王蘭蘭
摘 要:RNA干擾(RNA interference, RNAi)是正常生物體內(nèi)抑制特定基因表達(dá)的一種現(xiàn)象,通過雙鏈RNA的介導(dǎo)特異性降解相應(yīng)序列的mRNA,從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄后水平的基因沉默。RNAi發(fā)生過程主要分為3個階段:起始階段、擴增階段、效應(yīng)階段。其在抵抗病毒感染、抑制轉(zhuǎn)座子活動、調(diào)控內(nèi)源性基因表達(dá)等方面發(fā)揮重要作用。本文就RNAi的分子機制、作用特點及其應(yīng)用研究方面的進展做相關(guān)介紹。
關(guān)鍵詞:RNA干涉;基因沉默;雙鏈RNA
RNA 干擾(RNA interference,RNAi) 是指與靶基因序列同源的雙鏈RNA( dsRNA) 所誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后基因沉默現(xiàn)象,是真核生物抵御病毒入侵、抑制轉(zhuǎn)座子活動、調(diào)控基因表達(dá)的監(jiān)控機制。基因的表達(dá)具有選擇性,我們發(fā)現(xiàn)生物體內(nèi)存在一套RNA 監(jiān)視系統(tǒng),能通過多種途徑產(chǎn)生異常dsRNA,誘發(fā)RNAi,激活抑制基因,控制活躍基因,從而參與基因選擇性表達(dá)。目前RNAi 技術(shù)因其操作簡單、特異性強、高效性等特點,被廣泛應(yīng)用于植物的抗病毒研究、藥物靶基因的篩選、腫瘤治療等領(lǐng)域[1]。現(xiàn)對RNAi的研究進展做綜述。
1 RNA干涉的的發(fā)現(xiàn)
RNAi最早是在線蟲C.elegans上發(fā)現(xiàn)的,人們發(fā)現(xiàn)水蛭、錐體蟲、渦蟲、果蠅等無脊椎動物RNAi都非常有效。開始,較長雙鏈RNA只能引起少數(shù)胚胎細(xì)胞(如斑馬魚和小鼠胚胎)的RNAi現(xiàn)象。后來人工合成的21nt長度的RNA二合體在培養(yǎng)的哺乳動物細(xì)胞成功進行了RNAi。最近,利用載體表達(dá)的shRNA在許多培養(yǎng)的人源,猴源和鼠源的哺乳動物細(xì)胞的RNAi實驗取得了成功。RNAi廣泛存在于是生物界的現(xiàn)象。
2? RNA干涉的分子機制及作用特點
2.1 RNA干涉的分子機制
雖然遺傳學(xué)和生物化學(xué)的方法都已用于探索RNA干涉的機制,但其真正的機理尚未明了。目前認(rèn)為其可能機制可分為三步:
第一步:dsRNA的形成。dsRNA是誘導(dǎo)細(xì)胞RNAi的關(guān)鍵組分,外源DNA、RNA序列均可激發(fā)細(xì)胞產(chǎn)生相應(yīng)的dsRNA,但產(chǎn)生的方式不同。RNA病毒在病毒或細(xì)胞中RNA依賴性RNA聚合酶的催化下,合成病毒的RNA序列互補鏈,并與之結(jié)合形成dsRNA;細(xì)胞通過“通讀轉(zhuǎn)錄’,轉(zhuǎn)座子的反向重復(fù)序列,直接產(chǎn)生雙鏈RNA[2]。
第二步:siRNA的形成。形成的dsRNA要在細(xì)胞中大量擴增,當(dāng)其在細(xì)胞中達(dá)到一定量的時候,會被一種特異的核酸內(nèi)切酶識別并與之結(jié)合形成酶-dsRNA復(fù)合體。此后,在ATP的參與下,細(xì)胞中存在的另一種復(fù)合體—RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體,利用結(jié)合在其上的核酸內(nèi)切酶活性切割靶mRNA分子中與dsRNA反義鏈互補的區(qū)域,形成了21-23個核昔酸的dsRNA,小片段稱之為短干涉RNA[3]。
第三步:RNAi的形成。SiRNA還可作為一種特殊的引物,在RdRP酶的作用下以把mRNA為模板合成dsRNA分子,這些dsNRA分子又可被RISC切割形成新的siRNA,新的siRNA又可進人上述循環(huán),這種過程稱之為隨機降解性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。新生的dsRNA反復(fù)合成和降解,不斷產(chǎn)生新的siNRA,從而使靶mRNA漸進性減少,導(dǎo)致目的基因沉默,呈現(xiàn)RNiA現(xiàn)象。
2.2 RNA干涉的作用特點
