李慶偉,宗英杰,郭 嬌,劉成洪,陸瑞菊,許建華,黃劍華*
(1上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院,上海201306;2上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院,上海201106;3光明種業(yè)有限公司,上海 202171)
為了應(yīng)對洪澇、干旱、冷、鹽和病蟲害等各種環(huán)境脅迫,植物在長期的進(jìn)化過程中形成了復(fù)雜的抗逆機(jī)制。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化是細(xì)胞中極其重要的一種蛋白質(zhì)翻譯后調(diào)控方式,與植物應(yīng)答環(huán)境脅迫信號機(jī)制有關(guān)[1]。SnRK蛋白是一種高度保守的SerThr蛋白激酶,在植物中廣泛存在。SnRK蛋白激酶可以通過磷酸化修飾靶蛋白來調(diào)控植物應(yīng)答脅迫中的多種信號途徑,在植物脅迫應(yīng)答過程中起著至關(guān)重要的作用[2]。研究表明,根據(jù)蛋白結(jié)構(gòu)差異,SnRK家族的38個(gè)成員可劃分為SnRK123三個(gè)亞家族;其中SnRK1蛋白與酵母SNF1蛋白以及哺乳動物AMPK蛋白存在著較高的序列相似性,而SnRK2和SnRK3蛋白是植物所特有的一類蛋白激酶[3]。
研究表明,SnRK2蛋白在植物脫落酸(ABA)脅迫中調(diào)節(jié)參與植物滲透脅迫信號通路[4]。當(dāng)ABA存在時(shí),SnRK2蛋白的抑制因子PP2C的活性被抑制,SnRK2蛋白的功能開始作用[5]?;罨蟮腟nRK2蛋白可以通過磷酸化ABA響應(yīng)元件ABFs來調(diào)節(jié)ABA響應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄,還可以作用于下游的一些元件,如離子通道、bZIP轉(zhuǎn)錄因子、NADPH氧化酶[6],這些蛋白與植物抗逆性關(guān)系密切。在SnRK2蛋白參與的抗逆研究中,關(guān)于非生物脅迫的報(bào)道最為常見,如將玉米的SnRK2蛋白激酶基因轉(zhuǎn)到擬南芥中,明顯增強(qiáng)了擬南芥的耐鹽能力;過表達(dá)蘋果的MpSnRK2.10基因明顯增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因擬南芥的抗旱性[7-8]。也有一些SnRK2蛋白相關(guān)的植物抗病報(bào)道,如胡丹丹等[9]研究表明,沉默水稻中的SnRK2類基因OsSAPK2,轉(zhuǎn)基因水稻感白葉枯病比對照顯著提高。SnRK2基因是否參與大麥對白粉菌的抗性反應(yīng)還未有報(bào)道。
白粉病是我國大麥生產(chǎn)中的重要病害,大麥感病后一般可造成20%以上的產(chǎn)量損失,嚴(yán)重時(shí)損失達(dá)30%[10-11]。培育抗白粉病大麥品種不但能減少產(chǎn)量損失,還能減少化學(xué)農(nóng)藥的使用,是控制白粉病害最有效的手段。大麥抗白粉病相關(guān)基因的克隆和抗病機(jī)理研究是抗病育種的重要基礎(chǔ)?!P大麥7號’是一個(gè)高抗白粉病的大麥品種[12],本試驗(yàn)前期對‘鳳大麥7號’進(jìn)行白粉菌侵染后的轉(zhuǎn)錄組測序,發(fā)現(xiàn)一個(gè)SnRK2家族基因HORVU1Hr1G055340在受白粉菌侵染的‘鳳大麥7號’葉片中上調(diào)表達(dá)。本試驗(yàn)擬對該基因進(jìn)行克隆,并初步分析其在大麥抗白粉病中的功能,以期對‘鳳大麥7號’抗白粉病機(jī)理進(jìn)行更深入的研究。
‘鳳大麥7號’為大理白族自治州農(nóng)業(yè)科學(xué)推廣研究院引進(jìn)的大麥品種,抗白粉病;‘花30’為本實(shí)驗(yàn)室育成的大麥品種,感白粉病。大麥白粉菌取于上海本地大麥試驗(yàn)田。
‘鳳大麥7號’和‘花30’幼苗生長至二葉一心期時(shí),在葉片上均勻抖落新鮮白粉菌孢子,取處理后0 h、6 h、12 h、24 h的大麥葉片,用于總RNA 的提取。
參照李穎波等[13]方法提取大麥總RNA。所提取的RNA采用1%甲醛變性膠電泳檢測RNA 的完整性,同時(shí)測定OD230、OD260、OD280吸收值以檢測純度。cDNA第Ⅰ鏈合成具體步驟按照RevertAidTMFirst Strand cDNA Synthesis Kit(Life)說明書進(jìn)行。
HvSAPK3蛋白理論相對分子質(zhì)量和等電點(diǎn)采用Expasy的ProtParam在線分析軟件(http:web.expasy.orgprotparam)分析并預(yù)測。HvSAPK3蛋白的同源蛋白、結(jié)構(gòu)域利用NCBI的BlastP在線分析軟件(https:blast.ncbi.nlm.nih.gov)查找。
