祁閃閃,楊 李,盧文婕,孫 鳴,宋 娜,陳 智,熊 昊
(華中科技大學(xué)同濟醫(yī)學(xué)院武漢兒童醫(yī)院血液腫瘤科,湖北武漢 430015)
人第10 號染色體缺失的磷酸酶及張力蛋白同源基因(phosphatase and tensin homologue deleted on chromosome ten,PTEN)是一個經(jīng)典的抑癌基因,位于染色體10q23.3,其編碼區(qū)含有1 209個堿基,編碼一個含有403 個氨基酸的蛋白。PTEN 蛋白含有4 個重要的功能區(qū)域:(1)N末端結(jié)構(gòu)域,是PTEN蛋白N端的32個氨基酸組成的短肽,含有核定位序列;(2)催化結(jié)構(gòu)域,由第7~185位氨基酸殘基在內(nèi)的179個氨基酸組成,負責PTEN 的去磷酸化活性;(3)C2 結(jié)構(gòu)域,由第186~351位氨基酸殘基在內(nèi)的186個氨基酸組成,主要介導(dǎo)PTEN蛋白插入和錨定到脂質(zhì)雙分子層;(4)尾區(qū),包含第352~403 位氨基酸殘基在內(nèi)的肽段,該區(qū)域富含絲氨酸和蘇氨酸,參與調(diào)控PTEN 的穩(wěn)定性和磷脂酶活性。PTEN 尾區(qū)最后4 個(第400~403 位)氨基酸即ITKV,被稱為PDZ 結(jié)合基序(PDZ-binding motif,PDZ-BM),這一肽段介導(dǎo)PTEN與含有PDZ結(jié)構(gòu)域的蛋白的相互結(jié)合。
PTEN 的氨基酸序列決定了其可以在胞漿和胞核之間動態(tài)穿梭的特性。而胞漿的PTEN 和胞核的PTEN 在腫瘤抑制方面扮演著不同的角色。胞漿中的PTEN 通過去磷酸化作用,將磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate,PIP3)轉(zhuǎn)化為磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸(phosphati?dylinositol-4,5-bisphosphate,PIP2),從而拮抗磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,PKB/AKT)通路的活性。因此,胞漿PTEN 的丟失可以導(dǎo)致PIP3 的累積并激活下游通路,促進細胞的存活、生長、增殖、代謝和遷移[1-2]。而胞核PTEN 的磷脂酶活性對維持染色體的完整性是必須的[3]。胞核PTEN 位于著絲粒附近,與著絲粒蛋白C(centromere protein C,CENP-C)協(xié)同作用,作為在有絲分裂時染色體分離所需動粒的重要組分,維持染色質(zhì)的穩(wěn)定性[3]。最近的研究表明,PTEN 的PDZ-BM 與腫瘤抑制蛋白DLG1(disc large homolog 1)/驅(qū)動蛋白EG5(kinesin EG5,EG5)直接的相互作用可調(diào)節(jié)紡錘體極體的組成和運動。PDZBM缺乏的細胞傾向于出現(xiàn)染色體的錯配,而且PDZ-BM缺失的小鼠易患淋巴瘤和乳腺癌[4-5]。
與一些經(jīng)典的抑癌基因需要完全缺失才能誘發(fā)癌癥的現(xiàn)象不同,PTEN 功能的部分丟失便可對腫瘤的發(fā)生和發(fā)展產(chǎn)生巨大的影響。在本文中,我們將對近些年來已發(fā)現(xiàn)的調(diào)控PTEN 表達水平和酶活性的轉(zhuǎn)錄前與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機制進行概述。