RNAi途徑主要存在于細(xì)胞漿中,與反義核酸,核酶相比,RNAi具有以下特點。①特異性。siRNA是嚴(yán)格按照堿基配對法則與靶mRNA結(jié)合的,故只引起同源mRNA的降解。②遺傳性。dsRNA分子可擴散至生物體各個細(xì)胞,干擾效應(yīng)可遺傳給后代,研究表明,通過注射或者浸泡siRNA,在二代線蟲中仍可觀察到對靶基因的抑制作用。③位置效應(yīng)。研究表明只有針對編碼區(qū)的dsRNA才產(chǎn)生干擾效應(yīng),對內(nèi)含子區(qū)域的dsRNA不產(chǎn)生干擾效應(yīng)[4]。
3 RNA干涉的應(yīng)用
3.1用于基因治療
RNAi的作用具有高效率和高特異性的特點,它能使目標(biāo)蛋白的mRNA發(fā)生特異性的降解。目前,人們已經(jīng)證明在培養(yǎng)的哺乳動物細(xì)胞中,RNAi可用于抗病毒和抗腫瘤等的基因治療Wilda等[5],在K562細(xì)胞系用針對融合基因bcr-abl的dsRNA可以明顯引起細(xì)胞凋亡。隨著RNAi被成功應(yīng)用于哺乳動物細(xì)胞,用于人類疾病的治療已為期不遠(yuǎn)。
3.2新藥物的研究與開發(fā)
蛋白質(zhì)是細(xì)胞功能的執(zhí)行者,各種疾病的發(fā)生和蛋白質(zhì)功能的異常是分不開的。RNAi不僅可以使細(xì)胞產(chǎn)生特定基因表型,而且它還具有高效和特異的特點。因此,它在新藥的開發(fā)與研究上具有廣闊的前景。比如RNAi可以作為尋找新的藥物靶標(biāo)的工具[6],可以高通量地對發(fā)現(xiàn)的藥物靶基因做功能分析,可幫助了解藥物作用的生化模式等。
3.3探索基因功能的工具
由于RNAi可以使特異基因mRNA發(fā)生降解,從而獲得特定蛋白功能喪失或降低的突變株。因此,RNAi可以作為一種強有力的研究工具,用于后基因組的研究。線蟲全基因組已于1998年測序完畢,RNAi的發(fā)現(xiàn)又為系統(tǒng)和高通量研究線蟲全基因組功能提供了可能。目前已探索了幾乎整個線蟲的所有基因(約19 000個)。植物的全基因組探索也正在進行中。
展望
RNAi作為一種改變基因表達(dá)的方法已在許多生物中進行了嘗試,取得了不同程度的成功。研究已發(fā)現(xiàn)在培養(yǎng)的人類細(xì)胞中確實存在RNAi現(xiàn)象,使人們看到了將RNAi作為遺傳學(xué)工具用于哺乳類乃至人類進行研究的曙光[7]。雖然RNAi研究的歷史很短,許多問題仍有待認(rèn)識、解決,但隨著對RNAi機制的深入理解,RNAi將在功能基因組學(xué)、發(fā)育生物學(xué)研究,以及疾病的基因治療等方面發(fā)揮巨大的作用。
參 考 文 獻(xiàn)
[1] Koch A, Kogel K H. New wind in the sails: improving the agronomic value of crop plants through RNAi-mediated gene silencing.[J]. Plant Biotechnology Journal, 2014, 12(7):821-831
[2] 付文金, 巢時斌, 彭劍雄. RNA干擾[J]. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報, 2002, 24(5):279-282.
[3] Zamore P D, Tuschl T, Sharp P A, et al. RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals.[J]. Cell, 2000, 101(1):25-33.
[4] 萬志紅, 王宇明. 基因功能研究新途徑-RNA干擾[J]. 世界華人消化雜志, 2004, 12(4):962-964.
[5] 萬志紅, 王宇明. 基因功能研究新途徑-RNA干擾[J]. 世界華人消化雜志, 2004, 12(4):962-964.
[6] 吳濤, 石寶晨, 陳潤生. RNA干涉現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)與研究進展——2006年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎簡介[J]. 生物化學(xué)與生物物理進展, 2006, 33(10):915-917.
[7] 孫秀菊. RNA干涉:沉默基因的機制及應(yīng)用研究新進展[J]. 國際遺傳學(xué)雜志, 2002, 25(6):313-316.