方金蘭,柴哲,陳保善,張木清
(1.廣西大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,南寧 530004;2.亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南寧 530004;3.廣西生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南寧 530004)
赤霉素(Gibberellin,GAs)是調(diào)節(jié)種子萌發(fā)、莖伸長、開花等生長發(fā)育過程的四環(huán)二萜植物激素,DELLA蛋白是GA 信號途徑的負(fù)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子[1]。DELLA 蛋白由N 端DELLA 調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)域和C 端GRAS(GAI、RGA和SCRECROW)功能結(jié)構(gòu)域組成[2-5]。N端DELLA 調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)域包含DELLA、TVHYNP和polyS/T/V,GRAS功能結(jié)構(gòu)域包含核定位信號肽,兩個(gè)亮氨酸七肽重復(fù)基序(LHR1和LHR2)以及PFYRE和SAW 基序[6]。N 端結(jié)構(gòu)域的缺失增加了DELLA抑制作用,導(dǎo)致植株出現(xiàn)半矮化[3]。GRAS功能域的突變導(dǎo)致缺失DELLA抑制功能,出現(xiàn)高或細(xì)長的植物表型。DELLA 蛋白與植物體內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子蛋白相互作用來調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育等過程,例如PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR3(PIF3)、PIF4、PIF1/5、ALCATRAZ(ALC)、JASMONATE ZIM DOMAIN1(JAZ1)、SPATULA(SPT)、BRASSINOOZALE-RESISTANT1(BZR1)、SCARECROW-LIKE3(SCL3)[7-15]。DELLA 蛋白不僅在赤霉素信號途徑中發(fā)揮重要作用,同時(shí)還參與乙烯信號響應(yīng)和脫落酸信號途徑。
近年來關(guān)于DELLA 蛋白的研究頗多。除了上述功能外,DELLA 蛋白在植物生物脅迫、非生物脅迫、下胚軸彎鉤結(jié)構(gòu)的形成等方面也發(fā)揮著重要作用。Huang 等[16]研究發(fā)現(xiàn),在水稻中,DELLA 蛋白通過與NAC蛋白互作影響纖維素的合成,并且說明了這一調(diào)控模式在植物中是保守的。在擬南芥中,RGL2能調(diào)節(jié)胚乳細(xì)胞的擴(kuò)增,調(diào)控種子過渡到幼苗的過程[17]。與野生型相比,過表達(dá)WRKY45基因的擬南芥轉(zhuǎn)基因植株更早衰老,相反,wrky45突變體延遲衰老,而DELLA蛋白能抑制WRKY45蛋白降低衰老葉片的衰老速度[18]。
甘蔗是重要的糖料和能源作物,90%的糖產(chǎn)量來源于甘蔗(http://faostat.fao.org/)。除此之外,甘蔗還廣泛應(yīng)用于能源、有機(jī)肥料、飼料等[19]。甘蔗是一種C4禾本科作物,其遺傳背景復(fù)雜,迄今為止,對其研究較少。Tavares等[20]研究發(fā)現(xiàn)甘蔗中ScGAI蛋白能與ScPIF/ScPIF4 和乙烯信號元件ScEIN3/ScEIL1相互作用來調(diào)節(jié)甘蔗莖和葉的生長。在甘蔗中過表達(dá)ScGAI基因引起植株矮小,而ScGAI基因沉默則變高。2018 年,Zhang 等[21]解析了割手密基因組必定會加速對甘蔗的研究進(jìn)程。甘蔗中DELLA 蛋白如何與其他蛋白互作調(diào)控開花、參與脅迫應(yīng)答、種子萌發(fā)、纖維素合成等過程尚待解決。鑒于Tavares等表達(dá)的蛋白是包涵體,變性復(fù)性后會影響其活性。本試驗(yàn)通過將ScGAI基因分別克隆到不同蛋白表達(dá)載體,以期在上清中獲得穩(wěn)定表達(dá)的蛋白,為ScGAI蛋白純化提供了思路,為后續(xù)加強(qiáng)對ScGAI基因功能的研究奠定良好基礎(chǔ)。
