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入侵云南草地貪夜蛾的分子鑒定

2019-07-23 08:40:58張磊靳明輝張丹丹姜玉英劉杰吳孔明蕭玉濤
植物保護(hù) 2019年2期
關(guān)鍵詞:草地貪夜蛾亞群

張磊 靳明輝 張丹丹 姜玉英 劉杰 吳孔明 蕭玉濤

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摘要草地貪夜蛾Spodoptera frugiperda(J.E Smith)是一種原產(chǎn)于美洲熱帶和亞熱帶地區(qū)的重要農(nóng)業(yè)入侵害蟲,目前已從緬甸進(jìn)入我國云南西南部地區(qū),且呈現(xiàn)蔓延之勢。對入侵物種快速準(zhǔn)確鑒定是早期預(yù)警和監(jiān)測預(yù)防的關(guān)鍵。本研究采用分子標(biāo)記手段,對采自云南5個縣(市)的83份樣品進(jìn)行鑒定,通過PCR擴(kuò)增細(xì)胞色素C氧化酶第1亞基(COI)和磷酸甘油醛異構(gòu)酶(Tpi)兩個基因片段并進(jìn)行序列測定分析。結(jié)果表明,基于CA)I基因片段的序列比對能夠?qū)Σ莸刎澮苟赀M(jìn)行準(zhǔn)確的物種鑒定,并且能夠?qū)ζ浣捶N甜菜夜蛾等進(jìn)行鑒定。基于Ypi基因序列的特異單倍型位點(diǎn)比較分析,確認(rèn)入侵我國的草地貪夜蛾均為“玉米型”。該研究為草地貪夜蛾的快速識別提供了方法支持,同時為進(jìn)一步的蟲源地解析和遺傳溯源積累了寶貴的前期數(shù)據(jù)。

關(guān)鍵詞草地貪夜蛾;DNA條碼;單倍型;亞群

中圖分類號:S 435.132文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A DOI:10.16688/j.zwbh.2019121

草地貪夜蛾Spodoptera frugiperda,也稱秋黏蟲,具有雜食性、遷飛性、暴發(fā)性的特點(diǎn)。該蟲廣泛分布于美洲大陸,雖然在熱帶和亞熱帶地區(qū)以外區(qū)域不能越冬存活,由于其遠(yuǎn)距離遷飛能力,在溫度適中的夏季和秋季,其危害范圍能夠向北延伸至加拿大。隨著全球經(jīng)濟(jì)一體化的發(fā)展,國際交流和進(jìn)出口貿(mào)易成為生物入侵的一個主要通道。草地貪夜蛾于2016年在非洲首次被發(fā)現(xiàn),兩年時問內(nèi)迅速擴(kuò)散至撒哈拉以南幾乎44個國家,造成嚴(yán)重的玉米減產(chǎn)。2018年5月草地貪夜蛾首次確認(rèn)侵入印度,2018年底已經(jīng)在緬甸形成蟲源基地,并通過中緬邊境零星進(jìn)入我國云南境內(nèi),嚴(yán)重威脅我國的糧食作物安全生產(chǎn)。

準(zhǔn)確迅速地進(jìn)行物種識別,是外來入侵生物綜合防控的關(guān)鍵技術(shù)。夜蛾科灰翅夜蛾屬Spodoptera包含有多種重要農(nóng)業(yè)害蟲,包括常見的甜菜夜蛾S ex-igua和斜紋夜蛾S.litura等,均具有雜食性、分布廣泛等特點(diǎn),由于形態(tài)特征相近,僅從外形難以區(qū)分,給傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定帶來一定的挑戰(zhàn),且傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)鑒定方法受到蟲態(tài)、亞群、單倍型等影響,很容易與其他近緣物種混淆,急需開發(fā)分子手段,補(bǔ)充形態(tài)學(xué)鑒定的局限性,達(dá)到快速準(zhǔn)確鑒定的目的。