多重序列比對通過Clustal X 1.83軟件進(jìn)行,采用 MEGA 4.1 軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(neighbor-joining 方法),其中bootstrap設(shè)為1 000 replicates。
qRT-PCR分析使用ABI 7500 fast 定量PCR儀進(jìn)行。反應(yīng)體系20 μL,包括2×SYBR Mix(Life),上、下游引物各0.4 μmolL,每個(gè)反應(yīng)含大約 30 ng cDNA,3 個(gè)重復(fù),陰性對照不加模板體系。qRT-PCR 反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性30 s;94℃變性5 s,60℃退火20 s,72℃延伸20 s,45個(gè)循環(huán)。通過產(chǎn)物溶解曲線分析 qRT-PCR 引物擴(kuò)增的特異性。利用2-ΔΔCT方法計(jì)算相對表達(dá)量。qRT-PCR引物根據(jù)HvSAPK3基因序列設(shè)計(jì):上游引物5’-CAAGGAACTTCCGGAAAACA-3’,下游引物5’-CTCAGGCTCCTTGAAGTTGG-3’;采用大麥的Actin基因作為內(nèi)參基因(Actin-F:5’-GACTCTGGTGATGGTGTCAGC-3’,Actin-R:5’-GGCTGGAAGAGGACCTCAGG-3’)。
VIGS試驗(yàn)過程參照Wang等[14]方法。特異性引物VIGS-F:5’-CTAGCTAGCTACGAGGCGTTGAAG-GAGTTGG-3’,VIGS-R:5’-CTAGCTAGCTTCGAAGAGTTCTCCGCCAGCA-3’,序列長度為252 bp。在接種大麥條紋花葉病毒(Barley stripe mosaic virus,BSMV)病毒10 d后觀察‘鳳大麥7號’的葉片病毒癥狀。以沉默八氫番茄紅素脫氫酶基因(PDS)植株為參照,分別對Mock(接種緩沖液)和接種BSMV:HvSAPK3植株取樣,進(jìn)行qRT-PCR分析,檢測目的基因的沉默效率。取出現(xiàn)病毒表型的植株葉片,整齊地?cái)[放于已滅菌的6-BA保鮮培養(yǎng)基上,用抖落法接種新鮮白粉菌孢子,接種6—8d后觀察葉片發(fā)病情況。
根據(jù)HORVU1Hr1G055340設(shè)計(jì)跨ORF引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序,發(fā)現(xiàn)該P(yáng)CR產(chǎn)物含有編碼長度為1 026 bp的完整ORF核苷酸序列。該基因編碼的蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量為38.54 ku,理論等電點(diǎn)為6.03。將該蛋白氨基酸序列進(jìn)行BLASTp同源比對,發(fā)現(xiàn)該蛋白在5—243位氨基酸與SnRK2蛋白激酶家族典型的結(jié)構(gòu)域Cdd:cd14662相似度很高(圖1),表明該基因?qū)儆赟nRK2基因家族,故將該基因命名為HvSAPK3。
“”表示序列一致,“:”表示保守性突變,“.”表示弱半保守性突變圖1 HvSAPK3蛋白與SNRK2保守結(jié)構(gòu)域Cdd:cd14662序列比對 Fig.1 Sequence alignment of HvSAPK3 protein with the conserved domain Cdd:cd14662 of SNRK2
GenBank序列號:AgSAPK3(XP_020185663.1),BdSAPK3(XP_003574349.1),OsSAPK3(XP_015614267.1),ZmSnRK2.3 (NP_001136496.1),SbSAPK3(XP_021306693.1),SiSAPK3(XP_004983620.1),BdSAPK2(NP_001304800.1), SiSAPK2(XP_004958353.1),OsSAPK2(Q0D4J7.1),OsSAPK1(Q75LR7.1)圖2 部分禾本科植物SAPK同源蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.2 Phylogenetic analysis of SAPK homologous proteins in some Gramineae plants
將HvSAPK3蛋白與粗山羊草、谷子、二穗短柄草、玉米、高粱、水稻的SnRK2 類蛋白進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析表明:HvSAPK3蛋白和其他禾本科植物的SAPK3蛋白形成一個(gè)群(圖2),其中HvSAPK3蛋白和粗山羊草SnRK2 類蛋白AgSAPK3親緣關(guān)系最近,表明SAPK3蛋白在禾本科中進(jìn)化比較保守。