PTEN蛋白C端360-385肽段絲氨酸/蘇氨酸的磷酸化可以增加PTEN 的蛋白穩(wěn)定性或降低PTEN 的磷脂酶活性。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有10 多種胞內(nèi)激酶可以直接對PTEN 進行磷酸化。其中,酪蛋白激酶2(casein kinase 2,CK2)和糖原合成酶激酶3β(glyco?gen synthase kinase-3β,GSK-3β)是重要的兩個磷酸激酶,分別對PTEN 的S380-S385(集簇Ⅰ)和S361-S370(集簇Ⅱ)兩個肽段進行磷酸化。在集簇Ⅰ中,磷酸化的順序為S385>S380>T383>T382;在集簇Ⅱ中,磷酸化的順序為S370>T366>S362>S361>T363。這些位點的磷酸化掩蓋了PTEN 蛋白N 端的催化結(jié)構(gòu)域與C 端的C2 結(jié)構(gòu)域分子內(nèi)的相互作用[6-8]。將常發(fā)生磷酸化的5 個位點T366、S370、S380、T382 和T383 替換為丙氨酸可明顯使PTEN 的半衰期降低6倍[9]。與之類似,PTEN 整個C 端的截短也可明顯降低其穩(wěn)定性[10]。這可能是因為PTEN 蛋白C 端的磷酸化使其呈現(xiàn)出一種閉合狀態(tài),而保護了PTEN蛋白對水解敏感的部位。雖然上述的磷酸化可以增加PTEN 蛋白的穩(wěn)定性,但S361/S380/T382/T383 或S385 的磷酸化卻可以降低PTEN 對底物PIP3 的去磷酸化活性[11-12]??偟膩碚f,PTEN 的磷酸化調(diào)控機制部分解釋了:為什么在一些急性T 淋巴細胞白血病中,即使白血病細胞高表達非突變的PTEN,PI3KAKT信號通路仍處于高激活的狀態(tài)[13]。
雖然磷酸化PTEN 的激酶對調(diào)控PTEN 發(fā)揮著重要的作用,但是使PTEN去磷酸化的磷脂酶也有同等重要的作用。據(jù)報道,PTEN 可以通過其去磷酸化的活性對自身的T366 位點進行去磷酸化[14]。其他的磷脂酶,例如蛋白磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)可以被N-Myc 下游調(diào)節(jié)基因2(N-Myc downstream regulated gene 2,NDRG2)招募,對PTEN進行去磷酸化[15]。在T 淋巴細胞白血病細胞中,經(jīng)常由于NDRG2 的低表達而使PTEN 在S380/T382/T383殘基磷酸化水平增加,進而增強PI3K-AKT信號通路的活化[15]。
PTEN 與多數(shù)蛋白類似,其賴氨酸殘基的單泛素化可調(diào)節(jié)蛋白的功能,而賴氨酸殘基的多泛素化則介導(dǎo)蛋白的蛋白酶體降解。PTEN 蛋白賴氨酸殘基的泛素化集中在N 端。據(jù)報道,K13 或K289 的單泛素化以及K254的類泛素化都可以促進PTEN 的胞核轉(zhuǎn)移和駐留[16-17]。NEDD4-1(neural precursor cell ex?pressed,developmentally downregulated 4-1)和X 連鎖凋亡抑制蛋白(X-linked inhibitor of apoptosis pro?tein,XIAP)是PTEN 單泛素化E3 連接酶[18-19];E3 連接酶活化STAT 蛋白抑制物χα(protein inhibitor of activated STAT χα,PIASχα)則負責PTEN 的類泛素化[20];而負責PTEN 去泛素化的是皰疹病毒相關(guān)性泛素特異性肽酶(herpesvirus-associated ubiquitin-spe?cific peptidase,HAUSP)[21]。PTEN 上述賴氨酸位點的去泛素化促進PTEN從胞核向胞漿轉(zhuǎn)移[21]。
PTEN 是一個相對較穩(wěn)定的蛋白,其半衰期長于12 h[10]。K13 和K289 的多泛素化與其蛋白酶體調(diào)節(jié)的降解密切相關(guān)。泛素特異性肽酶11(ubiquitinspecific peptidase 11,USP11)負責多泛素化PTEN 的去泛素化,使PTEN 免于蛋白酶體的降解。USP11缺失的小鼠易于發(fā)生PTEN 相關(guān)的腫瘤[22]。目前,以E3 泛素連接酶為靶點的藥物正在被研究,以期通過抑制PTEN 的降解,上調(diào)PTEN 的蛋白水平,用于人類腫瘤的治療。
