高飛,胡澤斌,孫楠,段然慧,游延軍,左甜甜,夏昆,黃杰
脆性X綜合征外周血淋巴細(xì)胞永生化細(xì)胞系的建立與驗(yàn)證
高飛*,胡澤斌*,孫楠,段然慧,游延軍,左甜甜,夏昆,黃杰
100050 北京,中國食品藥品檢定研究院體外診斷試劑所非傳染病診斷試劑室(高飛、胡澤斌、孫楠、黃杰),中藥民族藥檢定所天然藥物室(左甜甜);410078 長(zhǎng)沙,中南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究中心(段然慧、夏昆);611731 成都,四川省食品藥品檢驗(yàn)檢測(cè)院(游延軍)
脆性 X 綜合征(fragile X syndrome,F(xiàn)XS)是一種 X 連鎖不完全外顯性遺傳病,是引起遺傳性智力低下和孤獨(dú)癥譜系障礙最常見的單基因病[1],因細(xì)胞中 X 染色體末端在特殊培養(yǎng)基中經(jīng)誘變劑作用后可顯示如同斷裂的脆性部位而得名。男性患者多見且癥狀較重,表現(xiàn)為智力低下、巨睪、特殊面容、語言行為障礙等;女性攜帶者約 1/3 表現(xiàn)出智力低下或其他癥狀。95% ~ 99% 的 FXS 患者是由1基因 5'UTR CGG 重復(fù)擴(kuò)增的動(dòng)態(tài)突變和異常甲基化導(dǎo)致1 基因轉(zhuǎn)錄沉默、FMRP 蛋白合成減少或丟失所致。正常人群中 CGG 重復(fù)數(shù)目在 5 ~ 44 之間,最常見的重復(fù)數(shù)目為 29 或 30;CGG 重復(fù)數(shù)目在 45 ~ 54 之間時(shí)稱為灰區(qū)(中間型),該等位基因亦屬正常范圍;傳遞過程中可發(fā)生小尺寸的重復(fù)數(shù)目增加或減少,一代內(nèi)不會(huì)擴(kuò)增至全突變,但可在更遠(yuǎn)的世代傳遞中擴(kuò)增為全突變,從而導(dǎo)致發(fā)病。前突變(premutation,PM)CGG 重復(fù)數(shù)目在 55 ~ 200 之間,無FXS 患病表現(xiàn);全突變(full mutation,F(xiàn)M)CGG 重復(fù)擴(kuò)增至 200 以上,部分重復(fù)數(shù)目達(dá)幾百甚至上千,F(xiàn)XS 特征表現(xiàn)明顯[2]。具體的1基因突變類型與發(fā)病關(guān)系如圖 1 所示。
圖 1 FMR1基因型與發(fā)病關(guān)系[3]
1995 年至今,我國共對(duì) 12 676 例智力低下患兒進(jìn)行了脆性 X 綜合征的篩查,查出患兒共計(jì) 804 例,以此計(jì)算出脆性 X 綜合征在我國智力低下患兒中的患病率約為 6.3%[4]。鑒于該遺傳病患者生活不能自理、發(fā)病率較高且樣本獲得困難的特點(diǎn),對(duì)臨床樣本的永生化細(xì)胞系的轉(zhuǎn)化和有效檢測(cè)方法的建立至關(guān)重要,可以為脆性 X 遺傳病和分子生物學(xué)研究提供長(zhǎng)期穩(wěn)定的遺傳資源。目前國內(nèi)相關(guān)的研究,特別是脆性 X 綜合征永生化細(xì)胞系建立的報(bào)道較少。本研究的驗(yàn)證方法采用熒光 PCR-毛細(xì)管電泳法和 Southern blot 法,Southern 印跡雜交是目前最主要的脆性 X 確診方法[5],可診斷出全突變患者和 CGG 異常擴(kuò)增次數(shù)較多的前突變攜帶者,但對(duì)擴(kuò)增次數(shù)較少的前突變攜帶者或嵌合體攜帶者可能存在漏檢。因此采用熒光 PCR-毛細(xì)管電泳法和Southern blot 法相結(jié)合的檢測(cè)方法可保證驗(yàn)證結(jié)果的全面及準(zhǔn)確。
1.1.1 樣本來源 取經(jīng)在中南大學(xué)家輝遺傳醫(yī)院確診患者的外周血 5 ml。患者均簽署知情同意書。樣本信息詳見表 1。
表 1 10 例樣本信息
