李思博 譚 晶 張麗娜
(1. 佳木斯大學附屬第一醫(yī)院,佳木斯 黑龍江 154007; 2. 大慶油田總醫(yī)院,大慶 黑龍江 163411)
膠質(zhì)母細胞瘤(GBM)是世界衛(wèi)生組織分類為Ⅳ級高度惡性的腦腫瘤,中位生存期小于兩年[1]。目前標準治療方法是最大限度腫瘤切除手術(shù)、替莫唑胺(TMZ)和放療(RT)的聯(lián)合應用,但也只能夠短暫增加患者的生存期。在膠質(zhì)母細胞瘤中,IDH突變作為一個獨立分類的標準,具有獨特的CpG島高甲基化特征(G-CIMP)[2],與患者更好的預后相關[3],中位生存期為3.6年[4]。盡管IDH野生型和IDH突變膠質(zhì)母細胞瘤具有相似的組織學特征,但在生物學特性上被視為兩個不同的實體[5]。
異檸檬酸脫氫酶(IDH)在三羧酸循環(huán)中將異檸檬酸轉(zhuǎn)化為α-酮戊二酸,在膠質(zhì)瘤母細胞瘤的發(fā)生中,編碼IDH1/2的基因突變導致酶活性的改變,將α-酮戊二酸轉(zhuǎn)化為D-α-羥基戊二酸,通過競爭性抑制減少α-酮戊二酸的生成[6]。TET蛋白家族是一種依賴于α-酮戊二酸的雙加氧酶,催化表觀遺傳甲基化修飾5-甲基胞嘧啶的去甲基化反應,生成5-羥甲基胞嘧啶[7]。研究表明,在多種癌癥中DNA去甲基化的中間產(chǎn)物5-羥甲基胞嘧啶發(fā)生減少,并且與癌癥發(fā)生關系密切[8,9]。
對膠質(zhì)母細胞瘤表觀遺傳修飾和生物化學特性的深入了解,將有助于我們發(fā)現(xiàn)潛在的治療弱點,制定特異性治療策略,從而改善患者的預后。
腫瘤干細胞具有自我更新能力,維持腫瘤細胞的增殖和細胞異質(zhì)性,通過對腫瘤干細胞的深入研究,可以追溯到腫瘤的起源。Zhou D等[10]通過對人膠質(zhì)母細胞瘤來源異種移植進行表觀基因組分析發(fā)現(xiàn),TET2蛋白在膠質(zhì)瘤干細胞中表達上調(diào),并且與細胞增殖和DNA損傷反應相關,通過敲除TET2,發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)瘤干細胞對博萊霉素的敏感性上調(diào)。在膠質(zhì)瘤母細胞瘤細胞中TET2蛋白表達降低,卻在腫瘤干細胞中表達增加,暗示TET2蛋白可能在參與維持腫瘤低分化表型和腫瘤異質(zhì)性過程中起到重要作用。靶向TET2蛋白調(diào)控腫瘤細胞的化療敏感性可能成為膠質(zhì)母細胞瘤一個潛在的治療靶點。
先前的研究表明敲除TET3使神經(jīng)元分化的過程受到抑制[11],暗示TET3水平的破壞可能增加神經(jīng)祖細胞的自我更新,增加了腫瘤發(fā)生的潛能。Carella A等[12]在免疫缺陷小鼠模型中增強了TET3的表達,部分逆轉(zhuǎn)了膠質(zhì)母細胞瘤中的DNA羥甲基化的缺失,降低了異種移植小鼠腦腫瘤的形成。并且在膠質(zhì)母細胞瘤模型中,恢復TET3的表達增強了細胞的分化能力[12]。
上述研究結(jié)果表明TET蛋白家族在膠質(zhì)母細胞瘤存在不同的作用。通過靶向調(diào)控TET蛋白家族成員,以不同的機制影響膠質(zhì)母細胞瘤的發(fā)展,可能會成為一個潛在的治療弱點。
腦組織中5-羥甲基胞嘧啶的水平遠高于其他組織,提示DNA羥甲基化修飾在神經(jīng)系統(tǒng)中的潛在作用[13]。近期一項研究,Kraus T F等[14]對膠質(zhì)母細胞瘤中5-甲基胞嘧啶和5-羥甲基胞嘧啶全基因組水平進行分析,發(fā)現(xiàn)一種發(fā)生于增強子和轉(zhuǎn)錄區(qū)域的非典型異常高甲基化模式,這些位點通常由5-羥甲基胞嘧啶修飾;這種非典型異常高甲基化模式表現(xiàn)為5-羥甲基胞嘧啶缺失、CpG島富集基因啟動子相關,標記H3K4me2。表明了膠質(zhì)瘤依賴于5-羥甲基胞嘧啶的異常甲基化模式,可能通過表觀遺傳修飾變化參與調(diào)控相關基因的表達。DNA的甲基化/羥甲基化修飾通常與轉(zhuǎn)錄抑制相關[15],IDH1/2突變導致膠質(zhì)母細胞瘤基因組DNA的整體高甲基化模式和DNA羥甲基化的缺失[16]。