原核表達(dá)載體pSPK2721(廣西大學(xué)劉云峰實(shí)驗(yàn)室提供);pMAL-c2Xh 和pET28a+MBP 表達(dá)載體(廣西大學(xué)明振華實(shí)驗(yàn)室提供);大腸桿菌菌株TOP10(上海唯地生物技術(shù)有限公司);BL21(DE3)和HIS 純化基質(zhì)(購自天地人和生物科技有限公司);MBP 純化基質(zhì)(購自NEB 公司);PCR 擴(kuò)增試劑、核酸內(nèi)切酶和In-Fusion HD Cloning Plus(購自Takara 公司);蛋白marker(購自天根生化科技有限公司);gateway 試劑盒(購自Invitrogen)。
1.2.1 載體構(gòu)建
將ScGAI(MK088091.1)與pMal-c2X 構(gòu)成重組質(zhì)粒。ScGAI和ScGAI-C與pSPK2721 載體連接構(gòu)成重組質(zhì)粒,ScGAI-C與pET28a+MBP 表達(dá)載體連接構(gòu)成重組載體,連接后將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入TOP10 感受態(tài)中,每個(gè)分別挑單菌落做菌液PCR檢測并測序驗(yàn)證。
1.2.2 重組融合蛋白質(zhì)的載體表達(dá)探究及純化
pMal-c2X-ScGAI 重組載體轉(zhuǎn)BL21 感受態(tài),以1∶100 比例加入10 mL LB培養(yǎng)基中分別在37℃1 mmol/L IPTG 培養(yǎng)3 h、25℃0.5 mmol/L IPTG 培養(yǎng)12 h、16℃0.1 mmol/L IPTG 培養(yǎng)20 h 后SDS-PAGE檢測總蛋白表達(dá)情況。pSPK2721-ScGAI、pSPK2721-ScGAI-C重組載體分別轉(zhuǎn)BL21菌株后加0.5 mmol/L IPTG 誘導(dǎo),分別在37℃3 h、4 h、5 h 取樣,加入5×SDS page loading buffer,100℃煮沸10 min,SDS-PAGE 檢測;pET28a+MBP-ScGAI-C 表達(dá)載體轉(zhuǎn)BL21 菌株,16℃,1 mmol/L IPTG 誘導(dǎo)表達(dá)20 h,離心收集菌體,緩沖液A(50 mmol/L Tris-HCl,500 mmol/L NaCl,0.2 mmol/L EDTA2Na,2 mmol/L β-巰基乙醇,5%甘油)與15 mmol/L 咪唑重懸菌體,超聲破碎,離心取上清與His 基質(zhì)結(jié)合,緩沖液A 洗除雜質(zhì)后,緩沖液A 分別與30 mmol/L、40 mmol/L、50 mmol/L、60 mmol/L、300 mmol/L咪唑洗脫10 mL后,SDS-PAGE膠檢測。樣品濃縮后-80℃保存。
1.2.3 Western blot檢測
蛋白電泳結(jié)束后,凝膠轉(zhuǎn)膜1 h;轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,先用PBST 洗滌4 次,每次5 min;將膜置于5%脫脂奶粉封閉液中封閉1 h,37℃;用PBST稀釋一抗,將膜在一抗稀釋液中過夜,4℃;然后將膜取出后用PBST沖洗4次,每次5 min;二抗稀釋后將膜置于二抗中37℃反應(yīng)1 h;反應(yīng)結(jié)束后將膜置于干凈的盒子中沖洗4 次,每次5 min,最后進(jìn)行ECT顯影,曝光,拍照。
所用引物如表1 所示。利用In-fusion 方法將ScGAI克?。▓D1A)后與酶切后的pMal-c2X(BamHI、SalI)膠回收產(chǎn)物連接轉(zhuǎn)入TOP10 感受態(tài)中,挑單菌落進(jìn)行菌液PCR檢測(圖1B)并測序驗(yàn)證。利用gateway 方法將ScGAI和ScGAI-C(圖1C)分別與pDONR211 載體進(jìn)行BR 反應(yīng)(圖1D),提取質(zhì)粒Mlu 酶酶切(圖1E)后,與pSPK2721 載體進(jìn)行LR 反應(yīng),轉(zhuǎn)入TOP10 感受態(tài)后,挑單菌落進(jìn)行菌液PCR檢測(圖1F)并測序驗(yàn)證。利用In-fusion 方法將ScGAI-C(圖1G)與pET28a+MBP 載體(BamHI、XhoI雙酶切)連接轉(zhuǎn)化,挑單菌落進(jìn)行菌液PCR檢測(圖1H)并測序驗(yàn)證。
表1 ScGAI 與ScGAI-C 連接在不同表達(dá)載體上的引物序列Table 1 Primer sequences of ScGAI and ScGAI-C linked to different expression vectors
圖1 甘蔗ScGAI與ScGAI-C基因原核表達(dá)載體構(gòu)建Fig.1 Construction of prokaryotic expression vectors of sugarcane ScGAI and ScGAI-C gene
圖2 不同載體、溫度和表達(dá)時(shí)間的蛋白表達(dá)結(jié)果Fig.2 Protein expression in different vectors,temperatures and expression times
