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反芻動(dòng)物POU1F1基因多態(tài)性與經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)聯(lián)研究進(jìn)展

2019-05-27 11:16張陽海潘傳英雷初朝藍(lán)賢勇
中國牛業(yè)科學(xué) 2019年2期
關(guān)鍵詞:內(nèi)含子反芻動(dòng)物外顯子

楊 韓, 張陽海, 潘傳英, 雷初朝, 陳 宏, 藍(lán)賢勇

(西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,陜西 楊凌 712100)

垂體特異性轉(zhuǎn)錄因子(pituitary specific transcription factor,POU1F1,又叫PIT-1或GHF-1)是POU(Pit-Oct-Unc)家族成員之一,在垂體前葉特異性表達(dá),是重要的組織特異性轉(zhuǎn)錄因子[1]。POU1F1具有高度保守的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,通過識別并結(jié)合催乳素(prolactin,PRL)、生長激素(growth hormone,GH)和促甲狀腺素β亞基(thyroid-stimulating hormone beta subunit,TSHβ)基因啟動(dòng)子中特異的DNA序列,對這些基因起正向調(diào)控作用,從而對哺乳動(dòng)物生長發(fā)育等方面起著重要作用[2]。研究表明,POU1F1基因突變會導(dǎo)致垂體發(fā)育不全,造成動(dòng)物體內(nèi)PRL、GH、TSH激素的缺乏,從而阻礙動(dòng)物生長發(fā)育。在小鼠上,POU1F1基因突變導(dǎo)致Snell矮小型(dw)和Jackson矮小型(dw-J)出現(xiàn)[3];同時(shí),人POU1F1基因突變會導(dǎo)致聯(lián)合性垂體激素缺乏癥(combined pituitary hormone deficiency,CPHD),患者發(fā)育遲緩,生長出現(xiàn)明顯障礙[4]。

此外,有大量研究報(bào)道了POU1F1基因多態(tài)性與牛、山羊、綿羊等反芻動(dòng)物的生長性狀之間存在顯著關(guān)聯(lián)[5-7]。以上研究表明POU1F1基因?qū)τ诜雌c動(dòng)物生長、繁殖及泌乳等具有重要的調(diào)節(jié)作用,據(jù)此,本文主要就牛羊等反芻動(dòng)物POU1F1基因結(jié)構(gòu)及生物學(xué)特性、基因多態(tài)性及其與經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)聯(lián)研究等進(jìn)行綜述。

1 反芻動(dòng)物POU1F1基因的結(jié)構(gòu)特征及其生物學(xué)特性

牛、綿羊和山羊POU1F1基因均定位于1號染色體的q21-22區(qū)[8]。該基因結(jié)構(gòu)高度保守,一般由6個(gè)外顯子,5個(gè)內(nèi)含子及其他相關(guān)DNA元件組成(圖1)。POU1F1基因表達(dá)于動(dòng)物的垂體前葉細(xì)胞,其表達(dá)產(chǎn)物POU1F1蛋白包含3個(gè)重要的功能區(qū),其一是含129個(gè)氨基酸的N端區(qū),其二是含142個(gè)氨基酸的POU蛋白區(qū),其三為含20個(gè)氨基酸的C端區(qū);其中POU結(jié)構(gòu)域的主要功能是識別DNA特異順序,并與之呈高親和力結(jié)合,從而啟動(dòng)靶基因轉(zhuǎn)錄,該區(qū)又可分為POU同源區(qū)(POU-homeo domain,POU-HD)及POU特異區(qū)(POU-specific domain,POU-SD)兩部分[9]。

POU1F1是垂體生長激素(GH)細(xì)胞,催乳素(PRL)細(xì)胞以及促甲狀腺素(TSH)細(xì)胞內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄的重要調(diào)節(jié)者,能特異地識別基因上的DNA序列,并與之結(jié)合,進(jìn)而影響相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄,最終影響家畜生長、繁殖及泌乳等各個(gè)方面。據(jù)此,該基因的多態(tài)性及其在家畜育種工作上應(yīng)用研究成為國內(nèi)外諸多學(xué)者研究重點(diǎn)。國內(nèi)外研究表明,POU1F1基因多態(tài)性對牛的體重、產(chǎn)奶量等生產(chǎn)性狀有顯著影響[10-11],對羊的產(chǎn)羔數(shù)、體重、產(chǎn)奶量、產(chǎn)絨量等性狀有顯著影響[12-15]。因此,對POU1F1基因調(diào)控機(jī)制的深入研究對于提高牛羊等反芻動(dòng)物生產(chǎn)成績至關(guān)重要。

