鈺華 李爽 蓋穎
摘要:從毛白楊中克隆得到木葡聚糖內(nèi)轉(zhuǎn)糖苷酶/水解酶PtoXTH35基因,根據(jù)SignalIP在線軟件預(yù)測蛋白信號肽,并分別構(gòu)建至pET28a、pET32a、pGEX-4t-1、pMAL-c5e、pET 43.1a等5種原核表達(dá)載體,經(jīng)雙酶切和測序驗(yàn)證后轉(zhuǎn)化至BL21(DE3)感受態(tài),使用終濃度為0.4 mmol/L的異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)誘導(dǎo)其表達(dá)目的蛋白。經(jīng)SDS-PAGE檢測,結(jié)果表明5種載體均可表達(dá)目的蛋白,pET28a、pET32a、pGEX-4t-1等3種載體所表達(dá)蛋白均以包涵體的形式存在,而pMAL-c5e和pET 43.1a載體攜帶蛋白表達(dá)量高并且所表達(dá)蛋白50%為可溶性蛋白,實(shí)現(xiàn)了毛白楊PtoXTH35在原核表達(dá)系統(tǒng)中的高效可溶性表達(dá),該試驗(yàn)為后續(xù)進(jìn)一步研究毛白楊PtoXTH35的體外功能奠定了基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:毛白楊;木葡聚糖內(nèi)轉(zhuǎn)糖苷酶/水解酶;原核表達(dá);包涵體;可溶性蛋白
中圖分類號: S792.117.01文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號:1002-1302(2019)08-0033-04
在植物的生長發(fā)育以及抵御生物和非生物脅迫過程中,細(xì)胞壁發(fā)揮著不可忽視的作用。在雙子葉植物的初生細(xì)胞壁中,木葡聚糖以非共價鍵的形式與纖維素相連,從而形成了初生細(xì)胞壁當(dāng)中主要的張力承載結(jié)構(gòu),木葡聚糖水解酶(xyloglucan endohydrolase,XEH)可以快速催化木葡聚糖的水解從而實(shí)現(xiàn)細(xì)胞壁的膨脹[1]。Albersheim等做出假設(shè)認(rèn)為在植物細(xì)胞生長過程中還存在一種糖苷內(nèi)部轉(zhuǎn)移酶,將多糖鏈的一部分轉(zhuǎn)移至自身的其他位置[2]。隨后Fry等率先發(fā)現(xiàn)了一種蛋白可以在快速生長的植物細(xì)胞當(dāng)中催化木葡聚糖鏈的斷裂以及重連,并命名為木葡聚糖內(nèi)轉(zhuǎn)糖苷酶(xyloglucan endotransglycosylase,XET)[3],XET和XEH共同組成了木葡聚糖內(nèi)轉(zhuǎn)糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase,XTH)家族,被認(rèn)為是一種細(xì)胞壁松弛酶,在植物生長過程中以及抵御外界脅迫過程中參與了細(xì)胞壁重構(gòu)。XTH是一類龐大的多基因家族,屬于碳水化合物活性酶家族數(shù)據(jù)庫(CAZy)中的糖苷水解家族GH16。在毛果楊、擬南芥中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了該基因家族中分別含有41、33個成員[4],根據(jù)XTH蛋白編碼的氨基酸序列以及蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)可以將它們分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ等3類,其中Ⅰ和Ⅱ類具有糖基轉(zhuǎn)移酶活性,Ⅲ類具有糖苷水解酶活性[5]。
目前對于XTH的研究主要集中在對該基因家族成員的功能鑒定及其在植物生長發(fā)育和抵御外界脅迫過程中發(fā)揮作用的機(jī)制,而要對基因家族中的成員進(jìn)行體外功能驗(yàn)證則必須要實(shí)現(xiàn)蛋白的體外可溶性表達(dá)。目前文獻(xiàn)中多采用酵母表達(dá)方法獲得XTH可溶性蛋白,只有極少數(shù)文獻(xiàn)報道通過原核表達(dá)以及包涵體變復(fù)性的方法獲得可溶性蛋白,這可能是受限于XTH在原核系統(tǒng)中多以包涵體的形式表達(dá)[6-10]。因此,本研究擬通過更換攜帶有不同可溶性標(biāo)簽的載體以實(shí)現(xiàn)毛白楊PtoXTH35(Populus tomentosa xyloglucan endotransgl-ycosylase/hydrolase 35)蛋白在原核中的高效可溶性表達(dá),以期為后續(xù)功能驗(yàn)證等相關(guān)試驗(yàn)奠定基礎(chǔ)。
1材料與方法
試驗(yàn)于2016年10月至2017年3月在北京市海淀區(qū)北京林業(yè)大學(xué)進(jìn)行。