在白粉菌侵染的‘鳳大麥7號’葉片中,HvSAPK3基因在12h時(shí)開始上調(diào)表達(dá),隨后表達(dá)量逐漸恢復(fù)到侵染前水平(圖3A);而在感白粉病品種‘花30’ 葉片中,HvSAPK3基因在白粉菌侵染后下調(diào)表達(dá)(圖3B),表明HvSAPK3基因可能參與‘鳳大麥7號’的抗病反應(yīng)。
*表示P<0.05圖3 HvSAPK3基因在受白粉菌侵染的抗感大麥材料中的表達(dá)特征Fig.3 Expression characteristics of HvSAPK3 gene in resistant and susceptible barley infected by powdery mildew
A:在‘鳳大麥7號’葉片上接種BSMV病毒載體10 d后葉片的癥狀;B:利用qRT-PCR檢測HvSAPK3基因的沉默效率,*表示P<0.05;C:沉默HvSAPK3基因植株葉片離體接種大麥白粉菌后的表型,以BSMV:PDS為對照,‘花30’為感病對照;D:接種BSMV:PDS和BSMV:HvSAPK3病毒重組載體的‘鳳大麥7號’葉片接種白粉菌后白粉菌侵染比較,紅色箭頭表示形成的分生孢子,標(biāo)尺=100 μm圖4 利用VIGS分析HvSAPK3基因在‘鳳大麥7號’中的功能Fig.4 Analysis of the function of HvSAPK3 gene in ‘Fengdamai 7’ by VIGS
將BSMV病毒α鏈、β鏈體外轉(zhuǎn)錄物分別與BSMV:PDS、BSMV:HvSAPK3體外轉(zhuǎn)錄物混合,接種二葉一心期‘鳳大麥7號’植株的第二張葉片,10d后觀察葉片上的病毒侵染癥狀。結(jié)果顯示,在參照植株(接種BSMV:PDS)的葉片上產(chǎn)生明顯的長條狀光漂白表型,表明植株內(nèi)PDS基因已被成功沉默,病毒已成功侵染(圖4A);而在接種BSMV:HvSAPK3的葉片上,也出現(xiàn)明顯褪綠的病毒花斑癥狀。
病毒載體接種10 d后,利用qRT-PCR分析沉默植株中HvSAPK3基因的表達(dá)情況,同時(shí)離體接種鑒定其白粉病抗性。結(jié)果顯示,沉默植株中的HvSAPK3基因表達(dá)量和對照植株相比顯著降低,說明接種病毒葉片中HvSAPK3基因已被沉默(圖4B)。接種白粉菌孢子后,BSMV:PDS、BSMV:HvSAPK3和Mock的植株葉片上未觀察到明顯的白粉菌孢子堆生成(圖4C)。進(jìn)一步通過顯微觀察發(fā)現(xiàn),接種BSMV:PDS植株的葉片上白粉菌盡管能夠侵染,但無法形成分生孢子梗;而接種BSMV:HvSAPK3的植株葉片上,部分白粉菌能正常繁殖并形成次生菌絲(圖4D)。以上結(jié)果表明,在‘鳳大麥7號’中沉默HvSAPK3基因可降低其抗病性,證明該基因在抗白粉病中發(fā)揮作用。
SnRK2是脅迫相關(guān)蛋白激酶,通過傳遞的信號誘發(fā)植物脅迫應(yīng)答反應(yīng)[2]。本研究以轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),在高抗白粉病大麥品種中克隆了一個(gè)響應(yīng)白粉菌侵染的SnRK2類基因HvSAPK3,進(jìn)化分析顯示:HvSAPK3蛋白和其他禾本科作物中同類蛋白聚類到同一個(gè)群,表明HvSAPK3基因在禾本科作物中進(jìn)化較保守,推測HvSAPK3基因在禾本科作物中的功能也是保守的。
Xu等[15]研究認(rèn)為,在沒有抗病基因存在的條件下,水稻OsSAPKs家族基因不會被脅迫所誘導(dǎo)。在本研究中,HvSAPK3基因在‘鳳大麥7號’中受白粉菌侵染后表達(dá)上調(diào),而在感白粉病品種‘花30’中受白粉菌侵染后表達(dá)下調(diào),表明HvSAPK3基因可能參與‘鳳大麥7號’對白粉病的抗病反應(yīng)。
胡丹丹等[9]沉默水稻中的OsSAPK2基因,轉(zhuǎn)基因水稻感白葉枯病顯著提高,顯示OsSAPK2基因的正向調(diào)控作用。在本研究中,VIGS試驗(yàn)顯示,沉默HvSAPK3基因后,白粉菌能在‘鳳大麥7號’葉片上能形成次生菌絲,表明HvSAPK3基因在‘鳳大麥7號’抗病反應(yīng)中起正向調(diào)控作用。目前,大麥對白粉菌?;剐缘难芯枯^多,已報(bào)道的大麥主效抗白粉病基因位點(diǎn)有22個(gè)[16],HvSAPK3基因究竟參與哪個(gè)基因的調(diào)控,還需要對‘鳳大麥7號’進(jìn)行更加深入的研究。
致謝:
感謝大理白族自治州農(nóng)業(yè)科學(xué)推廣研究院李國強(qiáng)研究員提供‘鳳大麥7號’材料。
上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)2019年2期