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利用SSR標記快速鑒定西瓜雜交種純度

2018-12-17 08:28張佩倫郭祿芹胡倩梅楊路明馬長生
中國瓜菜 2018年5期
關鍵詞:分子標記西瓜

張佩倫 郭祿芹 胡倩梅 楊路明 馬長生

摘要:為了快速高效地鑒定雜交種純度,建立完善的西瓜雜交種純度SSR分子標記鑒定技術體系。利用30對雜合率高、多態(tài)性高的SSR引物對‘豫藝360‘豫藝黑小寶‘國豫二號和‘甜王這4份在河南省廣泛種植的西瓜雜交種父母本進行篩選,篩選出7對條帶清晰、多態(tài)性較好的引物。通過PCR反應體系擴增及凝膠電泳進行純度分析,對4份雜交種的F1樣本進行鑒定,純度分別為91.1%、93.2%、92.6%、91.4%,將分子標記鑒定結果與田間形態(tài)學鑒定的結果相比對,兩者偏差52%,在允許范圍之內(nèi),表現(xiàn)出高度一致。

關鍵詞:西瓜;SSR;分子標記;純度鑒定

傳統(tǒng)的形態(tài)學性狀鑒定方法(即田間鑒定法)[1]存在費時費力,易受環(huán)境、氣候及人為因素的影響等一系列弊端。分子標記從DNA水平上檢測個體或種群間基因組中存在的某種差異,通過PCR反應體系擴增及凝膠電泳技術檢測出個體間的差異,準確區(qū)分出純合帶型和雜交帶型,從而快速高效地鑒定雜交種的純度。王吉明等[Z]總結出了系統(tǒng)性的鑒別方法,李超漢等[3]針對不同的西瓜雜交種進行純度鑒定和特異性分析。但由于西瓜遺傳背景狹窄,不同品種之間的親緣關系較近,分子標記多態(tài)性較低,會限制分子標記在純度鑒定上的應用。筆者利用SSR分子標記技術,旨在找出適宜的SSR標記鑒定‘豫藝360‘豫藝黑小寶‘國豫二號‘甜王這4份在河南普遍種植的西瓜雜交種純度,并通過田間形態(tài)學性狀鑒定進行相互驗證,進而可替代田間形態(tài)學性狀檢測方法[4],建立高效的SSR分子標記鑒定雜交種純度的體系。

1 材料與方法

1.1 供試西瓜雜交種

選擇4份在河南省廣泛種植,在各種性狀上均具有代表性的優(yōu)質西瓜商業(yè)雜交品種(表1),4份材料均由河南豫藝種業(yè)科技發(fā)展有限公司提供,分別為‘豫藝360‘豫藝黑小寶‘國豫二號和‘甜王。2017年5-8月在田間種植(河南農(nóng)業(yè)大學扶溝蔬菜研究院試驗基地)進行形態(tài)學性狀鑒定試驗,2017年9-12月在河南農(nóng)業(yè)大學園藝學院分子實驗室利用SSR分子標記進行雜交種的純度鑒定。

1.2 SSR分子標記純度鑒定方法

1.2.1 西瓜雜交種催茅與育苗 取每份雜交種的F1及其父母本種子,分別育苗。溫湯浸種10~15min,高錳酸鉀5000倍液浸泡4h,常溫浸泡4ho浸種后,將種子用濕毛巾包裹后置于培養(yǎng)箱中催芽,白晝時長14h,溫度30℃,夜間時長10h,溫度25℃,將種子放于吸水布上,并在種子上部覆蓋吸水紙進行育苗。后期根據(jù)幼苗出苗情況除去子葉上部種皮,幼苗子葉展平后采樣[5]。

1.2.2 提取供試雜交種F1及父母本DNA 利用孫利萍等[5]的堿裂解法快速提取雜交種F1DNA,利用CTAB法提取父母本的DNA.