當(dāng)前針對草地貪夜蛾分子鑒定的主要標(biāo)記有擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(amplified fragment length poly-morphisms,AFLP)、線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基工基因(cytochrome c oxidase subunit I COD。以及位于Z染色體上的磷酸甘油醛異構(gòu)酶基因(tri-ose-phosphate isomerase,Zpi)。其中基于線粒體OOI基因的序列分析是目前最常用也是最有效的分子條碼,基于個別SNP位點(diǎn)的比對還能夠達(dá)到鑒別草地貪夜蛾不同亞型的目的。研究顯示草地貪夜蛾雌性“水稻型”和雄性“米型”存在一定比例的雜交,由于線粒體母系遺傳的特征,因此往往容易造成分子鑒定結(jié)果的不一致。除CO工基因外,位于Z染色體的rpi基因也是草地貪夜蛾鑒定的標(biāo)記基因,該標(biāo)記由于位于核基因組,與寄主植物相關(guān)性更強(qiáng),且在不同亞型鑒定上顯示出比線粒體標(biāo)記更加準(zhǔn)確的特性。將兩種標(biāo)記鑒定方法有機(jī)結(jié)合,互為補(bǔ)充,互相驗(yàn)證,可保證鑒定結(jié)果更加可靠。

本研究利用COI和Tpi兩個基因片段對入侵我國的草地貪夜蛾進(jìn)行分子鑒定,探究該物種的快速識別技術(shù),對于進(jìn)一步明確其蟲源信息及其發(fā)生特征和暴發(fā)規(guī)律,以及指導(dǎo)草地貪夜蛾的監(jiān)測預(yù)警和早期控制具有重大意義。

1材料與方法

1.1試驗(yàn)材料

本次研究的樣品一共有83份,采集地點(diǎn)包括云南省德宏州的瑞麗市、芒市、隴川縣、盈江縣和普洱市江城縣等5個縣(市),寄主均為苗期至抽雄初期的冬玉米,每個地點(diǎn)樣品數(shù)2份至35份不等,所有樣品均為幼蟲。樣品采集后放入泡沫箱,活體常溫運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室,采用新鮮玉米葉片喂養(yǎng),具體樣品信息見表1。

1.2DNA提取及PCR擴(kuò)增

樣品DNA提取采用Muifisource Genomic DNAMiniprep Kit試劑盒,單頭蟲體用液氮研磨后,按照說明書進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)操作,純化的DNA經(jīng)過1%瓊脂糖電泳檢測,使用NanoDrop ND-2000儀器測定濃度,用作PCR擴(kuò)增模板。

分別對CO工基因和gpi基因片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,引物序列見表2,采用全式金2×EasyTQq酶進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)體系如下(50uL):DNA模板5uL,正反向引物各1.5uL,2×EasyTaq mix25uL,dd H217uL。PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5min,34個循環(huán),每個循環(huán)94℃變性30S,60℃退火30S,72℃延伸1min,72℃延伸10min。

PCR擴(kuò)增結(jié)束后,使用1%瓊脂糖電泳檢測擴(kuò)增結(jié)果,選取與目標(biāo)片段長度一致的單一片段PCR產(chǎn)物送生工生物工程(3a海)股份有限公司切膠測序,測序引物采用各自片段PCR擴(kuò)增引物。

1.3數(shù)據(jù)分析

利用SeqMan和BioEdit軟件對正反向測序序列進(jìn)行人工拼接及峰圖校正,獲得準(zhǔn)確的CO工和Zpi基因片段序列。同時從GenBank數(shù)據(jù)庫下載已經(jīng)發(fā)布的草地貪夜蛾對應(yīng)基因序列以及Spo-doptera屬近緣物種的對應(yīng)基因序列,去除低質(zhì)量序列,所有核酸序列采用MEGA5.0軟件進(jìn)行比對,截去兩端多余的序列,選取Kimura-2參數(shù)模型,依據(jù)鄰接法(neighbor joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,系統(tǒng)樹各分支的自舉檢驗(yàn)值(bootstrap)1000次重復(fù)檢驗(yàn)。針對已經(jīng)報(bào)道的基于Tpi基因序列的“玉米型”和“水稻型”單倍型特點(diǎn),運(yùn)用DNAMAN軟件進(jìn)行特異位點(diǎn)差異比對,以此確認(rèn)本研究草地貪夜蛾具體的亞型。