圖1 反芻動(dòng)物POU1F1基因結(jié)構(gòu)特征及其生物學(xué)特性示意圖

2 反芻動(dòng)物POU1F1基因多態(tài)性研究進(jìn)展

2.1 牛POU1F1基因多態(tài)性與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究

此前國內(nèi)外許多學(xué)者以POU1F1基因作為牛生產(chǎn)性狀選育改良的候選基因之一,圍繞基因多態(tài)位點(diǎn)與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)系開展了大量研究。20世紀(jì)90年代,國外最先開始對牛POU1F1基因多態(tài)性進(jìn)行挖掘。1994年,Woollard等[16]首次報(bào)道牛POU1F1基因第6外顯子遺傳變異位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)了可被HinfI內(nèi)切酶識別的SNP位點(diǎn)。2000年,Woollard等[8]進(jìn)一步將牛POU1F1基因定位于lq21-22區(qū)域,為進(jìn)一步探究該基因?qū)εIa(chǎn)性狀的影響打下基礎(chǔ)。最近于2018年,Pytlewski等[17]在Holstein-Friesian牛POU1F1基因第6外顯子上掃描到1個(gè)SNP位點(diǎn)(c.1178G>A),統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果表明該位點(diǎn)與體重、初配年齡、產(chǎn)后休息期、受胎率、產(chǎn)犢后奶牛體重、初生重等顯著相關(guān)(P<0.05)。同年,Thuy等[18]在Holstein-Friesian牛第2外顯子和第3外顯子上分別檢測到SNP位點(diǎn)c.545G>A和c.577A>C;相關(guān)性分析表明,c.545G>A位點(diǎn)與產(chǎn)奶量顯著相關(guān)(P<0.05),而c.577A>C位點(diǎn)則不存在相關(guān)性(P>0.05)。目前為止,關(guān)于POU1F1基因的研究在牛上做了包括Fleckvieh牛、Montbeliarde牛、南陽牛、秦川牛、郟縣紅牛、中國荷斯坦牛、魯西牛、安格斯牛、晉南牛、固原牛、Holstein-Friesian牛、Nellore牛、Hanwoo牛、Canchim牛、Zebuine牛、皮埃蒙特牛、新疆褐牛、申扎、類烏奇、斯布、帕里共21個(gè)品種,共檢測了10個(gè)SNP位點(diǎn)與牛的體重、體高、體長、體斜長、胸圍、腹圍、產(chǎn)奶量、乳蛋白含量、乳脂含量、生產(chǎn)壽命、背膘厚、初生重、斷奶前平均日增重、料肉比、胸深、胸寬、初配年齡、產(chǎn)后休息期、受胎率、產(chǎn)犢后母牛體重等20個(gè)性狀相關(guān)聯(lián),其中大部分研究集中于POU1F1基因第6外顯子區(qū)域多態(tài)性(表1)。根據(jù)現(xiàn)有研究,發(fā)現(xiàn)位于第6外顯子上的HinfI位點(diǎn)在各個(gè)品種牛的基因組上均廣泛存在,且與多個(gè)生長性狀及泌乳性狀相關(guān)聯(lián),提示該位點(diǎn)可作為潛在的分子標(biāo)記進(jìn)行優(yōu)良牛種選育。另外,目前的研究多集中于奶牛、黃牛等常見牛種上,而屬于青藏高原及其毗鄰高寒牧區(qū)特有的牦牛上研究卻較少。作為高寒地區(qū)重要的品種,應(yīng)加強(qiáng)對POU1F1基因多態(tài)性的研究,對提高牦牛的生產(chǎn)性能具有重要意義。