1.2.3 PCR擴增及電泳檢測 PCR體系為模板DNA2μL,引物1μL,Master Mix 5μL,ddH2O2μL。PCR反應程序為95℃5min,94℃45s,58~68℃1min,6個循環(huán),72℃1min,94℃30s,50~58℃1min,8個循環(huán),72℃1min,94℃30s,50℃30s,20個循環(huán),72℃1min,72℃7min,4℃保存。用30%(ω)聚丙烯酰胺凝膠對PCR擴增產(chǎn)物電泳90min,使用銀染法進行染色,分析電泳結果[6]。

1.3 田間形態(tài)學性狀鑒定方法

主要結合瓜胎和幼瓜果皮顏色2個形態(tài)指標,在坐瓜期和幼瓜期進行綜合鑒定,將田間種植的純度鑒定結果收集整理,與實驗室的鑒定結果作比對[1]。

1.4 供試西瓜雜交種SSR分子標記引物的篩選

從Zhu等[7]設計的480對西瓜SSR引物中隨機篩選出多態(tài)性高且雜合率高的30對引物用于本試驗的純度鑒定,用4份西瓜雜交種的親本對這30對引物進一步篩選(圖1),最后篩選出7對在4份雜交種中表現(xiàn)出較好多態(tài)性的引物(表2)。

2 結果與分析

2.1 SSR標記引物篩選結果

引物WMSSR09205適用品種較多,在‘豫藝360‘豫藝黑小寶和‘甜王3個雜交種均可以擴增出雜交或互補帶型,可以鑒定雜交種的純度。而引物WMSSR05567只適用于‘國豫二號的純度鑒定,在其他品種的純度鑒定條帶中表現(xiàn)均無差異性。

2.2 SSR標記對西瓜雜交種的純度鑒定

通過引物WMSSR29311對‘豫藝360雜交種的純度檢測(圖2),結果顯示在90個F1單株中,有82個單株表型為父母本雜合帶型,另外8個單株為母本純合帶型,因此該批樣本的純度鑒定結果為91.1%;利用引物WMSSR13827對‘豫藝黑小寶雜交種進行檢測,結果顯示在‘豫藝黑小寶的89個F1單株中,有83個單株表型為父母本雜合帶型,6個單株為母本純合帶型,純度鑒定結果為93.2%;引物WMSSR09205對‘甜王雜交種純度檢測(圖3),結果顯示在93個F1單株中,有85個單株表型為父母本雜合帶型,8個單株為母本純合帶型,純度為91.4%。

利用引物WMSSR05567對‘國豫二號進行純度鑒定,結果顯示在95個F1單株中,有88個單株表型為父母本雜合帶型,7個單株為母本純合帶型,故純度為92.6%。

2.3 SSR標記與形態(tài)學性狀純度鑒定結果比對

利用田間形態(tài)學性狀鑒定法進行田間鑒定,將得到的數(shù)據(jù)統(tǒng)一收集整理,與SSR分子標記鑒定結果進行對比(表3)。

將田間形態(tài)學性狀純度鑒定與SSR分子標記鑒定結果進行比對,發(fā)現(xiàn)兩者的純度偏差均符合允許的誤差范圍≤2%。導致田間純度鑒定結果與SSR分子標記鑒定結果產(chǎn)生偏差的原因,可能是取樣過程中沒有做到完全隨機或苗期長勢較弱的植株(通常為母本)死亡,從而導致田間純度鑒定結果高于SSR分子標記檢測結果。

3 討論

在利用分子標記對西瓜雜交種進行純度鑒定中,首先面臨的是引物篩選問題,需要找到可以將親本與雜交一代鑒別開來、滿足西瓜純度鑒定的雜合率高和多態(tài)性高的核心引物。本研究中篩選出的引物在這4份西瓜雜交種中均表現(xiàn)良好,篩選出的特異性條帶清晰,便于識別,方便對西瓜雜交種純度進行分析。蔣莉莉等[8]也通過試驗證明SSR分子標記技術進行室內(nèi)鑒定的可行性,但篩選出的引物擴增產(chǎn)物大小比較接近,不利于多重PCR的擴增。劉子記等[9]則利用兩對擴增產(chǎn)物大小相差100bp的兩對引物進行多重PCR試驗,證明其可行性,可以顯著提高檢測效率。而在本研究中除WMS-SR05567擴增產(chǎn)物在162bp,其他引物擴增產(chǎn)物均在210~270bp之間,下一步應篩選更多引物進行多重PCR試驗。多重PCR技術高效、快捷且具有高度特異敏感性,可以同時對多個位點的變異情況進行檢測,有利于加快純度鑒定進程,建立標準化的鑒定程序。

對于因堿裂解法提取的DNA濃度較低、造成條帶較弱或缺失的樣本,應使用CTAB法提取高質量的DNA用于PCR的擴增。也可以增加電泳時的上樣量,以便獲得更加清晰、容易識別的條帶。同時,點樣時應注意經(jīng)常更換槍頭,避免樣本間的串樣和污染,影響電泳條帶的顯示結果。