1.1質(zhì)粒和菌株
pET28a、pET32a、pGEX-4t-1、pMAL-c5e、pET 43.1a質(zhì)粒載體以及大腸桿菌(Escherichia coli) BL21(DE3)、JM109菌株均由筆者所在實(shí)驗(yàn)室保留。
1.2試劑
胰蛋白胨、酵母粉均購自O(shè)xiod公司;Taq酶、T4連接酶、限制性內(nèi)切酶、2 ku DNA Maker、10 ku DNA Maker,均購自寶生物工程(大連)有限公司;蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn),購自中國科學(xué)院上海生物化學(xué)研究所;其他化學(xué)試劑均購自北京藍(lán)弋化工產(chǎn)品有限責(zé)任公司。
1.3主要儀器
POWER PAC 300電泳儀(美國BIO-RED公司),Universal Hood Ⅱ型凝膠成像儀(美國BIO-RED公司),ABI Veriti FAST 梯度PCR儀(美國Applied Biosystems公司),DNA Engine連接儀(美國BIO-RED公司),SHK-02-Ⅰ臺式空氣恒溫?fù)u床(北京北方同正生物技術(shù)發(fā)展有限公司),JY92-Ⅱ型超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)(寧波新芝科器研究所)。
1.4試驗(yàn)方法
1.4.1毛白楊PtoXTH35基因克隆與序列分析
通過在NCBI上查找得到毛果楊PtrXTH35基因序列信息,利用DNAMAN設(shè)計(jì)正向引物5′-ATGGCTGTTTCAGTCTTTAAG-3′和反向引物5′-CTAGTGGTGGCGGTGGCT-3′。以毛白楊的cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?5 ℃ 5 min,95 ℃ 45 s,55 ℃ 45 s,72 ℃ 1 min,30個循環(huán),72 ℃ 10 min。對PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,并利用DNA純化回收試劑盒進(jìn)行膠回收并送至北京睿博興科生物技術(shù)有限公司測序,將測序所得序列與毛果楊PtrXTH35序列進(jìn)行比對。
1.4.2原核表達(dá)載體的構(gòu)建
利用DNAMAN將測序得到的PtoXTH35的DNA序列翻譯為氨基酸序列并上傳至SignalIP和TMHMM 2.0在線軟件分析信號肽序列和跨膜區(qū),以去除信號肽的序列為模板設(shè)計(jì)引物,利用PCR方法為目的基因兩端加上酶切位點(diǎn),將PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,切膠回收后用相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切并回收目的片段,同時用相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶對質(zhì)粒載體pET28a、pET32a、pGEX-4t-1、pMAL-c5e、pET 43.1a進(jìn)行酶切回收,之后將酶切的載體和目的片段利用T4連接酶連接,將連接液經(jīng)CaCl2法轉(zhuǎn)化至JM109感受態(tài),待長出單克隆后搖菌提取質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定。載體構(gòu)建引物及酶切位點(diǎn)如表1所示。
1.4.3PtoXTH35蛋白原核表達(dá)
將構(gòu)建好的載體pET28a-PtoXTH35、pET32a-PtoXTH35、pGEX-4t1-PtoXTH35、pMAL-c5e-PtoXTH35、pET 43.1a-PtoXTH35轉(zhuǎn)化至E. coli BL21(DE3)感受態(tài)并用抗生素篩選陽性菌株,挑取陽性單克隆接種于5 mL含相應(yīng)抗生素的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min 振蕩培養(yǎng)12 h,之后將5 mL菌液接種于 100 mL 含相應(yīng)抗生素的LB培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)至 D600 nm=0.4左右,加入異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)至終濃度為0.4 mmol/L。 28 ℃誘導(dǎo)表達(dá)4 h,6 000 r/min 離心10 min收集菌體,加入4倍體積50 mmol/L Tris-HCl(pH值為8.0)緩沖液重懸,經(jīng)超聲破碎后 12 000 r/min 離心,取上清和沉淀加入等體積蛋白上樣緩沖液,沸水中煮5 min后離心取上清,采用十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)鑒定蛋白表達(dá)。