2.2 山羊POU1F1基因遺傳變異與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究

2000年,Woollard等[8]將山羊POU1F1基因定位于1q21-22區(qū)域。在此基礎(chǔ)上,國內(nèi)最先就山羊POU1F1基因多態(tài)性及其與生產(chǎn)性狀的關(guān)系開展了大量研究,而國外對此鮮有報(bào)道。2007年,Lan等[12-13,32-33]首次報(bào)道山羊POU1F1基因外顯子6及其3′-UTR區(qū)域多態(tài)性(AluI、PstI和DdeI位點(diǎn))對產(chǎn)奶量、產(chǎn)羔數(shù)和產(chǎn)絨性狀等生產(chǎn)性狀的影響。2009年,Lan等[34]對內(nèi)蒙古白絨山羊群體中POU1F1基因上未報(bào)道的外顯子1~5和5′UTR區(qū)域的遺傳變異情況進(jìn)行了篩選,共發(fā)現(xiàn)12個(gè)SNP位點(diǎn)(表2);進(jìn)一步分析表明,這些多態(tài)位點(diǎn)對產(chǎn)絨量和羊絨纖維長度有顯著的影響。2012年,F(xiàn)eng等[7]在5個(gè)中國本地山羊品種上檢測到6個(gè)突變,包括第3外顯子C256T、第3內(nèi)含子C53T和T123G,第6外顯子G682T(A228S)、T723G和C837T,分析結(jié)果初步表明濟(jì)寧灰山羊POU1F1基因C256T和G682T位點(diǎn)的T等位基因與高產(chǎn)羔數(shù)之間存在顯著關(guān)聯(lián)。最近,Zhu等[15]在陜北白絨山羊中檢測了4個(gè)SNP位點(diǎn),其中c.682G>T、c.723T>G和c.837T>C位于POU1F1基因第6外顯子,均表現(xiàn)為3種基因型;而定位于3′-UTR區(qū)域的c.876+110T>C在該群體中未分型;進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),c.682G>T和c.837T>C位點(diǎn)與產(chǎn)羔數(shù)顯著相關(guān)(P<0.05),c.682G>T、c.723T>G和c.837T>C位點(diǎn)對生長性狀有顯著影響(P<0.05);雙倍型分析表明,不同的雙倍型和產(chǎn)羔數(shù)及生長性狀之間存在強(qiáng)相關(guān)性,且具有H3H7雙倍型(GTTT-TTTT)的雌性山羊比其他雙倍型個(gè)體擁有更多的產(chǎn)羔數(shù)和更優(yōu)的生長狀況(P<0.05)。截至目前,關(guān)于山羊POU1F1基因多態(tài)性研究主要集中于內(nèi)蒙古白絨山羊、濟(jì)寧灰山羊、貴州白山羊等15個(gè)中國本地山羊品種,共檢測到25個(gè)SNP位點(diǎn),與絨、肉、奶等13種生產(chǎn)性狀顯著相關(guān)(表2)。