將菌液PCR 鑒定及測序正確的pMal-c2X-ScGAI 重組載體轉(zhuǎn)入BL21 感受態(tài)后,分別在37℃1 mmol/L IPTG、25℃0.5 mmol/L IPTG、16℃0.1 mmol/L IPTG 誘導(dǎo)條件下取樣,離心,8 mol/L 尿素重懸100℃煮沸10 min,離心取上清SDS-PAGE 膠檢測。結(jié)果表明,pMal-c2X-ScGAI在有/無IPTG 條件下,不同溫度、不同誘導(dǎo)濃度培養(yǎng)的總蛋白無明顯變化,而空載在IPTG 誘導(dǎo)下,總蛋白在有明顯表達(dá)(圖2A)。更換pSPK2721 表達(dá)載體,在37℃1 mmol/L IPTG 誘導(dǎo)3 h、4 h、5 h 后取樣,總蛋白經(jīng)SDS-PAGE 膠檢測,pSPK2721-ScGAI 有/無IPTG 誘導(dǎo)無明顯變化,但pSPK2721-ScGAI-C 有或無IPTG 誘導(dǎo)的總蛋白在63~75 kD 之間有明顯區(qū)別(圖2B)。因此在37℃1 mmol/L IPTG 誘導(dǎo)5 h 后,收集菌液,超聲破碎,離心后與MBP 基質(zhì)混合2 h,Column buffer洗除雜質(zhì)后,10 mmol/L麥芽糖進(jìn)行洗脫收集。將pSPK2721-ScGAI-C的沉淀、上清和純化后的洗脫液進(jìn)行SDS-PAGE 膠檢測,結(jié)果顯示,目的蛋白在上清中無表達(dá)。重新?lián)QpET28a+MBP 進(jìn)行表達(dá),pET28a+MBP-ScGAI-C在低溫16℃、1 mmol/L IPTG 條件下誘導(dǎo)20 h收集菌體,超聲破碎,離心,取上清與His 基質(zhì)結(jié)合,取上清、沉淀、基質(zhì)1(與上清結(jié)合后的基質(zhì))、不同咪唑洗脫的溶液、基質(zhì)2(洗脫后的基質(zhì))進(jìn)行檢測,結(jié)果表明,從30 mmol/L 到300 mmol/L 不同濃度咪唑洗脫液在100 kD 處都有一條蛋白條帶,可能是目的蛋白有表達(dá)(圖2C)。
利用免疫印記(western bloting,WB)技術(shù),對獲得的蛋白進(jìn)行檢測,GST標(biāo)簽蛋白作為對照,結(jié)果顯示(圖3),anti-His抗體能識別pET28a+MBP-ScGAI-C,但不能識別GST 標(biāo)簽蛋白,表明本次研究獲得了正確的His-MBP-ScGAI-C融合蛋白。
圖3 pET28a+MBP-ScGAI-C蛋白WB檢測Fig.3 Western bloting detection of pET28a+MBP-ScGAI-C protein
在開花植物中,DELLA 蛋白作為GA 依賴的生長與發(fā)育等多個(gè)途徑的主要轉(zhuǎn)錄抑制子,發(fā)揮著重要作用。盡管前人對于GA 如何緩解DELLA 蛋白產(chǎn)生的抑制作用有了很多的了解,但是對蛋白質(zhì)作用機(jī)制的了解還不多。Li 等[22]通過研究Os-SCL7的GRAS 結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu),對其結(jié)構(gòu)和生物化學(xué)研究展現(xiàn)了GRAS蛋白的結(jié)構(gòu)和DNA 相互作用機(jī)制。本研究通過gateway 和Infusion 方法將ScGAI或ScGAI-C分別與pRSPK2721、pMal-c2X、pET28a+MBP構(gòu)建表達(dá)載體連接,探究不同溫度下最適表達(dá)時(shí)間和IPTG 誘導(dǎo)濃度,結(jié)果表明ScGAI 全長表達(dá)較困難,因此參照Li 等[22]研究方法,嘗試表達(dá)ScGAI的C 端GRAS 功能域。pMalc2X-ScGAI-C 蛋白表達(dá)純化后上清無表達(dá),在沉淀和總蛋白泳道48~63 kD 之間有明顯較粗一條帶,猜測可能是表達(dá)過程與標(biāo)簽斷裂形成包涵體。重新選擇pET系列載體,pET載體在原核表達(dá)系統(tǒng)中,基礎(chǔ)表達(dá)水平最低。由于ScGAI-C 在原核表達(dá)體系中易形成包涵體,因此選擇改造后的pET28a 載體(添加MBP 標(biāo)簽),ScGAI-C 能在上清中表達(dá),并且由western bloting 進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果表明,pET 載體和促溶蛋白MBP 有助于ScGAI-C 蛋白在上清中穩(wěn)定表達(dá),MBP 起到了很好的促溶效果。本次試驗(yàn)為DELLA 蛋白可溶性的表達(dá)純化提供了思路,為甘蔗DELLA蛋白功能研究奠定了良好的基礎(chǔ)。