2結(jié)果與分析
2.1毛白楊PtoXTH35基因克隆與序列分析
經(jīng)PCR擴(kuò)增得到如圖1所示的DNA片段,測序獲得毛白楊PtoXTH35核酸序列,與毛果楊PtrXTH35序列比對相似度高達(dá)98.32%(圖2),證實(shí)該序列為毛白楊PtoXTH35基因片段,該序列全長888 bp,由269個氨基酸組成,所翻譯的蛋白質(zhì)分子量為33.69 ku,經(jīng)SignalIP和TMHMM 2.0在線軟件分析該蛋白N端存在跨膜區(qū)可能為信號肽序列,且推測信號肽裂解位點(diǎn)位于第25和第26個氨基酸之間(圖3、圖4)。
2.2原核表達(dá)載體的構(gòu)建
將5個載體的陽性質(zhì)粒經(jīng)雙酶切進(jìn)行驗(yàn)證,分別選用表碼和突變,可以用于下一步的誘導(dǎo)表達(dá)。
2.3PtoXTH35蛋白的原核誘導(dǎo)表達(dá)
將5種重組質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài),經(jīng)0.4 mmol/L IPTG誘導(dǎo)培養(yǎng)4 h后收集菌體,取全菌以及經(jīng)超聲破碎后的沉淀和上清液煮沸后經(jīng)12% SDA-PAGE檢測蛋白表達(dá),由于5種原核表達(dá)載體均攜帶了分子量不同的可溶性蛋白標(biāo)簽,因此所表達(dá)的融合蛋白分子量并不相同,根據(jù)計(jì)算獲得融合蛋白分子量的理論值,pET28a攜帶了1個 6×His標(biāo)簽,融合蛋白分子量約為32 ku;pET32a攜帶了1個19 ku的硫氧還蛋白(thioredoxin,Trx),融合蛋白分子量約為51 ku;pGEX-4t-1攜帶了1個27 ku的谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(glutathione S transferase,GST),融合蛋白分子量約為 59 ku;pMAL-c5e攜帶了1個40 ku的麥芽糖結(jié)合蛋白(maltose-binding protein,MBP),融合蛋白分子量約為72 ku;pET 43.1a攜帶了1個60 ku的轉(zhuǎn)錄終止抗終止因子(N-utilization substance,Nus),融合蛋白分子量約為92 ku。結(jié)果表明,經(jīng)IPTG誘導(dǎo),攜帶5種重組載體的大腸桿菌均成功表達(dá)了融合蛋白,并且分子量與理論分子量相符合(圖6)。但五種原核表達(dá)載體所表達(dá)蛋白的表達(dá)量以及可溶性表達(dá)情況并不相同,其中pET28a蛋白表達(dá)量最高,但蛋白幾乎全部以包涵體形式存在;pGEX-4t-1和pET32a蛋白表達(dá)量較低,并且所表達(dá)蛋白同樣以包涵體形式存在;而pMAL-c5e和pET 43.1a蛋白表達(dá)量較高,而可溶性蛋白含量與包涵體蛋白大致相同,因此可溶性蛋白達(dá)到了總表達(dá)蛋白的50%左右,實(shí)現(xiàn)了PtoXTH蛋白在原核表達(dá)系統(tǒng)中的高效可溶性表達(dá)。
3結(jié)論
XTH基因廣泛存在于植物中,在植物細(xì)胞壁修飾中發(fā)揮重要作用,其龐大的基因家族中存在眾多還未明確得到功能驗(yàn)證的成員,因此迫切需要對該家族中成員進(jìn)行體外和體內(nèi)功能驗(yàn)證,包括活性測定以及體外蛋白互作研究則須要獲得可溶性的目的蛋白?,F(xiàn)有報道XTH的原核表達(dá)往往會形成包涵體,大部分文獻(xiàn)中采用酵母表達(dá)的方法獲得XTH蛋白,但酵母表達(dá)方法耗時較長,并且純化步驟較為繁瑣,對表達(dá)條件也更為敏感,本研究更換了5種攜帶有不同可溶性標(biāo)簽的原核表達(dá)載體,通過嘗試發(fā)現(xiàn)攜帶有MBP蛋白的pMAL-c5e和攜帶有Nus因子的pET 43.1a均可實(shí)現(xiàn)PtoXTH35蛋白在原核表達(dá)系統(tǒng)中的高效可溶性表達(dá),與大部分文獻(xiàn)中[6-9]通過酵母表達(dá)獲得XTH蛋白的方法相比,縮短了試驗(yàn)周期,并且表達(dá)條件穩(wěn)定,純化步驟相較酵母表達(dá)也更為簡單,這為后續(xù)深入研究毛白楊PtoXTH35的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。
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