)合物在癌癥治療中具有廣泛的適用性,是治療非小細(xì)胞肺癌的潛在工具。

Zhou[43]等人通過SELEX細(xì)胞產(chǎn)生的核酸適配體作用于小細(xì)胞肺癌(SCLC)細(xì)胞,鑒定出了一種新的小細(xì)胞肺癌蛋白生物標(biāo)記物,即高密度脂蛋白結(jié)合蛋白(HDLBP)。在該研究中的免疫組化的結(jié)果顯示小細(xì)胞肺癌組織中的HDLBP水平升高。用核酸適配體siRNA抑制HDLBP的表達(dá),從而在體外抑制了SCLC細(xì)胞的增值和轉(zhuǎn)移,在體內(nèi)抑制了腫瘤的形成,并且抑制HDLBP的表達(dá)可以使腫瘤細(xì)胞阻滯在G0/G1期,抑制小細(xì)胞肺癌的進展[43]。

展 望

核酸適配體因為具有高度親和力、高特異性等特點,使其在臨床腫瘤的診斷和治療中的作用越來越突出。核酸適配體介導(dǎo)的靶向給藥系統(tǒng)也會隨著研究的進一步發(fā)展,在疾病的治療中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。核酸適配體現(xiàn)已成為生物醫(yī)學(xué)研究和藥物篩選等領(lǐng)域中的重要工具,在疾病臨床診斷與治療方面已經(jīng)有了一些實際的應(yīng)用并具有巨大的潛能,以及隨著 SELEX 的技術(shù)不斷完善和化學(xué)修飾方法的進步,將會有越來越多的針對腫瘤治療與診斷的核酸適配體從實驗室應(yīng)用于臨床。

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