IDH1/2突變抑制TET蛋白表達介導了5-羥甲基胞嘧啶生成減少,然而近期一項實驗發(fā)現(xiàn)IDH突變型膠質(zhì)母細胞瘤較IDH野生型表現(xiàn)出更高水平的5-羥甲基胞嘧啶[17]。關于IDH突變與5-羥甲基胞嘧啶之間的相關性并沒有達成一致的見解[18,14]。Glowacka W. K等17使用定量位點特異性方法分析IDH1突變膠質(zhì)母細胞瘤5-羥甲基胞嘧啶水平,發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)瘤發(fā)病機制相關的增強子處具有更高水平的5-羥甲基胞嘧啶,并且5-羥甲基胞嘧啶參與了膠質(zhì)瘤CpG島高甲基化特征的形成。在膠質(zhì)母細胞瘤中5-甲基胞嘧和5-羥甲基胞嘧啶水平以及膠質(zhì)瘤CpG島高甲基化特征與患者更好的預后相關[3]。盡管5-羥甲基胞嘧啶參與基因組轉(zhuǎn)錄的分子機制并不完全清楚,但上述研究表明膠質(zhì)母細胞瘤中5-羥甲基胞嘧啶是一個有潛力的調(diào)控靶點,相信對于5-羥甲基胞嘧啶的進一步研究,可以更加深入的了解膠質(zhì)母細胞瘤的分子生物學特性,從而開發(fā)潛在的治療弱點,制定具有特異性的靶向治療策略。
癌癥基因突變改變了膠質(zhì)瘤的代謝環(huán)境,使得腫瘤細胞得以生長和增殖[19],通過對這種癌癥生物學特性的深入研究和代謝途徑的開發(fā)為膠質(zhì)母細胞瘤治療提供了全新的觀點。McBrayer S. K等[20]發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)瘤中IDH1 R132H突變抑制了支鏈氨基酸轉(zhuǎn)氨酶BCAT的活性,減少了谷氨酸的生成,使得膠質(zhì)瘤谷氨酸代謝更依賴谷氨酰胺酶;靶向擬制谷氨酰胺酶可以抑制增強IDH1 R132H突變膠質(zhì)瘤的氧化應激,從而提升放療的敏感性。然而在TP53和ATRX基因突變的情況下,IDH1 R132H突變可以通過ATM通路增強DNA損傷反應[21],降低了放療的敏感性。IDH突變膠質(zhì)母細胞瘤遺傳背景和基因之間的相互作用是十分復雜的。
關于異檸檬酸脫氫酶的致癌突變研究主要集中在IDH1/2,關于IDH3的報導并不多。May J.L等[22]發(fā)現(xiàn)IDH3亞基IDH3α在膠質(zhì)母細胞瘤中高表達,并且促進異種移植小鼠膠質(zhì)母細胞瘤發(fā)育,并且觀察到IDH3α與胞質(zhì)絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶的結(jié)合,增強了核苷酸的利用率。與IDH1/2不同,IDH3α促進了病程進展,增強了膠質(zhì)母細胞瘤代謝的效率,昭示著不良的預后。敲除IDH3α發(fā)現(xiàn)膠質(zhì)母細胞瘤三羧酸循環(huán)和氧化磷酸化受到抑制,降低了腫瘤代謝的效率;并且通過增強蛋氨酸循環(huán)誘導DNA高甲基化,使相關癌基因轉(zhuǎn)錄受到抑制,減少了腫瘤細胞的增殖[22]。
IDH基因致癌突變的分子機制并不是完全清楚,其家族成員的功能和定位存在一定的差異,IDH家族對于腫瘤微環(huán)境和基因協(xié)同效應之間的相互作用十分復雜,具有非常高的研究價值和治療潛能。
在IDH突變膠質(zhì)母細胞瘤中,DNA的高甲基化模式和DNA羥甲基化的缺失會降低TET3蛋白的表達,進一步的降低DNA羥甲基化的水平[12]。這種DNA的異常模式被認為是由于IDH1/2突變抑制了TET蛋白導致的[16]。但在TET蛋白正常表達的腫瘤中也表現(xiàn)為DNA羥甲基化的缺失[23],提示可能存在其他調(diào)控機制。TET3的缺失可能在腫瘤發(fā)生之前就已經(jīng)出現(xiàn)了,低水平的TET3使細胞分化受到阻滯,增加了細胞永生化的潛能。TET蛋白家族在腫瘤中遺傳背景并不是很明確,通過對TET家族蛋白的進一步研究,可能有助于了解膠質(zhì)母細胞瘤中復雜的分子機制。
膠質(zhì)瘤中異常甲基化模式被歸因于5-甲基胞嘧啶的分布異常所導致的,隨著5-羥甲基胞嘧啶研究的開展,5-羥甲基胞嘧啶水平對于表觀基因組的影響逐漸被揭開。在膠質(zhì)瘤中5-羥甲基胞嘧啶的缺失呈現(xiàn)了一種獨特的甲基化模式[14],并且5-羥甲基胞嘧啶的水平與基因表達增強具有很強的相關性[17],讓人聯(lián)想到這種獨特的甲基化模式對于基因過表達的影響。IDH突變與5-羥甲基胞嘧啶的關聯(lián)還存在爭議,但是在IDH突變膠質(zhì)母細胞瘤中觀察到有悖于IDH功能的高5-羥甲基胞嘧啶水平,這其中潛在的調(diào)控機制可能超過TET蛋白對于5-羥甲基胞嘧啶的影響。
IDH突變對于膠質(zhì)瘤母細胞表觀基因組和生物學特性的影響是極為廣泛的,盡管膠質(zhì)母細胞瘤是無法治愈的惡性腫瘤,但在膠質(zhì)瘤中IDH突變相較于IDH野生型表現(xiàn)出較好的預后[4],仍然需要更多的研究來探索其中潛在的機制,通過靶向放大這種良性影響,有望改善患者的預后。