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甘肅東部地區(qū)羊接觸傳染性膿包皮炎PCR方法的檢測和應(yīng)用

2019-07-20 08:11:46豆思遠任章章
甘肅畜牧獸醫(yī) 2019年6期
關(guān)鍵詞:膿包環(huán)縣慶陽市

張 莉,豆思遠*,任章章

(1.甘肅省動物疫病預防控制中心,甘肅 蘭州 730046;2.隴南市動物疫病預防控制中心,甘肅 隴南 742500)

羊接觸傳染性膿包皮炎是由傳染性膿皰病毒(Orf virus,ORFV)感染綿羊、山羊引起的一種急性、高度接觸性的人畜共患病[1]。主要特征是唇、鼻、眼瞼、乳房、四肢皮膚及口腔黏膜出現(xiàn)丘疹、水皰、膿皰和痂皮等[2]。該病多發(fā)生在一歲以內(nèi)的羔羊,其中3~6月齡羔羊是最易感。ORFV抵抗力十分頑強,可持續(xù)多年對羊群造成危害[3],已是影響我國乃至世界公共安全衛(wèi)生的一個重要隱患。ORF在世界各地羊群頻繁發(fā)生且常呈群發(fā)性流行[4]。

20世紀70年代國內(nèi)外就開始ORFV分子生物學研究,自2004年Delhon揭開ORFV全基因組研究序幕[5],2006年Mercer揭示ORFV基因組兩末端區(qū)部分反向重復序列存在高度變異性[6]。隨著研究深入,ORFV基因組結(jié)構(gòu)、特性及其功能因子等逐步得到明確。本研究針對ORFV全基因序列中較保守的B2L設(shè)計引物,建立PCR診斷方法。為確定建立的PCR診斷技術(shù)檢測羊接觸傳染性膿包皮炎病毒(ORFV)基因的準確性,本研究對甘肅省平?jīng)鍪腥A亭縣、慶陽市環(huán)縣和鎮(zhèn)原縣、慶陽市和張掖市肅南裕固族自治縣的臨床樣品進行檢測,旨在確定該診斷技術(shù)在臨床快速檢測的可行性。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 臨床樣品 血樣采自甘肅省平?jīng)鍪腥A亭縣、慶陽市環(huán)縣和鎮(zhèn)原縣、慶陽市和張掖市肅南裕固族自治縣的養(yǎng)殖場和散養(yǎng)戶。每只羊經(jīng)頸靜脈無菌法采取新鮮血液8 ml,按1:5抗凝劑與血液體積比加入ACD(100 ml抗凝劑中含檸檬酸0.48 g,檸檬酸三鈉1.32 g,葡萄糖1.47 g)抗凝。所有血液樣品分裝并保存于-70℃。

1.1.2 主要試劑 PCR試劑(Taq DNA聚合酶、PCR反應(yīng)緩沖液、dNTP),DNA Marker、瓊脂糖等均購自寶生物工程(大連)有限公司;ddH2O(雙蒸水,Distillation-Distillation H2O),70%乙醇,異丙醇溶液(-20℃預冷),6mol/LNaI溶液,氯仿-異戊醇(24:1)溶液,醋酸鈉溶液(3mol/L)等均為為國產(chǎn)分析純試劑。

1.1.3 主要儀器與設(shè)備 TGL-18B-C離心機(上海安亭科學儀器廠),TC-700 PCR儀(Funglyn Biotech Inc生產(chǎn),上海楓嶺生物技術(shù)有限公司供貨),凝膠成像系統(tǒng)-TC-240(上海天呈科技有限公司)。

1.2 方法

1.2.1 羊基因組DNA提取 嚴格按照NaI法提取靜脈抗凝血ORF病毒DNA[7],提取羊基因組DNA后經(jīng)8g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測,并將基因組冷凍保存。

1.2.2 引物設(shè)計與合成 參照GenBank收錄的羊序列(B2L)設(shè)計引物,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成[8]。

引物序列如下:

上游引物:5′-CACGGCCACGAACTTCCACCTCAA-3′

下游引物:5′-TCCCGCTCGAAGACCGCAGACAG-3′

反應(yīng)體系如下(表1):

表1 ORFV基因的擴增體系

1.2.3 PCR擴增

離心混勻后置PCR擴增儀中進行擴增,PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)15g/L瓊脂糖凝膠檢測。擴增程序如下(表2):8.0 ml PCR擴增產(chǎn)物與2.0 ml上樣緩沖液離心混勻后,經(jīng)15g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測。

2 結(jié)果與分析

2.1 基因組DNA的提取

經(jīng)8 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測,其完整性良好,證明從羊全血中獲得基因組DNA。

2.2 ORFV基因的擴增

PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)15 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測,ORFV基因的擴增產(chǎn)物在540 bp的位置出現(xiàn)特異條帶,條帶清晰,表明成功獲得目的DNA片段。

2.3 PCR檢測ORFV的結(jié)果

表3統(tǒng)計結(jié)果中,四個縣的羊接觸傳染性膿包皮炎陽性檢出率分別為23.74%、14.56%、41.06%、9.78%。

環(huán)縣羊接觸傳染性膿皰皮炎檢測陽性率逐年降低,由34.78%降至15.02%。

3 討論

從表3的統(tǒng)計結(jié)果可見,四個縣的的羊接觸傳染性膿包皮炎陽性檢出率從9.78%~41.06%,差別很大,從一定程度了反映了該病在不同地區(qū)流行和發(fā)病的高低。鎮(zhèn)原縣和華亭縣較低,反映了這兩個縣近些年肉羊養(yǎng)殖規(guī)模化程度高,羊只流通監(jiān)管力度強有關(guān);肅南縣血液采集自傳統(tǒng)牧區(qū)皇城鎮(zhèn),羊只飼養(yǎng)量大,流通頻繁,23.74%的陽性檢出率也和近年羊接觸傳染性膿包皮炎發(fā)病情況一致;環(huán)縣近幾年大力開展肉用羊只和絨山羊養(yǎng)殖,同時在進行灘羊改良,新建羊場、羊群較多,引種、流通頻繁,這些因素都能加速該病擴散,使當?shù)仃栃詸z出率高。

表2 ORFV基因的擴增程序

表3 2013年ORFV檢測陽性率

這四個縣的羊只飼養(yǎng)量大、分布廣,血樣采集的隨機性很大,加之血樣采集時間的不同,都可能使測定數(shù)據(jù)有偏差,這需要增加血樣采集區(qū)域、提高采集頻率,來提高實驗數(shù)據(jù)精準性。

從表4可見,隨著近年來防控和治療方法的普及,環(huán)縣羊接觸傳染性膿皰皮炎檢測陽性率逐年降低,一方面是養(yǎng)殖戶在日常管理、圈舍消毒、病羊隔離、糞便無毒處理和科學化引種、配種方面防病意識加強,另一方面是結(jié)合PCR診斷檢測結(jié)果,對羊接觸傳染性膿皰皮炎陽性率高的羊場重點開展治理,如建立檔案進行羊只追蹤、限制活羊流通等手段,從源頭上控制了該病傳播、擴散。

表4 2014-2016年ORFV檢測陽性率

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