2結(jié)果與分析

通過PCR擴(kuò)增,CO工引物及gpi引物在所有83份樣品中均得到很好的擴(kuò)增效果,條帶單一整齊,其中COI基因片段長度約800bp,Ypi基因片段長度約400bp,均與預(yù)期片段大小一致(圖1)。該結(jié)果表明兩種基因片段均適合作為草地貪夜蛾分子鑒定的DNA條碼,引物顯示出很強(qiáng)的種屬擴(kuò)增特異性。

通過序列測定和峰圖校正分析,得到了所有83份樣品準(zhǔn)確的CO工基因片段和Tpi基因片段序列,其中COI片段長度均為789bp,除了采自芒市的1號樣品之外,其余82份樣品的COI序列完全一致。Tpi片段長度為386~388bp,其中芒市的1號樣品序列長度為388bp,其余82份樣品的序列長度均為386bp且序列完全一致。序列比對結(jié)果顯示芒市1號樣品與其余樣品的CO工序列相似度為92.9%,ypi序列相似度僅為83.76%,表明芒市1號樣品極有可能為不同的物種,而其余82份樣品為同一物種。

根據(jù)本研究測定的CO工序列及GenBank數(shù)據(jù)庫中下載的18條Spodoptera屬近緣物種COI序列,以棉鈴蟲Helicoverpa armigera COI序列作為外群,采用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2),由于本研究中有82份樣品序列完全一致,僅選取瑞麗1號樣品作為代表。

從系統(tǒng)樹可以看出,COI基因片段能夠?qū)podoptera屬不同個體按照各自所屬的物種明顯地區(qū)分開來,來自同一物種的不同個體均優(yōu)先聚在一起,且各分支均具有較高的支持率。其中采自云南的樣品與之前研究發(fā)表的草地貪夜蛾聚為一支,表明云南的所有82份樣品均為草地貪夜蛾,而采自芒市的1號樣品與甜菜夜蛾聚為一支,可將芒市1號樣品鑒定為甜菜夜蛾。且從系統(tǒng)進(jìn)化樹可以看出,草地貪夜蛾與S.d0lichos和S.pulchella顯示出更近的親緣關(guān)系。

將本研究測定的草地貪夜蛾Tpi基因序列與之前研究發(fā)表的兩種亞型對應(yīng)的Tpi基因序列進(jìn)行單倍型比對分析,結(jié)果顯示在能夠區(qū)分“水稻型”和“玉米型”的10個多態(tài)性單倍型中,云南樣品在所有10個位點(diǎn)與“玉米型”單倍型完全一致(圖3),證明所鑒定的82份草地貪夜蛾樣品均為“玉米型”。鑒于本研究采樣地點(diǎn)全部來自玉米種植區(qū),因此更加確認(rèn)早期入侵我國的草地貪夜蛾屬于“玉米型”。

3討論

草地貪夜蛾作為一種入侵性極強(qiáng)的毀滅性害蟲,其入侵風(fēng)險評估、快速識別技術(shù)和監(jiān)測預(yù)防工作顯得尤為重要。當(dāng)前,由草地貪夜蛾的快速擴(kuò)散和嚴(yán)重為害引發(fā)全球關(guān)注,多國已經(jīng)啟動應(yīng)急處置預(yù)案,聯(lián)合制定綜合治理方案,歐洲已將其作為檢疫害蟲。由于我國并沒有草地貪夜蛾本地種,此次草地貪夜蛾從緬甸入侵我國,如不引起足夠重視,一旦全面暴發(fā),后果將難以控制,給我國農(nóng)業(yè)發(fā)展帶來嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。