本研究中每份西瓜雜交種都篩選出了多態(tài)性較好的引物,在檢測自交苗的同時能將摻雜其中的其他品種植株鑒別開來。這些引物可以提高檢測效率,確保結果的準確性,為今后形成SSR分子標記應用于西瓜雜交純度鑒定的技術規(guī)程奠定研究基礎。同時,西瓜SSR分子標記、西瓜表型的多樣性分析[10]、西瓜種群分布的聚類分析[11]、抗病品種的選育[12]、遺傳圖譜的構建和相關性狀的分析[13]等一系列研究工作,都對西瓜的產(chǎn)業(yè)發(fā)展起到了一定的推動作用。

4 結論

本研究結合4份在河南省廣泛種植的西瓜雜交種作為供試樣本,篩選出多態(tài)性較好的7對引物,適用于這4份西瓜雜交種。這些引物可以將西瓜雜交種之中的自交苗以及其他品種的異形株鑒別開來。其中引物WMSSR09205在‘豫藝360‘豫藝黑小寶‘甜王這3份西瓜雜交種樣本中均具有良好的多態(tài)性,可作為鑒別這3個西瓜雜交種純度的優(yōu)質引物。通過利用SSR分子標記技術進行西瓜雜交種的純度鑒定,與田間形態(tài)學性狀鑒定結果比對,對兩者結果進行顯著分析,兩者的純度偏差均符合允許的誤差范圍≤2%,證明SSR分子標記技術檢測西瓜雜交種純度的方法可以替代田間形態(tài)學性狀鑒定法。該技術可避免在雜交種純度鑒定中傳統(tǒng)田間形態(tài)學性狀鑒定法的繁瑣和不穩(wěn)定,減少勞動量,消除人為主觀判斷對鑒定結果的影響,準確、快捷、科學的鑒定出雜交種純度,具有更高的可信度。

參考文獻

[1]馬雙武,韋小敏,王吉明.我國西瓜雜交種子純度鑒定方法綜述[J].長江蔬菜,2006(10):27-30.

[2]王吉明,郭瑞盼,尚建立,等.利用SSR標記鑒定西瓜品種純度[C]//中國園藝學會2012年學術年會論文摘要集,2012.

[3]李超漢,劉莉,劉翔,等.基于SSR標記的5個西瓜新品種純度鑒定及特異性分析的研究[J].中國農(nóng)學通報,2015,31(33):177-185.

[4]方小雪,姚少林,薄永明.利用SSR分子標記鑒定甜瓜雜交種純度[J].浙江農(nóng)業(yè)科學,2016,57(2):178-181.

[5]孫利萍,賈芝琪,胡建斌,等.堿裂解法快速提取番茄DNA的研究[J].河南農(nóng)業(yè)大學學報,2012,46(2):136-138.

[6]李其松,王金玉,沈華,等.DNA聚丙烯酰胺凝膠電泳及銀染方法的探討[J].黑龍江畜牧獸醫(yī),2006(10):79-80.

[7]ZHUh,SONG P,KOO D H,et al.Genome wide characteriza-tion of simple sequence repeats in watermelon genomeand theirapplication in comparative mapping and genetic diversityanalysis[J].BMC Genomics,2016,17(1):557.

[8]蔣莉莉,張高原,張建農(nóng).西瓜雜交組合T-1種子純度鑒定的SSR標記研究[J].西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版),2016,44(6):93-98.

[9]劉子記,詹園鳳,朱婕,等.利用SSR標記鑒定西瓜雜交種純度的研究[J].熱帶作物學報,2016,37(9):1714-1718.

[10] KWON Y S.Use of EST-SSR markers for genetic characteri-sation of commercial watermelon varietiesandhybrid seedpurity testing[J].Seed Science&Technology;,2013,41 (2):245-256.

[11]李鈺婷,安美忱,張興雷,等.西瓜莖葉表型性狀的多樣性分析[J].山西農(nóng)業(yè)科學,2017,45(7):1061-1065.

[12]王吉明,尚建立,董亞玲,等.西瓜抗枯萎病育種的分子輔助選擇[J].中國農(nóng)學通報,2015,31(7):2170-2173.

[13]劉傳奇,高鵬,欒非時.西瓜遺傳圖譜構建及果實相關性狀QTL分析[J].中國農(nóng)業(yè)科學,2014,47(14):2814-2829.

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