在多種腫瘤中,微小RNA(microRNA,miRNA,miR)和長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是促進PTEN mRNA 降解的重要機制。有多種miRNA 可以結(jié)合在PTEN 的3′-UTR,其中最重要的一個是miR-21。miR-21 在人腫瘤中常高表達,而且可以直接靶向PTEN 的mRNA,負性調(diào)節(jié)PTEN的蛋白水平,進而促進細胞的增殖和侵襲[23]。其他的miRNA,例如miR-23a[24]、miR-26a[25]、miR-92a[26]、miR-130a[27]、miR-205-5p[28]和miR-221[29]也可以負性調(diào)控PTEN 的蛋白表達,激活PI3K-AKT 信號通路而促進腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和侵襲。
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物中最常見的mRNA 修飾[30-31]。甲基轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體,包括甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白3(methyltransferase like protein 3,METTL3)和METTL14,負責將m6A 共價修飾到mRNA 上。目前,m6A 修飾對PTEN mRNA的調(diào)控尚不清楚。但是,有研究報道METTL3 可以調(diào)控包括PTEN在內(nèi)的多種基因的表達[32]。而且,METTL3的缺失可以導(dǎo)致m6A 甲基化的PTEN mRNA水平降低,以及PTEN 蛋白表達下調(diào)。這提示m6A 甲基化或許參與PTEN表達的調(diào)控。
可變剪接(alternative splicing,AS)是常見的PTEN mRNA 轉(zhuǎn)錄后的加工修飾,增加了轉(zhuǎn)錄本的多樣性。PTEN 存在多種剪切異構(gòu)體(splice variant,SV)。早期的研究在膠質(zhì)母細胞瘤和前列腺細胞發(fā)現(xiàn)的兩種PTEN SV 分別是PTEN-Δ和PTEN-B[33]。這兩種PTEN SV 都有C 端的缺失,由于穩(wěn)定性降低,降解迅速,所以幾乎沒有磷酸酯酶活性。近期研究提示,Cowden 綜合征的致病機制與PTEN SV 胚系異常有關(guān),在部分患者中存在3、4 或6 號外顯子缺失的PTEN SV,導(dǎo)致PTEN 蛋白水平下調(diào)。但最近在腎細胞癌中的研究表明,PTEN-Δ 與全長的PTEN 類似,具有腫瘤抑制的作用,高表達PTEN-Δ的患者具有更好的無轉(zhuǎn)移生存期和總生存期[33]。PTEN-L 是最近發(fā)現(xiàn)的一種PTEN SV,包含了PTEN 所有的結(jié)構(gòu)域,但在N 端額外有一段173 個氨基酸的可變翻譯區(qū)域(alternately translated region,ATR)[34]。PTEN-L 的ATR 包含了可變剪切位點的信號肽,這使得PTEN-L可以被分泌至細胞外。在人血漿和血清及人源性細胞的培養(yǎng)上清中都可以檢測到PTEN-L。PTEN-L 的ATR 還包含一個類似于細胞滲入性多肽的聚精氨酸基序,使得PTEN-L 能夠進入細胞。類似于胞內(nèi)的PTEN,外源性的PTEN-L能夠下調(diào)PI3K通路,影響細胞在體外的存活。因為PTEN-L 能夠脫離供體細胞,并作用于受體細胞,所以在腫瘤微環(huán)境中,間質(zhì)細胞PTEN的狀態(tài)可能會對腫瘤細胞PTEN的活性產(chǎn)生影響。PTEN-L 的旁分泌功能也許可以解釋之前存在的現(xiàn)象,即在體外PTEN的缺失對腫瘤細胞的增殖有明顯的影響,但是PTEN缺失的腫瘤細胞移植至小鼠體內(nèi)時腫瘤的生長并不一定存在差異[35]。