草地貪夜蛾在原產(chǎn)地美洲長期進(jìn)化過程中分化成兩種生態(tài)型,根據(jù)取食寄主植物的不同分為“玉米型”和“水稻型”,前者主要取食玉米和高梁,后者主要取食水稻和狗牙根等草坪草。這兩種生態(tài)型在雌性性信息素成分、交配行為等生理學(xué)方面具有較為明顯的差異,然而兩種亞型之問并沒有絕對的生殖隔離,有報(bào)道顯示兩種亞型之問存在一定比例的雜交,給基于生理學(xué)差異和基于寄主選擇性的表型鑒定帶來更多的不確定性,并且兩種亞型在外部形態(tài)特征上基本一致,無法進(jìn)行有效的形態(tài)學(xué)區(qū)分,目前開發(fā)分子標(biāo)記是對兩種亞型進(jìn)行區(qū)分的最有效手段。除此之外,草地貪夜蛾在低齡幼蟲期以及卵階段難以與其他近緣物種進(jìn)行區(qū)分,也需要借助分子手段的輔助鑒定。對入侵害蟲進(jìn)行快速準(zhǔn)確的鑒定分型,明確其為害特征,有助于提前科學(xué)布局和開展針對性的防控措施,減少農(nóng)林經(jīng)濟(jì)損失,因此,開展基于分子輔助手段的鑒定工作很有必要且意義重大。

本研究采用分子標(biāo)記手段,對入侵我國的草地貪夜蛾進(jìn)行了準(zhǔn)確的物種鑒定。所選取的兩個片段在所有樣品均得到較好的擴(kuò)增,表明兩種標(biāo)記都能夠達(dá)到對該物種進(jìn)行快速鑒定的目的。同時,本研究采用的引物通用性強(qiáng),對甜菜夜蛾DNA也能進(jìn)行有效擴(kuò)增,可以應(yīng)用于Spodo ptera屬近緣物種的分子鑒定。且進(jìn)一步通過Tpi基因序列特異位點(diǎn)單倍型分析,確認(rèn)入侵我國的草地貪夜蛾為“玉米型”。由于本次研究的82份草地貪夜蛾樣品COI和Tpi兩個基因片段序列完全一致,推測入侵云南5個縣(市)的草地貪夜蛾均來自同一蟲源地,或侵入中國之后進(jìn)行的擴(kuò)散。

作為一種國際性重大遷飛農(nóng)業(yè)害蟲,當(dāng)前針對草地貪夜蛾的研究日益增多,采用COI和TPI等分子條碼能夠有效地對草地貪夜蛾進(jìn)行物種鑒定,很容易與其他物種進(jìn)行區(qū)分。但是,對于“玉米型”和“水稻型”的區(qū)分依然是研究的難點(diǎn),當(dāng)前也僅僅是依靠個別基因有限SNP位點(diǎn)的單倍型進(jìn)行鑒定,由于草地貪夜蛾遷飛性強(qiáng)且分布廣泛,候選基因往往變異速率快,不少研究表明在相關(guān)位點(diǎn)出現(xiàn)雜合的現(xiàn)象,給鑒定分型帶來困擾。一直以來針對兩種亞型分析的方法也不斷改進(jìn),對鑒定的準(zhǔn)確性要求不斷提高,然而,依然需要開發(fā)更多與取食寄主關(guān)聯(lián)的遺傳標(biāo)記位點(diǎn),達(dá)到鑒定的系統(tǒng)性和多重驗(yàn)證。盡管目前兩種亞型的基因組數(shù)據(jù)已經(jīng)發(fā)布,然而關(guān)于兩者取食不同寄主直接的基因和相關(guān)機(jī)制并未闡明,因此僅能通過與表型性狀關(guān)聯(lián)的分子特征進(jìn)行亞型區(qū)分。

兩種不同亞型的草地貪夜蛾往往同時發(fā)生,目前非洲已經(jīng)有兩種亞型的定殖為害。本研究雖然鑒定入侵我國云南地區(qū)的草地貪夜蛾均為“玉米型”,但是由于取樣地點(diǎn)和取樣數(shù)目的局限性,并不能完全排除“水稻型”草地貪夜蛾已經(jīng)侵入我國,需要做好更大范圍的監(jiān)測和調(diào)查。此外,關(guān)于本次研究的草地貪夜蛾的最初來源仍需要進(jìn)一步確認(rèn),通過序列比對構(gòu)建系統(tǒng)樹從而分析源頭的方法已證實(shí)可行。由于緬甸以及中國并沒有草地貪夜蛾本地種,需要深入厘清其來源,從源頭進(jìn)行控制和管理,明確草地貪夜蛾發(fā)生動態(tài)規(guī)律,為指導(dǎo)草地貪夜蛾的科學(xué)防控提供更加可靠的信息。

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