表1 牛POU1F1基因單核苷酸多態(tài)性匯總

注:E為外顯子(exon);I為內(nèi)含子(intron)。下同。

表2 山羊POU1F1基因單核苷酸多態(tài)性匯總

表3 綿羊POU1F1基因單核苷酸多態(tài)性匯總

2.3 綿羊POU1F1基因遺傳變異與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究

在綿羊上,國內(nèi)外關(guān)于POU1F1基因遺傳變異的研究工作較少。2006年,Bastos等[37]首次報(bào)道了綿羊POU1F1基因的結(jié)構(gòu),包含6個(gè)外顯子和5個(gè)內(nèi)含子,長度為5 787 bp;同時(shí)發(fā)現(xiàn)了葡萄牙本地綿羊POU1F1基因第2、3外顯子上存在三處錯(cuò)義突變,這些突變可能改變POU1F1蛋白的結(jié)構(gòu)和活性;同時(shí),在第4內(nèi)含子上也發(fā)現(xiàn)存在一處突變,但未在外顯子1、4和6中檢測到突變。2017年,趙憲林等[6]在藏羊POU1F1基因第4內(nèi)含子上檢測到1個(gè)SNP位點(diǎn)(g.14205G>A),在第5內(nèi)含子上檢測出2個(gè)SNP位點(diǎn)(g.15223G>A和g.15286A>G);關(guān)聯(lián)性分析表明,g.14205G>A位點(diǎn)與藏羊體質(zhì)量和體長顯著相關(guān)(P<0.05),AA基因型個(gè)體為優(yōu)勢個(gè)體;g.15223G>A位點(diǎn)與藏羊體質(zhì)量顯著相關(guān)(P<0.05),GG基因型為優(yōu)勢基因型;g.15286A>G位點(diǎn)與藏羊體質(zhì)量和體高顯著相關(guān)(P<0.05),AA基因型個(gè)體為優(yōu)勢個(gè)體。從2006年第1篇報(bào)道到現(xiàn)在為止,關(guān)于綿羊POU1F1基因的研究僅對包括Churra da Terra Quente綿羊(葡萄牙)、Zel綿羊(伊朗)、Lori-Bakhtiari綿羊(伊朗)、Sakiz(土耳其)、White Karaman(土耳其)、Awassi綿羊(土耳其)、Sarda綿羊(撒丁島)、藏羊在內(nèi)的8個(gè)綿羊品種進(jìn)行了檢測,發(fā)現(xiàn)了17個(gè)SNP位點(diǎn),其與斷奶重、產(chǎn)奶量、乳糖含量、體重、體長、體高等生產(chǎn)性狀顯著相關(guān)(表3)。這些結(jié)果表明綿羊POU1F1基因上存在較為豐富的多態(tài)性,應(yīng)當(dāng)大力發(fā)掘,以期尋找與綿羊優(yōu)良生產(chǎn)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,為綿羊的選育改良提供基礎(chǔ)。

3 其他家畜POU1F1基因遺傳變異與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究

鑒于POU1F1基因?qū)?dòng)物生長發(fā)育起著十分重要的作用,除了對牛、山羊、綿羊等反芻動(dòng)物POU1F1基因多態(tài)性進(jìn)行研究以外,在豬、馬等家畜及家禽上也開展了大量研究。2011年,宋成義等[40]在豬POU1F1基因的1.5 kb啟動(dòng)子區(qū)域發(fā)現(xiàn)了5個(gè)突變位點(diǎn),其中5 bp插入/缺失突變A等位基因(128 bp/42 bp)的頻率在引入品種豬中最高,在培育品種蘇姜豬中處于中等,而在中國地方品種最低;進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)該突變與豬6月齡的體高、體長、胸圍和體重等生長性狀顯著相關(guān)(P<0.05)。2013年,Yan等[41]在POU1F1基因中檢測到1個(gè)SNP位點(diǎn)(NC_006088.2:g.3109G>A),相關(guān)性分析表明該位點(diǎn)的GA基因型個(gè)體在16周時(shí)體重較大,300日齡時(shí)所產(chǎn)生的卵子數(shù)較多(P<0.05)。2017年,于農(nóng)淇等[42]發(fā)現(xiàn)伊犁馬POU1F1基因內(nèi)含子區(qū)的SNP(g.2758G>A)與日均母馬產(chǎn)奶量差異不顯著(P>0.05)。2018年,徐瓏洋等[43]在藏雞、滬寧雞POU1F1基因的外顯子2上發(fā)現(xiàn)1個(gè)多態(tài)位點(diǎn)(C/T),其中C等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因,而CT基因型是控制瀘寧雞早期生長速度的優(yōu)勢基因型,因此該位點(diǎn)可以作為影響雞早期生長速度的1個(gè)潛在分子標(biāo)記進(jìn)行選育。

4 展 望

POU1F1基因被認(rèn)為是神經(jīng)—內(nèi)分泌—生長軸的重要成員之一,其通過調(diào)控TSH、PRL、GH基因表達(dá)及垂體細(xì)胞的分化,對動(dòng)物生長發(fā)育及繁殖等起重要調(diào)節(jié)作用。目前,國內(nèi)外對牛和山羊,以及豬、家禽等家養(yǎng)動(dòng)物POU1F1基因及其對生長發(fā)育的影響的相關(guān)研究越來越多,但對綿羊和牦牛的關(guān)注度有所不足,遺傳效應(yīng)研究較少。綜上所述,對反芻動(dòng)物POU1F1基因的深入研究,對畜禽的選育改良具有很重要的理論價(jià)值和實(shí)際意義。

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