1.1.2 試劑和耗材 核酸提取試劑盒為寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;永生化細(xì)胞系建立所需試劑購自美國 Gibco 公司;參考品驗(yàn)證所需試劑盒購自廣州市達(dá)瑞生物技術(shù)股份有限公司和北京貝瑞和康生物技術(shù)有限公司;NanoDrop 核酸蛋白測(cè)定儀為安捷倫公司產(chǎn)品。
1.2.1 EBV 病毒液的制備 利用饑餓后的病毒細(xì)胞準(zhǔn)備新鮮病毒液,RPMI1640 + 1× 雙抗,復(fù)蘇 1 株 B95-8 細(xì)胞株,接種于5 ml 20% FBS 和 80% RPMI1640 的培養(yǎng)基中,每隔 2 ~ 3 天補(bǔ)液一次,逐漸增加培養(yǎng)液到所需的用量,饑餓細(xì)胞 4 ~ 7 d 后,收集細(xì)胞在液氮及 37 ℃條件下反復(fù)凍融 3 次,2000 r/min 離心 10 min。取上清液用 0.2 μm 濾膜過濾后短暫放置于 4 ℃冰箱,最終于–70 ℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 脆性 X 綜合征患者淋巴細(xì)胞的分離 使用肝素抗凝管盛裝患者及親屬的外周靜脈全血 5 ml,將血液轉(zhuǎn)移到 Corning 離心管后加入 4 ml Ficoll 淋巴細(xì)胞分離液,加入等體積的含有青霉素及鏈霉素的 RPMI1640 培養(yǎng)液,2500 r/min 離心 30 min 后移取白色絮狀淋巴細(xì)胞至另一試管中,加入8 ml RPMI1640 洗滌 2 次,800 r/min 離心 10 min 備用。
1.2.3 脆性 X 綜合征患者淋巴細(xì)胞的永生化轉(zhuǎn)化 將分離出的細(xì)胞用 8 ml RPMI1640 培養(yǎng)基洗滌 2 次后,在800 r/min 條件下離心10 min 去上清,加入 EBV病毒液1.5 ml,環(huán)孢菌素 A 0.4 ml(200 μg/ml 母液,最終作用濃度 2 μg/ml),混勻后等份轉(zhuǎn)入 2 個(gè) 10 ml 培養(yǎng)瓶中,置于 37 ℃ 5% CO2培養(yǎng)箱中,培養(yǎng) 24 ~ 48 h 后,使用倒置顯微鏡觀察細(xì)胞轉(zhuǎn)化情況并拍照,根據(jù)細(xì)胞轉(zhuǎn)化和聚集情況進(jìn)行加液或半量換液,當(dāng)細(xì)胞數(shù)達(dá)到(3 ~ 6)× 106個(gè)/ml 時(shí)將細(xì)胞吹勻,1500 r/min 離心 5 min 后用凍存液重懸并置于凍存管中凍存。
1.2.4 脆性 X 綜合征患者永生化細(xì)胞系的凍存 在細(xì)胞株凍存前 24 h 換液;將細(xì)胞培養(yǎng)物收集至 10 ml 離心管中,1200 r/min 離心 10 min,棄上清,根據(jù)細(xì)胞的數(shù)量加入一定量的凍存液(30% 胎牛血清、70% RPMI1640、10% 二甲基亞砜,過濾滅菌,–20 ℃避光保存),分裝在凍存管中,每管1 ml 凍存液,置–20 ℃ 2 h 后置于–70 ℃,2 h 后放入液氮中保存。
1.2.5 脆性 X 綜合征患者永生化細(xì)胞系的分子生物學(xué)檢驗(yàn) 將脆性 X 綜合征患者永生化細(xì)胞系取出復(fù)蘇后進(jìn)行 DNA 提取,再進(jìn)行熒光 PCR-毛細(xì)管電泳法和 Southern blot 法的驗(yàn)證檢驗(yàn)。
10 份細(xì)胞株樣本在復(fù)蘇并培養(yǎng) 7 d 時(shí),在倒置顯微鏡下可觀察到光滑透亮的淋巴細(xì)胞明顯發(fā)生增大、聚團(tuán),且細(xì)胞周邊有較多的胞質(zhì)突出(圖 2);30 d 時(shí),顯微鏡下可觀察到淋巴細(xì)胞生長(zhǎng)形成密集的細(xì)胞團(tuán)且外壁有不規(guī)則毛刺狀突起(圖 3),表明細(xì)胞轉(zhuǎn)化為淋巴母細(xì)胞樣 B 細(xì)胞,表明轉(zhuǎn)化成功。
