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南京農(nóng)大構(gòu)建世界首個植物重復(fù)基因數(shù)據(jù)庫

2019-03-26 02:22
發(fā)明與創(chuàng)新 2019年9期
關(guān)鍵詞:園藝作物南京農(nóng)業(yè)大學(xué)基因組

日前,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院教授張紹鈴團(tuán)隊系統(tǒng)鑒定了141種植物基因組中不同類型重復(fù)基因,構(gòu)建了世界首個植物重復(fù)基因數(shù)據(jù)庫,揭示重復(fù)基因進(jìn)化的普遍規(guī)律。

以往研究發(fā)現(xiàn),有的植物有復(fù)制自己基因的功能,即通過不同類型復(fù)制方式產(chǎn)生一個與原基因序列相同的新基因。基因復(fù)制產(chǎn)生的兩個同源基因稱為重復(fù)基因或“姊妹基因”。近年來,越來越多的植物基因組被破譯,目前已經(jīng)完成全基因組測序的植物超過200種,但仍缺乏一個具有廣泛適用性的鑒定不同種類植物重復(fù)基因的方法。

該團(tuán)隊通過大規(guī)模收集整合國內(nèi)外植物基因組數(shù)據(jù)資源,構(gòu)建了世界首個植物重復(fù)基因數(shù)據(jù)庫,目前已收錄141種完成基因組測序的植物,包含大豆、水稻、小麥、玉米等大宗糧食作物,以及梨、桃、葡萄、蔬菜、花卉等園藝作物,并將拓展為植物相關(guān)的所有類別。該數(shù)據(jù)庫將為深入研究重復(fù)基因的進(jìn)化機制提供寶貴的數(shù)據(jù)資源。

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