可變聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)是PTEN mRNA 轉(zhuǎn)錄后修飾的另一種方式:通過在不同的APA 位點切割,然后添加polyA,豐富了PTEN轉(zhuǎn)錄本的多樣性。PTEN基因受APA調(diào)控的位點位于終止密碼子上游3 kb[36]、290 bp 及60 bp 處,可以導(dǎo)致PTEN 轉(zhuǎn)錄本的縮短[37-38]。有研究人員認為PTEN 3′-UTR 的縮短可以限制miRNA 的結(jié)合,從而增加PTEN mRNA的穩(wěn)定性[39]。
上述PTEN 的調(diào)控都是發(fā)生在轉(zhuǎn)錄后,而PTEN轉(zhuǎn)錄前的調(diào)控對PTEN的表達也發(fā)揮著重要的作用。據(jù)報道,多種轉(zhuǎn)錄因子可以正向或負向調(diào)控PTEN的轉(zhuǎn)錄。其中p53、表皮生長因子1(epidermal growth factor 1,EGF1)及過氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator-activated receptor γ,PPARγ)可以結(jié)合在PTEN的啟動子上,上調(diào)PTEN 的表達[40-41]。與之相反,SNAIL、c-Jun 和NF-κB 可以下調(diào)PTEN 的表達[42-43]。而NOTCH1既可以上調(diào)也可以下調(diào)PTEN 的表達,這取決于NOTCH1是與著絲粒結(jié)合因子1(centromere binding factor-1,CBF-1)相互作用還是與MYC相互作用[44-45]。
PTEN啟動子的表觀沉默是PTEN基因失活的另一種方式。PTEN啟動子CpG 島的異常高甲基化存在于多種腫瘤中,包括乳腺癌、結(jié)腸癌、多發(fā)性骨髓瘤和胃癌等[46-50]。同時,PTEN的轉(zhuǎn)錄也受到組蛋白乙酰化的調(diào)控。有報道稱,轉(zhuǎn)錄因子SALI4 可以通過招募具有染色質(zhì)重塑作用的ATP 酶和具有組蛋白脫乙?;钚缘暮诵◇w重構(gòu)及脫乙酰酶(nucleo?some remodeling and deacetylase,NuRD)復(fù)合體至PTEN的啟動子上,抑制PTEN的轉(zhuǎn)錄[51]。
恢復(fù)PTEN 功能的傳統(tǒng)臨床研究著重于拮抗PI3K 信號。這類研究的靶點涉及整個PI3K 通路的激酶,包括受體酪氨酸激酶、PI3K、AKT 和哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)[52]。而最近的研究將重點轉(zhuǎn)移到PTEN缺失對基因組穩(wěn)定性和使用PARP 抑制劑靶向PTEN缺失的腫瘤上[53]。在大量體外和體內(nèi)的臨床前研究中,PTEN基因的恢復(fù)能夠降低一些腫瘤細胞系細胞的凋亡[54-55]。然而這些模型依賴于PTEN基因的基因重組,目前尚不能在臨床上實施。
本文對調(diào)控PTEN 表達和活性的機制進行了總結(jié)。最近幾十年中,相關(guān)機制有了許多新的發(fā)現(xiàn)。但是目前這些調(diào)控機制尚未能為臨床治療提供很大幫助。不限于,但可能存在以下的原因造成了這一現(xiàn)象:(1)異質(zhì)性大:在不同類型的腫瘤中,甚至是同一種腫瘤的不同患者中,調(diào)控PTEN的機制都可能存在很大的異質(zhì)性;(2)機制定位難:PTEN 是一個穿梭在胞漿和胞核的蛋白,在不同部位發(fā)揮著不同的抑癌作用,但目前尚無有效的手段可以迅速對患者PTEN 調(diào)控機制異常進行定位;(3)靶向性差,調(diào)控PTEN的上游通路往往同時調(diào)控著其他靶蛋白,而且PTEN 亦調(diào)控著下游眾多靶基因,形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),導(dǎo)致藥物很難有準確的靶向性??傊瑢@一關(guān)鍵抑癌基因調(diào)控機制的全面了解或許可以指導(dǎo)開發(fā)更多有效的恢復(fù)PTEN抗腫瘤活性的藥物。