將 10 份永生化細(xì)胞株樣本用核酸提取試劑盒進(jìn)行 DNA 抽提,提取的 DNA 用NanoDrop 核酸蛋白測(cè)定儀測(cè)定260/280和260/230值并用瓊脂糖凝膠電泳膠檢驗(yàn) DNA 的完整性,NanoDropTMOne 對(duì) DNA 進(jìn)行精確定量;對(duì) DNA 樣本進(jìn)行熒光 PCR-毛細(xì)管電泳法及Southern blot 法檢驗(yàn)分析,分析結(jié)果顯示全部陽性樣本的堿基序列與樣本 CGG 重復(fù)數(shù)一致。檢測(cè)結(jié)果見表 2、圖 4、圖 5。
圖 2 永生化細(xì)胞系轉(zhuǎn)化第 7 天結(jié)果(40 ×)
圖 3 永生化細(xì)胞系轉(zhuǎn)化第 30 天結(jié)果(100 ×)
表 2 10 份脆性 X 樣本永生化細(xì)胞系驗(yàn)證結(jié)果
注:該 10 份脆性 X 永生化細(xì)胞系樣本為建系成功后液氮凍存的樣本。
圖 4 10 份脆性 X 樣本永生化細(xì)胞系熒光 PCR-毛細(xì)管電泳法結(jié)果
圖 5 10 份脆性 X 樣本永生化細(xì)胞系 Southern blot 法結(jié)果
建立具有人類全基因組的永生化淋巴細(xì)胞系,是人類重要疾病遺傳資源保存與收集的主要技術(shù)手段和首選方法[6]。目前世界上具有較大影響力的基因細(xì)胞遺傳資源存儲(chǔ)機(jī)構(gòu)包括英國生物樣本庫(The UK Biobank)、美國國立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health,NIH)和美國國家人類基因細(xì)胞庫(The NIGMS Human Genetic Cell Repository),它們均是以永生化淋巴細(xì)胞系作為最主要的技術(shù)方法保存細(xì)胞遺傳資源[7]。建立永生化淋巴細(xì)胞系的優(yōu)點(diǎn)明顯:樣本用量較少,由 EBV 轉(zhuǎn)化外周血 B 淋巴細(xì)胞建立永生細(xì)胞株的方法規(guī)范[8];連續(xù)培養(yǎng)傳代過程中染色體穩(wěn)定;細(xì)胞建系和培養(yǎng)成本較低;重要的是可獲得取之不盡的細(xì)胞遺傳資源用于遺傳性疾病的研究[9]。
本研究采用經(jīng)肝素抗凝的脆性 X 綜合征各突變類型的外周全血樣本,通過反復(fù)研究采用了(1 ~ 5)× 105個(gè)/ml 低密度接種轉(zhuǎn)化細(xì)胞,減少了 T、B 細(xì)胞的接觸機(jī)會(huì);加入環(huán)孢素 A(終濃度 1 μg/ml)抑制了 T 細(xì)胞活性,最終成功建立了脆性 X 綜合征各類型樣本的外周血永生化細(xì)胞系,且成功進(jìn)行了傳代、凍存和復(fù)蘇。同時(shí)對(duì)建系成功的永生化細(xì)胞株進(jìn)行了可精確讀取 CGG 重復(fù)數(shù)量的熒光 PCR-毛細(xì)管電泳和脆性 X 檢測(cè)經(jīng)典方法的 Southern blot 法驗(yàn)證,結(jié)果表明脆性 X 基因組 DNA 遺傳穩(wěn)定,可作為寶貴的樣本資源,為檢測(cè)試劑盒生產(chǎn)企業(yè)和科研機(jī)構(gòu)相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的研制及后續(xù)的脆性 X 綜合征臨床檢驗(yàn)與疾病控制奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
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*同為第一作者
10.3969/j.issn.1673-713X.2019.05.015
中國食品藥品檢定研究院中青年發(fā)展研究基金(2017C1)
黃杰,Email:jhuang5522@126.com;夏昆,Email:xiakun@ sklmg.edu.cn
2019-08-13